• Title/Summary/Keyword: 결합 알고리즘

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Fragment Combination From DNA Sequence Data Using Fuzzy Reasoning Method (퍼지 추론기법을 이용한 DNA 염기 서열의 단편결합)

  • Kim, Kwang-Baek;Park, Hyun-Jung
    • Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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    • v.10 no.12
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    • pp.2329-2334
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    • 2006
  • In this paper, we proposed a method complementing failure of combining DNA fragments, defect of conventional contig assembly programs. In the proposed method, very long DNA sequence data are made into a prototype of fragment of about 700 bases that can be analyzed by automatic sequence analyzer at one time, and then matching ratio is calculated by comparing a standard prototype with 3 fragmented clones of about 700 bases generated by the PCR method. In this process, the time for calculation of matching ratio is reduced by Compute Agreement algorithm. Two candidates of combined fragments of every prototype are extracted by the degree of overlapping of calculated fragment pairs, and then degree of combination is decided using a fuzzy reasoning method that utilizes the matching ratios of each extracted fragment, and A, C, G, T membership degrees of each DNA sequence, and previous frequencies of each A, C, G, T. In this paper. DNA sequence combination is completed by the iteration of the process to combine decided optimal test fragments until no fragment remains. For the experiments, fragments or about 700 bases were generated from each sequence of 10,000 bases and 100,000 bases extracted from 'PCC6803', complete protein genome. From the experiments by applying random notations on these fragments, we could see that the proposed method was faster than FAP program, and combination failure, defect of conventional contig assembly programs, did not occur.

Efficient Multiple Joins using the Synchronization of Page Execution Time in Limited Processors Environments (한정된 프로세서 환경에서 체이지 실행시간 동기화를 이용한 효율적인 다중 결합)

  • Lee, Kyu-Ock;Weon, Young-Sun;Hong, Man-Pyo
    • Journal of KIISE:Databases
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    • v.28 no.4
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    • pp.732-741
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    • 2001
  • In the relational database systems the join operation is one of the most time-consuming query operations. Many parallel join algorithms have been developed 개 reduce the execution time Multiple hash join algorithm using allocation tree is one of the most efficient ones. However, it may have some delay on the processing each node of allocation tree, which is occurred in tuple-probing phase by the difference between one page reading time of outer relation and the processing time of already read one. This delay problem was solved by using the concept of synchronization of page execution time with we had proposed In this paper the effects of the performance improvements in each node of the allocation tree are extended to the whole allocation tree and the performance evaluation about that is processed. In addition we propose an efficient algorithm for multiple hash joins in limited number of processor environments according to the relationship between the number of input relations in the allocation tree and the number of processors allocated to the tree. Finally. we analyze the performance by building the analytical cost model and verify the validity of it by various performance comparison with previous method.

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De-interlacing Algorithm based on Motion Compensation Reliability (움직임 보상의 신뢰도에 기반 한 순차주사화 알고리즘)

  • Chang, Joon-Young;Kim, Young-Duk;Kang, Moon-Gi
    • Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea SP
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    • v.46 no.6
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    • pp.102-111
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    • 2009
  • In this paper, we propose a de-interlacing algorithm that combines a motion compensation (MC) method and the vertical-temporal filter with motion compensation (MC V-T filter) according to motion compensation reliability. The MC method represent one of the best ways of improving the resolution of de-interlaced frames, but it may introduce motion compensation artifacts in regions with incorrect motion information. In these regions, the MC V-T filter that is very robust to motion vector errors can be used to correct motion compensation artifacts. The combination between two methods is controlled by the motion compensation reliability that is measured by analyzing the estimated motion vectors and the results of MC. The motion compensation reliability contains information about motion compensation artifacts of MC results and determines the combination weight according to this information. Therefore, the combination rule of the proposed method is more accurate than those of the conventional methods and it enables the proposed method to provide high quality video sequences without producing any visible artifacts. Experimental results with various test sequences show that the proposed algorithm outperforms conventional algorithms in terms of both visual and numerical criteria.

An Efficient Concurrency Control Scheme for Multi-dimensional Index Sturctures (다차원 색인구조를 위한 효율적인 동시성 제어기법)

  • 김영호;송석일;이석희;유재수
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2000.04b
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    • pp.131-133
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    • 2000
  • 이 논문에서는 다차원 색인 구조에서 질의를 지연시키는 주된 요인인 노드 분할연산과 MBR(Minimun Bounding Regions)변경 연산에 대해 효율적으로 대처하는 동시성 제어 기법을 제안한다. 분할 시 탐색이 지연되는 시간을 최소화 하기 위해 대부분의 과정에서 질의와 호환되는 공유 래치를 획득한 후 수행하고 분할이 발생된 노드에 엔트리들이 복사되는 동안만 배타 래치를 획득하는 방법을 사용한다. MBR 변경 연산의 동시성을 높이기 위해 부분적인 잠금 결합을 사용한다. 즉, MBR 변경 연산중 주로 발생되는 MBR이 증가되는 삽입연산은 잠금 결합을 수행하지 않고, 감소되는 삭제 연산만 잠금 결합을 수행한다. 또한 성능 평가를 통하여 제안된 동시성 제어 기법이 GiST의 동시성 제어 알고리즘에 비해 처리율 관점에서 성능이 우수함을 보인다.

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An Interactive Molecular Modeling Using a Motion Path Prediction on a Distributed Processing System (분산 처리 기반의 사용자 입력 예측을 이용한 분자 모델링 시뮬레이션 도구의 상호작용 시스템)

  • Kim Bosoon;Kim Jee-In
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2005.11b
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    • pp.256-258
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    • 2005
  • 분자모델링 시뮬레이션 도구는 신 물질과 신약개발을 위한 가상 실험을 하는데 사용되는 중요한 도구이다. 이 도구는 분자 물질간의 결합을 통하여 에너지 계산을 하여 가장 낮은 에너지 준위를 보여주는 위치를 탐색한다. 에너지 결과를 빠르게 제공하면 사용자가 분자 물질을 결합하여 안정된 위치를 찾는데 많은 도움을 줄 수 있다. 본 연구에서는 에너지 계산을 고성능으로 처리 할 수 있는 분산처리시스템과 실시간 응답성 보장 스케줄링 알고리즘을 적용한 환경에 사용자 입력 예측 시스템을 추가하여 에너지 계산을 기존 시스템 보다. 빠르게 요청하였으며, 에너지 계산 결과의 응답성을 향상 시켰다. 또한 사용자 입력 예측시스템에서 발생하는 오차의 문제를 예측 시스템의 운영 방식을 통해 해결 방법을 제시하고 있다. 본 연구는 에너지 결과의 응답성 보장을 통하여 사용자가 좀 더 빠르게 안정된 결합 위치를 찾도록 도와준다.

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Analysis of Magnetic field with Line Source by Coupling FEM and Analytical Solution (유한요소법과 해석해의 결합에 의한 선전류 문제의 해석)

  • Cho, Jin-Seok;Kim, Young-Sun;Lee, Ki-Sik
    • Proceedings of the KIEE Conference
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    • 2004.10a
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    • pp.55-59
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    • 2004
  • 유한요소법을 이용하여 전자장을 해석할 경우 전류원이 전 영역에 비해 극히 작은 영역이면, 요소분할 과정에서 소스부분을 세분하여야 하므로 결국 미지수의 증가를 가져오게 된다. 또한, 선전류 문제의 경우 2차원 유한 요소 해석이 용이하지 않다. 이를 보안하기 위해 본 논문에서는 소스가 선전류이고 관심 영역이 선전류원으로부터 떨어져 있는 경우, 소스 영역은 해석해를 적용하여 유한요소법과 결합하는 방법을 제시하였다. 해석적인 해는 원통좌표계에서 반정에 대한 멱함수와 회전각도에 대한 삼각함수의 곱의 형태로 표현된다. 이때 두 종류의 적분 상수가 있는데, 이는 경계상의 포텐셜값과 유한요소법의 경계 적분항을 푸리에급수로 전개한 계수로 표현된다. 제안한 알고리즘의 검증을 위하여 해석해가 존재하는 모델을 설정하여 해석적인 방법, 기존의 유한요소 법 및 결합 방법에 의한 해를 비교 검증하였다.

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Development of a Global Simulator and Databases for Semiconductor Etching Processes (반도체 식각 공정용 공간 평균 시뮬레이터 및 데이터베이스 개발)

  • Gwon, Deuk-Cheol;Lee, Se-A;Jang, Won-Seok;Song, Mi-Yeong;Yun, Jeong-Sik;Yu, Dong-Hun;Kim, Dae-Ung;Yu, Sin-Jae;Im, Yeon-Ho
    • Proceedings of the Korean Institute of Surface Engineering Conference
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    • 2013.05a
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    • pp.65-66
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    • 2013
  • 최근 개발된 수치해석 알고리즘 및 RF sheath 모델을 적용하여 반도체 식각 공정용 공간 평균 시뮬레이터를 개발하였다. 개발된 시뮬레이터는 전자가열 모듈, 수송 모듈, 그리고 RF sheath 모듈로 구성된다. 유도결합 플라즈마원에 대한 전자가열모듈은 비충돌 과정인 anomalous skin effect가 포함된 Yoon의 모델을 적용하였고, 축전결합 플라즈마원에 대해서는 RF sheath 모델을 수치적으로 풀어 흡수된 파워를 결정하고 수송 모듈과 일관성을 잃지 않게 결합되었다. RF sheath 모듈에서는 Dai의 collisonless sheath 모듈을 적용하였고 RF 펄싱이 적용될 수 있도록 확장하였다. 특히, 식각 공정에 사용되는 fluorocarbon 플라즈마에 대한 데이터베이스를 개발하였고, 또한 진단 데이터와의 비교를 통해 데이터베이스를 최적화하였다.

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Data Fusion of Network and System Call Data For Efficient Intrusion Detection (효율적인 침입탐지를 위한 네트워크 정보와 시스템 콜 정보융합 방법개발)

  • 문규원;김은주;류정우;김명원
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2004.10a
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    • pp.208-210
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    • 2004
  • 최근 인터넷, 인트라넷과 같은 통신 기술 발전에 따라 거의 모든 시스템이 서로 연결되었고, 사용자들은 손쉽게 정보를 공유할 수 있게 되었다. 따라서 시스템 침입을 통한 데이터의 변형과 인증 받지 않은 접근과 같은 컴퓨터 범죄가 급속도로 증가하고 있다. 그러므로 이러한 컴퓨터 범죄를 막기 위한 침입 탐지 기술 개발은 매우 중요하다. 전통적인 침입 탐지 모델은 단지 네트워크 패킷 데이터만을 사용하고 있으며. 침입탐지 시스템의 성능을 높이기 위해 서로 다른 분류 알고리즘을 결합하는 방법을 사용해왔다. 그러나 이러한 모델은 일반적으로 성능향상에 있어서 제한적이다. 본 논문에서는 침입탐지 시스템의 성능을 개선하기 위해 네트워크 데이터와 시스템 콜 데이터를 융합하는 방법을 제안하였으며. 데이터 융합 모델로서 Multi-Layer Perceptron (MLP)를 사용하였다. 그리고 DARPA 에서 생성한 네트워크 데이터와 본 논문에서 가상으로 생성한 시스템 콜 데이터를 함께 결합하여 모델을 생성 한 뒤 실험을 수행하였다. 본 논문에서의 실험결과로. 단순히 네트워크 데이터만을 사용한 모델에 비해 시스템 콜 데이터를 함께 결합한 모델이 훨씬 더 놓은 인식률을 보인다는 것을 확인할 수 있다

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Region-based Image Retrieval Algorithm Using Image Segmentation and Multi-Feature (영상분할과 다중 특징을 이용한 영역기반 영상검색 알고리즘)

  • Noh, Jin-Soo;Rhee, Kang-Hyeon
    • Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea CI
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    • v.46 no.3
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    • pp.57-63
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    • 2009
  • The rapid growth of computer-based image database, necessity of a system that can manage an image information is increasing. This paper presents a region-based image retrieval method using the combination of color(autocorrelogram), texture(CWT moments) and shape(Hu invariant moments) features. As a color feature, a color autocorrelogram is chosen by extracting from the hue and saturation components of a color image(HSV). As a texture, shape and position feature are extracted from the value component. For efficient similarity confutation, the extracted features(color autocorrelogram, Hu invariant moments, and CWT moments) are combined and then precision and recall are measured. Experiment results for Corel and VisTex DBs show that the proposed image retrieval algorithm has 94.8% Precision, 90.7% recall and can successfully apply to image retrieval system.

Feature Filtering Methods for Web Documents Clustering (웹 문서 클러스터링에서의 자질 필터링 방법)

  • Park Heum;Kwon Hyuk-Chul
    • The KIPS Transactions:PartB
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    • v.13B no.4 s.107
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    • pp.489-498
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    • 2006
  • Clustering results differ according to the datasets and the performance worsens even while using web documents which are manually processed by an indexer, because although representative clusters for a feature can be obtained by statistical feature selection methods, irrelevant features(i.e., non-obvious features and those appearing in general documents) are not eliminated. Those irrelevant features should be eliminated for improving clustering performance. Therefore, this paper proposes three feature-filtering algorithms which consider feature values per document set, together with distribution, frequency, and weights of features per document set: (l) features filtering algorithm in a document (FFID), (2) features filtering algorithm in a document matrix (FFIM), and (3) a hybrid method combining both FFID and FFIM (HFF). We have tested the clustering performance by feature selection using term frequency and expand co link information, and by feature filtering using the above methods FFID, FFIM, HFF methods. According to the results of our experiments, HFF had the best performance, whereas FFIM performed better than FFID.