• 제목/요약/키워드: $P^+$ region

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Subcloning and Sequencing of Maize rbcL Promoter Region

  • Woong-Seop Sim
    • Journal of Plant Biology
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    • 제38권1호
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    • pp.107-113
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    • 1995
  • pRLYS1 containing intact rbcL gene of maize (Zea mays L. cv Golden X Bantam T-51; Zm-A) was digested with several restriction enzymes to construct subcones carrying promoter region of rbcL. The DNA fragments of 0.20, 0.19, 0.92 and 1.55 kb among the EcoRI digests, the EcoRI-DdeI digests, the AvaI digests and the EcoRI-BamHI digests of pRLYS1 were subcloned into pBluscriptSK+and named pRLPS2, pRLPS3, pRLPS14 and pRLPS35, respectively. Four subclones contain the 1.92 kb portion from 136 nucleotide downstream to 1780 nucleotide upstream from the ATG initiation codon of rbcL gene. pRLPS2 (-29 to -229) and pRLPS3 (-239 to -420 from the ATG) were sequenced. When nucleotide sequence of Zm-A was compared with sequence of rbcL promoter region of a different cultivar of maize (Zea mays L. cv WFG TMS X BS7; Zm-B), the difference rate between two cultivars was 4.3%. The mean of sequence divergence between Zm-A and three grass species in the same tribe, Andropogoneae, in the upstream region from 29 to 420 of ATG was 1.8%, whereas between Zm-B and above-mentioned three species was 5.4%. Therefore, Zm-A seems to evolutionarily closer to three other species in Andropogoneae tribe than Zm-B is.

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A Small Cryptic Plasmid pZMO1 of Zymomonas mobilis ATCC10988

  • Kang, Hyung-Lyun;Kang, Hyen-Sam
    • Genomics & Informatics
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    • 제1권1호
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    • pp.55-60
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    • 2003
  • The nucleotide sequence of pZMO1, a small cryptic plasmid of Zymomonas mobilis ATCC10988 was determined. Analysis of 1,680 bp of sequence revealed $69\%$ identity with Shigella sonnei plasmid, pKYM and $61\%$ identity with Nostoc sp. ss DNA replicating plasmid. Analysis of a deduced amino acid sequence of an orf of pZMO1 revealed $75\%$ identity and $90\%$ similarity with the repA gene of Synechocystis sp. plasmid pCA2.4. The upstream region of the repA gene of pZMO1 possesses six directed repeat sequences and two inverted repeat sequences at downstream of the IR consensus sequence of nick region of rolling circle replication (RCR) plasmid. A typical terminator hairpin structure was found at the downstream region of repA gene. Degradation of single-stranded plasmid DNA by S1 nuclease was detected by Southern hybridization. It suggests that pZMO1 replicates by a rolling circle mechanism in Z. mobilis ATCC10988 cells.

산모의 요통 실태와 관리에 대한 조사 연구 (A Survey of Characteristics and Management of Low Back Pain in Postpartum Women)

  • 김선엽;남건우
    • 한국전문물리치료학회지
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    • 제9권1호
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    • pp.69-79
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    • 2002
  • Many pregnant women have experienced low back pain (LBP) during pregnancy and after delivery, and it has been an important component in women health. This study was designed to investigate the characteristics and management of the LBP in postpartum women. Eighty-five postpartum women were participated in this survey. Mean age of 85 women was 28.1 years. Of 85 postpartum women, 55.3% (n=47) had LBP after pregnancy. Thirty of 47 women had pain on lumbar region, 17 postpartum women had pain on sacroilium region. Of 85 postpartum women, 74% (n=54) had LBP before pregnancy and 71.8% (n=61) had LBP during pregnancy. Of 47 postpartum women who had LBP, 83% (n=39) had not received medical management for LBP, 12.8% (n=6) took medication, and 4.3% (n=2) performed self-exercise. None of postpartum women had received physical therapy during pregnancy and after delivery for treatment low back pain. The pain in SI region was more severe than in lumbar region after pregnancy according to VAS (visual analog scale) (p<.05). However, there was no significant difference in VAS scores between SI pain and lumbar pain before and during pregnancy (p>.05). Pain region after delivery was related to pain region of pre-pregnancy and during pregnancy (p<.01). Pain level after delivery was related to the pain and night pain level during pregnancy (p<.01).

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영역 확장법을 통한 평면에서 원들의 보로노이 다이어그램의 강건한 계산 (Robust Construction of Voronoi Diagram of Circles by Region-Expansion Algorithm)

  • 김동욱
    • 산업경영시스템학회지
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    • 제42권3호
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    • pp.52-60
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    • 2019
  • This paper presents a numerically robust algorithm to construct a Voronoi diagram of circles in the plane. The circles are allowed to have intersections among them, but one circle cannot fully contain another circle. The Voronoi diagram is a tessellation of the plane into Voronoi regions of given circles. Each circle has its Voronoi region which is defined by a set of points in the plane closer to the circle than any other circles. The distance from a point p to a circle $c_i$ of center $p_i$ and radius $r_i$ is ${\parallel}p-p_i{\parallel}-r_i$, which is the closest Euclidean distance from p to the circle boundary. The proposed algorithm first constructs the point Voronoi diagram of centers of given circles, then it enlarges each point to the circle and expands its Voronoi region accordingly. This region-expansion process is done by local modifications and after completing this process for the whole circles the desired circle Voronoi diagram can be obtained. The proposed algorithm is numerically robust and we provide with a few examples to show its robustness. The algorithm runs in $O(n^2)$ time in the worst case and O(n) time on average where n is the number of the circles. The experiment shows that the region-expansion algorithm is robust and runs fast with strong linear time behavior.

Glucoamylase 유전자의 promoter 와 분비신호서열을 이용한 Bacillus subtilis Endo-1-4$\beta$-D-Glucanase 의 효모에서 분비 (Secretion of Bacillus subtilis Endo-1,4-$\beta$-D-Glucanase in Yeast Using Promoter and Signal Sequence of Glucoamylase Gene)

  • 안종석;강대욱;황인규;박승환;박무영;민태익
    • 미생물학회지
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    • 제30권5호
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    • pp.403-409
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    • 1992
  • STA1 유전자의 promoter 와 분비신호서열을 이용하여 B. subtilis 의 CMSase 를 분비하는 재조합 효모균주를 육성하였다. STA1A 유전자의 promoter, 분비신호서열, TS region 및 mature glucoamylase N-말단부위의 아미노산 98개와 B. subtilis 의 CMCase 구조유전자가 차례로 연결된 재조합플라스미드 pYESC24 를 제작한후 효모에 형질전환하였으나 CMCase 가 세포외로 분비되지 않았다. 반면에 STA1 의 TS region 및 mature glucoamylase N-말단 아미노산 98 개를 제거하여 CMMase 구조유전자갸 STA1 의 분비신호서열에 바로 연결된 재조합 플라스미드 pYESC11 에 의한 효모형질전환 균주는 CMCase 분비능이 아주 우수하였다. 이 형질전환 균주를 YPD 배지에서 4 일간 배양한 후 세포부위 별 CMCase 역가를 측정한 결과 배양액 1 m/당 총역가 44.7 unit 존재하였으며 이중 93% 이상이 배양상등액에서 관찰되었다.

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PET/CT 영상에서의 치과재료에 의한 인공물에 관한 연구 (Evaluation of Artifacts by Dental Metal Prostheses and Implants on PET/CT Images: Phantom and Clinical Studies)

  • 반영각;박훈희;남궁혁;조석원;임한상;이창호
    • 핵의학기술
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    • 제14권2호
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    • pp.110-116
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    • 2010
  • PET/CT 검사는 기술의 발전에 따라 감쇄보정 방법이 $^{68}Ge$이나 $^{137}Cs$등의 동위원소를 사용하지 않고, CT 기반의 감쇄보정 영상을 구현하여 검사 시간의 단축과 해부학적인 영상을 제공한다. 그러나 CT 기반의 금속에 의한 CT 영상의 인공물이 발생하여 감쇄보정된 PET 영상에 영향을 준다. 그러므로 본 연구는 임상 실험과 phantom 실험을 통해 금속 치과 임상 실험은 구강 내질환이 없는 40명의 환자(평균나이: $56{\pm}17$세)를 대상으로 하였으며, 치아에 치과보철을 매식한 환자 20명과 치과 임플란트를 매식한 환자 20명을 대상으로 PET/CT 검사를 시행했다. phantom 실험은 원형 phantom내에 치과보철과 치과 임플란트를 매식한 치아모형을 이용하여 PET/CT 검사를 시행했다. 분석방법은 같은 단층상의 PET/CT 영상에서 CT 영상의 CT 값과 PET 영상의 표준섭취계수 변화를 인공물의 영향이 없는 부분, 어둡게 인공물이 나타난 부분, 밝게 인공물이 나타난 부분, 세 부분의 관심영역을 설정하여 측정했고, 통계분석은 대응표본 t-test를 이용했다. 치아 보철을 매식한 실험에서 환자의 경우 표준섭취계수가 인공물의 영향이 없는 부분에 비해 어둡게 인공물이 나타난 부분은 약 19.6% (p<0.05) 감소됐고, 밝게 인공물이 나타난 부분은 90.1% (p>0.05) 증가했다. phantom의 경우 표준섭취계수가 인공물의 영향이 없는 부분에 비해 어둡게 인공물이 나타난 부분은약 18.1% 감소됐고, 밝게 인공물이 나타난 부분은 18.0% 증가했다. 치아 임플란트를 매식한 실험에서 환자의 경우 표준섭취계수가 인공물의 영향이 없는 부분에 비해 어둡게 인공물이 나타난 부분은 약 19.1% (p<0.05) 증가됐고, 밝게 인공물이 나타난 부분은 96.6% (p>0.05) 증가했다. phantom의 경우 표준섭취계수가 인공물의 영향이 없는 부분에 비해 어둡게 인공물이 나타난 부분은 약 14.4% 감소됐고, 밝게 인공물이 나타난 부분은 7.0% 증가했다. PET/CT 검사의 CT 기반 보정 영상 구현 시 금속 치과 재료로 인해 CT 값에 영향을 주어 PET 영상에서도 표준섭취계수에 영향이 미치는 것을 볼 수 있다. 그리고 치아 임플란트보다 치아 보철에서 과 보정이 된 것을 볼 수 있다. 특히, 임상 실험에서 치아 보철의 표준섭취계수가 어둡게 인공물이 나타난 부분이 19.6% 감소되어 나타난 것을 확인 할 수 있어 위 음성으로 오인할 가능성이 있다. 그러므로 금속 치아 보철이나 임플란트를 시행한 환자들의 PET/CT 검사 시 구강내 병변이 의심 된다면, CT 영상으로 보정이 되지 않은 무보정(non-attenuation correction) PET 영상을 확인하는 것이 정확한 진단에 도움을 줄 것으로 사료된다.

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후지 사과의 산지에 따른 부위별 항산화 활성 비교 (Comparison of Antioxidative Activities of Fuji Apples Parts according to Production Region)

  • 방혜열;조순덕;김동만;김건희
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제44권4호
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    • pp.557-563
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    • 2015
  • 본 연구에서는 Fuji 사과의 기능성 확인을 위해 산지별, 부위별 일반 성분 및 항산화 성분을 비교 분석하였다. 에탄올 추출물을 이용하여 항산화 활성을 분석한 결과 DPPH radical 소거 활성은 충주지역 사과에서 과피 82.84%, 과피근접 과육 26.98%, 과육 18.89% 등으로 다른 지역에 비해 낮은 값을 나타냈으나(P<0.01) 과심은 48.64%로 과피근접과육이나 과육보다 높았다. ABTS radical 소거 활성 측정 결과 과피는 안동지역 사과가 79.80%, 과피근접과육 및 과육은 예산지역이 각각 30.29%, 30.48%로 가장 높게 나타났으나(P<0.01) 과심은 충주지역이 52.34%로 타 지역에 비해 2배 이상의 높은 활성을 보였다. 총 페놀 함량의 경우 무주지역 사과의 과피에서 12.03 mg GAE/g, 안동지역 과피근접과육 6.01 mg GAE/g, 예산지역 과육 5.57 mg GAE/g 등에서 유의적으로 높은 함량을 보였으나 과심에서는 과피, 과피근접과육, 과육에서 유의적으로 가장 낮은 충주지역의 사과가 6.53 mg GAE/g으로 상대적으로 높은 활성(P<0.01)을 보여주었다. 총 플라보노이드의 경우 과피, 과피근접과육 및 과심에서는 예산지역의 사과가 각각 56.23 mg QE/g(P<0.01), 4.05 mg QE/g(P<0.05), 4.00 mg QE/g(P<0.01)으로 높은 함량을 보였으며, 과육에서는 안동지역의 사과가 4.35 mg QE/g(P<0.01)으로 비교적 높은 함량을 나타내었다. 이상의 결과를 통해 전통적으로 후지 사과의 주 재배지로 인식하고 있는 경남지역과 비교할 때 나머지 지역이 후지 사과의 품질 특성 및 항산화 활성에 있어 충분한 경쟁력을 갖고 있는 것으로 판단되었다. 5개 지역 모두 부위별로는 과육에 비하여 과피 부분의 항산화 활성이 상대적으로 높게 나타났으며 과피근접 부분의 항산화 활성 역시 높게 나타나 섭취 시 과실의 가식 부위를 최대화시킬 필요가 있음을 알 수 있었다. 또한 과심 부분 역시 과육에 상당하는 항산화 활성이 나타나 식량자원의 효과적인 활용을 위해 비가식부위로 인식되는 사과 부산물의 적극적인 활용방안 및 제품개발 제고의 필요성을 확인할 수 있었다.

한국의료패널로 본 소득분위에 따른 권역별 건강수준과 의약품 지출 비용 (Regional Health Status and Medicine Expenses by Income Quartile Using the Korea Health Panel)

  • 김윤정;황병덕
    • 보건의료산업학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.117-130
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    • 2017
  • Objectives : In this study, 3,107 patients were used to evaluate the impact based on raw data of 2014 and the health status and medical expenses income quintile was collected and data was analyzed. Methods : Analysis method was the average comparison, ANOVA, subjected to a multiple logistic regression analysis, the statistical test was the t-test and the scheffe post verification. Results : Gender(p<.000), age(p<.000), marital status(p<.000) educational status (p<.000), easement(p<.000), medication(p<.000), subjective health status(p<.005) were analyzed. First quintile identified that the highest amount was spent in the Chungcheong region, the 2nd quintile showed that the highest output was in the Gyeongsang region. The 3rd and 4th quintiles indicated that the highest expenditure was in the Seoul metropolitan region. The 5th quintile showed that the Chungcheong was the highest once again and the Jeolla region was the lowest in terms of expediture. Conclusions : Future medical research on income will require the government's Big Data collection to create the primary basis for policy making in order to improve the efficiency, effectiveness and equity of medicine spending.

버섯에서 분리한 형광성 Pseudomonas spp. 의 ITS I 영역 분석에 의한 계통 분류 (Phylogeneitc Analysis of Fluorescent Pseudomonas spp. Isolated from the Cultivated Mushrooms on the Basis of ITS I Region)

  • 고승주;고승주;강희완;전명숙;류진창
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.350-357
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    • 1998
  • A total of 12 strains of fluorescent Pseudomonas isolated from the cultivated mushrooms such as Agaricus bisporus and Pleurotus ostreatus were collected. They consisted of pathogenic Pseudomonas spp. and epiphytic Pseudomonas spp. of the cultivated mushroom. To analyze the phylogenetic relationship of these strains, ITS I region, the 16S-23S intergenic spacer region in the ribosomal RNA (rRNA) operon, was cloned and sequenced. The spacer regions of these strains were 495∼527 nucleotides in length and contained the genes encoding isoleucine-tRNA (tRNAIle) and alanine-tRNA (tRNAAla). The reciprocal homologies of each ITS I sequence among these strains were in the range of 84.2%∼98.8%. According to the analysis of ITS I sequences, the fluorescent Pseudomonas spp. were phylogenetically classified into three clusters. Cluster I consisted of Pseudomonas fluorescens, P. tolaasii, P. gingeri’, and P.‘reactans’(WLRO). Cluster II comprised Pseudomonas fluorescens biovar C and F. Cluster III composed P. agarici. Cluster I and II could be classified into P. fluorescens complex. P. agarici formed an independent taxon clearly separable from P. florescens complex.

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Detection of Pectobacterium chrysanthemi Using Specific PCR Primers Designed from the 16S-23S rRNA Intergenic Spacer Region

  • Kwon, Soon-Wo;Myung, In-Sik;Go, Seung-Joo
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제16권5호
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    • pp.252-256
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    • 2000
  • The 16S-23S rRNA intergenic spacer regions (ISRs) were sequenced and analyzed to design specific primer for identification of Pectobacterium chrysanthemi. Two types ISRs, large and small ISRs, were identified from three strains (ATCC 11663, KACC 10163 and KACC 10165) of P. chrysanthemi and Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum ATCC 15713.Large ISRs contained transfer RNA-Ile(tRNA$^{Ile}$)and tRNA$^{Ala}$, and small ISRs contained tRNA$^{Glu}$. Size of the small ISRs of P. chrysanthemi ranged on 354-356 bp, while it was 451 bp in small ISR of P. carotovorum subsp. carotovorum ATCC 15713. From hypervariable region of small ISRs, species-specific primer for P. chrysanthemi with 20 bp length (CHPG) was designed from hypervariable region of small ISRs, which was used as forward promer to detect P. chrysanthemi strains with R23-1R produced PCR product of about 260bp size (CHSF) only from P. chrysanthemi strains, not from other Pectobacterium spp. and Erwinia spp. Direct PCR from bacterial cell without extracting DNA successfully amplified a specific fragment, CHSF, from P. chrysanthemi ATCC 11663. The limit of PCR detection was 1${\pm}10^2$ cfu/ml.

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