• Title/Summary/Keyword: 단백질 동정

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수화발생 저수지로부터 남조류 분해능을 가지는 미생물의 분리 (Isolation of the Microbes Having Cyanobacteria Lytic Activity from Blooming Reservoirs)

  • 신규철;한명수;최영길
    • 환경생물
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    • 제20권1호
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    • pp.20-24
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    • 2002
  • 남조류에 의한 수화가 발생한 과림, 도창, 물왕 저수지로부터 시료를 채수 하여 남조류 분해 균주의 분리를 시도하였다. BG-11배지에 Anabaena cylindrica를 double layer method를 이용하여 남조류 lawn을 만들어 각각의 시료를 $100\mu{l}$씩 smearing하였다. $28^\circ{C}$ 3,000 Lux light chamber에서 13일간 배양하여 도창 저수지 시료를 접종한 Anabaena cylindrica lawn에서 남조류 분해능을 가지는 곰팡이를 분리하였다. 분리된 곰팡이의 동정은 Vitek system을 이용하여 수행하였으며, 그 결과 Cryptococcous laurentii로 동정되었다. SDS-PAGE 결과 Cryptococcus laurentii는 4개(29, 35.2, 40.9, 51.1 kDa)의 세포외 분비 단백질을 가지는 것으로 확인되었으며. Anabaena cylindrica와 혼합 배양시에는 특히 29 kDa의 단백질이 많이 분비되는 것을 확인하였다.

Bacillus sp. WY-60에 의한 균체외 단백질의 분비조건 (Production of extracellular protein from Bacillus sp. WY-60)

  • 박신;권오진
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제36권1호
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    • pp.11-16
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    • 1993
  • 미생물에 의한 균체외 단백질의 생산 및 그 분비조건에 관한 기초자료를 얻기 위해 토양으로 부터 단백질 생산균주 11주를 분리하여 그 중 단백질 생산능이 강한 WY-60 균주를 선정하여 동정한 결과, Bacillus sp.으로 확인되었다. WY-60 균주의 단백질생산 최적조건은 fructose 4.0%, polypeptone 1.0%, $NH_4NO_3$ 0.1%, $K_2HPO_4$ 0.1%, $MgSO_4{\cdot}7H_2O$ 0.005%, $CaCO_3$ 1.0%, pH 8.0 및 온도 $30^{\circ}C$이였다. WY-60 균주는 penicillin G와 lincomycin을 첨가시에 단백질 생산을 촉진하였고 그 외의 항생물질의 첨가시는 단백질 생산을 증가하는 효과가 없었다. 배양시간에 따른 단백질 생산은 배양 5일째에 0.214 mg/ml로 최대가 되었다.

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Kinesin-I의 kinesin heavy chains과 직접 결합하는 heterotrimeric G protein의 β subunit의 규명 (The β Subunit of Heterotrimeric G Protein Interacts Directly with Kinesin Heavy Chains, Kinesin-I)

  • 석대현
    • 생명과학회지
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    • 제20권8호
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    • pp.1166-1172
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    • 2010
  • Kinesin-I은 4분자의 단백질로 구성되어 있으며, N-말단의 motor 영역과 C-말단영역을 가지는 장쇄(KHC, 또한 KIF5s로도 통용) 2분자와 KIF5s (KIF5A, KIF5B와 KIF5C)의 줄기영역과 결합하는 단쇄(KLC) 2분자로 구성되어 있다. KIF5A의 결합 단백질을 동정하기 위하여 효모 two-hybrid system을 사용하여 특이적으로 결합하는 heterotrimeric G 단백질의 ${\beta}$ 단위체 단백질($G{\beta}$)을 분리하였다. $G{\beta}$은 KIF5A의 808에서 935아미노산 부위와 결합하며, 다른 KIF5들과도 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. 또한 $G{\beta}$의 WD40 반복 서열은 KIF5A와의 결합에 필수영역임을 확인하였으며, 이러한 단백질간의 결합은 Glutathione S-transferase (GST) pull-down assay를 통하여 확인하였다. 생쥐의 뇌 파쇄액에 KIF5들의 항체로 면역침강을 행하여 heterotrimeric G 단백질을 확인한 결과, KIF5들은 heterotrimeric G 단백질과 특이적으로 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 kinesin-I는 heterotrimeric G 단백질이 포함된 소포를 미세소관을 따라 이동시킴을 시사한다.

향신료의 활성산소 포촉인자

  • 정신교
    • 한국식품저장유통학회:학술대회논문집
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    • 한국식품저장유통학회 1993년도 정기총회 및 제3차 학술발표회
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    • pp.10-11
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    • 1993
  • 기저상태의 산소분자는 비교적 안정하지만 생체ㅇ내외에서 물리적, 화학적으로 활성화 되어 $O_{2}$, $^{1}O_{2}$, OH, $H_{2}O_{2}$ 등의 활성산소종을 생성하며, 생체의 지질, 단백질, 핵산 당등의 분자에 산화적 상해를 초래하여 노화, 암, 순환기, 호흡기 게통의 질환과 식품의 품질열화에 관여하는 것으로 알려져 있다. 따라서 본인은 식품의 맛, 향기, 색 등을 부여하는 고유의 기능 외에도 방부제, 한방약으로 널리 이용되고 오고 있는 51종의 향신료를 대상으로 활성산소포촉활성을 조사하고 나아가 활성물질을 분리, 정제 및 동정함으로 향신료의 새로운 기능을 밝히고 신약 개발의 기초적 자료를 제시하고저 한다. Fenton 반응을 이용하여 2-deozyribose 산화법과 sodium benzoic acid 수산화법으로 51종의 향신료의 OH 포촉활성을 검색한 결과, Cruciferae과의 nustard 류, Labiatae과의 thyme, saga, savory, oregano, Myrtaceae과의 clove, allspice 가 1ug/ml 농도에서 50%이상의 포촉활성을 나타내었으며 그중 mustard 류는 같은 농도에서 거의 90%이상의 활성을 나타내었다. 활성물질의 분리 및 정제는 Amberlite XAD-2 갈럼과 preparative-HPLC를 이용 하였으며, EI, FAB-MS, IR, $^{1}H$, $^{13}C-NMR$, Cosy-NMR로 그 화학적 구조를 동정하였다. Brown mustard에서 동정된 4-hydroxy-3,5-dimethoxy cinnamic acid Methyl ester는 0.42$\mu$ mol 농도에서 90% 이상의 OH 포촉활성을 나타내어 이를 diazomethane 반응으로 조제하였으며 white mistard에서는 4-hydroxy-3,5-dimethoxy cinnamoyl choline을 동정하였다.

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큐어링 후 저장에 따른 고구마 저장뿌리 단백질체의 비교분석 (Comparative proteome profiling in the storage root of sweet potato during curing-mediated wound healing)

  • 신호용;지창윤;김호수;정정성;최성환;곽상수;김윤희;이증주
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제50권
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    • pp.1-10
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    • 2023
  • 고구마(Ipomoea batatas L. Lam)는 영양소, 가공 식품, 동물 사료 및 색소 재료의 유용한 공급원으로 이용 가능한 경제적으로 중요한 대표적인 뿌리 작물이다. 일반적으로 고구마의 저장 뿌리는 수확 후 저장 기간 동안 다양한 미생물과 질병에 의한 부패에 노출되기 쉽다. 수확 후 큐어링은 저장기간 동안 상처를 치유하고 미생물에 의한 부패를 방지하기 위한 가장 적합한 수단으로 알려져 있다. 본 연구에서는 큐어링과 연관된 분자적 기작에 관여하는 단백질들을 확인하기 위해, 큐어링 처리 후 저장기간 동안 단백질체의 변화를 분석하였다. 33℃ (큐어링) 및 15℃ (대조군)에서 3일 동안 처리하고 8주의 저장 기간이 지난 후 2D 전기영동 분석을 통해 단백질 spot의 변화를 확인한 결과, 31개 단백질 spot의 발현량이 차이 나는 것을 확인하였으며, 이들 중 15개의 단백질 spot을 동정하여 그 특성을 분석하였다. 동정된 단백질 중 alphaamylase (spot 1)는 큐어링 처리구에서만 발현량이 증가하였으며, probable aldo-keto reductase 2-like (spot 3) 및 hypothetical protein CHGG_01724 (spot 4)는 큐어링 및 대조구에서 동시에 발현량이 증가하였으나, sporamin A (spot 10)는 큐어링 및 대조구에서 발현량이 감소하였다. 한편, 대조구에서 enolase (spot 14)는 발현량이 증가하였으나, chain A of actinidin-E-64 complex+ (spot 19), ascorbate peroxidase (spot 22) 및 여러 sporamin 단백질들(spot 20, 21, 23, 24, 27, 29, 30 및 31)은 발현량이 감소하였다. 본 연구의 결과는 고구마 저장 뿌리에서 큐어링 처리와 관련된 단백질의 동정 및 수확 후 저장 기간동안 병 저항성과 관련된 기작에 대한 이해를 높이며, 향후 저온 저장 능력이 향상된 신품종 개발을 위한 후보 유전자의 도출에도 기여할 수 있을 것이다.

탄저 치사독소 처리에 의한 생쥐 대식세포의 단백질체 발현 양상 분석 (Proteome Profiling of Murine Macrophages Treated with the Anthrax Lethal Toxin)

  • 정경화;서귀문;김성주;김지천;오선미;오광근;채영규
    • 미생물학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.262-268
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    • 2005
  • 탄저 치사독소는 생쥐 대식세포 (RAW 264.7)의 유전자 발현에 많은 변화를 초래한다. 이들 변화를 초래하는 치사독소의 역할은 아직 확실하게 밝혀지지 ???았다. 본 연구에서는, 치사독소가 처리된 생쥐 대식세포의 단백질 프로파일을 이차원 전기영동으로 분석하였고, MALDI-TOF 질량분석기를 사용하여 해당 단백질의 질량을 측정하였다. 펩타이드 질량 분석 데이터는 ProFound 데이터베이스를 이용하여 동정하였다. 차별화되어 발현된 단백질 중에서 절단된 mitogen-activated protein kinase kinase (Mek1)와 glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD)가 치사독소 처리된 대식세포에서 각각 증가하였다. 치사독소를 처리하였을 경우, Mek1의 절단은 신호전달과정을 방해하고, 증가된 G6PD는 생성된 활성산소로부터 세포를 보호하는 역할을 하는 것으로 보인다. 단백질체 분석기술은 치사독소처리에 의한 생쥐 대식세포의 세포사멸 관련 단백질을 동정하는데 도움을 주어, 치사독소의 잠정적인 기질을 찾는데 유용할 것이다.

Methylisothiocyanate를 이용한 아미노산 배열결정시 N(O)-butyldimethylsilyl 유도체로서의 methylthiohydantoin 아미노산의 기체 크로마토그래피에 의한 분석 (Gas-chromatographic determination of methylthiohydantoin amino acid as N(O)-butyldimethylsilyl derivatives in amino acid sequencing with methylisothiocyanate)

  • 우강융
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제35권2호
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    • pp.132-138
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    • 1992
  • Methylisothiocyanate에 의한 단백질의 아미노산 배열 결정시 순차적으로 분리되어 나오는 methylthiohydantion 아미노산을 기체 크로마토그라피로 효과적으로 정성 및 정량하기위하여 새로운 silylating reagent인 N-methyl-N-(tert.-butyldimethylsily)trifluoroacetamide를 사용하여 N-tert.-butyldimethylsily MTH 유도체로 silylation 한 후 HP-1 capillary column으로 분석하였다. Cystine을 제외한 21개의 단백질 구성 아미노산을 동정할 수 있었고 지금까지 packed column에서 TMS 유도체로 동정할 수 없었던 arginine도 분리 동정되었다. 2개 이상의 peak를 나타낸 것으로는 hydroxyproline, proline, isoleucine, glycine 및 tyrosine이었고 이중 hydroxyproline은 많은 수의 peak들로 분리되었다. Lysine, histidine 및 arginine은 주입량 $5.0\;nmole{\sim}15.0\;nmole$의 범위에서 나머지는 $2.5\;nmole{\sim}7.5\;nmole$의 범위에서 상관관계를 측정한 결과 고도의 직선 상관관계를 나타내었다(p<0.001). TMS 유도체에 의한 분석은 많은 불순 peak들 때문에 정량분석에 이용할 수 없었다.

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Anti-Phosphoserine/Phosphothreonine/Phesphotyrosine Antibody Immunoaffinity Column Chromatography를 이용한 Streptomyces griseus의 인산화 단백질 동정 (Identification of Protein Kinases by Anti-phosphoserine/Phosphothreonine/Phosphotyrosine Antibody Immunoaffinity Column Chromatographies in Streptomyces griseus.)

  • 정용훈;김종희
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제35권2호
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    • pp.112-117
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    • 2007
  • Protein kinase는 진핵생물과 원핵생물을 포함하는 모든 생명체에서 세포생존에 절대적으로 중요한 조절 기능을 담당한다. 일반적으로 원핵생물은 histidine 과 aspartic acid kinase로 구성된 bacterial two-component regulatory system에 의하여 환경변화에 따른 유전자의 발현이 조절되지만, 방선균을 비롯한 고등 원핵생물에서는 진핵생물성의 serine/threonine kinase들이 세포분화와 같은 분화과정을 조절하고 있다. Streptomycin 생산균인 Streptomyces griseus 균주에서도 다양한 serine/threonine kinase들이 존재하는 것으로 추정되며, 이들의 기능을 밝히는 것은 생명현상을 이해하는 중요한 열쇠를 제공해 줄 것으로 기대된다. 따라서, S. griseus로부터 protein kinase 를 동정하는 연구를 실시하였으며, 기존의 복잡한 chromatography법의 단점을 보완하기 위해 anti-phosphothreonine, anti-phosphoserine, anti-phosphotyrosine antibody를 이용한 immunoaffinity column chromatography 방법을 도입하였다. 실험 결과 약 14, 29, 31, 35, 40, 52, 56, 60 kDa의 단백질을 효과적으로 동정 할 수 있었으며, nonradioactive protein kination assay 방법으로 이들의 인산화능을 확인하였다.

콩나물 제조중(製造中) 질소화합물(窒素化合物)의 변화(變化)와 그 영양학적(營養學的) 연구(硏究) -제육보(第六報). 단백질(蛋白質)의 전기영동양상변화(電氣泳動樣相變化)- (Changes of Nitrogen Compounds and Nutritional Evaluation of Soybean Sprout -Part VI. Changes in electrophoretic pattern of protein-)

  • 양차범;박상기;윤석권;박훈
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제27권2호
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    • pp.129-134
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    • 1984
  • 콩나물을 온도별로 길러 생장과정별 단백질조성을 7.5% polyacryl amide gel 전기영동법으로 조사하고 조제표품단백질의 그것으로 동정하였다. 원료대두(大豆)에서는 주(主) band 5개(a,b,c,d 및 p)와 미소 band 10개가 나타났고 4일자자엽(日字子葉)에서는 8개의 주(主) band와 (o band포함)와 11개 미소 band로 최고 band수(數)를 보였다. 배축(胚軸)에서는 자엽(子葉)에서 발견(發見)되는 band들이 모두 나타났으나 분리(分離)가 선명치 못하였다. 생육이 경과함에 따라 자엽(子葉)에서는 a band가 먼저, b,c,d band가 다음으로 감소해 갔으며 미소 band o+p는 6일(日)까지 증가하다 그후 감소하였다. 배축(胚軸)에서는 모든 band가 계속 증가하였는데 미소 band와 b+c+d가 증가속도가 컸다. a band는 7S, b+c+d는 11S, o+p는 2S globulin으로 동정되었다. 생육온도가 높아짐에 따라 자엽(子葉)에서의 감소와 배축(胚軸)에서의 증가속도가 빨라졌으며 7S보다 11S가 촉진되었다.

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Yeast two-hybrid system을 이용한 Ref-1 (redox factor-1) 결합 단백질의 분리 및 동정 (Detection of Ref-1 (Redox factor-1) Interacting Protein Using the Yeast Two-hybrid System)

  • 이수복;김규원;배문경;배명호;정주원;안미영;김영진
    • 생명과학회지
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    • 제14권1호
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    • pp.26-31
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    • 2004
  • 본 연구는 redox regulator로 알려 진 Ref-1 (Redox factor-1)과 결합하는 새로운 단백질을protein-protein interaction의 원리를 이용한 방법인 yeast two-hybrid assay로 검색, 동정하고, 검색된 단백질의 in vitro, in vivo 기능을 규명하는 데 그 목적을 두고, mouse 11-day Embryo cNA library를 prey로, full length REF-1을 bait로 하여 yeast strain 인 HF7C에 cotransformatiom시킨 후 histidine, leucine, tryptophan이 결핍된 SD plate에서 키워 자란 yeast transformants를 $\beta$-galactosidaseassay하여 screening하여 분리한 세 개의 clone중 한 clone이 DNA sequencing으로 확인한 결과 mouse thioredoxin임을 확인하였다.