• Title/Summary/Keyword: 상관계수 분석법

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Enumeration of Weissella cibaria phage with cytometry, epifluorescence microscopy, and plaque assay (유세포분석기, 형광현미경, 용균반검사 분석을 이용한 Weissella cibaria 박테리오파지 정량분석 및 상관관계분석)

  • Park, Won Jeong;Lim, Ga-Yeon;Park, Jong-Hyun
    • Korean Journal of Food Science and Technology
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    • v.50 no.2
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    • pp.244-247
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    • 2018
  • Quantitative analysis for non-host infection bacteriophage was conducted for their enumeration. Flow cytometry and epifluorescence microscopy (EPM) were selected as counting methods. Correlation analysis was performed based on the plaque assay method on the existing host infection and consisted of Pearson correlation statistical analysis, regression analysis, and difference analysis. Analyses of 12 samples with flow cytometry and plaque assay methods showed that there was a correlation of 96.7% with Pearson correlation value r=0.967, $R^2$ 0.9352, and difference value of 1.063. Analyses of 12 samples with EPM and plaque assay methods showed that there was a correlation of 99.0% with Pearson correlation value r=0.990, $R^2$ 0.9811, and difference value of 1.605. Therefore, flow cytometry and epifluorescence microscopy would be effective for enumeration of Weissella cibaria bacteriophage with plaque assay.

Development of Fast and Exact FFT Algorithm for Cross-Correlation PIV (상호상관 PIV기법을 위한 빠르고 정확한 FFT 알고리듬의 개발)

  • Yu, Kwon-Kyu;Kim, Dong-Su;Yoon, Byung-Man
    • Journal of Korea Water Resources Association
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    • v.38 no.10 s.159
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    • pp.851-859
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    • 2005
  • Normalized cross-correlation (correlation coefficient) is a useful measure for pattern matching in PIV (Particle Image Velocimetry) analysis. Because it does not have a corresponding simple expression in frequency domain, several fast but inexact measures have been used. Among them, three measures of correlation for PIV analysis and the normalized cross-correlation were evaluated with a sample calculation. The test revealed that all other proposed correlation measures sometimes show inaccurate results, except the normalized cross-correlation. However, correlation coefficient method has a weakpoint that it requires so long time for calculation. To overcome this shortcoming, a fast and exact method for calculating normalized cross-correlation is suggested. It adopts Fast Fourier Transform (FFT) for calculation of covariance and the successive-summing method for the denominator of correlation coefficient. The new algorithm showed that it is really fast and exact in calculating correlation coefficient.

Estimation of maximum measurable depth using hyperspectral image (초분광 영상을 활용한 최대추정가능수심 산정 기법 개발)

  • Seo, Youngcheol;Kim, Dongsu;You, Hojun;Kwon, Yeonghwa
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2022.05a
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    • pp.444-444
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    • 2022
  • 하천 수심 계측은 수심을 사람이 직접 계측하거나 초음파 기반 유속계 (ADCP) 등 최신 계측기기를 이용하여 간접적으로 계측을 실시하고 있다. 하지만 사람이 직접 하천에서 수심을 측정하는 것은 위험이 동반되고, 수심자료의 측정오차가 크게 발생한다. 따라서 수심측정에서 직접 측정 방식의 한계를 극복하기 위해, 초분광 영상의 반사도와 수심이 높은 상관관계를 보이는 것을 활용하여, 초분광 영상 기반 수심 산정 기법을 개발하였다. 초분광 영상 기반 수심 산정 기법은 복수의 파장이 존재하는 초분광영상으로부터 두 개의 파장대의 밴드를 추출하여 모든 경우의 수에 대해 밴드비를 산정한 후, 실측수심과 밴드비 간의 회귀분석을 실시하여 상관계수가 가장 높은 회귀식을 찾아내는 방식이 최적 밴드비 분석법에 기반한다. 최적 밴드비 분석법을 통해 획득된 높은 상관성의 밴드비-수심 관계식을 이용하여 수심을 추정할 수 있다. 이러한 방법은 직접 수심 측정 방식에 비해, 높은 해상도와 밀도, 양질의 데이터를 수집할 수 있는 장점이 있다. 과거 연구에 따르면 저수심부에서의 높은 정확도의 수심추정 결과를 보였지만, 고수심부에서는 실측수심과의 오차도 높아지는 등 정확성이 떨어지는 경향을 보인다. 따라서 본 연구에서는 보다 효율적인 수심계측을 할 수 있도록 최적 밴드비 분석법을 활용한 수심추정에서 신뢰성 있는 수심의 범위를 파악할 수 있는 방법을 제시하고자 한다. 본 연구에서는 대상지역으로 낙동강 본류와 황강 지류 합류부로 선정하였고, 초음파 기반 유속계(ADCP)와 드론을 활용하여 실측수심과 초분광 영상을 취득하였다. 민감도 분석을 위한 수심자료를 0.5m 단위로 분할하였으며, 구간별로 최적 밴드비 분석을 실시하였다. 그 결과, 구간별로 산정된 상관계수와 평균제곱근오차 (RMSE)를 통해 정확도가 높은 구간을 구별할 수 있었다. 또한 해당 구간을 초과하는 수심은 초분광 영상을 통해 추정이 어려운 것으로 판단되며, 분석한 구간까지를 최대 추정 가능 수심으로 정의하였다. 마지막으로 검증을 위해 최대추정가능수심으로 판단된 구간까지의 데이터만 활용하여 최적 밴드비 분석법을 적용하여 상관계수나 평균제곱근오차 결과의 개선여부 확인을 통해, 본 연구에서 제시한 방법이 정확한 최대추정가능수심 구간을 산정할 수 있는지 확인하였다.

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Study on the Alternative of Thiessen Coefficient by One Perceptron Neuron (단층퍼셉트론을 이용한 Thiessen 계수 대안에 관한 연구)

  • Park, Sung-Chun;Kim, Yong-Gu;Jeong, Cheon-lee;Moon, Byoung-seok
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2004.05b
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    • pp.859-862
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    • 2004
  • 유역평균강우량은 강우-유출모형을 통하여 유출량을 산정할 경우에 사용되며, 산정 방법에는 산술평균법, Thiessen 가중법, 등우선법 등이 있으나 일반적으로 Thiessen 가중법을 많이 적용하고 있다. Thiessen 가중법의 유역평균 강우량 산정방법은 각 관측소가 지배하는 면적(지배면적)을 전체면적으로 나누어 가중치(Thiessen계수)를 구한 후 여기에 각 관측소의 강우량을 곱하고 이를 합산함으로써 유역평균 강우량을 산정하는 방법이다. 본 연구에서는 면적비로 구해지는 Thiessen 계수의 대안을 찾기 위해 대상 유역으로는 영산강 1지류인 지석천 유역을 선정하였고, 단층퍼셉트론을 이용하여 동면, 청풍, 능주의 강우자료를 Input, 능주지점의 유출자료를 Output으로 상호 상관분석으로부터 한 개의 유출 사상에 대해 가장 높은 상관계수를 선택하여 Input 자료를 재구성하였다. 재구성 한 자료를 이용하여 훈련시키고 여기서 발생한 가중치를 Thiessen 계수의 대안의 값으로 추천한다.

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Cancer Classification with Gene Expression Profiles using Forward Selection Method (전진 선택법을 이용한 유전자 발현정보 기반의 암 분류)

  • Yoo, Si-Ho;Cho, Sung-Bae
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2003.05a
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    • pp.293-296
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    • 2003
  • 유전 발현 데이터는 생명체의 특정 조직에서 채취한 샘플을 microarray상에서 측정한 것으로 유전자들의 발현 정도가 수치로 나타난 데이터이다. 일반적으로 정상조직과 이상조직에서 관련 유전자들의 발현 정도는 차이를 보이기 때문에, 유전발현 데이터를 통하여 암을 분류할 수 있다. 하지만 분류에 모든 유전자가 관여하지는 않으므로 관련성 있는 유전자만을 선별해내는 작업인 특징 선택방법이 필요하다. 본 논문에서는 회귀분석의 변수선택방법중 하나인 전진 선택법(forward selection method)을 사용하여 유전자들을 선택하고 분류하는 방법을 제안한다. 실험데이터는 대장암 데이트를 사용하였고, 분류기는 KNN을 사용하였다. 이 방법과 상관계수를 이용한 특징 선택 방법인 피어슨 상관계수와 스피어맨 상관계수방법과 비교해본 결과 전진 선택법에 의한 특징 선택방법이 암의 분류에 있어서 더 효과적인 유전자 선택을 한다는 사실을 확인하였다. 실험결과 90.3%의 높은 인식률을 보였다.

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Analysis on Correlation Coefficient of Surface Image Velocimeter(SIV) for improved accutacy (정확도 향상을 위한 표면영상유속계(SIV)의 상관계수 분석)

  • Kim, Yong-Seok;Yang, Sung-Kee;Yoon, Kwon-kyu;Kim, Seo-jun
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2015.05a
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    • pp.381-381
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    • 2015
  • 표면영상유속계측법(Surface Image Velocimeter; SIV)은 영상분석기법의 일종으로 하천 표면의 유동을 영상저장장치로 기록하고 연속되는 이미지상의 입자이동을 계산하여 유속을 산정하는 방법이다. 그러나 표면영상유속계를 활용한 유속분석과정에서 현장 상황에 따라 많은 오차 요인들이 있을 수 있기 때문에 계산한 유속 산정 결과를 그대로 사용하면 정확도가 낮아질 수 있다. 특히 야간 영상과 같은 영상의 화질이 떨어지는 경우에는 유속 산정 결과를 필터링해서 사용해야 한다. 이는 순간 유속장을 분석하는 과정에서 획득된 이미지에 따라 분석된 유속벡터가 평균 유속보다 과다하게 크거나 상관계수 값이 너무 작은 경우가 포함되기 때문이다. 이 연구에서는 제주도 외도천 외도정수장에서 2013년 5월 27일 집중호우에 의한 유출 발생 주 야간 유출영상자료를 획득하여 표면영상유속계(SIV)와 ADCP를 활용하여 유량을 분석하고, 동시에 고정식 전자파 표면유속계인 Kalesto 관측 유량과 비교 분석하였다. 비교과정에서 제주도는 댐방류량과 같은 유량의 참값이 없으므로 각각 관측기기의 상대적인 비교를 하여 경향성을 분석하였다. 분석결과 주간유출영상은 상관계수가 0.6~0.7범위에 해당하는 유속이 전체 59개의 유속벡터 중 6.8%로 나타났으며, 0.7~0.8범위가 13.6%, 0.8~0.9범위가 18.6%, 0.9~1.0범위가 61.0%의 퍼센트를 나타났다. 야간유출영상을 주간유출영상과 비교해보면 0.6~0.7범위에 해당하는 상관계수가 6.8% 높게 분석되었으며, 반대로 0.9~1.0범위에 해당하는 상관계수는 17% 낮게 분석되었다. 이와 같은 결과는 야간유출영상이 주간유출영상에 비해 영상의 질이 떨어짐을 나타내며 표면영상유속계를 적용하여 유량을 산정하는 과정에서 획득되는 영상에 따라 상관계수에 대한 합리적인 필터링 과정이 필요하다.

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A Study on the Allowable Correlation Coefficient Determination for Image Matching in Digital Photogrammetry (수치사진측량을 위한 영상정합의 허용상관계수 결정에 관한 연구)

  • Lee, Jae-Kee;Cho, Jae-Ho
    • Journal of Korean Society for Geospatial Information Science
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    • v.5 no.2 s.10
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    • pp.99-110
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    • 1997
  • Image matching to determine the conjugate points in stereo photos is the one of the most important subject in digital photogrammetry and many researches In digital photogrammetric field are on going to automate the image matching process. In this study, we analyzes the effect of allowable correlation coefficient, which controls the accuracy in areal based image matching, on the accuracy of digital photogrammetry. So, some areal based matching methods such as image correlation coefficient matching, image Pyramid matching and interest point matching, are implemented, and the effect of allowable correlation coefficient on accuracy of digital photogrammetry in each method is analyzed. As a result of this study, a method to determine the optimal correlation coefficient is presented.

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Correlation analysis between climate indices and Korean precipitation and temperature using empirical mode decomposition : II. Correlation analysis (경험적 모드분해법을 이용한 기상인자와 우리나라 강수 및 기온의 상관관계 분석 : II. 상관관계 분석)

  • Ahn, Si-Kweon;Choi, Wonyoung;Shin, Hongjoon;Heo, Jun-Haeng
    • Journal of Korea Water Resources Association
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    • v.49 no.3
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    • pp.207-215
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    • 2016
  • In this study, it is analyzed how large scale climate variation has an effect on climate systems over Korea using correlation analysis between climate indices and Intrinsic Mode Functions (IMFs) of precipitation and temperature. For this purpose, the estimated IMFs of precipitation and temperature from the accompanying paper were used. Furthermore, cross correlation coefficients and lag time between climate indices and IMFs were calculated considering periodicities and tendencies. As results, more accurate correlation coefficients were obtained compared with those between climate indices and raw precipitation and temperature data. We found that the Korean climate is closely related with climate variations of $El-Ni{\tilde{n}}o$ in terms of periodicity and its tendency is followed with increasing sea surface temperature due to climate change.

Synthesis, Characterization and Correlation Analysis in Styryl 6-Methoxy-2-Naphthyl Ketones (Styryl-6-Methoxy-2-Naphthyl Ketone 유도체의 합성 및 특성 분석)

  • Thirunarayanan, G.
    • Journal of the Korean Chemical Society
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    • v.51 no.2
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    • pp.115-124
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    • 2007
  • A series of α, β-unsaturated ketones are synthesized by Crossed - Aldol condensation reaction, from ecofriendly 6-methoxy-2-naphthyl ketones and substituted benzaldehydes under solvent free conditions using silica-sulfuric acid as a catalytic reagent. The yields of ketones are more than 90% and the catalyst was reusable for further run. There is no appreciable decrease in the yield of product and the activity of catalyst. These chalcones were characterized by their physical constants and spectral data (IR, 1H-, 13C-NMR and Mass). These spectral data are subjected to correlate various Hammett substituent constants with single and multiparameter correlation equations. From the results of statistical analysis the influence of electronic effects of substituents on the spectral data of the ketones were explained.

Measurement of Shunt Amount Using Radionuclide Angiocardiography: Accuracy According to Level of Shunt and Associated Lesion (방사성 동위원소 심혈관 조영술을 이용한 단락량 측정법: 정확성에 영향을 미치는 인자)

  • Kim, Yang-Min
    • Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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    • v.40 no.4
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    • pp.200-204
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    • 2006
  • Purpose: Determination of pulmonary to systemic blood flow ratio (QP/QS) is important for the management of patients with left-to-right shunt. This study was performed to assess the agreement of Qp/Qs ratio using the radionuclide method and oxymetry, to investigate the factors influencing the agreement, and to know how interchangeable the results of each technique. Materials and Methods: We compared the Qp/Qs measured by single-pass radionuclide angiocardiography and oxymetry during catheterization in 207 patients who underwent both studies. In radionuclide method, Qp/Qs was calculated from the pulmonary time-activity curves using a gamma variate fit. The correlation and Bland-Altman analysis were performed according to the levels of shunt and associated lesions. Results: The mean Qp/Qs was $1.83{\pm}0.50$ by radionuclide, and $1.74{\pm}0.51$ by oxymetry. The overall correlation coefficient was 0.86(p<0.001), and Bland-Altman range of agreement encompassing 4SD was 1.05. For atrial septal defect, ventricular septal defect, patent ductus arteriosus, tricuspid and mitral insufficiency, the correlation coefficient was 0.78, 0.90, 0.84, 0.63 and 0.44, and Bland-Altman range was 1.51, 0.74, 0.96, 1.57, and 1.50, respectively. Conclusion: There is good agreement but wide variance between the Qp/Qs ratios by radionuclide method and oxymetry. Associated atrioventricular valvar insufficiency decreases the correlation coefficient and widens the variance. Wide overall variance suggests that Qp/Qs measurements by two techniques should not be used interchangeably.