• Title/Summary/Keyword: 생물변환

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Characterization and Stability of Gardenia Jasminoides Biotransformed Pigment Produced in Jar Fermentor (Jar Fermentor에서 생산된 치자 생물변환 색소의 특성 및 안정성)

  • Kim, Seon-Jae;Jang, Hong-Gi
    • Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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    • v.34 no.6
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    • pp.880-884
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    • 2005
  • Yellow pigment of Gardenia jasminoides was converted into new pigment by whole-cell biotransformation of thirteen different microbial species. The color value of the biotransformed pigment, which was produced by Streptococcus mutans MK-34, was higher than those of other biotransformed pigments. The biotransformed pigment produced by S. mutans MK-34 dispalyed an characteristic absorption peak at 588 nm and the absorption value increased during the incubation in a jar fermentor. The effects of light and temperature $(60^{\circ}C)$ on storage stability of the biotransformed pigment were investigated. As a result, the biotransformed pigments produced by Streptococcus mutans and Bacillus subtilis were more stable than Gardenia jasminoides yellow pigment during storage.

Biotransformation of trans,trans-farnesol by Wood Rot Fungi (목재부후균에 의한 trans,trans-farnesol의 생물변환)

  • Kim, Young-Hun;Lee, Su-Yeon;Park, Mi-Jin;Choi, In-Gyu;Lee, Jae-Won
    • Korean Journal of Microbiology
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    • v.48 no.1
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    • pp.37-41
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    • 2012
  • In this study, we screened and evaluated possibility of wood rot fungi as biocatalyst for biotransformation of sesquiterpenes. Screening were performed to select the most promising microorganisms with ability to biotransformation the substrate trans,trans-fanesol. Trans,trans-farnesol which is synthesized precursor of sesquiterpenes was used for resistance test on 19 of wood rot fungi. From the 19 tested wood rot fungi, 5 were selected by resistance test on different concentration of trans,trans-fanesol. Biotransformation was performed with selected wood rot fungi on liquid culture. The metabolites detected by GC-MS analysis were nerolidol for Laetiporus sulphureus var. miniatus (jungh) Imaz and eicosane for Coriolus versicolor (L.Fr) Prlar and isoborneol for Fomitopsis pinicola and isocyclocitral for Lampteromyces japonicas. As the results, wood rot fungi could be potential biocatalyst for biotransformation of sesquiterpenes.

Design and Implementation of an Intelligent Multiple DNA Sequence Translation Tool (지능적 다중염기서열 변환 도구의 설계 및 구현)

  • Lee Hye-Ri;Lee Geon-Myeong;Lee Chan-Hui;Lee Seong-Deok;Kim Seong-Su
    • Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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    • 2006.05a
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    • pp.37-40
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    • 2006
  • 계통분석을 하는 생물학자들은 관련된 분석대상에 대한 정보를 확보하여 비교분석하기 위해 NCBI 등으로부터 염기서열을 확보하여 아미노산 서열로 변환하는 작업을 수행하게 된다. 많은 서열 데이터에 대해서 데이터베이스로부터 데이터를 검색하고 이를 변환하는 작업을 순차적으로 분석자가 관여하여 작업하는 것이 현재 분석환경이다. 따라서 본 논문에서는 분석의 효율성을 향상시키기 위해, 관심서열의 등록번호(Accession Number) 리스트를 입력하면 해당 서열에 대항 정보를 NCBI로부터 웹로봇을 통해 자동으로 확보한 다음, 확보된 염기서열 전체를 아미노산 서열로 자동 변환하여 가장 긴 ORF(Open Reading Frame)을 추천해주기 위해 설계된 지능형 다중 염기서열 변환 도구에 대해서 소개한다.

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Natural Language Query Interpretation System for Biomedical Database Access (구조화된 생물의료 정보의 접근을 위한 자연언어 질의 시스템)

  • 이호동;박종철
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2002.04b
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    • pp.487-489
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    • 2002
  • 본 논문은 이질적인 데이터베이스에 산재되어 있는 생물의료 정보의 개념적인 접근을 가능하게 하기 위한 자연언어질의 시스템을 설명한다. 이를 위해 본 시스템에서는 질의문을 SQL, OQL, CPL 데이터베이스 정형언어로 변환하는데, 이 과정에서 필요한 질의문의 분석 및 변환과정을 보인다. 제안하는 방법은 구문분석에 의해 도출된 정보를 이용해 직접 다양한 정형언어들로 변환하므로, 시스템의 구조가 간결해지고 모듈화되어 전체 성능과 이식성의 향상을 가져올 수 있다.

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Measurement of Glucose Concentration Using a Bio-Sensor$(\mu{FIAS)}$ (바이오 센서$(\mu{FIAS)}$를 이용한 Glucose 농도 측정)

  • ;Joseph Irudayaraj
    • Proceedings of the Korean Society for Agricultural Machinery Conference
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    • 2003.02a
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    • pp.209-214
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    • 2003
  • 바이오 센서는 생물학적 인식 반응(Biological recognition reaction)이나 생물 촉매 공정(Bio-catalytic process)을 측정 가능한 전기적 신호로 변환시켜주는 적절한 변환기(Transducer)와 같은 생물학적 인식요소로 이루어진 감지 장치를 의미한다. 1962년 효소를 이용한 Glucose 전극봉의 개발이후 이 분야에 대한 수많은 연구와 기기의 개발이 진행되어왔다. 분석도구로써 바이오 센서는 효소, 항체, 수용체, 세포, 조직 등과 같은 생물학적 인식 요소들에 광범위하게 적용 가능하다는 장점이 있는 반면, 위에 열거한 생물학적 인식 요소들의 불안정성으로 인해 신뢰성이 유지되지 못하는 단점을 동시에 지니고 있다. (중략)

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Enhanced production of hGM-CSF by temperature shifting in transgenic Nicotiana tabacum cell suspension cultures

  • Kim, Yong-Hoon;Lee, Sang-Yoon;Kim, Dong-Il
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 2003.10a
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    • pp.329-333
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    • 2003
  • Human granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (hGM-CSF) is a glycoprotein that stimulates the production of granulocytes, macrophages and white blood cells. hGM-CSF secreted by transgenic Nicotiana tabacum suspension cells was unstable in the culture medium and rapidly degraded by extracellular preteases. In order to reduce extracellular pretense activity, culture temperature was lowered. Then, the production of hGM-CSF by transgenic plant suspension cell cultures could be enhanced by reduced degradation of hGM-CSF at low temperature.

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Statistical consideration of assessing bioequivalence in the new KFDA regulation (개정된 생물학적 동등성 시험 기준에 대한 통계적 고찰)

  • 고승곤;양지선;김정일;임남규
    • The Korean Journal of Applied Statistics
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    • v.15 no.2
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    • pp.281-296
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    • 2002
  • On the new medical system separating the prescription and dispensing of the drug, the qualification of pharmacist in substitution of prescribed medicine was restricted, except bioequivalence-certified drugs. Also, Korean Food and Drug Association(KFDA) revised the bioequivalence regulation on August, 2001 Among many changes from old guideline, impressive one is the statistical consideration. Specially, to estimate and analyze bioequivalence measures, AUC and $C_{max}$, the log-transformed model is recommended and the equivalence interval is modified from $\pm$20 rule to [In(0.8),In(1.25)] one. This meaningful act is very hope-for because it is statistically reasonable and is agreed with worldwide bioequivalence guideline, including USA, EU, Japan and Canada. In this paper, we introduce the new regulation of assessing bioequivalence, announced at August, 2001, mainly on statistical view points. Key points for the new regulation are discussed and the minimum sample size based on simulation studies are proposed.

The Biological Data Converter based on BSML for Sharing Information (정보 공유를 위한 BSML 기반의 생물학 데이터 변환기)

  • 김영억;정광수;정영진;차효성;류근호
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2004.10b
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    • pp.37-39
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    • 2004
  • 현재 생물학 연구실에서 시퀀싱 실험을 통해 생성되거나 또는 공개용 생물 데이터베이스로부터 획득된 유전체 및 단백질 정보는 각각 이질적인 데이터형식을 사용하고 있다. 이 때문에, 생물정보를 분석하여 상호간의 정보를 효율적으로 사용하기 위해서는 공통된 형식의 데이터 표준화작업이 필수적이다. 그리고 이러한 이질적 데이터 형식에 대한 표준화 연구의 미비로 인하여 플랫 파일간의 정보공유에 어려움을 겪고 있다. 따라서, 이 논문에서는 다양한 유전체 및 단백질 정보를 관리.공유하기 위해 이질적인 포맷간의 맵핑 과정을 통하여 BSML(Bioinformatic Sequence Markup Language) 형태로 변환하고, 이를 객체관계형 데이터베이스(Object Relational DataBase)에 저장하는 시스템을 개발하였다. 그리고, 개발된 시스템은 생물정보 데이터의 표준화를 위해 개발된 XML(Extend Markup Language) 기반의 BSML을 이용함으로써 효율적으로 생물학 데이터들 간의 정보를 공유할 수 있으며, 개인 생물학 데이터베이스 구축이나 다양한 생물학적 데이터를 통합 관리하는 시스템에서 유용하게 쓰일 수 있다.

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Consist of Security System with iris recognition (홍채 인식을 통한 보안 시스템의 구성)

  • 김병규;심준홍;이재균;전경재;이기동;이석규
    • Proceedings of the Korea Institutes of Information Security and Cryptology Conference
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    • 2003.07a
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    • pp.110-112
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    • 2003
  • 사람은 각각의 개인마다 전적으로 구분되는 생물학적인 고유한 특징을 가지고 있다. 유전자 형질, 지문, 목소리, 얼굴의 생김새, 눈동자의 홍채 등이 그러한 특징들이며, 이러한 개개인의 생물학적 고유성을 이용하여 자동으로 그 사람의 신원을 인식하는 시스템은 높은 신뢰도와 편리성 때문에 많은 연구가 되어왔고 현재 다양한 곳에서 실제 적용을 하여 사용되고 있다. 본 논문에서는 생체인식 시스템 중에서도 높은 신뢰도를 자랑하고 있는 홍채인식과 웨이블릿 변환을 이용한 홍채 코드 생성과정을 다루어 보았다. 화상처리 알고리즘과 최근 신호처리의 분야에서 많이 사용되고 있는 웨이블릿 변환을 중점으로 서술했으며 웨이블릿 변환을 응용한 여러 가지 인식 알고리즘의 적용을 개발 목표로 삼았다. 실제 홍채인식 시스템은 높은 보안을 필요로 하는 곳에 적용되어 상용화가 되어있고 많은 자료들이 공개가 되어 이미지 처리를 공부하는 사람들에게 좋은 아이템이라 생각한다.

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A Consideration of Logit Transformation for Estimating the Dosage-Mortality Regression Equation (약량 반응곡선의 추정에 있어서 Logit 변환법의 이용)

  • 송유한
    • Journal of Sericultural and Entomological Science
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    • v.20 no.2
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    • pp.36-39
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    • 1978
  • With the current advances in insect toxicant bioassay, the need for easy methods of estimating the dosage-mortality regression equation has become vital. The Probit analysis seems to be not convenient for estimating the dosage-mortality regression equation and median lethal dose(LD50) because of its complexity in calculation. This study presents a comparision between Probit and Losit transformation for the estimation from bioassay results. Validation of the two methods is presented for the pathogenecity of nuclear polyhedrosis virus to the larva of fall web worm, Hyphantria cunea D.

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