• 제목/요약/키워드: $MS^n$

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Metabolism of a New Neuroprotective Agent for Ischemia-Reperfusion Damage, KR-31543 in the Rats using Liquid Chromatography/Electrospray Mass Spectrometry

  • Kim, John;Ji, Hye-Young;Lee, Seung-Seok;Yoo, Sung-Eun;Kim, Sun-Ok;Lee, Dong-Ha;Lim, Hong;Lee, Hye-Suk
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제25권5호
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    • pp.664-668
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    • 2002
  • KR-31543,(2S,3R,4S)-6-amino-4-[N-(4-chlorophenyl)-N-(2-methyl-2H-tetrazol-5-ylmethyl)amino]-3,4-dihydro-2-dimethoxymethyl-3-hydroxy-2-methyl-2H-1-benzopyran is a new neuroprotetive agent for ischemia-reperfusion damage. The in vitro and in vivo metabolism of KR-31543 in rats has been studied by LC-electrospray mass spectrometry. Rat liver microsomal incubation of KR-31543 in the presence of NADPH resulted in the formation of a metabolite M1. M1 was identified as N-(4-chlorophenyl)-N-(2-methyl-2H-tetrazol-5-ylmethyl)amine on the basis of LC-MS/MS analysis with the synthesized authentic standard. Rat CYP3A1 and 3A2 are the major CYP isozymes involved in the formation of M1.

확률그래프모델을 이용한 MS/MS 기반 단백질 동정 기법 (A Method for Protein Identification Based on MS/MS using Probabilistic Graphical Models)

  • 이홍란;황규백
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2012년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.39 No.1(B)
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    • pp.426-428
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    • 2012
  • In order to identify proteins that are present in biological samples, these samples are separated and analyzed under the sequential procedure as follows: protein purification and digestion, peptide fragmentation by tandem mass spectrometry (MS/MS) which breaks peptides into fragments, peptide identification, and protein identification. One of the widely used methods for protein identification is based on probabilistic approaches such as ProteinProphet and BaysPro. However, they do not consider the difference in peptide identification probabilities according to their length. Here, we propose a probabilistic graphical model-based approach to protein identification from MS/MS data considering peptide identification probabilities, number of sibling peptides, and peptide length. We compared our approach with ProteinProphet using a yeast MS/MS dataset. As a result, our model identified 27 more proteins than ProteinProphet at 1% of FDR (false discovery rate), confirming the importance of peptide length information in protein identification.

파브리병의 신속한 진단을 위한 소변 중 Globotriaosylsphingosine의 UPLC-ESI-MS/MS 분석법 (Quantification of Globotriaosylsphingosine in Urine using UPLC-ESI-MS/MS; Application for Screening Fabry Disease)

  • 윤혜란
    • 약학회지
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    • 제60권1호
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    • pp.15-20
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    • 2016
  • Globotriaosylsphingosine (lyso Gb3) is considered as one of the biomarkers for Fabry disease. A rapid and simple UPLC-MS/MS method was developed for the determination of reliable biomarker, lyso Gb3. Total analytical procedure takes only 15 min including sample preparation and MS/MS analysis. Limit of detection was 0.85 ng/ml (S/N=3). The calibration curve was linear over the range of 2.0~400.0 ng/ml ($R^2=0.9999$). Inter-day and intra-day assay accuracy were 93.4~100.6% (RSD, 0.6~6.0%) and 97.5~100.7% (RSD, 3.6~5.2%). Absolute recoveries of 97.6~98.6 showed excellence of a new analytical method. The method was applied to human and mice urines, proved the suitability for the quantification of lyso-Gb3 for screening, diagnosis and therapeutic monitoring of Fabry disease patients.

초음파 조건에서 여러가지 아민 N-옥시드와 풀러렌($C_{70}$)를 이용한 풀러렌 산화물의 합성 (Synthesis of Fullerene Oxide by Fullerene ($C_{70}$) and Various Amino N-Oxides under Ultrasonic Irradiation)

  • 고원배;한지연;임영아;신원직;유구용
    • Elastomers and Composites
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    • 제39권2호
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    • pp.153-160
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    • 2004
  • 풀러렌($C_{70}$)을 3-picoline N-oxide, pyridine N-oxide hydrate, quinoline N-oxide, isoquinolne N-oxide의 여러가지 아민 N-옥시드를 사용하여 $25{\sim}43^{\circ}C$, 초음파 조건에서 반응시켜 풀러렌 산화물을 합성 하였다. 동일한 초음파 조건에서 여러가지 아민 N-옥시드에 대한 풀러렌 ($C_{70}$)의 반응성은 3-picoline N-oxide : pyridine N-oxide hydrate : quinoline N-oxide : isoquinoline N-oxide 처럼 동일하게 나타났다. MALDI -TOF MS, UV-vis 그리고 HPLC를 사용하여 생성된 풀러렌 산화물을 분석한 결과 [$C_{70}(O)n$] (n=1) 임을 알 수 있었다.

벼 담수직파재배시 완효성질소비료의 시용 효과 (Effects of Slow-Release Nitrogen Fertilizers, Latex coated urea and Meister 10, on Direct Seeded Rice in Flood Soil)

  • 장명환;백준호;이승호;이상조;임준영;김복진
    • 한국토양비료학회지
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    • 제34권6호
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    • pp.401-406
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    • 2001
  • 본 연구는 담수직파재배에서 완효성질소비료인 Latex coated urea(LCU)와 Meister10(MS10)의 효과를 구명하기 위하여 포장시험으로 조생종인 중화벼를 공시품종으로하여 무질소구, 요소구, LCU구, MS구로 처리하여 벼의 생육, 수량 및 수량구성요소, 질소흡수량 및 이용율, 시험전후 토양의 화학적특성을 조사한 결과는 다음과 같다. 초장과 분얼수는 요소구보다 LCU구와 MS10구가 높았고, MS10구는 LCU구보다 초장은 비슷했으나, 분얼수가 높았다. 입모수는 요소구, LCU구, MS10구간에 차이가 없었다. 간장은 요소구 보다 LCU구와 MS10구가 높았고, 수장은 요소구, LCU구 및 MS10구간에 통계적 유의성이 없었다. $m^2$당 수수는 MS10구가 가장 높았으나, LCU구와 요소구간에는 비슷하였다. 수량은 MS10구가 LCU구와 요소구보다 유의성있게 높았다. 수확기 질소흡수량과 질소이용율은 MS10구>LCU구>요소구 순이었다. 시험후 토양의 화학성은 시험전 토양에서보다 질소함량에는 변화가 없었으나, pH, 인산 및 가리 함량이 다소 낮아졌다.

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청각 EPR의 내외생적 요소들과 성격의 상관에 관한 연구 (Correlations of Exogenous and Endogenous Components of Auditory ERPs to Psychometric Measures of Personality)

  • 박창범;이지영;지상은;박은혜;이영혁;김현택
    • 한국감성과학회:학술대회논문집
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    • 한국감성과학회 2002년도 추계학술대회 논문집
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    • pp.132-139
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    • 2002
  • 본 실험은 청각 사상관련전위(ERP)를 이용하여 다양한 성격 특질 모형들의 생물학적 근거와, 구조의 공통점과 차이점을 명확히 하기 위해서 설계되었다. 48명의 대학생 피험자들에게 4가지 성격 측정 검사(NEO-PI-R, EPQ-R, BIS/BAS 척도, IVE)를 시행하고, 이어 두 종류의 청각 자극 세트(50ms와 300ms)를 이용한 오드볼 과제를 통해 ERP를 측정하였다. 설문지 간의 상관과, 설문지와 ERP 내외생적 구성 요소 간의 상관, 그리고 그 상관의 두피 분포 양상을 통합적으로 고려하여 해석하였다. 각 성격 검사의 외향성 척도에 해당한다 할 수 있는 E, E, BAS-FUN은 양성 모두에서 높은 수준의 설문지 척도 간 정적 상관을 보였으나, 50ms 자극으로 유발된 P3 진폭은 E와 BAS-FUN에 대해서만 유의하게 높은 상관을 나타내었다. 이 결과는 Eysenck의 모델과 일견 일치하는 결과이지만, 그가 개발한 EPQ-R의 외향성 척도(E) 보다는 오히려 다른 척도들이 뇌파에 반영된 성격의 생물학적 기제를 측정하기 위한 적절한 도구일 수도 있음을 시사한다. 신경증적 경향성을 반영하는 N과 N 척도는 50ms 자극에 대한 여성 피험자의 N1, P2 진폭과 유의한 상관을 보였다. 그러나 이론적으로 두 척도에 등가적인 것으로 예상되었던 BIS 척도는 설문지 간 상관이나 ERP 요소와의 상관에서 모두 유의한 결과를 보이지 않았다. Eysenck가 성격의 세 번째 축(차원)으로 제시했던 P(정신병적 경향성) 역시 여성 피험자들에게서 두드러지는 설문지 간 상관을 보였으나, 300ms 자극에 대한 P2 진폭과의 정적인 상관은 양성을 합한 자료에서만 발견되었다. 여성의 상관 분포는 비록 통계적으로 유의한 수준에는 이르지 못하였으나, 양성 자료의 분포와 유사함이 확인되었다. 이 실험의 결과는 P3 진폭과 외향성 간의 부적인 상관 관계를 보고하였던 기존 연구들을 지지한다. 또한 본 실험에서 확인된 Eysenck 모델의 신경증적 경향성이나 정신병적 경향성이 ERP의 비교적 초기에 나타나는 외생적 구성 요소들(N1, P2)과의 상관 양상은, P3 요소에 집중하였던 기존 연구들이 외향성 이외의 차원으로 일관된 결과를 얻어내지 못했던 이유를 설명해줄 수 있을 것이다. 또한 성격 차원과 그것을 지표 하는 ERP 구성 요소 간의 관계를 해석할 때에 성별이나 유발 자극의 속성을 고려해야 함을 보여준다.

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Multicomponent assessment and ginsenoside conversions of Panax quinquefolium L. roots before and after steaming by HPLC-MSn

  • Huang, Xin;Liu, Yan;Zhang, Yong;Li, Shuai-Ping;Yue, Hao;Chen, Chang-Bao;Liu, Shu-Ying
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제43권1호
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    • pp.27-37
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    • 2019
  • Background: The structural conversions in ginsenosides induced by steaming or heating or acidic condition could improve red ginseng bioactivities significantly. In this paper, the chemical transformations of red American ginseng from fresh Panax quinquefolium L. under steaming were investigated, and the possible mechanisms were discussed. Methods: A method with reversed-phase high-performance liquid chromatography coupled with linear ion trap mass spectrometry ($HPLC-MS^n$)-equipped electrospray ionization ion source was developed for structural analysis and quantitation of ginsenosides in dried and red American ginseng. Results: In total, 59 ginsenosides of protopanaxadiol, protopanaxatriol, oleanane, and ocotillol types were identified in American ginseng before and after steaming process by matching the molecular weight and/or comparing $MS^n$ fragmentation with that of standards and/or known published compounds, and some of them were determined to be disappeared or newly generated under different steaming time and temperature. The specific fragments of each aglycone-type ginsenosides were determined as well as aglycone hydrated and dehydrated ones. The mechanisms were deduced as hydrolysis, hydration, dehydration, and isomerization of neutral and acidic ginsenosides. Furthermore, the relative peak areas of detected compounds were calculated based on peak areas ratio. Conclusion: The multicomponent assessment of American ginseng was conducted by $HPLC-MS^n$. The result is expected to provide possibility for holistic evaluation of the processing procedures of red American ginseng and a scientific basis for the usage of American ginseng in prescription.

마이크로파 조건에서 풀러렌 산화물 [$C_{70}O_n$ ($n=1{\sim}3$ or n=1)의 합성 (Synthesis of Fullerene Oxides [$C_{70}O_n$] ($n=1{\sim}3$ or n=1) under Microwave Irradiation)

  • 고원배;안주현;임영아;한지연;한동설
    • Elastomers and Composites
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    • 제39권4호
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    • pp.309-317
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    • 2004
  • 풀러렌[$C_{70}$]을 3-chloroperoxy benzoic acid, chromium (VI) oxide, benzoyl peroxide, trichloroisocyanuric acid 등의 산화제를 사용하여 마이크로파 조건에서 반응시켜 풀러렌 난화물[$C_{70}O_n$] ($n=1{\sim}3$ or n=1)을 합성하였다. 동일한 마이크로파 조건에서 여러가지 산화제와 풀러렌[$C_{70}$]의 고체상태 반응성은 3-chloroperoxy benzoic acid > chromium(VI) oxide > trichloroisocyanuric acid $\simeq$ benzoyl peroxide 순으로 증가함을 나타냈다. MALDI-TOF-MS, UV-visible, 그리고 HPLC를 사용하여 분석한 결과 생성된 풀러렌 산화물은 [$C_{70}O_n$] ($n=1{\sim}3$ or n=1)임을 알 수 있었다.

이탈리안 라이그라스 종자로부터 캘러스 유도 및 식물체 재분화 (Callus Induction from Seeds of Italian ryegrass and Plant Regeneration)

  • 임용우;김기용;최기준;성병렬;신정섭
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제20권1호
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    • pp.25-30
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    • 2000
  • 이탈리안 라이그라스 (Lolium multiflorum Lam.) 종자로부터 직접 갤러스를 유도하고, 형성된 캘러스로부터 식물체를 재분화하는데 조건을 확립하였다. 캘러스 유도시 사용한 SH (Schenk and Hildebrandt), MS (Murashige and Skoog) 및 N6(Chu). 배지중에서 MS 배지가 캘러스 유도에 유리한 것으로 나타났으며, 캘러스 유도시에는 2,4-D $5\;mg/{\ell}$를 첨가한 조건, 캘러스 증식시에는 2,4-D $3\;mg/{\ell}$을 첨가한 조건이 가장 효율이 좋았다. 식물제 재분화 조건은 MS 배지에 BA $1.0\;mg/{\ell}$와 NAA $0.1\;mg/{\ell}$를 첨가한 재분화배지에서 계대배양하며 재분화를 완성한 처리구 9의 조건에서 재분화율 (15%)이 가장 높았다.

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The Anesthetic Effects of Clove Oil and MS-222 on Far Eastern Catfish, Silurus asotus

  • Park, In-Seok
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제23권2호
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    • pp.183-191
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    • 2019
  • The objective of this study is to evaluate the anesthetic effects of clove oil and tricaine methanesulfonate (MS-222) on the Far Eastern catfish, Silurus asotus, by measuring the times to anesthesia and recovery. Each anesthetic effect of clove oil and MS-222 was tested in two groups of fish with different body sizes: a group of small fish (mean body length: $15.5{\pm}1.58cm$, mean body weight: $50.1{\pm}5.91g$, n=20) and a group of large fish (mean body length: $31.5{\pm}4.19cm$, mean body weight: $302.1{\pm}15.22g$, n=20). The anesthetics were used at concentrations of 200, 300, 400, 500, and 600 ppm. The results showed significant relationships between the concentration of the anesthetic and the body size of the fish. Each of these variables showed statistical significance (p<0.05). The time to anesthesia decreased linearly with increasing concentration in the large fish for both clove oil and MS-222 (p<0.05). Based on an optimal anesthetic time of approximately 1 min, the preferred concentrations of the anesthetics were 500 ppm for clove oil and 600 ppm for MS-222. Both the anesthetic time and the recovery time were shorter for the small fish than for the large fish (p<0.05). Our study showed that the smaller-sized Far Eastern catfish was more easily anesthetized and recovered more rapidly from anesthesia than the larger-sized fish.