• Bioinformatics and Biosystems
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• v.2 no.2
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• pp.37-45
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• 2007

생물정보학은 컴퓨터를 이용하여 방대한 양의 생물학적 데이터를 처리하고 그 결과를 분석하는 학문으로서 IT의 고속성장과 맞물려 점차 그 활용도를 넓혀가고 있다. 특히 의학, 생명과학 연구에 사용되는 데이터는 그 종류도 다양하고 크기가 매우 큰 것이 일반적인데, 이의 처리를 위해서는 고속 네트워크가 바탕이 된 그리드-컴퓨팅(Grid-Computing) 기술 접목이 필연적이다. 고속 네트워크 기술의 발전은 슈퍼컴퓨터를 대체해 컴퓨터 풀 내에 분산된 시스템들을 하나로 묶을 수 있는 그리드-컴퓨팅 분야를 선도하고 있다. 최근 생물정보학 분야에서도 이처럼 발전된 고성능 분산 컴퓨팅 기술을 이용하여 데이터의 신속한 처리와 관리의 효율성을 증대시키고 있는 추세이다. 그리드-컴퓨팅 기술은 크게 데이터 가공을 위한 응용 프로그램 개발과 데이터 관리를 위한 데이터베이스 구축으로 구분 지을 수 있다. 전자에 해당하는 생물정보 연구용 프로그램들은 mpiBLAST, ClustalW-MPI와 같은 MSA서열정렬 프로그램들을 꼽을 수 있으며, BioSimGrid, Taverna와 같은 프로젝트는 그리드-데이터베이스 (Grid-Database)기술을 바탕으로 개발되었다. 본 고에서는 미지의 생명현상을 탐구하고 연구하기 위하여 현재까지 개발된 그리드-컴퓨팅 환경과 의생명과학 연구를 위한 응용 프로그램들, 그리고 그리드-데이터베이스 기술 등을 소개한다.

• Journal of Internet Computing and Services
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• v.2 no.5
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• pp.9-19
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• 2001

In this paper. we develop associate knowledge extraction method for finding and expanding user preference knowledge automatically from web document database. To reflect user interest or preferences, agent explores and extracts relevant information to central term involving the intent of users from the example documents. To do so, we apply association rule exploration data-mining method to the extraction of the relevant objects in the web documents. Also, to give the weighted-value to the extracted and relevant information, we present associate tag block-based weighting method. We applied to bioinformatics above associate knowledge extraction method to find related keywords.

• Journal of the Korean BIBLIA Society for library and Information Science
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• v.27 no.1
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• pp.217-235
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• 2016

Humanities academia and scientific community have been fused together in 21st centurty and it creates new theories and models. Among them, the embodied cognition theory has received attention in several related fields. This study reviews the major metatheories in information user behavior with their limitations. Then, "Life paradigm information behavior model" is suggested as a new theory, which communsurates with new era's request, introducing the embodied cognition theory and the entropy concept. By overcoming the limitations of individual approach to the information retrieval and user behaviors, we expect the discourse of the new integrated information retrieval paradigm.

• Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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• 2014.11a
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• pp.405-406
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• 2014

말라리아에 의한 감염 중 95% 이상을 차지하는 것은 열대열 원충과 삼일열 원충에 의한 감염이다. 각 원충들에 의한 감염은 초기증상이 유사하지만 각각의 치료방법이 다르게 적용되기 때문에 어떤 원충에 의한 발병인지 정확하고 빠른 진단이 필요하다. 본 연구에서는 생명정보학을 기반으로 각 원충에 특이적으로 발현되는 단백질 정보를 중심으로 epitope를 예측하고자 하였다. 먼저 NCBI에서 문헌조사 및 서열정보를 얻었으며, 두 원충에 대한 서열을 multiple alignment를 통해서 비교한 결과 90.2%의 유사성을 보였다. 확보된 특이 부위를 ProtScale Tool 프로그램을 이용하여 hydrophilicity를 분석하고 진단키트 제작에 사용할 수 있는 epitope를 예측하였다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2019.10a
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• pp.99-99
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• 2019

한국생명공학연구원 해외생물소재센터는 해외생물소재 확보 및 활용연구를 통하여 차세대 국가핵심전략 BT산업의 필수원자재인 생물소재의 범지구적 확보와 보존 관리의 임무를 수행하고 있다. 이를 위해 권역별 해외생물소재 공동연구센터(중국, 코스타리카, 인도네시아, 베트남) 및 37개국과의 국제협력 네트워크를 구축하고 있다. 세계적 수준의 생물소재 국가 인프라 구축을 목표로 국내 산 학 연 연구자들에게 다양한 해외생물소재 공급을 통한 지속 가능한 바이오 경제 기반 구축을 지원하고 있다. 해외생물소재센터에서는 2006년부터 특히 천연물 의약품 개발 분야에 많이 사용 되고 있는 해외 식물소재를 지속적으로 확보하고 있으며, 확보된 식물소재의 추출물 제조 및 추출물 은행을 구축, 이에 대한 생물활성 평가를 실시하며 연구자들에게 기초 자료로 제공하고 있다. 현재까지 총 36,500종의 해외식물소재를 확보하였으며, 추출물 약 320만점을 확보하였다. 확보된 소재의 분양활동을 통해 산 학 연 연구자들에게 180만여 점을 분양하였으며, 이를 활용한 다수의 논문과 특허를 획득하였고 중대형 기술이전을 실시하였다. 해외생물소재센터는 홈페이지 기반 분양 신청 시스템[https://www.ibmrc.re.kr]을 통하여 해외식물소재(Powder 와 Extact 형태) 분양서비스를 제공하고 있다. 또한 소재가치제고 연구를 통한 산업화 지원과 해외생물소재의 표본정보 서비스, 해외거점센터를 활용한 현지정보 제공 서비스를 지원하고 있다.

• Proceedings of the Korean Society of Life Science Conference
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• 2003.05a
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• pp.109-109
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• 2003

• The Journal of the Institute of Internet, Broadcasting and Communication
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• v.9 no.2
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• pp.29-36
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• 2009

Due to the progress of Bioinformatics field, We are making use of analyzing tools for effective analyzing enormous data of DNA sequence. But there was inconvenience in existing tools when searching and applying data for analyzing. Our treatise proposes a tool developed by a form based on RIA(Rich Internet Application) that you can solve the problems came from weak points. The analyzing tool for RIA indexing data of DNA sequence shows the results by real time in basis of Web 2.0 which supplemented basis on a form of Web. The web application was developed in Flex2 on Windows workstation.

• Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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• 2008.04a
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• pp.17-18
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• 2008

다차원 데이터들에 대한 거리기반 클러스터링에서는 데이터의 전체 차원을 고려한 거리 정보를 이용하여 근접한 것들을 인접하게 만든다. 마이크로어레이 데이터의 경우에는 일부 차원 관점에서 유사한 지역 클러스터를 찾는 것이 분석에서 유용한 경우가 있다. 이 논문에서는 마이크로어레이 데이터에 대한 지역 클러스터를 찾는 방법을 제안한다.

• Review of KIISC
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• v.16 no.4
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• pp.59-68
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• 2006

본 논문에서는 소프트웨어 개발 프로세스에서 보안성을 향상시키기 위해, 소프트웨어 개발단계에서 산출되는 문서를 바탕으로 내재되어 있는 취약성을 찾기 위한 체크리스트를 제안한다. 현재 소프트웨어 생명주기내에서 보안성을 지키기 위해서는 설계단계에서의 위험분석 이 요구되며, 이를 확인하기 위한 검증단계가 필수적이다. 따라서, 본고에서는 취약성을 찾는 구체적인 방법으로 ISO/IEC 15408(Common Criteria, 이하 CC)[1]기준의 보안성 평가방법론인 CEM[2]에 기반한 취약성검색을 통해 소프트웨어 설계단계에서 산출되는 개발문서에 대해 검증해야 할 항목을 제시한다.

• BT NEWS
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• v.14 no.4
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• pp.6-12
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• 2007