• Journal of Mushroom
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• v.5 no.1
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• pp.34-38
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• 2007

The white-colored and the dark gray-colored mutants were frequently happened in cultivated areas of Pleurotus ostreatus (Wonhyeong-neutari). These caused conflicts between farmers and spawn companies. Our studies were conducted to elucidate the mechanism of mutagenesis. The results from the studies would provide valuable informations that could be used to prevent the color-related mutation, and also will be applied in breeding programs of P. ostreatus. Oyster mushroom variety, Wonhyeong-neutari, is somatic hybrid of Pleurotus and has genetic makers for arginine, ornithine, proline, riboflavine. Genetic markers analysis of monospore isolates derived from color mutants show identical tendency with that of Wonhyeong-neutari, these results indicate that color mutants were derived from Wonhyeongneutari. Twenty-one and four homokaryons were selected from the white-colored mutant MGL 2205 and gray-colored ASI 2029. All 34 F1 hybrids derived from the white-colored mutant MGL 2205 produce white-color fruiting bodies, indicating that the white color trait is heritable. In the first generation hybrids between the white-colored MGL 2205 and the gray-colored ASI 2029, all 16 hybrids produced pigmented fruiting bodies. Homokaryons isolated from the hybrid MGL 2205 X ASI 2029 were mated with homokaryon tester strains derived from MGL 2205. By these result, we could assumed that white color trait is a heritable character which is controlled by more than one recessive gene.

• Journal of Embryo Transfer
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• v.31 no.3
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• pp.227-233
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• 2016

This study was conducted to analyze the effect of single nucleotide polymorphisms (SNPs) on the equine chromosomes (ECA) 3 for the body conformations of 12 month of age in Jeju crossbred (Jeju horses ${\times}$ Thoroughbred). A total of 199 Jeju crossbred horse samples were obtained from the National Institute of Subtropical Livestock Research Institute for this study. To correctly estimate the body conformations, we measured thirteen elements relevant to the body conformation such as body weight, wither height, body length for all the 199 horses at 12 month of age. Furthermore, all the horses were genotyped using four SNPs including the BIEC2-808466, BIEC2-808543, BIEC2-808967, BIEC2-809370, of which genomic coordinates range approximately from 105.1Mbp to 110 Mbp in the ECA3. For the phenotypic data sets, the average body weight was $193.7{\pm}24.5kg$ and the height was $124.5{\pm}4.0cm$. As for the genotypic data, the miner allele frequencies of the SNPs were shown to be varied from 0.01 to 0.291. Using the phenotypic and genotypic data sets, analysis of covariance was performed to find any association between those SNP genotypes and body conformations, using year of birth, month of birth, sex, and parity as the covariance components. The result showed that alternative genotypes in the BIEC2-808967 and BIEC2-809370 SNPs were significantly associated with the body length (P<0.05) and the wither height (P<0.05) respectively in the Jeju crossbred horses. Therefore, it is estimated that there are significant associations in the body conformation of 12 month of age of Jeju crossbred for those two SNPs used in this study.

• The Korean Journal of Zoology
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• v.34 no.1
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• pp.110-122
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• 1991

기름종개과의 N. toni, L. costota, N. multifasciata 3종에 대한 형태분석, 핵형분석 및 전기영동법에 의한 유전자 분석을 실시 각 종의 지리적 변이 및 계통적 유연관계를 조사하였다. 형태 측정치에 대한 discriminant 분석결과 연 yoni 월악산집단, 1. costoto 거제도집단 그리고 환multifasc지물 산철집단이 같은 종내 타 집단들과 형태상 완전히 분리 되어졌다. 핵형분석에서 N. muftifosciota와 1. costoto는 2n: 50으로 염색체수는 조사된 전 집단이 변리없이 동일하였다. N to티 삼척과 진부집단은 2n: 50으로 동일하였으나 고성집단은 2n=50, In : 48인 염색체상이 한개체에서 동시에 발견되었고, 인형성부위의 위치 및 형태가 타 집단과 차이가 있었다. 전기영동을 실시하여 총 28개의 유전자를 검출, 분석하였다. 3종중 N. multifosciata 청도집단의 유전적 변이 (HDi 123, HG : .160)가 가장 높았고, N. toni 고성집단이 가장 적었다. ( HD= .017, HG= .015). N. yoni 고성집단과 강릉집단은 각 집단의 고유한 genetic marker를 다수 갖고 있으며 타집단들과 유전적 근연관계도 매우 먼 것으로 나타나 각기 독립된 별종으로 추정된다.

• Laboratory Medicine Online
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• v.7 no.1
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• pp.13-19
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• 2017

Background: We evaluated a sensitive and quantitative method utilizing fragment analysis of the fms-like tyrosine kinase 3-internal tandem duplication (FLT3-ITD), simultaneously measuring mutant allele burden and length, and verified the analytical performance. Methods: The number and allelic burden of FLT3-ITD mutations was determined by fragment analysis. Serial mixtures of mutant and wild-type plasmid DNA were used to calculate the limit of detection of fragment analysis, conventional PCR, and Sanger sequencing. Specificity was evaluated using DNA samples derived from 50 normal donors. Results of fragment analysis were compared to those of conventional PCR, using 481 AML specimens. Results: Defined mixtures were consistently and accurately identified by fragment analysis at a 5% relative concentration of mutant to wild-type, and at 10% and 20% ratios by conventional PCR and direct sequencing, respectively. No false positivity was identified. Among 481 AML specimens, 40.1% (193/481) had FLT3-ITD mutations. The mutant allele burden (1.7-94.1%; median, 28.2%) and repeated length of the mutation (14-153 bp; median, 49 bp) were variable. The concordance rate between fragment analysis and conventional PCR was 97.7% (470/481). Fragment analysis was more sensitive than conventional PCR and detected 11 additional cases: seven had mutations below 10%, three cases represented conventional PCR failure, and one case showed false negativity because of short ITD length (14 bp). Conclusions: The new fragment analysis method proved to be sensitive and reliable for the detection and monitoring of FLT3-ITD in patients with AML. This could be used to simultaneously assess ITD mutant allele burden and length.

• Proceedings of the Korean Society of Broadcast Engineers Conference
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• 2009.11a
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• pp.269-272
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• 2009

본 논문에서는 변이지도의 정확도 향상을 위하여, 비용 함수를 이용한 교차 일치성 검사 기법을 제안하고, 다양한 조건의 실험을 통하여 제안한 알고리듬이 효율적임을 보였다. 좌우 변이정보를 이용하는 교차 일치성 검사로 오정합을 검출하는 방법을 시도해왔다. 하지만 이러한 방법은 물체의 경계에서 발생하는 오정합을 찾기가 어렵다. 본 논문에서는 최종 변이의 신뢰도 향상을 위해 교차 일치성 검사의 정확도를 높이는 방법을 제안하였다. 일반적으로 영역 기반 스테레오정합 방법은 물체의 경계에서 정확도 높지 못하다. 이러한 문제점을 해결하기 위해 정합창의 크기를 늘리거나 특징 점을 이용한 적응적 가변 정합창을 적용하는 방법을 시도하였다. 하지만, 여전히 기존 교차 일치성 검사를 통한 오정합 검출은 부정확하다. 이러한 영역의 비용 함수 값들을 비교한 결과 첫 번째와 두 번째 값의 차이가 적거나 크게 나타난다. 제안한 방법은 기존 방법에 비해 오정합 검출 능력을 향상 시킨다. 제안한 방법의 결과를 확인하기 위해 스테레오 비전에서 많이 사용되는 영상을 적용하고 분석하였다. 또한, 기존 교차 일치성 검사 방법과 제안한 방법의 객관적으로 비교하기 위해 전체 영역에 대한 오차율 (error ratio)과 교차 일치성 검사로 유효하다고 판단된 변이 값 중 실제 변이 값과 일치하지 않은 변이값의 오차율을 비교하였다. 실험 결과 기존 방법에 비해 제안한 방법이 1~5%정도 낮은 오차율을 보였다

• Proceeding of EDISON Challenge
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• 2015.03a
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• pp.99-104
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• 2015

DNA 복제는 굉장한 정확도를 가지고 이루어진다. 하지만 내, 외부적인 여러 요인으로 돌연변이가 일어나기도 한다. 그 중 토토머화에 의해 치환 돌연변이가 일어난다는 가설은 오래전부터 그 가능성이 논의되어 왔고, 직접적인 증거를 찾으려는 노력도 있어 왔다. 토토머화에 의하여 DNA염기가 다른 형으로 변하면 왓슨-크릭 염기쌍 (아데닌-타이민, 시토신-구아닌이 수소결합한 염기쌍)이 아닌 다른 염기쌍이 생성될 수 있다. 이 염기쌍이 기준이 되어 DNA가 복제되기 때문에 결과적으로 전이 돌연변이(transition), 혹은 전환 돌연변이(transversion)된 염기쌍이 생성될 수 있다. 우리는 이런 사례 중에 염기쌍의 전이 돌연변이를 중심으로 연구하고자 한다. A-T염기쌍중 하나가 지배적인 아민형(amine form)이 아니라 이민형(imine form)으로 존재할 때 아민형과는 다른 수소결합이 가능해지며 보통 잘 생성되지 않는 A-C, G-T결합이 생성될 수 있다. 이후 그 염기쌍이 기준이 되어 DNA가 복제될 때에는 왓슨-크릭 염기쌍이 주로 생성되어 A-T염기쌍이 G-C 염기쌍으로 치환되는 DNA가닥이 생기게 된다. 우리는 이러한 과정을 에너지와 반응속도 측면에 집중하여 분석해보았다. 계산 결과, $A-C^*$, $A^*-C$, $G-C^*$, $G^*-C$의 염기쌍 생성이 왓슨-크릭 염기쌍과 비슷하거나 더 큰 정도로 에너지 면에서 유리하였으며 대부분의 돌연변이가 에너지 측면에서 보았을 때 $A-C^*$ 염기쌍을 통하여 생김을 알 수 있었다. 계산된 값은 약 $10^{-6}$ 정도의 빈도를 보였다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2003.04a
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• pp.127-127
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• 2003

벼 도열병 저항성 조절과정을 연구하는 효율적인 방법은 돌연변이를 분리하여 해당유전자를 분석하는 것이다. 이를 위하여 벼에서 제조된 4가지 돌연변이 집단을 이용하여 도열병 저항성 돌연변이를 분리하였다. 실험재료로는 1) fast neturon을 처리하여 제조된 Moroberekan 2,000 라인, 2)T-DNA의 형질전환에 의해서 제조된 화영 1,000 라인, 3)DEB처리에 의해서 제조된 RIL260 3,000라인, 4) gamma ray 처리에 의해서 제조된 상해향혈나 10,000 라인 등이 사용되었다. 병 저항성이 감소된 돌연변이의 분리를 위하여 재료로 사용된 벼 품종과 비친화적 상호작용을 보이는 균주의 포자를 2-3주된 벼 잎에 직접 살포하는 방법을 이용하였다. 균주 접종 7 일 후에 blast lesion을 형성하거나 lesion mimic 표현형을 보이는 돌연변이 등 병저항성이 감소된 라인을 선별하였다. 현재까지 1) Moroberakan 5 라인, 2) 화영 4 라인, 3) RIL260 1 라인 등이 선별되었다. 이와 함께 병저항성이 현저히 증가된 돌연 변이를 선별하기 위하여 친화적인 균주를 사용한 실험에서는 상해향렬나 2 라인이 선별되었다. 선별된 돌연변이는 벼 도열병 저항성 유전자의 분리 및 저항성 조절기작을 연구하는데 효과적으로 사용될 것이다.

• Journal of Naturopathy
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• v.7 no.1
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• pp.20-25
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• 2018

The purpose of this study was investigated to observe the relatively low amino acid mutations in six different strains of ATCC or KCTC Salmonella strains (four species and two isolates). The mutations in the strains were to be detected and compared with the genes csgA and csgB corresponding to the Thin aggregative fimbriae. Amino acid mutations in the strains were observed from Ser20→ Gly(AGT→GGT) in the csgA gene, Asp25→Ala(GAT→GCT) and Lys66→Thr(AAA→ACA) in the csgB gene. Among the six strains, the two most common amino acid variations were observed in S. typhimurium - TH strains. On the other hand, no mutation of nucleotide sequence was observed in the strains of S. typhimurium ATCC 13311 and S. typhimurium KCTC 1925. In conclusion the genes csgA and csgB in the strains may be useful for the evaluation and detection of amino acid mutation.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.38 no.2
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• pp.93-109
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• 2008

The morphological variation was analysed to examine previous hypotheses on the taxonomy of B. amurensis complex which includes B. amurensis Rupr. var. amurensis, B. amurensis var. quelpaertensis (Nakai) Nakai and B. amurensis var. latifolia Nakai. The results from the univariational and principal components analyses employing 22 putatively diagnostic characters indicate that B. amurensis var. quelpaertensis is distinct from var. amurensis in the length and width of leaves, angle of leaf apex, distance between spinose teeth, length of internode, number of flowers per inflorescence, whereas B. amurensis var. latifolia is different from other varieties in the angle of leaf apex and leaf length/width ratio. In principal component analysis, the characters of the leaf including leaf width and length were the main characteristics to distinguish those three taxa. The evidence both from the principal components analyses and current geographical distribution pattern suggest that retaining the varietal status for the two taxa, B. amurensis var. latifolia and B. amurensis var. quelpaertensis is reasonable.

• Journal of Digital Convergence
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• v.20 no.2
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• pp.317-323
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• 2022

This study aimed to qualitative analyze the cusp variation pattern of the mandibular second premolars using a three-dimensional virtual models, and to analyze the left-right bilateral symmetry with a quantitative analysis of the tooth surface area according to the cusp variation. 127 virtual mandibular second premolars were prepared and individual absolute/relative cusp area, total crown area and groove form were analyzed using RapidForm2004(INUS technology INC, Seoul, Korea). Independent t-test, Kruskal-Wallis test and chi-square were performed. As a result, the groove form showed high bilateral symmetry between the left and right sides. Based on the left side of groove form, the bilateral symmetry was 100.0% for the U pattern, and 73.7% for the H patterned, and 78.9% for the Y pattern(p<.001). The finding could be as a meaningful reference for manufacturing CAD/CAM dental prostheses, and it is expected that further studies will be conducted on more samples including the mandibular second premolar immediately after eruption.