In biological domain, there exist a variety of protein analysis databases which have their own meaning toward the same target of protein. If we integrate these scattered heterogeneous data efficiently, we can obtain useful information which otherwise cannot be found from each original source. Reflecting the characteristics of biological data, each data source has its own syntax and semantics. If we describe these data through RDF(S) models, one of the Semantic Web standards, we can achieve not only syntactic but also semantic integration. In this paper, we propose a new concept of integration layer based on the RDF unified schema. As a conceptual model, we construct a unified schema focusing on the protein information; as a representational model, we propose a technique for the wrappers to aggregate necessary information from the relevant sources and dynamically generate RDF instances. Two example queries show that our integration layer succeeds in processing the integrated requests from users and displaying the appropriate results.
Integrated heterogeneous database systems provide the unified interface for users and applications today in order to access the underlying diverse data sources located in different sites. The multiple heterogeneous data sources have the different and specialized data structures and transaction processing capabilities. Because of local autonomy, the local system does not have the capability of cooperation to control the global transaction. Hence designing the global transaction manager with supporting the global serializability is difficult task. To resolve the well-known indirect conflict, we define the global transaction model by using the characteristics of global integrity constraints. And then we propose the site-locking operation and its protocol to manage the global transaction. The correctness and analysis of our site-locking protocol is proved and performance gain over the related other methods is also estimated in this paper.
The Journal of Information Technology and Database
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v.3
no.1
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pp.65-84
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1996
대규모 멀티미디어 데이타베이스 서비스 시스템은 웹(Web)의 대규모 멀티미디어 정보 서비스의 우수성과 데이타베이스 시스템의 방대한 데이타베이스 관리 가능을 상호 보완적으로 통합함으로써 구현할 수 있다. 데이타베이스 통로(gateway)는 이러한 통합의 핵심적인 소프트웨어라 할 수 있다. 데이타베이스 통로의 필요성이 인식된 후로 현재 많은 상용 및 연구용 제품이 개발되어 왔다. 데이타베이스 통로의 구조는 데이타베이스 접속을 웹에 어떻게 연동시키는가에 따라 다양하게 나누어지고 구조에 따라 성능도 달라지게 된다. 본 논문에서는 여러가지 데이타베이스 통로의 구조에 대하여 분류체계를 제안하고, 현재 충남대학교에서 개발하고 있는 UniWeb의 설계 및 구현을 기술한다. UniWeb은 웹을 위한 UniSQL/X 데이타베이스 통로로서 DBMS의 최적화 가능을 최대한 활용할 수 있는 구조를 가지고 있으며, 웹 응용 개발을 위한 환경을 지원하고 있다.
Since microarray data acquire tens of thousands of gene expression values simultaneously, they could be very useful in identifying the phenotypes of diseases. However, the results of analyzing several microarray datasets which were independently carried out with the same biological objectives, could turn out to be different. One of the main reasons is attributable to the limited number of samples involved in one microarry experiment. In order to increase the classification accuracy, it is desirable to augment the sample size by integrating and maximizing the use of independently-conducted microarray datasets. In this paper, we propose a novel two-stage approach which firstly integrates individual microarray datasets to overcome the problem caused by limited number of samples, and identifies informative genes, secondly builds a classifier using only the informative genes. The classifier from large samples by integrating independent microarray datasets achieves high accuracy up to 24.19% increase as against other comparison methods, sensitivity, and specificity on independent test sample dataset.
The Transactions of the Korea Information Processing Society
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v.2
no.1
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pp.12-22
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1995
When we integrate schema of distributed local databases, we mean entity integration as central concept of schema integration, and semantic of entity affects several factors. Thus the schema integration in distributed database environment starts from definition of domain relation among entity types of local schemas. Moreover, the domain relation defined by designer needs some works for confidence and validation of schema integration system. But this work was not presented in previous integration system. In this paper, we define object oriented integration for schema integration of local databases in distributed system environment, present models to verify validation on its integration, and implement the validation system.
The Journal of Information Technology and Database
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v.3
no.2
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pp.119-132
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1996
웹을 이용한 클라이언트-서버 데이타베이스 시스템은 웹의 서비스 능력과 데이타베이스 시스템의 데이타 관리 기능을 상호 보완적으로 통합함으로써 인터넷과 같은 대규모 환경에서 데이타베이스 업무 환경을 구축하는 데 매우 적합한 것으로 알려져 있다. 데이타베이스 통로는 이러한 통합의 가장 핵심적 구성 요소이다. 본 논문에서는 먼저 클라이언트-서버 데이타베이스 응용을 위한 데이타베이스 통로의 고려사항으로서, 고성능 실행구조, 응용 프로그램 개발 환경, 그리고 상태 및 트랜잭션 관리에 대해 기술하고, 이어서 UniSQL/X용 데이타베이스 통로인 UniWeb 2.0의 설계와 구현에 대하여 소개한다. UniWeb 2.0은 CGI 응용 서버 방식을 채택하여 다양한 플랫폼을 지원하고, 고성능 그리고 확장성을 제공한다. 또한 프로그래머가 HTML 문서에 SQL/X문장이 포함된 Tcl 스크립트를 끼워 넣을 수 있도록 하여 응용 프로그램 개발 생산성을 향상시키고 있다. UniWeb 2.0은 여러 웹 페이지에 걸친 상태 와 트랜잭션을 지원하고 있다.
대규모 멀티미디어 데이타베이스 서비스 시스템은 월드와이드 웹(WWW : World Wide Web)의 대규모 멀티미디어 정보 서비스의 우수성과 데이타베이스 시스템의 방대한 데이타베이스 관리 기능을 상호 보완적으로 통합함으로써 구현할 수 있다. 데이타베이스 통로는 이러한 통합의 핵심적인 소프트웨어라 할 수 있다. 데이타베이스 통로의 필요성이 인식된 후로 현재 많은 상용 및 연구용 제품이 개발되어 왔다. 데이타베이스 통로의 구조는 데이타베이스 접속을 WWW 에 어떻게 연동시키는가에 따라 다양하게 나누어지고 구조에 따라 성능도 달라지게 된다. 데이타베이스 통로의 성능은 대규모 데이타베이스 서비스 시스템 구축에 매우 중요하다고 할 수 있다. 이 문서에서는 여러가지 데이타베이스 통로의 구조에 대하여 분류체계를 세우고, 각 구조에 대한 특징을 성능 및 기능에 대하여 연구하였다.
In this paper, a conceptual data model, called the UDM(Unified Data Model), to efficiently represent database structures related with object technology and complex structured data, is proposed. This model integrates major features of modern data models, such as E-R model, Semantic Object Model, and UML, especially from the viewpoint of database design. This model is basically a simplified, but extended version of the Object-Relationship Model, which was proposed to model complex structures of temporal-spatial multimedia data. This model incorporates some of the important semantic and structural information of modern database applications and it is designed to support all of the major logical database models, including relational, object-relational, object-oriented, and (semi-)structured databases. A special diagrammatic technique, called the UDD(Unified Data Diagram), is introduced as a tool for database design. Also, possible ways to derive logical views of data from this unified data model are presented. The proposed model can be utilized as a convenient and practical tool for conceptual database designs.
The Transactions of the Korea Information Processing Society
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v.4
no.2
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pp.349-362
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1997
In order to make a meaningful multi-media object,it is usually necessary to apply a number of non-trival operations.If multi-media data can be encapsulated in a standaridized form and stored in a database,it is poss-ible to share and reuse multi-media data among users without repeating the same or similar operations. Based on the OLE component object model,this paper proposes the integrated computing enviroment for naive user to share and reuse of Ole objects.Various types of multi- media objects that are created by their appropriate OLE application programs can be aggreagated to form a multi-media document.In addition,the OLE objects can also be stored in database by a controlled manner.TheOLE object in a database can be retrieved by a visual query interface and reused to make a new document.This paper describes the common Platform to integrate various ment of OLE appfication programs,the separation process of an OLE object form a document,and the overall management of OLE object in a database.
Proceedings of the Korean Society for Emotion and Sensibility Conference
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2001.05a
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pp.210-214
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2001
본 연구의 목표는 인간의 감성을 평가하기 위하여 행해지는 실험에 있어서 생리신호 측정값 및 주관평가 측정값을 자동적으로 분석하여 결과를 산출하는 시스템을 설계하는데 있다. 인간의 감성을 평가하기 위한 방법으로서 인간의 생리신호(ECG,EEG,GSR,SKT등)를 측정하여 얻는 객관적데이타와 형용사에 의해 측정되는 주관적데이타가 있다. 통합감성평가시스템은 이러한 주관적데이타 객관적데이타를 분석하여 최종적이니 감성평가결과를 산출하는 시스템이다. 지금까지 감성평가실험에서 생리신호 측정값의 분석과 주관적평가측정값의 분석은 상당한 시간과 인력이 소비되었다. 이런 모든과정을 처리할 수 있는 시스템을 개발함으로써 보다 효과적인 실험환경의 조성 및 실험결과 산출로부터 신뢰성있고 다양한 결과를 도출해 낼 수 있을 것이다. 본 시스템은 감성종합 데이터베이스, 생리신호분석시스템, Sheet에 의한 주관평가 시스템, 실시간 주관평가 시스템을 통합하는 시스템이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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