A metabolomic study was conducted to identify key metabolic components, which are correlated with the growth of 4-year-old Pinus koraiensis seedlings harvested at actively height growing season (May 18th). Among 105 individual metabolites identified by GC/MS analysis, alanine, threonine, oleic acid, and butanoic acids were negatively correlated with both height and weight of 4-year-old seedlings, while malic acid, xylose, glucose, d-turanose and inositol had positive correlation with various growth parameters. During the actively growing season, the concentrations of both amino acids and organic acids in the main stem of Superior seedling group were lower but the photosynthates such as mono-saccharide and sucrose were higher than in other seedling groups such as Intermediate and Inferior. Interestingly, d-turanose, an analogue of sucrose that is not metabolized in higher plants but used as carbon source by many organisms including numerous species of bacteria and fungi, showed the highest correlation (r=0.896, p<0.001) with height of 4-year-old seedlings, indicating that possible interaction with mycorrhizal organisms. Therefore we suggest that several metabolites selected in this study may be used as metabolic markers for complex traits in P. koraiensis.
Alginates are found in marine brown seaweeds and in extracellular biofilms secreted by some bacteria. Previously, we reported an oligoalginate lyase from Sphingomonas sp. MJ-3 (MJ3-Oal) that had an exolytic activity and protein sequence homology with endolytic polymannuronate (polyM) lyase in the N-terminal region. In this study, the MJ3-Oal was tested for both exolytic and endolytic activity by homology modeling using the crystal structure of Alg17c from Saccharophagus degradans 2-40T. The tyrosine residue at the $426^{th}$ position, which possibly formed a hydrogen bond with the substrate, was mutated to phenylalanine. The FPLC profiles showed that MJ3-Oal degraded alginate quickly to monomers as a final product through the oligmers, whereas the Tyr426Phe mutant showed only exolytic alginate lyase activity. $^1H$-NMR spectra also showed that MJ3-Oal degraded the endoglycosidic bond of polyM and polyMG (polymannuronate-guluronate) blocks. These results indicate that oligoalginate lyase from Sphingomonas sp. MJ-3 probably catalyzes the degradation of both exo- and endo-glycosidic bonds of alginate.
The purpose of present study was to compare the speed of coronal leakage before and after post space preparation using Streptococcus mutans. Forty straight extracted human teeth were selected. The crowns were removed to a uniform remaining root length 14 mm. Canals were enlarged by 06 taper $Profiles^{(R)}$ to a size $\#40$ as a master apical file. And these were filled with gutta percha point and $Tubuliseal^{(R)}$ sealer, using continuous wave technique. Groupings are as follows. Group 1 - These teeth were obturated without sealer. Group 2 - These teeth were obturated and covered the surface of the root completely with sticky wax. Group 3 - These teeth were obturated. Group 4 - These teeth were obturated and prepared for post space remaining 5 mm of gutta percha. The teeth were suspended in plastic tubes. The upper chamber received the bacterial suspension everyday to simulate clinical situation. The lower chamber consisted of BHI added Andrade's indicator. All roots in the positive control group (Group 1) turned yellow within 24 h and those of negative control group (Group 2) remained red throughout the experimental period (70 days) The samples of group 3 were contaminated within an average of 27.2 days. The samples of group 4 were contaminated within an average of 15.7 days, ranging from 9 to 22 days. There was significant difference between group 3 and group 4 statistically (p < 0.05).
Acer tegmentosum (Acereaceae) has been used a source of traditional medicines for the treatment of hepatic disorders in Korea. This research was conducted to determine biofunctional activities of A. tegmentosum stem extract and to identify its bioactive components. Methanolic extract from A. tegmentosum stem was partitioned by using organic solvents, including n-hexane, ethyl acetate, n-butanol, and water. Two compounds were isolated by using an ODS column chromatography from ethyl acetate soluble fraction shown to the strongest antioxidant activity ($RC_{50}=3.15\;{\mu}g/m{\ell}$) among the fractions. The isolated compounds were analyzed by $^1H$ and $^{13}C$ NMR, IR, UV/VIS, MS spectrum data and identified as catechin, ${\rho}-Hydroxyphenethyl$ alcohol $1-O-{\beta}-_D-(6'-O-galloyl)-glucopyranoside$. The compounds have shown strong antioxidant activity, with similar activity to BHA ($RC_{50}=2\;{\mu}g/m{\ell}$). Especially, ${\rho}-Hydroxyphenethyl$ alcohol 1-O-{\beta}-_D-(6'-O-galloyl)-glucopyranoside$ was shown strong anti-lipid peroxidative activity. However, the compounds were not shown antimicrobial activities. In antimicrobial activity assays, ethyl acetate soluble fraction was effective to bacterial inhibition, such as Escherichia coli and Klebsiella pneumonia, with minimum inhibitory concentrations in $125\;{\mu}g/m{\ell}$. Otherwise, antifungal activity against Candida albicans was shown in n-hexane soluble fraction exhibiting $63\;{\mu}g/m{\ell}$ of minimum inhibitory concentration. In anticomplementary activity assays, water soluble fraction was the most effective exhibiting 24% inhibitory activity.
This study investigated the synergistic effect of single inoculation and co-inoculation of phosphate-solubilizing bacteria (PSB) Burkholderia metallica JH-7 and Burkholderia contaminans JH-15. Phosphate-solubilizing abilities of these strains were assessed by measuring phosphorus content in culture media that were singly inoculated or co-inoculated with these strains for 7 days. B. metallica JH-7 was found to release the highest content of soluble phosphorus ($140.80{\mu}g\;mL^{-1}$ ) into the medium, followed by single inoculation of B. contaminans JH-15 ($135.95{\mu}g\;mL^{-1}$ ) and co-inoculation of two strains ($134.84{\mu}g\;mL^{-1}$ ). The highest pH reduction, organic acid production, and glucose consumption were observed in the medium inoculated with B. metallica JH-7 alone compared with that in the medium co-inoculated with both the strains. Results of a plant growth promotion bioassay showed 17.4% and 7.48% higher leaf and root growth, respectively, in romaine lettuce inoculated with B. metallica JH-7 alone than in romaine lettuce inoculated with a control strain. However, no significant difference was observed between single inoculation and co-inoculation of these strains with respect to phosphorus release and plant growth. Although the results of the present study did not show the synergistic effect of phosphate solubilization by the PSB strains examined, these results indicate that treatment with PSB exerts a beneficial effect on crop growth.
The present study was conducted to investigate the synergistic effects caused by single and co-inoculation of the phosphate solubilizing bacteria (PSB), Paraburkholderia phenazinium YH3 and Paraburkholderia metrosideri YH4. Phosphate solubilization was assessed by measuring the phosphorus contents for 7 days in a single and co-inoculation medium. Co-inoculation of the two strains was found to release the highest content of soluble phosphorus ($1,250{\mu}g\;mL^{-1}$) into the medium, followed by the single inoculation of P. metrosideri YH4 ($1196.59{\mu}g\;mL^{-1}$) and P. phenazinium YH3 ($994.34{\mu}g\;mL^{-1}$). The highest pH reduction, organic acid production and glucose consumption was also observed in the co-inoculation medium of the two strains. A plant growth promotion bioassay revealed that co-inoculation with the two strains enhanced the growth of romaine lettuce more than single inoculation with either of the two strains (28.5% for leaf and 16.6% for root). Although there was no significant difference between single and co-inoculation of bacterial strains in terms of phosphorous release and plant growth, the synergistic effects of co-inoculation with PSB could be beneficial for crop growth.
In this study, we compared the levels of methylotrophic bacterial community diversity in the leaf samples of 19 rice cultivars collected from three regions of Korea. Nineteen pink pigmented isolates showing characteristic growth on methanol were obtained. Physiological and biochemical characters of each isolate were examined according to methods described in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. When phylotypes were defined by performing numerical analysis of 37 characteristics, four distinct clusters were formed. The two reference strains, Methylobacterium extorquens AM1 and Methylobacterium fujisawaense KACC10744 were found to group under cluster IV and cluster III respectively. Cluster I diverged on the basis of nitrate reduction and four isolates showed tolerance upto 0.5 M NaCl concentrations. Two strains in cluster I and III were found to possess methane utilizing properties. Most of the isolates in all the four clusters utilized monosaccharides, disaccharide and polyols as carbon source. When the isolates were subjected for indole-3-acetic acid (IAA) analysis in the presence of L-tryptophan, only 8 isolates exhibited IAA production. In addition, the nitrogen source in the medium was found to influence the IAA production. Addition of $(NH_4)_2SO_4$ in the medium led to a 2 to 30 fold increase in the indole synthesis. However, $KNO_3$, $NH_4NO_3$ and $NH_4Cl$ substitution did not significantly stimulate the synthesis of IAA in the growth medium. Result of gnotobiotic root elongation assay significantly increased roots and shoots lengths, and number of lateral roots, which is mediated by IAA production in the culture medium. The rice seedlings primary roots from seeds treated with methylotrophic isolates were on average 27 to 56% longer than the roots from seeds treated with the uninoculated seeds. In addition, application of different high concentrations of authentic IAA ($400g\;mL^{-1}$) to roots of rice seedlings inhibited root growth. However, the IAA concentration from 10 to $200g\;mL^{-1}$, IAA promoted root growth of rice seedlings. These results suggest that bacterial IAA plays a major role in the development of the host plant root system.
Sam Woong Kim;Young Jin Kim;Hyo In Choi;Sang Won Lee;Won-Jae Chi;Woo Young Bang;Tae Wan Kim;Kyu Ho Bang;Sang Wan Gal
Journal of Life Science
/
v.34
no.7
/
pp.465-475
/
2024
Lactiplantibacillus plantarum K9 is a probiotic strain that can be utilized from various bioactive substances isolated from Protaetia brevitarsis seulensis larvae. In this study, a genetic analysis of L. plantarum K9 revealed the existence of a bacterial chromosome and three plasmids. The glycolysis pathway and pentose phosphate pathway were examined for their normal functioning via an analysis of the core metabolic pathways of L. plantarum K9. Since the key enzymes, fluctose-1,6-bisphospatase (EC: 3.1.3.11) and 6-phosphogluconate dehydratase (EC: 4.2.1.12)/2-keto-deoxy-6-phosphogluconate (KDPG) aldolase (EC: 4.2.1.55), of gluconeogenesis and the ED pathway were not identified from the L. plantarum K9 genome, we suggest that gluconeogenesis and the ED pathway are not performed in L. plantarum K9. Additionally, while some enzymes, related to fumarate and malate biosyntheses, involved in the TCA cycle were identified from L. plantarum K9, the enzymes associated with the remaining TCA cycle were absent, indicating that the TCA cycle cannot proceed. Meanwhile, based on our findings, we propose that the oxidative electron transport system performs class IIB-type (bd-type) electron transfer. In summary, we assert that L. plantarum K9 performs homolactic fermentation, executes gluconeogenesis and the pentose phosphate pathway, and carries out energy metabolism through the class IIB-type oxidative electron transport system. Therefore, we suggest that L. plantarum K9 has relatively high lactic acid production, and that it has excellent antibacterial activity, as a result, compared to other lactic acid bacterial strains. Moreover, we speculate that L. plantarum K9 has an oxidative electron transport capability, indicating that it is highly resistant to oxygen and suggesting that it has fine cultivation characteristics, which collectively make it highly suitable for use as a probiotic.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.