• Title/Summary/Keyword: 거대분자

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Adaptive LOD Rendering for Large-Scale Molecular Models (거대분자 모텔의 적응형 LOD 렌더링 기법)

  • Lee, Jun;Park, Sung-Jun;Kim, Jee-In
    • Journal of the Korea Computer Graphics Society
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    • v.12 no.2
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    • pp.19-25
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    • 2006
  • 정보생물학 분야에 있어서 분자 구조를 3차원으로 렌더링하여 보여주는 것은 매우 중요한 작업이다. 특히 분자의 표면 렌더링은 분자의 3차원 구조 분석 등에 중요하게 사용된다. 그러나 분자 표면 렌더링을 수행하기 위해서는 많은 양의 폴리곤이 필요하게 된다. 대장균 바이러스와 같은 분자량이 많은 거대 분자를 자연스럽게 렌더링 하기 위해서는 고성능이며 고가의 그래픽 전용 워크스테이션을 사용해야 한다. 본 논문에서는 PC급 시스템에서도 거대 분자를 무리 없이 렌더링 할 수 있는 효율적인 알고리즘을 제안 하였다. 제안하는 알고리즘은 사용자의 시점에서 최적의 성능 및 시각적인 기여를 할 수 있는 적응형 상세 단계 렌더링을 수행한다. 제안된 알고리즘을 사용하여 거대 분자 모델의 렌더링시 대화식 프레임 수준이상의 성능향상을 보이며, 또한 시각적으로도 분자 모델이 가진 중요한 기하학적인 특성을 유지 할 수 있다.

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전달체로서의 덴드리머의 응용

  • 최이락;임수훈;안철희
    • Polymer Science and Technology
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    • v.15 no.4
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    • pp.402-410
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    • 2004
  • 덴드리머란 중심 (core) 분자로부터 나뭇가지 모양의 단위구조가 반복적으로 뻗어 나오는 거대분자 화합물이다. 3차원적으로는 구형에 가까운 구조를 가지고 있으며 중심부는 상대적으로 낮은 밀도를 가지는 반면, 외곽으로 갈수록 가지의 밀도가 증가한다. 덴드리머는 구조적으로 잘 정의된 거대분자로써, 정확한 분자량과 구조를 예측하여 합성함으로써 나노 크기 의 입자 형성이 용이하다. 덴드리머의 최외곽에 존재하는 말단기는 덴드리머의 표면 성질 및 용해도 등에 결정적인 영향을 미치는 것으로 알려져 있으며, 표면의 밀집된 말단기에 다양한 유도체와 작용기 도입이 가능하다.(중략)

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Preparation of Silane Dendrimer (Ⅱ) (나무가지꼴 실란 거대분자의 제법 (Ⅱ))

  • Kim, Chungkyun;Park, Eunmi;Kang, Eunju
    • Journal of the Korean Chemical Society
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    • v.39 no.10
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    • pp.799-805
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    • 1995
  • Silane dendrimer with 96 allylic end groups has been synthesized in excellent yield using repetitive alkenylation-hydrosilylation cycles. Each of the two steps provided the products in almost quantitative yields. After a simple chromotograpic purification (silica gel, chloroform), pure dendrimers were obtained and their purity was checked with 1H, 13C NMR spectroscopic method and elemental analysis.

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An Efficient Real-Time Rendering of Large Molecular Models based on GPU (GPU 기반의 효율적인 거대 분자의 실시간 렌더링 기법)

  • Lee, Jun;Park, Sung-Jun;Kim, Jee-In
    • Journal of the Korea Computer Graphics Society
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    • v.11 no.3
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    • pp.19-22
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    • 2005
  • 정보생물학 분야에 있어서 분자 구조를 3차원으로 렌더링하여 보여주는 것은 매우 중요한 작업이다. 특히 분자의 표면 렌더링은 분자의 3차원 구조 분석 등에 중요하게 사용된다. 그러나 분자 표면 렌더링을 수행하기 위해서는 많은 양의 폴리곤이 필요하게 된다. 특히 대장균 바이러스와 같은 분자량이 많은 거대 분자를 자연스럽게 렌더링 하기 위해서는 고가의 그래픽 전용 워크스테이션을 사용해야 한다. 본 논문에서는 저렴한 일반 PC 급 시스템에서도 거대 분자를 무리 없이 렌더링 할 수 있는 효율적인 알고리즘을 제안하였다. 제안하는 알고리즘은 높은 속도와 좋은 화질을 유지할 수 있는 Hybrid Point & Polygon 렌더링 기법이다. 이 알고리즘은 계층적인 자료구조인 옥트리(Octree)를 사용하였으며 최적의 성능을 내기 위하여 GPU가 작업을 처리한다. 제안된 알고리즘의 성능 평가는 일반 PC급에서 수행되었으며 특히 그래픽 카드 2개를 병렬로 연결하여 높은 성능을 낼 수 있는 SLI(Scalable Link Interface) 환경에서 평가를 수행하였다.

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Effective rendering of large molecular models (거대 분자의 효율적인 렌더링 기법)

  • Lee Jun;Park Sungjun;Kim Jee-In
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2005.11b
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    • pp.241-243
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    • 2005
  • 정보생물학 분야에 있어서 분자 구조를 3차원으로 렌더링하여 보여주는 것은 매우 중요한 작업이다. 특히 분자의 표면 렌더링은 분자 구조를 분석 하는데 필요한데, 렌더링을 하는데 있어서 폴리곤이 많이 필요하게 된다. 특히 분자량이 많은 거대 분자를 3차원으로 렌더링 하기 위해서는 고가의 그래픽 전용 워크스테이션을 사용하게 된다. 본 논문에서는 저렴한 일반 PC 급 시스템에서도 거대 분자를 렌더링 할 수 있는 알고리즘을 제안 하였다. 제안하는 알고리즘에는 옥트리(Octree)를 전처리로 사용한 Hybrid Point & Polygon 렌더링 기법을 적용 하였다. 각 렌더링 과정은 최적의 성능을 내기 위하여 GPU가 작업을 처리한다.

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Preparation and Termination of Carbosilane Dendrimer Based on Siloxane Tetramer (실옥산테트라머를 이용한 나뭇가지꼴 실란거대분자의 제조와 정지반응)

  • Kim, Chung Kyun;Park, Eun Mi
    • Journal of the Korean Chemical Society
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    • v.42 no.3
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    • pp.277-284
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    • 1998
  • Dendritic macromolecules of the first to fourth generation were synthesized, using alkenylation and hydrosilation cycles with allylmagnesium bromide and dichloromethylsilane as building blocks and siloxane tetramer $(Me(CH_2=CH)SiO)_4$, as core molecule. By the reaction of the dichloromethylsilyl-capped generation (G4P) with p-bromophenol, p-phenylphenol and lithium phenyethynylide, dendrimers with specific functions (G4P-BP (Mw: 16,300), G4P-PP (16,121), and CAP-PA (11,764)) have been produced. Analysis of new dendrimers by NMR, UV and MALD1 mass spectrometry suggests that they are pure and unified.

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Removal of Co++ Ion in the Hollow Fiber Ultrafiltration System using Anion Surfactant Micellar Enhancement (음이온 계면활성제 미셀형성을 이용한 중공사 한외여과막 시스템에서의 코발트(Co)이온 제거)

  • Yang, Hyun-Soo;Han, Kwang-Hee;Choi, Kwang-Soon
    • Applied Chemistry for Engineering
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    • v.7 no.1
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    • pp.109-117
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    • 1996
  • Removal of metal ions on the ultrafiltration membrane with micellar-enhanced with anion surfactants is a recently developed technique which can remove heavy metals and small molecular weight ions from wastewater with simple separation process and without a phase change. Above a certain concentration, so called the critical micelle con binding cationic cobalt ions and anionic surfactants, were removed by ultrafiltration membrane. The transmembrane pressure difference had a relatively small effect on the rejection coefficient of metal ions on the ultrafiltration membrane whereas the level of anionic surfactant-to-metal ratio (S/M) had a substantial effect.

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STM Study of Low Dimensional Nanostructures Formed by Adsorption of Dipyrromethane-trimer Molecules on Graphite Surface (흑연 표면에 형성된 dipyrromethene-trimer 분자의 저차원 나노구조의 주사 터널링 현미경 연구)

  • Son, S.B.;Lee, S.J.;Hahn, J.R.;Shin, J.Y.;Dolphin, D.
    • Journal of the Korean Vacuum Society
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    • v.17 no.5
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    • pp.375-380
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    • 2008
  • We have investigated the low-dimensional nanostructures produced by adsorption of triangular Co coplexed dipyrromethane(DPM-trimer, Fig. 1) on graphite surface by using scanning tunneling microscope. DPM-trimer deposition on the graphite surface leads to the formation of long 1-D molecular wires and 2-D hexagonal patterns. We analyzed the heights and structures of 1-D molecular wires and 2-D hexagonal patterns. The 1-D molecular wires were formed 'edge-on' alignments on graphite surface result of continuos $\pi-\pi$ stacking interactions. The other case of 2-D hexagonal patterns were formed 'face-on' alignments on graphite surface.

Study on the separation of large ionic-molecules by electrofiltration (전기여과에 의한 거대이온성 분자체 분리현상연구)

  • Park Young-Gyu
    • Journal of the Korean Electrochemical Society
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    • v.1 no.1
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    • pp.18-23
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    • 1998
  • Theoretical model has been derived in the electrophoretic separation system where an electric potential is applied to the system in the axial direction. The effect of electrophoretic convection in the polymeric media is significantly contributed to separate large ionic-molecules because the conformation of large ionic-molecule quickly orients in the field direction. The dependence of the transport in the polymeric media upon field intensity and molecular size aids in understanding the transport of large ionic-molecule in the system, since the convective velocity of large ionic-molecule is accelerated inside a porous material. The separation of two different large ionic-molecules is predicted with a value of $(Pe_t/Pe_g)$ of individual large ionic-molecule using an operator and the reptation theories.