• Journal of Soil and Groundwater Environment
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• v.12 no.5
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• pp.54-63
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• 2007

To examine the effects of amendments on heavy mineral oil degradation, a pilot scale experiment was conducted for over 105days. During the experiment, soil samples were collected and analyzed periodically for the determination of residual hydrocarbon and microbial activities. At the end of the experiment, the initial level of contamination ($6,205{\pm}173mgkg^{-1}$) was reduced by $33{\sim}45%$ in the amendment amended soil; whereas only 8% of the hydrocarbon was eliminated in the non-amended soil. Heavy mineral oil degradation was much faster and more complete in compost amended soils. Enhanced dissipation of heavy mineral oil in compost amended soil might be derived from increased microbial activities (respiration, microbial biomass-C) and soil enzyme activity(lipase, dehydrogenase, and FDA hydrolase) were strongly correlated with heavy mineral oil biodegradaton (P < 0.01).

• Clean Technology
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• v.13 no.1 s.36
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• pp.1-15
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• 2007

Biological treatment is a relatively recent air pollution control technology in which off-gases containing biodegradable odors and volatile organic compounds(VOCs) are vented through microbes. It is a promising alternative to conventional air pollution control methods. Bioreactors for air pollution control have found most of their success in the treatment of dilute and high flow waste air streams containing VOCs and odor compounds. They offer several advantages over traditional technologies such as incineration or adsorption. These include lower treatment costs, absence of formation of secondary pollutants, no spent chemicals, low energy demand and low temperature treatment. The three most widely used technologies are described, namely biofiltration, biotrickling filtration, bioscrubbing. The most widely used bioreactor for air pollution control is biofilter, but it has several limitations. In the past years major progress has been accomplished in the development of vapor phase bioreaction systems, for solving problems of biofilter. Biotrickling filters are more complex than biofilters, but are usually more effective, especially for the treatment of compounds which are difficult to degrade or compounds that generate acidic by-products. This, paper reviews fundamental and theoretical/practical aspect of air pollution control in biofilter, biotrickling filter and bioscrubber, focusing more extensively on biotrickling filtration. Special emphasis is given to the operating parameters and the factors influencing performance for air pollution control, and cost estimation in biotreatment technologies.

• The Korean Journal of Mycology
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• v.31 no.1
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• pp.44-49
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• 2003

Several microbial biocontrol products (Greenbiotech Co., Paju, Korea), Green-all T (Trichoderma harzianum), Green-all S(Bacillus sp.) and Green-all G (Streptomyces sp.) were supplemented with organic amendments such as sawdusts and rice hulls to study on efficacy of biological control of seeding damping-off of cucumber caused by Pythium ultimum. Sawdusts amended into potato dextrose agar alone could inhibit in vitro mycelial growth of P. ultimum. All there microbial products of Green-all T, Green-all G and Green-all S significantly reduced seeding damping-off (LSD, P=0.05). However, several amendments such as sawdusts and rice hulls into Green-all T and Green-all S products did not increase efficacy of biological control compared to non-amended treatment. In contrast, supplements of aminodoctor containing several amino acids (Greenbiotech Co., Korea) into Green-all G product significantly increased efficacy of biological control of seeding damping-off, resulting in from 42% to 2% disease incidence in relation to seedling emergence (LSD, P=0.05). Also, amendment of sawdusts into Tricoderma product significantly increased efficacy of biological control as disease index of 5.0 compared to non-amended control of 56.0 in Green-all T product alone. This indicates that organic amendments could increase efficacy of biological control of cucumber seedling damping-off.

• Korean Journal Plant Pathology
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• v.12 no.4
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• pp.407-414
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• 1996

벼 담수직파재배에서 Pythium arrhenomanes 1398에 의한 벼목썩음병의 발병 억제효과가 높은 biological control agent를 배지와 growth chamber 검정을 통하여 선발하고 생물학적 방제 효과를 온실에서 검정한 결과 공시한 66 세균 중 91-110 균주에 의해서만 벼모썩음병의 발병이 억제되었다. CMA 배지 검정에서는 P. arrhenomanes 1398 균주만을 접종한 볍씨는 100% 발병율을 보인 반면 91-110 균주와 P. arrhenomanes 1398 균주를 함께 처리한 경우에는 25.0%가 발병되었으며, 이 효과는 metalaxyl을 처리한 볍씨에서의 21.7% 발병율과 유사하였다. Growth chamber 검정에서는 P. arrhenomanes 1398 균주만을 접종한 볍씨는 27.7% 모 출아율을 보인 반면 91-110 균주와 함께 처리하면 59.1%가 출아되었다. 그러나 91-110 균주에 의한 발병 억제효과는 50% household bleach로 표면 소독한 볍씨에서만 인정되었으며, 이 소독한 볍씨를 91-110 균주의 세균 부유액에 침지하여 3시간 진탕한 후 그 부유액을 따라내고 24시간 배양한 것이 진탕하지 않고 배양한 것에 비하여 모출아율이 54.3%에서 65.7%로 증가되었다. 91-110 균주와 P. arrhenomanes 1398 균주를 함께 처리한 볍씨의 출아율은 62.3%로서 P. arrhenomanes 1398 균주만을 접종한것의 30.8%에 비하여 높았다. 이상과 같이 담수직파한 벼모썩음병의 발병 억제효과가 높은 91-110 균주는 Bacillus brevis로 동정되었다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2007.06b
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• pp.27-31
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• 2007

생물학적 서열 데이터는 크게 DNA 염기 서열과 단백질 아미노산 서열이 있다. 이들 서열은 일반적으로 많은 수의 항목들을 가지고 있어 그 길이가 매우 길다. 생물학적 데이터 서열들에는 보통 빈번하게 발생하는 부분 연속 서열들이 존재하는데 이들 서열들을 찾아내는 것은 다양한 서열 분석에서 유용하게 사용될 수 있다. 이를 위해 초기에는 Apriori 알고리즘을 기반으로 하는 순차패턴 마이닝 알고리즘들을 활용하는 방법들이 많이 제시되었다. 그중 PrefixSpan 알고리즘은 Apriori기반의 가장 효율적인 순차패턴 마이닝 기법이다. 하지만 이 알고리즘은 길이-1인 빈발 패턴들로부터 서열 패턴을 확장해나가는 방식으로 길이가 긴 연속 서열을 포함하는 생물학적 데이터 서열들에 대한 검색방법으로는 적합하지 않다. 최근에는 기존의 PrefixSpan방식을 이용하면서도 반복적인 처리과정을 줄인 MacosVSpan이 제안되었다. 하지만 이 알고리즘 또한 원본 데이터베이스보다 크기가 큰 별도의 프로젝션 데이터베이스를 사용함으로서 많은 비용부담이 발생하고 특히 길이가 긴 서열에 대해서는 더욱 효율적이지 못하다. 이에 본 논문에서 많은 양의 생물학적 데이터 서열들로부터 빈번한 연속서열을 고정길이 확장 트리를 이용하여 효과적으로 찾아내는 방법을 제안한다. 그리고 다양한 환경에서 실험을 통해 제안하는 방식이 MacosVSpan알고리즘에 비해 검색 성능이 우수함을 증명한다.

• KSBB Journal
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• v.21 no.1 s.96
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• pp.49-53
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• 2006

The aim of this research is to estimate the values of biological kinetic parameters of pharmaceutical wastewater for understanding biochemical properties. Maximum specific growth rate (${\mu}m$), yield coefficient (Y), and half-velocity coefficient (KS) were determined using oxygen uptake rate (OUR), and the results were 10.49/day (0.437/hr), 0.655, and 38.89 mg/L, respectively. Measured ${\mu}max$ by nonlinear regression of Monod equation was 10.63/day (or 0.443/hr), and this value was similar with above result. These parameters may be used to increase efficiency of pharmaceutical wastewater treatment and to determine amount of oxygen needed to removal BOD and dissolved oxygen in activated sludge process.

• KOREAN JOURNAL OF CROP SCIENCE
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• v.10
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• pp.45-50
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• 1971

For the purpose of finding out the effect of heat treatment on biological response and mutation rate, rice seeds were heat treated before and after gamma irradiation. 1. At a dose of 20 KR, pre-irradiation heat treatment showed reduced biological damage and increased mutation rate as compared with non-heat treatment. 2. Mutation frequency was increased in post-treatment of heat shock than in pre-irradiation heat treatment and non-heat treatment. 3. Pre-irradiation heat treatment at 6$0^{\circ}C$ for 30 minutes markedly reduced the biological damage and increased the mutation rate. 4. Mutation spectrum in heat treatment was different from non-treatment.

• Proceedings of the Korean Society of Soil and Groundwater Environment Conference
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• 2003.04a
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• pp.283-286
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• 2003

국내의 12개소 저산출 우물을 대상으로, 외국의 유정들에서의 산출량 증대를 위하여 많이 사용되고있는 인공수압파쇄 방법을 적용하여 산출성 증대 효과를 검증하였다. 12개소에 대하여 수압파쇄시험 전후로 양수 시험을 실시하여 투수성 증대 등의 효과와 비양수량을 정량적으로 평가한 결과, 비양수량의 경우 전체적으로 평균 약 45%의 증가하였으며 투수량계수 또한 약 26%가 증가하였다. 이러한 결과는 인공수압파쇄 방법이 대수층내 열극의 생성 혹은 확장 및 균열내의 막힘(clog) 물질 제거를 통해 투수성을 상당히 개선시킨 것으로 평가된다. 특히, 현재까지의 시험 결과, 퇴적암류 지역에서 보다 화성암류 지역에서의 시험 결과가 양호하게 나타났다. 화성암 지역에서 개발된 홍천에서의 사례를 볼 때, 고압의 주입을 통하여 상부 및 하부의 파쇄대가 확장 연결되고, 이들 파쇄 열극에 부착된 광물학적, 생물학적 막힘 물질이 제거되면서 산출성이 증대되는 것으로 나타났다.

• Proceedings of the Korea Society of Environmental Biology Conference
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• 2003.11a
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• pp.111-115
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• 2003

Tannic acid (0.5mg/ml, 1.0mg/ml, 2.0mg/ml)와 카드뮴(20mg/kg)을 마우스에 경구 투여한 결과는 다음과 같다. 1. Tannic acid와 카드뮴을 투여한 마우스의 증체량과 음수소비량에 변화가 있었으나, 카드뮴투여에 의한 변화는 tannic acid투여에 의하여 감소되었다. 2. 카드뮴투여에 의하여 간장의 상대중량과 뇌 상대중량이 대조군에 비하여 유의한 변화가 있었으며, tannic acid 1.0mg/ml 투여군에서는 간장의 상대중량, 폐장의 상대중량, 흉선의 상대중량도 유의하게 변화하였다. (P < 0.05) 3. Hemoglobin contents, packed cell volume, platelet count, neutrophill count 등의 혈액학적인 변화는 대조군에 비하여 카드뮴투여군에서 유의한 변화가 인정되었다. 그러나, 이러한 유의한 변화가 tannic acid를 동시 투여한 군에서는 나타나지 않았다. 4. 카드뮴을 투여한 군에서는 혈청학적 변화(ALT, AST, BUN와 creatinine)가 있었으나 tannic acid 0.5, 1.0, 2.0mg/ml을 동시투여한 군에서는 회복되는 경향이 나타났다. 위의 결과로 미루어 카드뮴 투여에 의한 독성이 tannic acid을 2.0 mg/ml/day 이상 4주간 투여하였을 때 경감효과가 나타날 수 있었다. 그러나, 카드뮴과 같은 중금속의 독성에 tannic acid가 어떻게 경감효과를 나타내는지에 관한 작용기전의 연구가 더 필요할 것으로 사료된다.

• The KIPS Transactions:PartD
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• v.15D no.2
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• pp.155-162
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• 2008

Biological sequences such as DNA sequences and amino acid sequences typically contain a large number of items. They have contiguous sequences that ordinarily consist of hundreds of frequent items. In biological sequences analysis(BSA), a frequent contiguous sequence search is one of the most important operations. Many studies have been done for mining sequential patterns efficiently. Most of the existing methods for mining sequential patterns are based on the Apriori algorithm. In particular, the prefixSpan algorithm is one of the most efficient sequential pattern mining schemes based on the Apriori algorithm. However, since the algorithm expands the sequential patterns from frequent patterns with length-1, it is not suitable for biological dataset with long frequent contiguous sequences. In recent years, the MacosVSpan algorithm was proposed based on the idea of the prefixSpan algorithm to significantly reduce its recursive process. However, the algorithm is still inefficient for mining frequent contiguous sequences from long biological data sequences. In this paper, we propose an efficient method to mine maximal frequent contiguous sequences in large biological data sequences by constructing the spanning tree with the fixed length. To verify the superiority of the proposed method, we perform experiments in various environments. As the result, the experiments show that the proposed method is much more efficient than MacosVSpan in terms of retrieval performance.