• Title/Summary/Keyword: 바이오 데이터

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Bio Ontology-based XML DB for Biological Pathway (Biological Pathway정보를 위한 타이오 온톨로지 기반의 XML DB)

  • 배은진;박승수
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2003.04c
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    • pp.407-409
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    • 2003
  • 최근 바이오인포메틱스 분야는 IT의 발전과 더불어 급속한 발전을 이루어 왔다. 또한 기존의 분자생물학분야의 연구들을 컴퓨터의 첨단 기술을 이용하여 자동화, 전산화하는 것으로 생명정보의 데이터베이스 구축을 시작으로 서열정보의 주석처리 둥이 발전되어 왔다. 또한 분자생물학의 오랜 연구결과들 중 수많은 문헌들을 토대로 한 분석인 텍스트마이닝, 정보추출은 전산학의 방법으로 데이터를 추출, 수집하여 분자생물학 데이터의 양적 팽창을 더욱 가속화하고 있다. 본 논문에서는 수집된 biological Pathway 정보의 효율적인 저장, 재사용 그리고 활용을 위해 바이오 온톨로지 기반의 XML DB를 설계하고자 한다. XML 스키마를 이용해 표현한 온톨로지를 기반으로 다양한 포맷의 생물학 데이터를 수집하고 수집된 데이터들로 XML DB를 구축한 후 Biological Pathway 정보 표현과 재사용. 나아가 생명정보학 응용분야에 활용하려 한다.

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Exploration of data alignment methods for bioassay analysis (생물 검정 데이터 정렬기법들의 비교 및 분석)

  • Kim, Han-Joo;Lee, Sung-Min;Park, Seung-Hyun;Yoon, Sung-Roh
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2012.06b
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    • pp.453-455
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    • 2012
  • 생물 검정(Bioassay)이란 생체 조직이나 분자의 구조 분석이나 기능 해석, 화합물이나 약에 의한 영향성을 실험하기 위해 실험체 조직과 약물의 상호작용에 의한 생성물의 양적 세기를 측정하는 과학적 실험 방법의 총칭이다. 바이오 어세이 실험 방법은 Gas Chromatography, 시험관 전기영동(Capillary Electrophoresis), 핵자기공명(NMR) 등의 다양한 실험 데이터를 포함한다. 결과로 생성된 실험 데이터를 정량적으로 분석하기 위해서는 일관성을 위해 얻어진 데이터를 정렬하는(alignment) 과정을 거쳐야 한다. 본 연구에서는 알려진 정렬 알고리즘들을 비교하기 위해, 알고리즘의 유형별로 분류하고 그 결과물을 분석하여 성능을 비교함과 동시에 특성을 파악하고자 한다.

치안분야에서의 Big Data 활용 사례와 바람직한 공공 연구조직 설계

  • Gwon, Hyo-Jin;Lee, Jang-Jae
    • Proceedings of the Korea Technology Innovation Society Conference
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    • 2017.11a
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    • pp.1245-1262
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    • 2017
  • 최근 범죄예측, 교통관리, 신원확인 등 다양한 목적으로 치안 분야에서 ICT 기술이 개발 이용되고 있다. 사물인터넷의 등장으로 인해 생성되는 데이터의 양이 폭발적으로 증가하고 있으며, 이를 통해 만들어진 빅데이터는 범죄분석 및 예방, 치안수요의 예측, 범죄 수사에 있어서 새로운 변화를 가져올 것으로 예고되고 있다. 새롭게 부각된 치안분야에서의 빅데이터 활용 서비스 사례로는 범죄 예측 서비스, 교통 관련 서비스, 영상 분석과 통합 관제 서비스, 웨어러블 폴리스캠 활용서비스, 신원 확인(바이오 인식 기술)서비스 등이 있다. 선진국에서는 이들 서비스를 개발하고 활용하기 위한 다양한 공공 연구조직이 설립되어 운영되고 있다. 본 고에서는 치안분야에서 빅데이터를 기반으로 한 국내외 서비스 사례와 함께 이를 수용하기 위한 바람직한 공공 연구조직에 대한 논의를 전개한다.

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Data analysis for quantitative proteomics research (프로테오믹스 연구를 위한 정량분석 데이터의 해석)

  • Kwon Kyung-Hoon
    • KOGO NEWS
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    • v.6 no.1
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    • pp.24-28
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    • 2006
  • 프로테오믹스는 생물체 안에 포함되어 있는 단백질을 통합적으로 연구한다. 단백질을 동정(Protein identification)하고, 단백질의 상태를 분석(Protein characterization)하며, 단백질의 양적 변화를 관찰(Protein quantitation)한다. 단백질에 대한 분석, 특히 질량분석기에 의해 초고속으로 대량의 단백질 데이터를 생산하는 프테테오믹스의 연구는 정량적인 단백질 발현양상분석의 정확도를 높이고 분석시간을 단축하기 위해 다양한 실험기법과 데이터 분석기법을 동원하고 있다. 1) 단백질의 양적 차이나 양적 변화의 관찰은 바이오마커를 발굴하고 생명현상의 메카니즘을 규명하여 그 결과를 신약개발에 활용하기 위한 기초 연구이다. 이 글에서는 프로테오믹스 연구의 초창기부터 사용되어온 2차원 전기영동법에 의해 생성되는 2D-gel image에서의 스팟(spot)분석법과 함께, 탄뎀 질량분석기를 사용하는 ICAT, SILAC 등의 동위 원소를 사용한 라벨링(labeling) 방법, 라벨링을 하지 않는 label-free 방법 등 프로테오믹스에서의 정량분석법에 대한 기본 개념을 살펴보고, 이들에서의 데이터 분석 기술의 적용에 대해 간략히 소개하였다.

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The Server based Realtime Biometric Signature Scheme (서버 기반 실시간 바이오메트릭 서명 기법)

  • Yun, Sunghyun
    • Journal of Digital Convergence
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    • v.11 no.9
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    • pp.173-179
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    • 2013
  • In a biometric authentication scheme, a user's biometric data that is unique to the user is used to prove the user's identity to the third party. Since the user should have to participate in every authentication sessions, it's not possible to delegate other users to authenticate instead of himself/herself. In a biometric signature scheme, contrary to authentication scheme, a user's biometric data is used to prove that "this message is signed by the signer who claims to be" to the third party. However, once the biometric key is created, it can be accessed by the signer. Thus, it's possible to lend the biometric key to other users. In this study, the server based biometric realtime signature scheme is proposed. The proposed scheme can be applied to sign the vote in electronic voting or to authenticate the copyright owner in DRM enabled mobile commerce where the proxy signatures are not allowed.

Towards Bio-Information Retrieval using Ontology (온톨로지를 적용한 생명정보 검색 시스템)

  • 이동훈;양정진
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2004.10b
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    • pp.262-264
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    • 2004
  • OMIM이나 MedLine과 같은 바이오 정보를 포함한 대규모의 데이터베이스에서의 바이오 정보검색이나 추출은 단계별 처리가 상호적인 운용에 의한 것이 아니라 수동 또는 Perl script에 의한 것이 대부분이다. 바이오정보(bio-information)의 효과적 추출과 유추를 위해서는 현재 상이한 스키마로 이루어진 다양한 데이터베이스들 간의 이질적 데이터(heterogeneous data)를 체계적이고 효율적으로 통합하는 표준 방안이 필요하다. 이를 위해서는 서로 다르게 표현된 다양한 개념간의 관계를 표현하는 지식체계가 필요하다. 본 연구에서는 이러한 지식체계인 온톨로지(ontology)와 자원 메타정보(metadata)를 표현하기 위한 국제적 표준안으로 대두되고 있는 시맨틱 웹(semantic web)에서 제공하는 온톨로지, 메타정보, 스키마 통합 안을 발전적으로 적용하여 이질적 바이오 정보의 효율적 통합처리 방안을 제시하고자 하였다.

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MAHA-FS : A Distributed File System for High Performance Metadata Processing and Random IO (MAHA-FS : 고성능 메타데이터 처리 및 랜덤 입출력을 위한 분산 파일 시스템)

  • Kim, Young Chang;Kim, Dong Oh;Kim, Hong Yeon;Kim, Young Kyun;Choi, Wan
    • KIPS Transactions on Software and Data Engineering
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    • v.2 no.2
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    • pp.91-96
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    • 2013
  • The application field of supercomputing systems are changing to support into the field for both a large-volume data processing and high-performance computing at the same time such as bio-applications. These applications require high-performance distributed file system for storage management and efficient high-speed processing of large amounts of data that occurs. In this paper, we introduce MAHA-FS for supercomputing systems for processing large amounts of data and high-performance computing, providing excellent metadata operation performance and IO performance. It is shown through performance analysis that MAHA-FS provides excellent performance in terms of the metadata processing and random IO processing.

Symptom Pattern Classification using Neural Networks in the Ubiquitous Healthcare Environment with Missing Values (손실 값을 갖는 유비쿼터스 헬스케어 환경에서 신경망을 이용한 에이전트 기반 증상 패턴 분류)

  • Salvo, Michael Angelo G.;Lee, Jae-Wan;Lee, Mal-Rey
    • Journal of Internet Computing and Services
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    • v.11 no.2
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    • pp.129-142
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    • 2010
  • The ubiquitous healthcare environment is one of the systems that benefit from wireless sensor network. But one of the challenges with wireless sensor network is its high loss rates when transmitting data. Data from the biosensors may not reach the base stations which can result in missing values. This paper proposes the Health Monitor Agent (HMA) to gather data from the base stations, predict missing values, classify symptom patterns into medical conditions, and take appropriate action in case of emergency. This agent is applied in the Ubiquitous Healthcare Environment and uses data from the biosensors and from the patient’s medical history as symptom patterns to recognize medical conditions. In the event of missing data, the HMA uses a predictive algorithm to fill missing values in the symptom patterns before classification. Simulation results show that the predictive algorithm using the HMA makes classification of the symptom patterns more accurate than other methods.

The One Time Biometric Key Generation and Authentication Model for Portection of Paid Video Contents (상용 비디오 콘텐츠 보호를 위한 일회용 바이오메트릭 키 생성 및 인증 모델)

  • Yun, Sunghyun
    • Journal of the Korea Convergence Society
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    • v.5 no.4
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    • pp.101-106
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    • 2014
  • Most peoples are used to prefer to view the video contents rather than the other contents since the video contents are more easy to understand with both their eyes and ears. As the wide spread use of smartphones, the demands for the contents services are increasing rapidly. To promote the contents business, it's important to provide security of subscriber authentication and corresponding communication channels through which the contents are delivered. Generally, symmetric key encryption scheme is used to protect the contents in the channel, and the session key should be upadated periodically for the security reasons. In addition, to protect viewing paid contents by illegal users, the proxy authentication should not be allowed. In this paper, we propose biometric based user authentication and one time key generation models. The proposed model is consist of biometric template registration, session key generation and chanel encryption steps. We analyze the difference and benefits of our model with existing CAS models which are made for CATV contents protection, and also provides applications of our model in electronic commerce area.

Science Technology - 빅데이터가 불러올 건강관리 혁명

  • Lee, Dong-Hun
    • TTA Journal
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    • s.176
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    • pp.64-65
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    • 2018
  • 옛말에도 "박학이상설지, 장이반설약야(博學而詳說之, 將以反說約也)."라고 했다. "넓게 배우고 깊이 공부하는 것은 반대로 간략히 설명하기 위해서다."라는 뜻이다. "넓게 배우고 깊이 공부하는 것"은 제14차 산업혁명의 이기 중 하나인 빅데이터와 바로 통한다. 빅데이터는 모든 분야에서 '정답'을 매우 효율적으로 얻게 해 줄 수 있다. 거기에는 개인과 사회의 건강관리도 포함된다.

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