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Selection of optimal protein domains for DNA repair inhibition in cancer cells based on bioinformatics (생물정보학 기반 암세포 내 DNA 복구 저해를 위한 최적 단백질 도메인 선정)

  • Jo, Si Hyang;Kim, Hak Yong
    • Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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    • 2016.05a
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    • pp.185-186
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    • 2016
  • 최근 DNA 복구 기작 저해가 암 전이를 억제한다는 연구결과가 발표되었다. 이번 연구에서는 DNA 복구 기작을 효율적으로 저해시킬 수 있는 단백질을 선정하고자 했다. 먼저 HPRD에서 59개의 DNA repair 단백질 정보를 얻고 각각의 도메인 정보를 추출하였다. 이 단백질과 상호작용하는 단백질을 KEGG로 부터 추출하고 추출한 단백질의 도메인 정보는 HPRD에서 얻었다. Cytoscape를 통하여 DNA 복구 단백질-상호작용 단백질-도메인의 네트워크를 시각화하였다. 네트워크 상에서 보존적이며 핵심적인 단백질 후보 및 도메인 후보를 선정 하였다. KEGG에서 제공하는 암의 경로(pathways in cancer)을 이용하여 후보의 적용 가능성을 확인하였다. 선정한 최종 후보들은 향후 암 전이 억제에 사용될 수 있는 타깃이 될 수 있을 것으로 기대한다.

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Mechanisms of Adsorption with Respect to Sulfate Mobility in Multispecies Systems of Soils (토양의 다중이온체계내에서의 황산이온의 이동을 고려한 흡착기작)

  • Chung, Doug Young
    • Korean Journal of Agricultural Science
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    • v.27 no.2
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    • pp.135-140
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    • 2000
  • The mobility of sulfate in soils defends on several factors including redox potential, soil mineralogy, pH, and the presence of other anions that compete for sorption sites with sulfate. The proposed model of adsorption mechanism for sulfate postulated that reaction is between anions in solution and charged surfaces of soil particles. With appropriate choice of parameters obtained from the adsorption-desorption experiments, the equation of transport model adapt an empirical approach, capable of handling most general equilibrium adsorption isotherms, suitable for multispecies systems.

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A Study on the Risk Impact Map Development of Considering the Debris flow Hazard and Impact Level (토석류 발생가능성 및 시설안전성을 고려한 토석류 위험지도작성에 관한 연구)

  • Nam, Dong Ho;Lee, Suk Ho;Kim, Byung Sik
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2019.05a
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    • pp.296-296
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    • 2019
  • 전 세계적으로 기후변화로 인한 국지성 집중호우 및 태풍으로 인한 피해가 지속적으로 발생하고 있으며, 그에 따른 2차 피해인 산사태 및 토석류 피해 또한 증가하고 있는 추세이다. 최근 국내의 산사태 및 토석류에 대한 선행연구는 지속적으로 수행되고 있으나, 산사태 및 토석류 위험성이 높은 구간, 즉, 발생기작을 판단할 수 있도록 지표화 해놓은 것이며, 현재 피해예측지도 및 피해 하류부의 시설물을 고려한 연구는 미비한 실정이다. 따라서 본 연구에서는 강우-유출모형인 S-RAT모형 및 토석류 수치해석 프로그램 RAMMS 모형을 이용하여 산사태 및 토석류 피해를 극대화 시키는 인자인 토석유동심(H), 토석유속(V)을 이용하여 토석류피해예측지도를 작성하였으며, 피해 하류부의 시설물을 건물 유형별 시설물의 중요도로 구분하였다. 또한 작성된 피해예측지도 및 시설물 중요도를 중첩하여 위험성 지도를 제시하였다.

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