• Title/Summary/Keyword: 분산 병렬 알고리즘

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Compression-Based Volume Rendering on Distributed Memory Parallel Computers (분산 메모리 구조를 갖는 병렬 컴퓨터 상에서의 압축 기반 볼륨 렌더링)

  • Koo, Gee-Bum;Park, Sang-Hun;Song, Dong-Sub;Ihm, In-Sung
    • Journal of KIISE:Computing Practices and Letters
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    • v.6 no.5
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    • pp.457-467
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    • 2000
  • 본 논문에서는 분산 메모리 구조를 갖는 병렬 컴퓨터 상에서 방대한 크기를 갖는 볼륨 데이터의 효과적인 가시화를 위한 병렬 광선 투사법을 제안한다. 데이터의 압축을 기반으로 하는 본 기법은 다른 프로세서의 메모리로부터 데이터를 읽기보다는 자신의 지역 메모리에 존재하는 압축된 데이터를 빠르게 복원함으로써 병렬 렌더링 성능을 향상시키는 것을 목표로 한다. 본 기법은 객체-순서와 영상-순서 탐색 알고리즘 모두의 정점을 이용하여 성능을 향상시켰다. 즉, 블록 단위의 최대-최소 팔진트리의 탐색과 각 픽셀의 불투명도 값을 동적으로 유지하는 실시간 사진트리를 응용함으로써 객체-공간과 영상-공간 각각의 응집성을 이용하였다. 본 논문에서 제안하는 압축 기반 병렬 볼륨 렌더링 방법은 렌더링 수행 중 발생하는 프로세서간의 통신을 최소화하도록 구현되었는데, 이러한 특징은 프로세서 사이의 상당히 높은 데이터 통신 비용을 감수하여야 하는 PC 및 워크스테이션의 클러스터와 같은 더욱 실용적인 분산 환경에서 매우 유용하다. 본 논문에서는 Cray T3E 병렬 컴퓨터 상에서 Visible Man 데이터를 이용하여 실험을 수행하였다.

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A synchronous/asynchronous hybrid parallel method for some eigenvalue problems on distributed systems

  • 박필성
    • Proceedings of the Korean Society of Computational and Applied Mathematics Conference
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    • 2003.09a
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    • pp.11-11
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    • 2003
  • 오늘날 단일 슈퍼컴퓨터로는 처리가 불가능한 거대한 문제들의 해법이 시도되고 있는데, 이들은 지리적으로 분산된 슈퍼컴퓨터, 데이터베이스, 과학장비 및 디스플레이 장치 등을 초고속 통신망으로 연결한 GRID 환경에서 효과적으로 실행시킬 수 있다. GRID는 1990년대 중반 과학 및 공학용 분산 컴퓨팅의 연구 과정에서 등장한 것으로, 점차 응용분야가 넓어지고 있다. 그러나 GRID 같은 분산 환경은 기존의 단일 병렬 시스템과는 많은 점에서 다르며 이전의 기술들을 그대로 적용하기에는 무리가 있다. 기존 병렬 시스템에서는 주로 동기 알고리즘(synchronous algorithm)이 사용되는데, 직렬 연산과 같은 결과를 얻기 위해 동기화(synchronization)가 필요하며, 부하 균형이 필수적이다. 그러나 부하 균형은 이질 클러스터(heterogeneous cluster)처럼 프로세서들의 성능이 서로 다르거나, 지리적으로 분산된 계산자원을 사용하는 GRID 환경에서는 이기종의 문제뿐 아니라 네트워크를 통한 메시지의 전송 지연 등으로 유휴시간이 길어질 수밖에 없다. 이처럼 동기화의 필요성에 의한 연산의 지연을 해결하는 하나의 방안으로 비동기 반복법(asynchronous iteration)이 나왔으며, 지금도 활발히 연구되고 있다. 이는 알고리즘의 동기점을 가능한 한 제거함으로써 빠른 프로세서의 유휴 시간을 줄이는 것이 목적이다. 즉 비동기 알고리즘에서는, 각 프로세서는 다른 프로세서로부터 갱신된 데이터가 올 때까지 기다리지 않고 계속 다음 작업을 수행해 나간다. 따라서 동시에 갱신된 데이터를 교환한 후 다음 단계로 진행하는 동기 알고리즘에 비해, 미처 갱신되지 않은 데이터를 사용하는 경우가 많으므로 전체적으로는 연산량 대비의 수렴 속도는 느릴 수 있다 그러나 각 프로세서는 거의 유휴 시간이 없이 연산을 수행하므로 wall clock time은 동기 알고리즘보다 적게 걸리며, 때로는 50%까지 빠른 결과도 보고되고 있다 그러나 현재까지의 연구는 모두 어떤 수렴조건을 만족하는 선형 시스템의 해법에 국한되어 있으며 비교적 구현하기 쉬운 공유 메모리 시스템에서의 연구만 보고되어 있다. 본 연구에서는 행렬의 주요 고유쌍을 구하는 데 있어 비동기 반복법의 적용 가능성을 타진하기 위해 우선 이론적으로 단순한 멱승법을 사용하여 실험하였고 그 결과 순수한 비동기 반복법은 수렴하기 어렵다는 결론을 얻었다 그리하여 동기 알고리즘에 비동기적 요소를 추가한 혼합 병렬 알고리즘을 제안하고, MPI(Message Passing Interface)를 사용하여 수원대학교의 Hydra cluster에서 구현하였다. 그 결과 특정 노드의 성능이 다른 것에 비해 현저하게 떨어질 때 전체적인 알고리즘의 수렴 속도가 떨어지는 것을 상당히 완화할 수 있음이 밝혀졌다.

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Iceberg Cube Parallel Computation using MapReduce (맵리듀스를 이용한 빙산 큐브 병렬 계산)

  • Lee, Su-An;Kim, Jin-Ho;Moon, Yang-Sae;Loh, Woong-Kee
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2010.06a
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    • pp.25-26
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    • 2010
  • 대용량 데이터의 효율적 분석을 위해 데이터 뷰브가 연구되었으며, 데이터 큐브 계산의 고비용 문제점을 해결하기 위하여 큐브의 일부 영역만을 계산하는 빙산 큐브가 등장하였다. 빙산 큐브는 저장 공간의 감소, 집중적인 분석 등의 장점이 있으나, 여전히 많은 계산과 저장 공간을 필요로 하는 단점이 있다. 본 논문에서는 이러한 문제점을 해결하는 실용적인 방법으로 대용량 문제를 분산하여 처리하는 분산 병렬 컴퓨팅 기술인 맵리듀스(MapReduce) 프레임워크를 사용하여 분산 병렬 빙산 큐브인 MR-Naive와 MR-BUC 알고리즘을 제안한다. 실험을 통해 맵리듀스 프레임워크를 통한 빙사 큐브 계산이 효율적으로 분산 병렬 처리 됨을 확인하였다.

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Implementation of Parallel Local Alignment Method for DNA Sequence using Apache Spark (Apache Spark을 이용한 병렬 DNA 시퀀스 지역 정렬 기법 구현)

  • Kim, Bosung;Kim, Jinsu;Choi, Dojin;Kim, Sangsoo;Song, Seokil
    • The Journal of the Korea Contents Association
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    • v.16 no.10
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    • pp.608-616
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    • 2016
  • The Smith-Watrman (SW) algorithm is a local alignment algorithm which is one of important operations in DNA sequence analysis. The SW algorithm finds the optimal local alignment with respect to the scoring system being used, but it has a problem to demand long execution time. To solve the problem of SW, some methods to perform SW in distributed and parallel manner have been proposed. The ADAM which is a distributed and parallel processing framework for DNA sequence has parallel SW. However, the parallel SW of the ADAM does not consider that the SW is a dynamic programming method, so the parallel SW of the ADAM has the limit of its performance. In this paper, we propose a method to enhance the parallel SW of ADAM. The proposed parallel SW (PSW) is performed in two phases. In the first phase, the PSW splits a DNA sequence into the number of partitions and assigns them to multiple nodes. Then, the original Smith-Waterman algorithm is performed in parallel at each node. In the second phase, the PSW estimates the portion of data sequence that should be recalculated, and the recalculation is performed on the portions in parallel at each node. In the experiment, we compare the proposed PSW to the parallel SW of the ADAM to show the superiority of the PSW.

A Distributed Electrical Impedance Tomography Algorithm for Real-Time Image Reconstruction (실시간 영상 복원을 위한 분산 전기단층촬영 알고리즘)

  • Junghoon Lee;Gyunglin Park
    • Journal of KIISE:Computing Practices and Letters
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    • v.10 no.1
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    • pp.25-36
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    • 2004
  • This paper proposes and measures the performance of a distributed EIT (Electrical Impedance Tomography) image reconstruction algorithm which has a master-slave structure. The image construction is a computation based application of which the execute time is proportional to the cube of the unknowns. After receiving a specific frame from the master, each computing node extracts the basic elements by executing the first iteration of Kalman Filter in parallel. Then the master merges the basic element lists into one group and then performs the sequential iterations with the reduced number of unknowns. Every computing node has MATLAB functions as well as extended library implemented for the exchange of MATLAB data structure. The master implements another libraries such as threaded multiplication, partitioned inverse, and fast Jacobian to improve the speed of the serial execution part. The parallel library reduces the reconstruction time of image visualization about by half, while the distributed grouping scheme further reduces by about 12 times for the given target object when there are 4 computing nodes.

Task Allocation strategy for Distributed/Parallel Computing based on Realtime Network Monitoring (실시간 네트워크 모니터링 기반 분산/병렬 컴퓨팅의 작업 할당 전략)

  • 정재홍;김수자;박복자;송은하;정영식
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2003.10c
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    • pp.631-633
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    • 2003
  • 인터넷 가반 분산/병렬 처리 프레임 워크 PDP(Parallel/Distributed Processing Scheme on Web)는 네트워크 내 유휴 상태 호스트들을 활용하여 대용량 작업을 병렬로 처리한다. 본 논문에서는 이러한 서브 작업을 할당받는 자원이 동작하는 네트워크 환경을 모니터링 함으로써 수시로 변화하는 네트워크 환경에 대처하는 방안을 제시한다. 특히 네트워크 환경 모니터링 예측 결과를 PDP의 작업 할당 알고리즘에 적용하여 네트워크 과부하 및 결함 등으로 인해 발생되는 작업 지연 요소에 적응적 대처함으로써 전체 작업 수행 처리율 향상을 도모하는 방법을 제안한다.

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An Efficient Dynamic Load balancing Strategy for Tree-structured Computations (트리구조의 계산을 위한 효율적인 동적 부하분산 전략)

  • Hwang, In-Jae;Hong, Dong-Kweon
    • The KIPS Transactions:PartA
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    • v.8A no.4
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    • pp.455-460
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    • 2001
  • For some applications, the computational structure changes dynamically during the program execution. When this happens, static partitioning and allocation of tasks are not enough to achieve high performance in parallel computers. In this paper, we propose a dynamic load balancing algorithm efficiently distributes the computation with dynamically growing tree structure to processors. We present an implementation technique for the algorithm on mesh architectures, and analyze its complexity. We also demonstrate through experiments how our algorithm provides good quality solutions.

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A Parallel Distributed Algorithm of the Independent Set Problem using Pregel (Pregel을 이용한 독립집합 문제의 병렬 분산 알고리즘)

  • Shin, Eun-Ok;Yi, Sung-Min;Chung, Yon-Dohn
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2012.06c
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    • pp.104-106
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    • 2012
  • 다양한 그래프 문제들은 대부분 NP-완전 문제로, 그 중 하나인 독립집합을 구하는 문제 또한 최적의 알고리즘이 존재하지 않는다. 따라서 규모가 큰 대용량 그래프 데이터로 독립집합 문제를 처리하기 위해서는 많은 시간과 비용이 소요된다. 이를 효율적으로 해결하기 위해 분산 환경에서 그래프 처리에 적합한 모델인 Pregel을 이용하여 독립집합 문제를 푼다. 이를 위해 정점 사이의 메시지 전달에 따른 정점 상태 변환 방법을 이용하여 분산 병렬 환경에 알맞은 알고리즘을 제안한다.

Matrix-based Filtering and Load-balancing Algorithm for Efficient Similarity Join Query Processing in Distributed Computing Environment (분산 컴퓨팅 환경에서 효율적인 유사 조인 질의 처리를 위한 행렬 기반 필터링 및 부하 분산 알고리즘)

  • Yang, Hyeon-Sik;Jang, Miyoung;Chang, Jae-Woo
    • The Journal of the Korea Contents Association
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    • v.16 no.7
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    • pp.667-680
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    • 2016
  • As distributed computing platforms like Hadoop MapReduce have been developed, it is necessary to perform the conventional query processing techniques, which have been executed in a single computing machine, in distributed computing environments efficiently. Especially, studies on similarity join query processing in distributed computing environments have been done where similarity join means retrieving all data pairs with high similarity between given two data sets. But the existing similarity join query processing schemes for distributed computing environments have a problem of skewed computing load balance between clusters because they consider only the data transmission cost. In this paper, we propose Matrix-based Load-balancing Algorithm for efficient similarity join query processing in distributed computing environment. In order to uniform load balancing of clusters, the proposed algorithm estimates expected computing cost by using matrix and generates partitions based on the estimated cost. In addition, it can reduce computing loads by filtering out data which are not used in query processing in clusters. Finally, it is shown from our performance evaluation that the proposed algorithm is better on query processing performance than the existing one.

An Analysis of Existing Studies on Parallel and Distributed Processing of the Rete Algorithm (Rete 알고리즘의 병렬 및 분산 처리에 관한 기존 연구 분석)

  • Kim, Jaehoon
    • The Journal of Korean Institute of Information Technology
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    • v.17 no.7
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    • pp.31-45
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    • 2019
  • The core technologies for intelligent services today are deep learning, that is neural networks, and parallel and distributed processing technologies such as GPU parallel computing and big data. However, for intelligent services and knowledge sharing services through globally shared ontologies in the future, there is a technology that is better than the neural networks for representing and reasoning knowledge. It is a knowledge representation of IF-THEN in RIF or SWRL, which is the standard rule language of the Semantic Web, and can be inferred efficiently using the rete algorithm. However, when the number of rules processed by the rete algorithm running on a single computer is 100,000, its performance becomes very poor with several tens of minutes, and there is an obvious limitation. Therefore, in this paper, we analyze the past and current studies on parallel and distributed processing of rete algorithm, and examine what aspects should be considered to implement an efficient rete algorithm.