• Journal of Embryo Transfer
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• v.22 no.3
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• pp.167-172
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• 2007

Pituitary-specific transcription factor (PIT1) 유전자는 동물의 성장을 조절하고 근육 형성에 관여하는 유전자로서 최근에는 단일염기다형성 변이가 한우를 비롯한 동물에서 관찰되었으며, 한우의 경제 형질과 연관성이 보고되었다. 본 연구는 PIT1 유전자의 단일염기다형성 변이가 한우에서 성장 인자에 미치는 영향과 경제 형질에 대한 유전자형간 육종가와의 상관성에 대해 알아보고자 하였다. 도체 성적을 보유하고 있는 한우 후보종모우 집단 268두를 대상으로 PIT1 유전자 A1256G 다형성을 조사하여 유전자형의 빈도를 분석하였고 각각의 유전형에 따른 기본적인 검정 성적을 바탕으로 경제 형질과의 연관성을 비교 분석하였다. 268두의 한우에서 PIT1 유전자의 A1256G 유전자형 빈도는 MseI 제한 효소를 사용했을 때 A 유전자 빈도(0.37)보다 G 유전자 빈도(0.62)가 높게 나타났다. 통계적 분석을 통하여 각 유전자형에 대한 경제 형질과의 관련성을 분석한 결과, 각 유전자형 간에 12개월령 체중 (body weight 12, BW12)에서 유의한 차이를 보였고, 등지방 두께 육종가 (Backfat thickness-estimated breeding value, BF-EBV)와도 유의한 차이가 있었지만 (p<0.05), marbling score (MS), carcass weight (CW), M. longissimus dorsi area (LDA) 등 다른 경제 형질과는 통계학적으로 유의한 차이가 없었다. PIT1 유전자의 A1256G 다형성은 한우의 성장과 도체체중에 관여하는 인자로 작용하는 것으로 보여진다.

• Journal of Acupuncture Research
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• v.21 no.1
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• pp.211-225
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• 2004

목적 : 류마티스 관절염 환자의 골 파괴에 중요한 역할을 하는 것으로 알려진 Matrix Metalloproteinase-1(MMP-1) 유전자의 단일 염기 다형성을 분석하고, 나아가 봉독약침 치료에 대한 반응과의 연관성을 조사하기 위하여 본 연구를 시행하였다. 방법 : 미국류마티스학회의 류마티스 관절염 기준에 해당하는 122명의 한국인 류마티스 관절염 환자와 건강한 92명의 대조군을 대상으로 pyrosequencing 방법을 이용하여 MMP-1 유전자의 -519 위치의 다형성을 비교 분석하였으며, 류마티스 관절염 환자군을 다시 유전자 유형에 따라 동통 관절수, 종창 관절수, 조기 강직, 통증 강도, 삶의 질 평가도구인 HAQ, 환자 및 의사의 전반적 질병상태 평가, ESR, CRP 등의 항목을 치료 전후 평가하여 비교 분석하였다. 결과 : 1. 류마티스 환자군과 건강한 대조군간에 MMP-1 유전자의 단일 염기 다형성의 유전자형의 분포와 대립유전자 발현 빈도에 통계적으로 유의한 차이가 나타났으며, 이는 MMP-1 유전자 다형성이 한국인 류마티스 관절염 환자의 질병 감수성과 관련이 있음을 추정할 수 있다. 2. 각 유전자형 그룹간 치료전 질병의 중증도 평가에서 임상 평가와 혈액의 급성 염증 반응물질 평가에서 통계적으로 유의한 차이는 없었다. 3. 급성 염증 반응의 지표인 ESR과 CRP level의 봉독약침 치료 전후 변화는 MMP-1의 유전자 다형성과 유의한 연관이 없었다. 4. 각 유전자형 그룹간의 치료 전후 질병 호전도 비교에서, AA 유전자형이 종창 관절수 평가에서 더나은 호전을 보였으며, 다른 모든 평가에서는 통계적으로 유의한 차이가 없었으며, 향후 관련 유전자와의 연관성 연구가 필요하다고 사료된다.

• The Korean Journal of Zoology
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• v.35 no.3
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• pp.287-294
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• 1992

배양 중의 골격근 세포는 증식을 거쳐 세포융합을 통해 다핵세포로 분화되므로 세포분화의 연구에 좋은 모델로서 이용되고 있다. 이전 실험에서 근원세포 융합을 억제하는 단일클론항체(MII-3J31)가 제작되었으며(Kim et al., 1992)이 항체에 대한 항원은 분자량이 약 35 kDa인 세포막 단백질로 추정되었다. 본 실험에서는 13일 계배와 성체의 근섬유 mRNA에서 CDNA라이브러리를 제작하여 근원세포 분화에 특이적으로 나타나는 유전자를 추적하였다. 근원세포 융합에 관여하는 단백질에 대한 CDNA는 계배 13일 째의 근원세포 CDNA라이브러리에서 단일클론항체를 사용한 immunoscreening 방법을 이용하여 확인하였다. 이 CDNA의 크기는 약 1.5 kb였다. 한편 13일 계배와성체 근섬유 CDNA 라이브러 리를 이용하여 13일 계배에만 특이하게 유전자 발현 이 일어 나고 성체에서는 나타나지 않는 약 0.8 kb의 CDNA플 찾았다.

• Proceedings of the Korean Society of Toxicology Conference
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• 1997.05a
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• pp.57-60
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• 1997

Aloe의 추출 시료들 중 혈관생성을 촉진하는 물질이 G1M1D1M1 분획에 있음을 chorioallantoic-membrane(CAM) assay, in vitro angiogenesis assay, u-PA, PAI, u-PAR, 및 matrix metalloprotease(MMP)의 유전자 발현조사, gelatin zymogram assay, modified CAM assay를 하여 확인 하였다. 그런 다음 G1M1D1M1 분획을 다시 분리하여 단일 성분인 NY932와 3종의 분획들을(U>3,000, 3,000>U>1,000, U<1,000) 얻었다. 이들 각각에 대한 혈관 생성 촉진 작용을 CAM assay 방법으로 조사한 결과 순수단일 성분인NY932가 혈관 생성 촉진 활성을 가장 높게 나타났다. 즉 NY932의 농도를 100ng, 2, 10, 35, 60 $\mu$g으로 투여하였을 때, 각각 2/18($11\%$), 4/10($49\%$), 16/22($73\%$), 15/17($88\%$), 9/9($100\%$)의 혈관생성 촉진 효과를 보였다. 따라서 순수 단일 성분인 NY932의 혈관 생성 촉진 작용기전을 규명하기 위하여 혈관 생성에 관련된 효소들[matrix metalloprotease(MMP)s, urokinase-plasminogen activator(uPA) 등]과 그 저해제들(TIMPs, PAI)의 유전자 발현을 조사하였으며, wounding migration assay등을 수행하였다.

• The Microorganisms and Industry
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• v.17 no.1
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• pp.51-55
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• 1991

쥐의 단일클론항체는 기초연구에 뿐만 아니라 질병의 진단시약으로서도 광범위하게 유용되어 왔다. 반면, 쥐의 단일클론항체를 인체에 임상적으로 사용하는 것은 인체에 면역반응을 유발시킨다는 근본적인 문제점 때문에 어려운 일이라 인식되어 왔다. 그러나, 최근 2-3년간 유전자 기술과 단백질공학적인 방법에 의하여 쥐의 단일클론항체를 인간화시키거나 항체절편의 생산을 시도하게 되어, 단일클론항체의 임상적인 이용에 대한 가능성이 긍정적으로 진단되고 있다. 본 난에서는 항체의 구조와 기능을 간략히 살펴보고, 최근 항체의 단백질공학에 대한 경향과 방법 및 engineered 항체의 특성들에 관하여 논의하고자 한다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2006.06a
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• pp.40-42
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• 2006

유전자 발현에 있어서의 조절작용은 유전자간의 복합적인 상호작용의 결과에 기인한다. 따라서 이러한 현상으로부터 기능적으로 연관된 유전자 군을 식별하기 위해서는 단일 유전자보다는 복수의 유전자군의 발현패턴을 대상으로 하게 된다. 이 경우 발현패턴의 시간에 따른 다양하고 복잡한 특징들은 은닉변수학습 모형을 이용하므로서 보다 명확하게 표현될 수 있고, 유사한 기능을 가진 유전자 군을 탐색 하는데에 효과적으로 이용될 수 있다. 본 논문에서 제시된 은닉변수학습 모형은 이스트 Cell Cycle 데이터에 적용한 결과 특정 조절유전자에 대하여 생물학적으로 연관된 유전자 군을 찾는 데에 다른 방법과 비교하여 효과적임을 보일 수 있었다.

• KSBB Journal
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• v.20 no.4
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• pp.323-327
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• 2005

RT-PCR is an useful method to investigate the expression of target gene as detection tools. Although RT-PCR is the powerful detection method for tissues, it was difficult to amplify the target gene product using the single cell. To clarify the expression level of the genes related to Parkinson's disease (PD), I performed the laser dissection of single cell from Substantia nigra. I examined the mRNA expression level in the dopaminergic neuron isolated from the PD patients by the single cell RT-PCR method. It is known that tyrosine hydroxylase (TH), DOPA decarboxylase (DDC) are involved in biosynthesis of the catecholamine such as dopamine. Little has been known about the gene expression features of these enzymes in single dopaminergic neuron. I could detect the specific gene products in single cell level. The different expression was observed in PD-related gene products from the single neuron of PD patients. Interestingly, TH gene expression was significantly decreased with comparing the ratio of decrease in other PD-related genes. Hence, I represented data that indicate the RT-PCR method described in this report is an effective method in detecting a specific single-cell mRNA level related with diseases.

• Korean Journal of Plant Tissue Culture
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• v.22 no.3
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• pp.169-173
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• 1995

Border cells are differentiated cells which originate from meristematic cells in The root cap. Experimentally border cells can be released from the root cap by a physical treatment, for example dipping the root tip in the waters After 20-25 hours of release, the new border cell layer forms in the root cap. During the border cell differentiation, new gene expressions were observed in the root cap of pea which was determined by mRNA differential display These new gene expressions may be involved in the border cell differentiation Border cells had unique gene expressions which were determined by mRNA differential display, This suggests that border cells are differentiated cells which are different from the other tissues (ie., leaves, stems, roots or root caps).

• Journal of the Korean Society for Aeronautical & Space Sciences
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• v.35 no.3
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• pp.238-247
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• 2007

Genetic Algorithms(GA) which searches optimum solution using natural selection and the law of heredity has been applied to learning algorithms in order to estimate performance deterioration of the aircraft gas turbine engine. The compressor, gas generator turbine and power turbine are considered for engine performance deterioration and estimation for performance deterioration of a single component at design point was conducted. As a result of that, defect diagnostics has been conducted. The input criteria for the genetic algorithm to guarantee the high stability and reliability was discussed as increasing learning data sets. As a result, the accuracy of defect estimation and diagnostics were verified with its RMS error within 3%.

• Journal of Animal Science and Technology
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• v.54 no.1
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• pp.1-8
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• 2012

This study aimed to investigate the single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the porcine MC4R gene and validate the effect of the MC4R genotype for marker assisted selection (MAS). Six amplicons were produced to analyze the entire base sequences of the porcine MC4R gene and six SNPs were detected (c.-780C>G, c.-135C>T, c.175C>T-Leu59Leu, c.707A>G-Arg236His, c.892A>G-Asp298Asn, and c.*430A>T). Linkage disequilibrium (LD) of the six SNPs was analyzed by performing haploid analysis. There was a perfect linkage disequilibrium in c.-780C>G, c.-135C>T, c.175C>T-Leu59Leu, c.707A>G-Arg236His, and c.*430A>T. Only the c.892A>G (Asp298Asn) SNP showed a very low LD with an $r^2$ value of 0.028 and the D' value of 0.348. As a result, the two SNPs-c.707A>G (Arg236His) and c.892A>G (Asp298Asn)-were selected to extract the genotype frequencies from the 5 pig breeds by using the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) genotype analysis method. The SNP frequency of c.707A>G (Arg236His) indicated the presence of the A (His) allele only in Yorkshire, while the G allele was fixed in the KNP, Landrace, Berkshire, and Duroc. Association analysis was carried out in 484 pigs with the c.707A>G (Arg236His) SNP and the meat quality traits of four different pig cross populations: a significant association was noted in crude fat, sirloin moisture, meat color, and the degree of red and yellow coloration. The frequency of the c.892A>G(Asp298Asn) SNP genotype varied among the breeds; while Duroc showed the highest frequency of the A (Asn) allele, KNP showed the highest frequency of the G (Asp) allele. Association analysis was carried out in 1126 pigs with the c.892A>G (Asp298Asn) SNP and the meat quality traits of four pig populations: a highly significant linkage was noted in the back-fat thickness (P<0.002). It was found that the back-fat thickness was higher in individuals with the AA genotype than in those with the AG or GG genotype. Thus, in this study, we verified that the c.892A>G (Asp298Asn) SNP in the pig MC4R gene has a sufficient effect as a gene marker for MAS in Korean pork industry.