• 제목/요약/키워드: $p_n$-sequences

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Occurrence of Bacterial Stem Rot of Ranunculus asiaticus Caused by Pseudomonas marginalis in Korea

  • Li, Weilan;Ten, Leonid N.;Kim, Seung-Han;Lee, Seung-Yeol;Jung, Hee-Young
    • 식물병연구
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    • 제24권2호
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    • pp.138-144
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    • 2018
  • In December 2016, stem rot symptoms were observed on Persian buttercup (Ranunculus asiaticus) plants in Chilgok, Gyeongbuk, Korea. In the early stage of the disease, several black spots appeared on the stem of infected plants. As the disease progressed, the infected stem cleaved and wilted. The causal agent was isolated from a lesion and incubated on Reasoner's 2A (R2A) agar at $25^{\circ}C$. Total genomic DNA was extracted for phylogenetic analysis. Based on the 16S rRNA gene analysis, the isolated strain was found to belong to the genus Pseudomonas. To identify the isolated bacterial strain at the species level, the nucleotide sequences of the gyrase B (gyrB) and RNA polymerase D (rpoD) genes were obtained and compared with the sequences in the GenBank database. As the result, the causal agent of the stem rot disease was identified as Pseudomonas marginalis. To determine the pathogenicity of the isolated bacterial strain, it was inoculated into the stem of healthy R. asiaticus plant, the inoculated plant showed a lesion with the same characteristics as the naturally infected plant. Based on these results, this is the first report of bacterial stem rot on R. asiaticus caused by P. marginalis in Korea.

MPEG system의 DCT변환영역에서 DC성분과 움직임 벡터를 이용한 영상 장면전환 검출기법 (Scene Change Detection Techniques Using DC components and Moving Vector in DCT-domain of MPEG systems)

  • 박재두;이광형
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제4권3호
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    • pp.28-34
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    • 1999
  • 본 논문에서는 DCT 영역에서 DCT블록내의 DC성분과 매크로블록내의 움직임 벡터성분을 이용하여 동영상 장면전환 자동 검출에 관한 방법을 제안한다. 제안하는 방법은 압축된 MPEG 신호열내의 픽쳐 종류와 상관없이 임의의 신호열에서 장면전환을 검출한다. 이를 위해 MPEG 신호열의 DCT 영역에서 픽쳐구성요소의 특징을 이용하여 새로운 비교잣대를 정의하고 움직임 벡터에 예민한 B-picture 의 특성을 이용하여 정확한 장면전환을 검출한다. 이때. I-picture를 가지고 급격한(cut) 장면전환을 검출하고 P. B picture 를 가지고 점진적인(gradual) 장면 전환을 검출한다. 제안한 방법은 다양한 MPEG 신호열에 대하여 시험결과 그 효율성이 우수함을 보인다.

크라프크 펄프 표백의 과산화수소 표백시 첨가제의 이용 (Use of Additive in Peroxide Bleaching with Unbleached Kraft Pulp)

  • 김용식;김세종;윤병호
    • 펄프종이기술
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    • 제32권1호
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    • pp.78-85
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    • 2000
  • Due to environmental proessures there is increasing use of hydrogen peroxide as a total or partial substitute for chlorine based bleaching agents within ECF or TCF sequences. However, to aceive satifactory brightness using peroxide alone, stages having a combination of high temperature, pressure, pH or residence time are required. It may also have negative impact on fiber quality . Therefore, it would be of advantage if vertain means could be found to make hydrogen peroxide more effective in bleacing , via shortening treaction time and allevaiating the need for such forcing reaction conditions. This can be achieve by converting the peroxide in-situ to stronger oxidant through the use of 손 bleach activator. In this study to investigate the influence of additives, such as tetraacetylethylenediamine (TAED) and Molybdate (MO) . addition on peroxide bleaching were carried out. Under alkaline conditions the bleching additives. TAED and Mo. can react H2O2 to form peracetic acid and peroxomolybdate respectively and these generated activators can improve deliginification,. The activators make it possible to bleach the pulp efficiently at low temperature in the range 50 to 7$0^{\circ}C$. Also, addition of TAED and Mo is an environmentally friendly way of enhancing the performance of peroxide bleaching can be incorporated into TCF and ECF sequences.

코드분할 다중통신용 새로운 다진법 코드의 개발 (A New Family of Nonbinary Sequences Having large Complexity For CDMA)

  • Chulki Kim;Dongchan Shin;Sooryong Lee
    • 한국정보보호학회:학술대회논문집
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    • 한국정보보호학회 1991년도 학술발표논문집
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    • pp.134-143
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    • 1991
  • 코드분할 다중통신(Code Division Multiple Access Communication)은 Spread Spectrum 통신의 발전된 형태로서 군사목적상 이동 무선통신(Combat Multiple Communication)을 위해서 최근들어 급속도로 중요시 되고있다. 잘 알려진 바와 같이 두 가지 가장 일반적인 다중통신 방식은 주파수 분할 다중통신방식과 시분할 다중 통신 방식이다. 주파수 분할 다중통신 방식에서는 모든 사용자가 각각 다른 주파수를 사용하여 동시에 신호를 보내고 시분할 다중통신에서는 같은 주파수를 사용하되 시간대를 달리하고 있다. 이 두가지 방식을 결합하여 모든 사용자가 같은 시각과 같은 주파수를 공유하여 통신을 가능케 할 수 있는 방식이 코드분할 다중통신이다. 여기에서 사용자는 각각 고유한 코드를 부여받는다. 이때 각 코드간에는 낮은 상관계수(Cross-correlation )를 가져야 하며, 이러한 성질을 만족하는 코드 집합을 구하기 위한 노력이 경주되었으며 현재까지 2진법 코드 집합으로서 Gold, Kasami, No 코드가 알려져 있으며, 복잡성(Complexity)을 증가시키기 위한 노력으로서 (군사목적에 중요) 다진법 코드에 대한 연구가 활발해지고 있으나 공개된 것은 없었다. 최근에 (1990), 다진법 코드로서 Kumar 코드가 발표되었다. 그러나 이러한 코드들은 복잡성(Complexity or Linear Span)을 증가시키지는 못하였다. 본 논문은 복잡성(Complexity)이 증가한 새로운 다진법 코드의 집합을 제안하였다. 각 집합은 $P^{n}$ 개의 코드로 구성되며, 최대 상관계수 값은 $f^{m}$ (p-1)-1 이다. (n=2m)

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이중선RNA결합담백질(RBFII)의 cDNA분리 (Isolation of cDNA Encoding Double-Stranded RNA Binding Protein (RBFII))

  • 박희성
    • 생명과학회지
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    • 제7권3호
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    • pp.167-171
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    • 1997
  • 번역개시 및 인산화의 조절에 관여하는 RNA와 단백질의 결합 및 인식기작을 연구하기 위해서[$\alpha$^{-32}$P] UMP-labeled HIV Rev-responsive element(RRE) RNA를 이용한 affinity screening에 이해서 Hela ZA-PII cDNA library로부터 이중선RNA결합단백질의 cDNA (RBFII)를 분리하였다. RBFII의 cDNA에 대한 염기서열을 결정하였으며 기존에 연구된 바 있는 RBFII(RBF 또는 TRBP로 보고되었으며 본 연구에서는 RBFII와 구분하기 위해 RBFI으로 명명)과 대부분의 경우 공통적인 ORF를 지니는 것으로 나타났다. 그러나 5’말단에서는 공통적인 ORF 가 RBFI의 경우 21개의 아미노산을 의미하는 63 nt가 Lac-Z의 N-말단에 연결된데 비해서 특이한 46개 아미노기를 의미하는 138nt가 존재함이 밝혀졌다. 5’-말단에 처음 나타나는 ATG 및 부근의 염기서열을 분석해 볼 때 양 cDNA는 5’말단이 완전하지 않은 것으로 사료된다.

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Geographic Variation of Granulilittorina exigua (Littorinidae, Gastropoda) in Korea Based on the Mitochondrial Cytochrome b Gene Sequence

  • Song, Jun-Im;Suh, Jae-Hwa;Kim, Sook-Jung
    • Animal cells and systems
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    • 제4권3호
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    • pp.267-272
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    • 2000
  • Partial sequence of the mitochondrial cytochrome b gene was analyzed to investigate genetic variation from 10 geographic populations of Granulilittorina exigua in Korea. The sequence of 282 base pairs was determined by PCR-directed silver sequencing method. The sequences of two species within the genus Littorina reserved in NIH blast search were utilized to determine geographic variations of species referred. The levels of mtDNA sequence differences were 0.00-2.54% within populations and 0.71-4.43% between populations. There were four amino acid differences between representative species of the genera Granulilittorina and Littorina, but no differences within populations of the genus Granulilittorina. The UPGMA and the N-J trees based on Tamura-Nei genetic distance matrix were constructed, which showed that the genus Granulilittorina was divided into three groups such as eastern (even exception for Tokdo population), southern, and western regional populations. The degrees of genetic divergence within populations of each group were p=0.021, p=0.019, and p=0.018, respectively. The divergence between the eastern and southern populations was p=0.032, showing closer relationship than with the western populations (p=0.052). Based on the diverged time estimation, the eastern and southern populations of Granulilittorina exigua in Korea diverged from the western populations about 2.1 MYBP, and the eastern and southern populations diverged from each other about 1.3 MYBP.

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First Report of Pectobacterium versatile as the Causal Pathogen of Soft Rot in Kimchi Cabbage in Korea

  • Kyoung-Taek Park;Soo-Min Hong;Chang-Gi Back;Young-Je Cho;Seung-Yeol Lee;Leonid N. Ten;Hee-Young Jung
    • 식물병연구
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    • 제29권1호
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    • pp.72-78
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    • 2023
  • In September 2021, gray-to-brown discoloration and expanding water-soaked lesions were observed on the outer and inner layers and the core of kimchi cabbage (Brassica rapa subsp. pekinensis) in fields located in Samcheok, Gangwondo, Korea. A bacterial strain designated as KNUB-02-21 was isolated from infected cabbage samples. Phylogenetic analysis based on the sequences of the 16S rRNA region and the dnaX, leuS, and recA genes confirmed that the strain was affiliated with Pectobacterium versatile. Additionally, the biochemical and morphological profiles of the isolate were similar to those of P. versatile. Based on these results, the isolate was identified as a novel strain of P. versatile. Healthy kimchi cabbage slices developed soft rot upon inoculation with P. versatile KNUB-02-21 and exhibited symptoms similar to those observed in the diseased plants in fields. The re-isolated strains were similar to those of P. versatile. Prior to our study, P. versatile as the causative pathogen of kimchi cabbage soft rot had not been reported in Korea.

Bacillus subtilis 분리균 2주 유래 mannanases의 특성 비교 (Isolation of Mannanase-producing Bacteria, Bacillus subtilis WL-6 and WL-11, and Cloning and Characterization of Mannanase)

  • 윤기홍
    • 생명과학회지
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    • 제26권10호
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    • pp.1113-1120
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    • 2016
  • 우리나라의 전통 발효 된장으로부터 균체외 효소로 mannanase를 생산하는 세균 2주가 분리되었다. 분리균 WL-6과 WL-11은 형태적 특성, 생화학적 성질 및 16S rDNA의 염기서열에 따라 Bacillus subtilis로 확인되었다. 이들 두 균주로부터 각각 mannanase 유전자를 대장균에 클로닝하여 염기서열을 결정한 결과 mannanase 유전자는 362 아미노산으로 구성된 단백질을 코드하며 1,086 뉴클레오티드로 동일하게 이루어졌다. WL-6과 WL-11 mannanase (Man6, Man11)의 아미노산 잔기 배열은 서로 8개 잔기가 다르며 GH family 26에 속하는 B. subtilis의 mannanases와 매우 상동성이 높았다. Man6과 Man11의 아미노 말단의 26개 아미노 잔기가 signal peptide로 예측되었다. 재조합 대장균로부터 각각 생산된 Man6과 Man11은 94~95% 정도가 균체내에 존재하였고, mannotriose, mannotetraose, mannopentaose, mannohexaose와 같은 만노올리고당과 locust bean gum을 유사하게 분해하여 주된 반응산물로 mannobiose와 mannotriose를 생성하였다. Man6는 55℃와 pH 6.0, Man11은 60℃와 pH 5.5에서 각각 최대 반응활성을 보였으며, Man11이 Man6에 비해 열안정성이 높았다.

고 Testability를 위한 Domino CMOS회로의 설계 (On Designing Domino CMOS Circuits for High Testability)

  • 이재민;강성모
    • 한국통신학회논문지
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    • 제19권3호
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    • pp.401-417
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    • 1994
  • 본 논문에서는 논리 모니터링 방식에 의해 stuck-at(s-at)고장, stuck-open(s-op)고장 및 stuck on(s-on) 고장을 검출하기 위한 Domino CMOS회로의 테스트용이화 셀계기법을 제안한다. Domino CMOS게이트내 nMOS트랜지스터들의 s-op고장과 s-on고장을 검출하기 위하여 한개의 pMOS 트랜지스터를 부가하고 단일 게이트 및 다단 Domino CMOS회로내 인버어터의 pMOS트랜지스터 s-on 고장을 검출하기 위해서 한개의 nMOS트랜지스터를 부가한가. 부가된 트랜지스터는 Domino CMOS를 테스트 모드에서 pseudo nMOS회로로 동작하도록 만든다. 따라서 일반 domino CMOS회로의 테스트 시 회로지연에 의한 오동작을 방지하는 선충전(precharge phase)과 논리결정(evaluation phase)의 이상(two-phase)동작을 필요로 하지 않아 테스트 시간과 테스트 생성의 복잡도를 줄일 수 있게 된다. 제안된 회로에서는 대부분의 고장들이 단일 테스트 패턴에 의해 검출되는데 이에따라 경로지연이나 타임스큐, 전하재분배 및 그리치 등에 의해 테스트가 무효화되는 것을 피할 수 있으며 테스트 패턴 생성을 위하여 기존의 자동 테스트패턴생성기(ATPG)를 이용할 수 있는 장점을 갖는다.

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Isolation, Purification, and Partial Characterization of an AMP Deaminase from Saccharomyces cerevisiae D

  • Kim, Myung-Hee;Lee, Jung-Kee;Kim, Hyung-Kwoun;Oh, Tae-Kwang
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제9권4호
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    • pp.429-435
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    • 1999
  • An adenosine 5'-monophosphate deaminase (AMP aminohydrolase, EC 3.5.4.6) was purified to homogeneity from the cell-free extract of Saccharomyces cerevisiae DKCTC7248. The molecular mass of subunit was estimated to be 80 kDa on SDS-PAGE, and that of the holoenzyme was shown to be 240 kDa by gel filtration. The isoelectric point of the enzyme (AMP deaminase D) was determined to be 6.2. The AMP deaminase D was specific towards AMP with an apparent $K_m$ value of 4.1 mM and a Hill coefficient, $n_H$, of 2.2. Both ATP and ADP were positive allosteric effectors of the AMP deaminase D: The apparent $K_{m}$ was decreased to 1.6 mM and 3.3 mM in the presence of 0.1 mM ATP and ADP, respectively, lowering $n_{H}$ to 1.0. Univalent cations like $K^+, Na^+ and Li^ +$ activated the enzyme but some divalent cations such as $Cu^{ 2+} and Cd^{2+}$ showed strong inhibitory effects. This enzyme displayed optimum activity at $30^{\circ}C$ and pH 7.0. In addition, it was stable up to $45^{\circ}C$ and over a wide pH range(pH 5.5-9.0). Amino acid sequences of its N-terminal region were analyzed to be ADYKMQMFADDA.

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