• 제목/요약/키워드: (P, Q)-number

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Attenuated Secretion of the Thermostable Xylanase xynB from Pichia pastoris Using Synthesized Sequences Optimized from the Preferred Codon Usage in Yeast

  • Huang, Yuankai;Chen, Yaosheng;Mo, Delin;Cong, Peiqing;He, Zuyong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권3호
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    • pp.316-325
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    • 2012
  • Xylanase has been used extensively in the industrial and agricultural fields. However, the low-yield production of xylanase from native species cannot meet the increasing demand of the market. Therefore, improving the heterologous expression of xylanase through basic gene optimization may help to overcome the shortage. In this study, we synthesized a high-GC-content native sequence of the thermostable xylanase gene xynB from Streptomyces olivaceoviridis A1 and, also designed a slightly AT-biased sequence with codons completely optimized to be favorable to Pichia pastoris. The comparison of the sequences' expression efficiencies in P. pastoris X33 was determined through the detection of single-copy-number integrants, which were quantified using qPCR. Surprisingly, the high GC content did not appear to be detrimental to the heterologous expression of xynB in yeast, whereas the optimized sequence, with its extremely skewed codon usage, exhibited more abundant accumulation of synthesized recombinant proteins in the yeast cell, but an approximately 30% reduction of the secretion level, deduced from the enzymatic activity assay. In this study, we developed a more accurate method for comparing the expression levels of individual yeast transformants. Moreover, our results provide a practical example for further investigation of what constitutes a rational design strategy for a heterologously expressed and secreted protein.

관악산의 식생구조 특성과 변화 연구 (A Study on the Characteristics and Changes of Vegetation Structure of the Plant Community in Mt. Kwanak)

  • 장재훈;한봉호;이경재;최진우;노태환
    • 한국환경생태학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.344-356
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    • 2013
  • 본 연구는 관악산 산림의 식물군집동태를 22년간(1972~1993년) 모니터링 한 연구의 연속된 연구이다. 이에 도시환경변화에 따른 관악산 산림의 식생구조 변화실태를 분석하여 향후 도시림 관리의 기초자료를 제공하고자 하였다. 지난 39년간(1972~2010년) 평균기온은 약 $1.1{\sim}1.7^{\circ}C$ 이상 상승하였고, 토양 산성화(pH $5.40{\rightarrow}4.50$)와 $K^+$($0.67{\rightarrow}0.25$), $Ca^{{+}{+}}$($3.20{\rightarrow}0.87$) 함량의 감소경향이 뚜렷하였다. DCA에 의하여 분류된 군집유형의 상대우점치와 흉고직경급별 분석결과 추정되는 천이경향은 39년간 신갈나무에서 멈춰 있었고, 향후 천이계열은 신갈나무에서 유지되거나 소나무${\rightarrow}$신갈나무, 상수리나무${\rightarrow}$졸참나무로 예측되었다. 관악산 산림에 생육하는 수목의 규격은 증가하였지만 종수 및 개체수는 39년간 감소하는 경향을 보였으며, 도시환경 변화 지표종인 때죽나무와 팥배나무의 세력은 지속적으로 증가하였다. 지난 39년간의 토양 산성화, $K^+$, $Ca^{{+}{+}}$, $Mg^{{+}{+}}$ 감소가 도시 외곽 도시림인 관악산 식생구조의 쇠퇴에 영향을 미친 것으로 나타났다.

래버린스 위어를 이용한 침사지 내 침전효율 개선 (Improvement of Sedimentation Rate in the Settling Basin by Labyrinth Weir)

  • 조훈식;여창건;임장혁;이승오
    • 대한토목학회논문집
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    • 제32권3B호
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    • pp.153-159
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    • 2012
  • 본 연구에서는 기존의 침사지 내부 수공구조물(격벽)로 사용되고 있는 둔턱을 대체하여 일반형 사다리꼴 래버린스 위어 (generic labyrinth weir)와 변형된 형태인 경사형 마루 래버린스 위어(inclined crest labyrinth weir)를 제시하였으며, 래버린스 위어 적용시 발생하는 수리학적 흐름특성을 이용하여 침사지에서 침전율을 개선하고자 하였다. 본 연구에서는 전수두비 (headwater ratio) $H_t/P$, 와 확폭비(magnification ratio) L/W, 그리고 총 마루길이 당 유입유량 $q_L$을 침전효율의 주요 분석지표로 제시하였으며, 기존의 침사지 형상과 래버린스 위어를 적용한 래버린스 침사지 형상을 제작하여 실험을 수행하였다. 실험결과 래버린스 위어를 적용한 침사지는 확폭비 변화에 따른 전수두비의 변동이 침전효율(%)에 크게 영향을 미치는 것으로 분석되었으며, 래버린스 위어 반복배열수(N)가 2~4개 일 때 침전효율이 개선되는 것으로 분석되었다. 또한 회기분석을 통해 침전효율이 개선되는 유입조건 및 형상은 총 마루길이 당 유입유량이 $q_L{\geq}3.5cm^2/s$인 조건과 확폭비가 $L/W{\leq}3.5$ 인 경우 로 나타났으며, 이러한 침전효율이 개선되는 구간을 도표상으로 표현 및 분석하였다. 본 연구에서 제시한 분석지표를 통해 오탁수 유입량 및 침사지 소요면적 등 설계조건에 따른 적합한 침전효율을 갖는 구조적으로 최적화된 래버린스 침사지의 기초 설계에 활용될 수 있을 것이다.

Efficient Processing of k-Farthest Neighbor Queries for Road Networks

  • Kim, Taelee;Cho, Hyung-Ju;Hong, Hee Ju;Nam, Hyogeun;Cho, Hyejun;Do, Gyung Yoon;Jeon, Pilkyu
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제24권10호
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    • pp.79-89
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    • 2019
  • 본 연구에서는 도로 네트워크에서 k-최원접 이웃 검색을 위한 효율적인 FANS(k-FArthest Neighbor Search) 알고리즘을 제안한다. 양의 정수 k, 질의 객체 q, 일련의 데이터 객체 집합 P가 주어지면, k-최원접 이웃 질의는 질의 객체 q에서 가장 멀리 있는 k개의 데이터 객체를 찾는다. 데이터베이스 분야에서 대부분의 연구는 k-최근접 이웃 질의에 중점을 두고 있어서, k-최원접 이웃 질의라는 중요한 근접 질의유형은 별다른 관심을 받지 못했다. 이 논문에서는 도로 네트워크에서 가장 멀리 있는 이웃을 찾는 문제를 다룬다. 도로 네트워크에서 k-최원접 이웃 질의를 처리하는 연구는 거의 없었다. 도로 네트워크에서 k-최원접 이웃 질의를 처리해야 하는 문제는 최단 경로 거리를 계산하는 횟수를 줄이는 것인데, 이는 도로 네트워크와 유클리드 공간의 질의 처리에서 가장 중요한 차이다. 질의 객체와 데이터 객체 사이의 최단 경로 거리에 대한 중복 계산을 줄이기 위하여 공유 계산 전략을 사용한다. 질의 객체에서 데이터 세그먼트까지 최대 거리를 기반으로 효과적으로 후보군을 제거하는 방법은 제시한다. 마지막으로 실제 도로 지도를 사용한 광범위한 실험을 통해 제시된 방법의 효율성과 확장성을 보여준다.

CONTACT THREE CR-SUBMANIFOLDS OF A (4m + 3)-DIMENSIONAL UNIT SPHERE

  • Kim, Hyang-Sook;Kim, Young-Mi;Kwon, Jung-Hwan;Pak, Jin-Suk
    • 대한수학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.373-391
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    • 2007
  • We study an (n+3)($n\;{\geq}\;7-dimensional$ real submanifold of a (4m+3)-unit sphere $S^{4m+3}$ with Sasakian 3-structure induced from the canonical quaternionic $K\"{a}hler$ structure of quaternionic (m+1)-number space $Q^{m+1}$, and especially determine contact three CR-submanifolds with (p-1) contact three CR-dimension under the equality conditions given in (4.1), where p = 4m - n denotes the codimension of the submanifold. Also we provide necessary conditions concerning sectional curvature in order that a compact contact three CR-submanifold of (p-1) contact three CR-dimension in $S^{4m+3}$ is the model space $S^{4n_1+3}(r_1){\times}S^{4n_2+3}(r_2)$ for some portion $(n_1,\;n_2)$ of (n-3)/4 and some $r_1,\;r_2$ with $r^{2}_{1}+r^{2}_{2}=1$.

Testing the Mediating Effect of Appraisal in the Model of Uncertainty in Illness

  • Kang, Younhee
    • 대한간호학회지
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    • 제33권8호
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    • pp.1127-1134
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    • 2003
  • Background. Although there have been a great number of research studies based on the model of uncertainty in illness, few studies have considered the appraisal portion of model. Purpose. The purpose of this study was to test the mediating effect of appraisal in the model of uncertainty in illness. Additionally, this study aimed to examine the relationships among uncertainty, symptom severity, appraisal, and anxiety in patients newly diagnosed with atrial fibrillation. Methods. This study employed a descriptive correlational and cross-sectional survey design using a face-to-face interview method. Patients diagnosed with atrial fibrillation within the previous 6 months prior to data collection were interviewed by Mishel Uncertainty in Illness Scale-Community Form, appraisal scale, Symptom Checklist-Severity V.3, and State Anxiety Inventory. Results. A total of 81 patients with atrial fibrillation were recruited from two large urban medical centers in Cleveland, Ohio, U.S.A.. Symptom severity was the significant variable in explaining uncertainty ($\beta$=0.34). Individuals with greater symptom severity perceived more uncertainty. Uncertainty was appraised as a danger rather than opportunity, and those with greater uncertainty appraised a greater danger (p<.0l). While the appraisal of opportunity had the negative relationship with anxiety (r=-0.25), the appraisal of danger was positively associated with anxiety (r=0.78). The measure of goodness of fit (Q) of the model was .7863, and the significant test (X$^2$) for the Q was statistically significant (df =3, p<.00l). Accordingly, the overall mediating model of uncertainty in illness was proven not to be fit to the empirical data of patients with atrial fibrillation. Consequently, the mediating effect of appraisal was not supported by the empirical data of this study. Conclusion. The findings of this study were discussed in terms of their relevance compared with those of previous studies or theoretical framework and the plausible explanations on study findings. Lastly, in order to expand the present body of knowledge on uncertainty in illness model, recommendations for the future nursing studies were included.

다방향불규칙파 조파수조의 조파특성에 관한 연구 (A Study on the Wave Generating Characteristics of the Multi-directional Irregular Wave Basin)

  • 손병규;류청로
    • 한국수산과학회지
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    • 제34권6호
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    • pp.705-712
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    • 2001
  • 다방향불규칙파 조파장치를 이용하여 평면수조내의 발생파의 특성과 목표스펙트럼의 재현성 및 대표파의 통계적인 안정과 선형적인 관계를 검토하여 유효조파영역 및 모형구조물의 설치대상 영역을 검정하였다. 주요한 결과를 요약하면 다음과 같다. 다방향불규칙파에 의한 발생파의 특성과 목표스펙트럼의 재현성은 양호한 결과를 얻었으며, 이들 결과로부터 유효조파영역 및 대표적인 파랑의 재현성이 높은 영역을 설정할 수 있었다. 유효조파영역에서 얻어진 관측자료인 대표파는 통계적으로 안정하였으며, spectrum peakedness parameter $Q_p$와 평균 run-length, $Q_p$$U_r$로서 대표파의 선형적인 관계를 나타낼 수 있었다.

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Robust Design for Showerhead Thermal Deformation

  • 공대위;김호준;이승무;원제형
    • 한국진공학회:학술대회논문집
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    • 한국진공학회 2014년도 제46회 동계 정기학술대회 초록집
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    • pp.150.1-150.1
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    • 2014
  • Showerhead is used as a main part in the semiconductor equipment. The face plate flatness should remain constant and the cleaning performance must be gained to keep the uniformity level of etching or deposition in chemical vapor deposition process. High operating temperature or long period of thermal loading could lead the showerhead to be deformed thermally. In some case, the thermal deformation appears very sensitive to showerhead performance. This paper describes the methods for robust design using computational fluid dynamics. To reveal the influence of the post distribution on flow pattern in the showerhead cavity, numerical simulation was performed for several post distributions. The flow structure appears similar to an impinging flow near a centered baffle in showerhead cavity. We took the structure as an index to estimate diffusion path. A robust design to reduce the thermal deformation of showerhead can be achieved using post number increase without ill effect on flow. To prevent the showerhead deformation by heat loading, its face plate thickness was determined additionally using numerical simulation. The face plate has thousands of impinging holes. The design key is to keep pressure drop distribution on the showerhead face plate with the holes. This study reads the methodology to apply to a showerhead hole design. A Hagen-Poiseuille equation gives the pressure drop in a fluid flowing through such hole. The assumptions of the equation are the fluid is viscous-incompressible and the flow is laminar fully developed in a through hole. An equation can be expressed with radius R and length L related to the volume flow rate Q from the Hagen-Poiseuille equation, $Q={\pi}R4{\Delta}p/8{\mu}L$, where ${\mu}$ is the viscosity and ${\Delta}p$ is the pressure drop. In present case, each hole has steps at both the inlet and the outlet, and the fluid appears compressible. So we simplify the equation as $Q=C(R,L){\Delta}p$. A series of performance curves for a through hole with geometric parameters were obtained using two-dimensional numerical simulation. We obtained a relation between the hole diameter and hole length from the test cases to determine hole diameter at fixed hole length. A numerical simulation has been performed as a tool for enhancing showerhead robust design from flow structure. Geometric parameters for the design were post distribution and face plate thickness. The reinforced showerhead has been installed and its effective deposition profile is being shown in factory.

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GnRH Antagonist (Cetrotide) Short Protocol의 임상적 유용성에 관한 연구 (A Study for GnRH Antagonist (Cetrotide) Short Protocol in Controlled Ovarian Hyperstimulation)

  • 김문영;정병준
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제28권4호
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    • pp.265-270
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    • 2001
  • Objective : The aim of this study was to evaluate the outcome the GnRH antagonist (Cetrotide) short protocol in controlled ovarian hyperstimulation comparing with GnRH agonist long protocol. Materials and Method: From July 2000 to November 2001, 26 patients, 28 cycles were performed in controlled ovarian hyperstimulation by GnRH antagonist and GnRH agonist. GnRH antagonist (Cetrotide) was administered in 12 patients (14 cycles, Group 1) and GnRH agonist (Lucrin, Sub Q, Group 2) in 14 patients (14 cycles). Ovulation induction was performed by hMG (Pergonal) in group 1, and by Combo (Metrodine HP + Pergonal) in group 2. We compared the fertilization rate, good quality embryo, and clinical pregnancy rate between the two groups. Student-t test and Chi-square were used to determine statistical significance. Statistical significance was defined as p<0.05. Results: Ovarian hyperstimulation syndrome did not occurred in which estradiol (E2) level was $3874{\pm}809\;pg/ml$ and the number of retrieved oocytes was $18.4{\pm}2.4$. The number of used gonadotropin ampules was significantly decreased in Group 1 (26.0 vs. 33.1, p<0.04). There were no significant difference in the number of preovulatory oocyte ($10.6{\pm}6.9$ vs. $10.0{\pm}6.1$), fertilization rate ($74.8{\pm}23.4$ vs. $72.2{\pm}21.8$), good quality embryo ($58.7{\pm}23.6$ vs. $38.7{\pm}36.6$), and embryo transfer ($4.3{\pm}1.6$ vs. $4.4{\pm}1.6$). Although the age of the group 1 was older than the group 2 (34.4 vs. 30.8), there was no significant difference in clinical pregnancy rate (50.0% vs. 57.1%). Conclusions: We suggest that GnRH antagonist was a safe, effective, and alternative method in the controlled ovarian hyperstimulation, especially in PCOD patients who will be develop the ovarian hyperstimulation syndrome.

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ARIMA모형을 이용한 코로나19 확진자수 예측 (Prediction of Covid-19 confirmed number of cases using ARIMA model)

  • 김재호;김장영
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제25권12호
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    • pp.1756-1761
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    • 2021
  • 2019년 12월경 후베이 우한시에서 발생한 코로나19 바이러스가 점차 줄어드는 듯 보였으나, 2020년 11월, 2021년 6월 기준으로 점차 늘어나고 있으며, 전세계적으로 총 1억 9천 2백만명, 대한민국 기준 총 확진자는 대략 18만4천명으로 추정된다. 이에 따른 대책으로 중앙재난안전대책본부는 사회적 거리두기 4단계를 시행하면서 강력한 대응책을 내고있지만, 델타바이러스등 전염성이 강한 코로나 변이 바이러스가 기승을 부리면서 국내 일일 확진자 수는 1800명대 까지 증가하게 되었다. 그에따라 코로나바이러스의 심각성을 강조하고자 코로나 누적 확진자 수를 ARIMA 알고리즘을 이용해 예측한다. 그 과정에서 추세와 계절성을 제거하기 위해서 차분을 이용하고, MA, AR, 자기상관함수와 편자기상관함수를 이용해 ARIMA에서 p,d,q값을 결정하고 예측한다. 마지막으로 예측값과 실제값을 비교해 얼마나 잘 예측되었는지 평가한다.