• Title/Summary/Keyword: 대사체

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Precursor Feeding Effects of Alkaloid Production in Suspension Cultures of Eschscholtzia californica (캘리포니아 양귀비(Eschscholtzia californica) 현탁세포배양에서 전구체가 알칼로이드 생성에 미치는 영향)

  • 주영운;김철변상요
    • KSBB Journal
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    • v.8 no.5
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    • pp.488-494
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    • 1993
  • The accumulation of benzophenanthridine alkaloids, sanguinarine, chelerythrine, chelirubine and macarpine occurred in suspension cultures of Eschscholtzia californica. To increase alkaloid production, feeding experiments with the biosynthetic precursors, tyrosine, tyramine, L-dopa, dopamine with and without elicitation were studied. In feeding experiments with various precursors, the total alkaloid production was slightly increased. The precursor feeding with elicitation, however, increased total alkaloid production several times.

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Reconstruction of Metabolic Pathway for the Chicken Genome (닭 특이 대사 경로 재확립)

  • Kim, Woon-Su;Lee, Se-Young;Park, Hye-Sun;Baik, Woon-Kee;Lee, Jun-Heon;Seo, Seong-Won
    • Korean Journal of Poultry Science
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    • v.37 no.3
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    • pp.275-282
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    • 2010
  • Chicken is an important livestock as a valuable biomedical model as well as food for human, and there is a strong rationale for improving our understanding on metabolism and physiology of this organism. The first draft of chicken genome assembly was released in 2004, which enables elaboration on the linkage between genetic and metabolic traits of chicken. The objectives of this study were thus to reconstruct metabolic pathway of the chicken genome and to construct a chicken specific pathway genome database (PGDB). We developed a comprehensive genome database for chicken by integrating all the known annotations for chicken genes and proteins using a pipeline written in Perl. Based on the comprehensive genome annotations, metabolic pathways of the chicken genome were reconstructed using the PathoLogic algorithm in Pathway Tools software. We identified a total of 212 metabolic pathways, 2,709 enzymes, 71 transporters, 1,698 enzymatic reactions, 8 transport reactions, and 1,360 compounds in the current chicken genome build, Gallus_gallus-2.1. Comparative metabolic analysis with the human, mouse and cattle genomes revealed that core metabolic pathways are highly conserved in the chicken genome. It was indicated the quality of assembly and annotations of the chicken genome need to be improved and more researches are required for improving our understanding on function of genes and metabolic pathways of avian species. We conclude that the chicken PGDB is useful for studies on avian and chicken metabolism and provides a platform for comparative genomic and metabolic analysis of animal biology and biomedicine.

Comparative untargeted metabolomic analysis of Korean soybean four varieties (Glycine max (L.) Merr.) based on liquid chromatography mass spectrometry (국내콩 4품종의 LC-MS 기반 비표적대사체 비교평가)

  • Eun-Ha Kim;Soo-Yun Park;Sang-Gu Lee;Hyoun-Min Park;Oh Suk Yu;Yun-Young Kang;Myeong Ji Kim;Jung-Won Jung;Seon-Woo Oh
    • Journal of Applied Biological Chemistry
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    • v.65 no.4
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    • pp.439-446
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    • 2022
  • Soybean is a crop with high-quality of protein and oil, and it is one of the most widely used genetically modified (GM) crops in the world today. In South Korea, Kwangan is the most utilized variety as a parental line for GM soybean development. In this study, untargeted LC-MS metabolomic approaches were used to compare metabolite profiles of Kwangan and three other commercial varieties cultivated in Gunwi and Jeonju in 2020 year. Metabolomic studies revealed that the 4 soybean varieties were distinct based on the partial least squares-discriminant analysis (PLS-DA) score plots; 18 metabolites contributed to variety distinction, including phenylalanine, isoflavones, and fatty acids. All varieties were clearly differentiated by location on the PLS-DA score plot, indicating that the growing environment is also attributable to metabolite variability. In particular, isoflavones and linolenic acid levels in Kwangan were significantly lower and higher, respectively compared to those of the three varieties. It was discussed that it might need to include more diverse conventional varieties as comparators in regard to metabolic characteristics of Kwangan for the assessment of substantial equivalence biogenetically engineered soybeans in a Kwangan-variety background.

Reactive Intermediates and Reaction Mechanisms in the Oxidative Metabolism of Organophosphorus Compounds (유기인계 화합물의 산화대사중 반응성 중간체와 반응기작에 관한 고찰)

  • Kim, Jeong-Han;Toia, Robert F.;Park, Chang-Kyu
    • Korean Journal of Environmental Agriculture
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    • v.15 no.2
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    • pp.246-261
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    • 1996
  • Organophosphorus pesticides, which are an important part of synthetic pesticides in current use contain sulfur atom in their molecules and can be activated or detoxified by environmental and/or biological metabolism. Among the related metabolic reactions, oxidative processes are particularly important with their final products and the study on the reactive intermediates formed in those reactions is essential to elucidate the metabolic pathways and mechanisms and to understand the toxicological properties. This review dealt with the reactive intermediates formed in various reactions from the structural and mechanistic point of view for organophosphorus pesticides and related compounds.

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후 시상하부의 심혈관계 조절기전(I): 흰쥐 후 시상하부에서 세포외액의 모노아민과 그 대사체들에 대한 생체내 미세투석법에 의한 연구

  • 이상복;성기옥;조영진;이석용;김인순;김성윤
    • Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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    • 1992.05a
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    • pp.34-34
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    • 1992
  • 심혈관계의 중추 조절작용과 고혈압 치료제의 작용기전을 규명하기 위한 연구의 한 단계로서 생체내 미세투석법(in vivo microdialysis)을 이용하여 후 시상하부의 국소부위에서 catecholamine들과 serotonin 및 그 대사체들의 세포와 농도의 변화를 정상혈압 횐쥐 (WKY)에서 관찰하고, 자연발생성 고혈압 횐쥐(SHR)에서 이들의 기준치를 비교하였다. 뇌정위 고정장치에 의해서 미세투석관을 후 시상하부에 위치시킨 후 링거액으로 관류하였다. 모노아민들과 그 대사체들은 고속액체 크로마토그라피와 전기화학 검출기률 이용하여 정량하였다. WKY에서 imipramine(50$\mu$M)의 관류에 의하여 norepinephrine의 농도가 유의하게 증가되었고, 또한 Pargyline (75mg/kg, i.p.)에 의하여 norepinephrine의 농도는 유의하게 증가된 반면에 DOPAC, HVA 및 5-HIAA는 감소하였다. WKY와 SHR에서 비교하였을때 norepinephrine, epinephrine, dopamine, serotonin의 농도는 차이가 없었으나 DOPAC, HVA, 5-HIAA의 농도는 SHR에서 유의하게 증가된 결과를 얻었다. 상의 결과들은 모노아민중에서 norepinephrine이 정상혈압 흰쥐의 후 시상하부에서 유리되는 주된 신경전달물질임을 시사한다. 또한 자연 발생성 고혈압 흰쥐의 후 시상하부에서 dopamine과 serotonin의 교체속도가 증가되었을 가능성이 큰 것으로 사료된다.

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Capsaicin Intake Estimated by Urinary Metabolites as Biomarkers (뇨중 대사체 정량에 의한 capsaicinoid의 생화학적 섭취지표 개발 연구)

  • Choo, Yeon-Soo;Kwon, Hoon-Jeong
    • Korean Journal of Food Science and Technology
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    • v.33 no.6
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    • pp.784-788
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    • 2001
  • Reliable data on the exposure of capsaicin, which evokes hot sensation in hot red pepper, are important prerequisites for studying biological functions of capsaicin in human body since its roles are controversial according to animal and epidemiological studies. To get accurate data, the use of urinary biomarkers was considered as a measure of internal exposure of capsaicin. After 2-day-capsaicin depletion five to six women in their 20's were instructed to eat 60 or 80 g/day hot red pepper soybean paste as a capsaicin source with meal which did not contain capsaicinoid, and to collect their urine separately. HPLC conditions were set to detect capsaicinoid and urinary metabolites at the same time. Most of capsaicinoid were excreted in the form of 4-hydroxy-3-methoxybenzoic acid in three subjects at the highest dose. This result suggests the oxidation of the 4-hydroxy3-methoxybenzaldehyde, the hydrolysis product of capsaicin, is the major metabolic pathway in the human body, whereas the reduction of the aldehyde is the major route in rats. However, neither any metabolite nor the parent compound was ever shown in two of the subjects reflecting large individual differences of capsaicin absorption and/or biotransformation.

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Evolutionary Classification of Metabolic Networks by Hierarchical Clustering (클러스터링 기법을 통한 대사 네트웍의 진화적 분류)

  • 오석준;정제균;장병탁
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2002.10c
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    • pp.226-228
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    • 2002
  • 현재 유전자 서열 분석이 완료된 유전체들이 점점 늘어나고 있다. 따라서 이에 대한 방대한 정보가 생성됨에 따라 다양한 생물체들에 대하여 대사 네트웍을 통한 다차원적 분석이 가능하게 되었다. 대사 네트웍은 단백질 또는 효소들의 전체적인 상호작용을 표현하기 때문에 생물학적 메카니즘에 대하여 보다 풍부한 정보를 제공해 준다. 본 논문에서는 일차원적인 유전자 서열에 의한 종의 계통 분류가 아니라 메타 수준의 생리 구조적 비교를 통하여 계통분류학에 대하여 새로운 방법의 접근을 제안하고자 한다. 제안된 방법은 기존의 상동성 비교에 의한 계통 분류와 함께 좀 더 포괄적이고 거시적인 분석을 가능하게 한다.

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신규 항암제 DA-125의 ADME 연구

  • 이명걸;윤은정;심현주
    • Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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    • 1993.04a
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    • pp.133-133
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    • 1993
  • DA-125의 rat blood중 분해반감기는 4.28분으로, DA-125는 정맥 투여후 신속히 M1으로 분해되었으며, DA-125는 투여 10분 후부터 검출되지 않았다. Mouse에 25mg/kg 정맥주사 한 후의 M1의 phamacokinetic parameter는 terminal t$\frac{1}{2}$ 344분, MRT 371분, Vss 25.7 $\ell$/kg, CL$_{total}$ 69.3 ml/min/kg이었으며 투여 2hr후에 M1및 대사체가 폐, 위, 신장등에는 다량 존재하였으나 심장에서는 검출되지 않았다. Rat에 10 mg/kg 정맥주사한 후의 혈장농도는 terminal phase에 도달하지 못하고 혈장농도가 변동을 나타내었다. 담즙으로의 배설은 주로 M2의 형태로 이루어졌으며 M1이 소량 차지하고 M3와 M4는 검출되지 않았다. DA-125는 rat 및 mouse liver homogenate에 의해 대사되어 FT-ADM(M1) ,13-dihy-dro FT-ADM(M2), 7-deoxy-adriamycinone(M3) 및 7-deoxy-13-dihydro adriamyci-none(M4)를 형성하였다. DA-125는 혐기, 호기 및 보효소, 종차에 관계얼이 반응개시 30분후에 약 90%가 분해되었으나 각 대사체의 생성여부 및 속도는 조건에 따라 변화하였다.

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The Analysis of Quantified Characteristics of Actor Gangho Song's Speech Disfluency rates in Thirst(2009) (박쥐(2009) 배우 송강호 대사에서 비유창성 비율의 정량적 특징 분석)

  • Nam, Seung Suk
    • Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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    • 2011.05a
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    • pp.311-312
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    • 2011
  • 이번 연구 목적은 배우 대사의 비유창성 비율 증감이 영화 내러티브 흐름과 어떤 상관 관계를 가지는지 전사작업을 통해 정량적으로 분석하는 것이다. 대화체는 잡음,간투어 등의 비유창성(DFs; Disfluencies) 이 나타난다. 배우는 자연스럽게 대사를 발화하려고 비유창성 비율을 인위적으로 높인다. 연구 대상은 박쥐(2009)의 배우 송강호(상현 역) 대사이다. 가톨릭 신부 상현이 뱀파이어가 되는 인물의 대사를 비유창성 특질들과 전사하였다. 그리고 주인공의 정체성에 따라 배우의 대사의 비유창성 비율의 변화 양상을 비교 분석하였다.

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양식넙치의 총대사활성에 미치는 수온변동의 영향 1. 순화수온에 따른 표준대사율의 변동

  • Jin, Pyung;Shin, Eun-Kyung;Lee, Jung-A;Kim, Kyung- Sun
    • Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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    • 2001.05a
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    • pp.465-466
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    • 2001
  • 동물의 대사기능은 체내 주요 생리기능의 지표로서 체내의 물질대사 또는 에너지 대사의 결과를 반영한다 체내의 모든 생리적 과정은 동물과 환경간에 있어서 물질 및 에너지의 교환과 체내의 물질 및 에너지의 전환을 통해서 수행된다. 따라서 생체의 대사작용은 생존을 위한 역원적 중추기능이며 생체의 대사활성은 동물체의 기능적 항상성을 유지하는데 관련된 생리기능의 총체적 척도가 된다. (중략)

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