• Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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• 2004.04a
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• pp.93-96
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• 2004

생태학, 환경공학, 임상진단 둥 여러 생물학 분야에서 미생물의 다양성 연구의 중요성이 대두되고 그 연구가 점증하고 있다. 특히 16S rRNA를 분자지표로한 DNA 염기서열 분석방법이 널리 사용되고 있다. 본 논문에서는 16S rRNA의 염기서열 분석과정을 각 단계별로 자동화하고, 생물학자들의 결과 판단이나 사용상의 편의를 도모하기 위하여 웹기반의 미생물 다양성 분석 어플리케이션을 개발하였다. 개발을 위하여 단계별 자동화 및 인터페이스 개발에 적합한 폴더 프로세스-필터 모델을 고안하고 적용하였다. 제공되는 생물정보분석도구는 서열입력, 서열방향교정, 다중서열정렬 및 가시화, 서열동정 등의 분석등이 있으며, 각 결과는 계통분류도구와 호환가능하도록 하였다. 또한 신생아의 장내 세균총에 대한 분석을 수행하여 개발된 도구의 유용성을 확인하였다. 개발된 웹 에플리케이션은 리눅스 시스템 상에서 Perl 과 CGI를 이용하였으며, http: //home.pusan.ac.kr/~genome/tools/rat.htm으로 접속하여 사용할 수 있다.

• Proceedings of the KSMRM Conference
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• 1999.04a
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• pp.1-9
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• 1999

핵자기 공명(NMR:nuclear magnetic resonance)은 19451건 Bloch, Procell등에 의해 처음으로 실험적으로 입증된 후에 생화학 및 약학 분야에서 분자단위의 물질의 성분, 구조, 대사물질의 역학적 운동 및 상태에 관한 정보를 아는데 유용한 기법으로 사용 되어 왔다. 의학분야에서는 Lauterber등에 의해 자기공명영상볍(Magnetic Resonance Imaging:MRI)으로 개발되어 질병의 진단 및 치료에 많은 공헌을 하게되었다. 해부학적영상 뿐 아니라 분석방법으로 병변 부위 및 인체 기관에서의 각종 대사물질의 정량적인 양과 변화를 알 수 있는 자기공명분광기법(magnetic resonance spectroscopy:MRS)도 활발한 임상적용이 이루어지고 있다. 자기공명영상법의 활발한 임상적 응용 및 새로운 technique이해를 위해서는 물리학적 개념(MR Physics)을 이해하는 것이 매우 중요하다.

• Korean journal of applied entomology
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• v.55 no.1
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• pp.77-77
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• 2016

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1994.11a
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• pp.81-90
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• 1994

리포좀은 1960년대 초 Bangham등에 의해 혈액응고시 인지질의 영향에 관한 연구 중 우연히 발견하게 되었다. 즉 인지질이 물에 분산되어 2 분자막 (Bilayer)을 형성함을 알았고, 이때 생긴 폐쇄소포체를 리포좀이라 하였다. 이러한 리포좀은 원형질 막이나 세포내의 소기관의 막과 유사한 구조를 갖고 있기 때문에 이것을 이용하여 생화학자나 생물리학자들은 생체막의 모델시스템으로 이용하여 생체막의 기능 연구에 널리 이용하여 왔다. 1970년 초반부터 리포좀을 이용한 약물의 생체내 공급(Drug Delivery System, DDS)에 대하여 많은 연구가 이루어져 왔고, 지금까지도 의약품외 전달매체로 이용할려고 많은 시도를 하고 있는 실정이다. 최근에는 리포좀을 이용하여 항원을 전달하는 면역보조제(Adjuvant System)로 이용하려는 시도를 하고 있다. 현재까지 리포좀을 이용한 상품들은 화장품과 임상용 진단시 약, DNA transfection system (Lipopectin)으로 활용되고 있다.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• v.24 no.2
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• pp.322-328
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• 2007

Ornithine transcarbamylase (OTC) deficiency is the most common inborn error of urea cycle metabolism; it is inherited in an X-linked manner. The OTC catalyzes the third step of the urea cycle, the conversion of ornithine and carbamyl phosphate to citrulline. Deficiency of OTC leads to the accumulation of ammonia, causing neurological deficits. In most affected hemizygote males, OTC deficiency manifests as hyperammonemic coma that often leads to death in the newborn period, and those who recover from the coma may be neurologically impaired due to the sequelae of the hyperammonemic encephalopathy. In some, late-onset manifestations develop. We report a male neonate with early onset OT deficiency that had apnea and was comatous. On mutation analysis using DNA sequencing after polymerase chain reaction (PCR) amplification of the 10 exons, deletions of 10 bases in codon 285, causing a frame shift was detected in exon 8. The mother and a sister were diagnosed as female carriers. Therefore, genetic counseling and the risk assessment could be provided to the family.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.37 no.1
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• pp.56-60
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• 2001

Molecular typing of Bacillus anthracis has been extremely difficult due to the lack of polymorphic DNA markers. Aiming to develop a DNA marker specific for Bacillus anthracis and to be able to discriminate this species from Bacillus genus, we applied the random amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR. We have identified B. anthracis from various Bacillus species. The analysis performed by RAPD clearly demonstrated substantial genetic variations among Bacillus species. This type of analysis is an easy, quick and highly discriminatory technique that may help in diagnosis of anthrax.

• Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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• v.5 no.1
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• pp.108-115
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• 2005

Inherited metabolic diseases (IMD) comprise a large class of genetic diseases involving disorders of metabolism. The majorities are due to defects of single genes that code for enzymes that facilitate conversion of various substances into others. Because of the multiplicity of conditions, many different diagnostic tests are used for screening of IMD. Molecular genetic diagnosis is the detection of pathogenic mutations in DNA and/or RNA samples and is becoming a much more common practice in medicine today. The purpose of molecular genetic testing in IMD includes diagnostic testing, pre-symptomatic testing, carrier screening, prenatal diagnosis, preimplantation testing, and population screening. However, because of the complexity, difficulty in interpreting the result, and the ethical considerations, an understanding of technical, conceptual, and practical aspects of molecular genetic diagnosis is mandatory.

• Proceedings of the Optical Society of Korea Conference
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• 1995.06a
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• pp.30-34
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• 1995

13C2H2분자의 1.54949$\mu$m 회전-진동 전이 흡스선을 이용하여 DFB LD의 발전주파수를 안정화 시킴으로써 이를 주파수대욕 광 다중통신(OFDM)의 표준주파수를 광동기 신호로 활용하는 방안에 대하여 연구하였다. 본 연구에서는 DFB LD의 발진주파수의 변화에 따른 기체 Cell의 투과한 빛의 세기의 변화를 연산 처리하여 이를 안정화 Loop에 대한 error 신호로 사용하여 줌으로써 MHz 이내에 주파수 안정도를 갖는 광 동기신호를 구성하였다. 이러한 안정화 방법을 이용하여 이제까지 제안된 다른 방법에 비하여 광학계통과 광신호처리 과정을 크게 단순화 된, 또한 동작중 자체 진단 및 자동복구 기능을 갖춘 이상적인 신호를 구성하였다.

• The Academic Congress of Korean Shoulder and Elbow Society
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• 2006.11a
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• pp.59-68
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• 2006

회전근 개 질환의 병리기전의 연구과정은 과거에 형태학, 거시적 해부학 또는 방사선학적 연구를 통해 충돌 증후군에 대한 연구에 집중되었으나 그간의 병리조직학 및 생역학의 발전에 힘입어 좀 더 근본적인 원인에 대한 접근이 가능하게 되어 다양한 요인에 의해 복합적인 기전을 통해 발생함이 밝혀지고 있다. 그러나 아직 이와 같은 성과를 바탕으로 임상적으로 적절한 진단, 치료, 재활 및 예방에 대한 명확한 해답을 제시하기에는 부족함이 있으며 향후 건 내의 퇴행성 변화에 대한 분자 생물학적인 접근과 생체 내와 같은 조건에서의 역동성을 재현할 수 있는 견관절 모델의 개발을 통한 더욱 향상된 생역학적 연구가 필요할 것으로 생각된다.

• Korean Journal of Clinical Laboratory Science
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• v.52 no.4
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• pp.381-388
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• 2020

The quality control of pathological specimens is important for accurate molecular pathology testing. This study evaluated that specimen factors affecting the DNA quality during tissue processing and sample types for BRAF, EGFR, and KRAS mutations tests. One thousand seven hundred and seventy-two molecular pathology tests were investigated for the factors influencing the DNA quality, such as sample type, formalin fixation time, and reexamination status. Cytology samples stored in a saline solution had better DNA quality than commercial cytology preservation. Tissue samples fixed in formalin within 24 hours had better DNA quality than the samples fixed over 24 hours. Between the types of samples, fresh tissue samples and tissue samples with a high tumor cell density had relatively better DNA quality than the formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues and cytology specimens. Of real-time PCR, the non-PNA Ct value increased proportionally with samples held for longer than 24 hours in formalin, and that the formalin-fixed time affects the sample DNA quality. In conclusion, the appropriate tumor cellularity and 10% neutral formalin fixation time are the most important factors for maintaining the DNA quality. These factors should be managed properly for an accurate pathological molecular test to ensure optimal DNA quality.