• 제목/요약/키워드: $B_{13}P_2$

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YEp 13 vector를 이용한 Bacillus amyloliquefaciens amylase gene의 cloning II. Saccharomyces cerevisiae에서의 발현 (Cloning of Bacillus amyloliquefaciens amylase gene using YEp 13 as a vector II. Expression of cloned amylase gene in Saccharomyces cerevisiae)

  • 김관필;서정훈
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.209-212
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    • 1986
  • YEp 13 plasmid에 B. amyloliquefaciens의 $\alpha$-amylase gene을 cloning시켜서 얻은 hybrid plasmid를 E. coli C 600으로 형질전환시켜서 amylase 활성을 나타내는 균주를 선별하였다. 선별된 E. coli C 600균주를 plasmid추출하여 전기영동해 본 결과 plasmid가 매우 불안정하였으며, 그중 가장 단순한 plasmid band를 지니고 있으며 amylase활성이 강한 E. coli균주를 선별하였다. 선별된 균주의 균체내에 있는 2개의 plasmid DNA를 분리하여 각각의 plasmid를 pTG 17-1, pTG 17-2로 명명하였으며 S. cerevisiae MC 16에서 형질전환이 가능한 pTG 17-2 DNA를 제한효소 EcoRI과 Pst I으로 restriction한 결과 EcoRI으로 처리한 경우는 7.3, 4.8, 2.4 kb인 3개의 분획으로 나타났으며 Pst I으로 처리한 경우는 linear로 14.5kb임을 알았으며 이로써 pTG 17-2 plasmid의 size가 약 14kb임을 알았다. 또한 E.coli균체내에서의 ampicillin sensitive로써 이 plasmid의 ampicillin resistance site가 결실되었음을 알았고 효모의 형진전환체로 부터의 $\alpha$-amylase는 균체외로 분비되지 않았고 효모균체내의 $\alpha$-amylase는 Somogyi-Nelson방법과 Agar diffusion 방법으로 확인하였다.

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여성골반에 대한 최적의 b-value(s/mm2)를 이용한 확산강조 자기공명영상의 정량적, 성적 평가 (Quantitative, qualitative Evaluation of Diffusion-Weighted MRI using Optimal b-value(s/mm2) for Female Pelvis)

  • 구은회
    • 디지털융복합연구
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    • 제11권1호
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    • pp.361-368
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    • 2013
  • 본 연구의 목적은 악성 및 양성 여성골반 병변에서 자기공명 확산강조영상의 정량적, 정성적평가을 통하여 최적의 확산경사계수(b-values) 값을 구하고, 임상적 유용성을 알아보고자 하였다. 확산강조영상의 b-value($s/mm^2$)값을 600, 800, 1000, 1200, 1400까지 변화시키면서 얻었다. 정량적 분석결과 b-values 값 중 800에서 자궁근종의 평균 신호대 잡음비 $84.6{\pm}4.57$(p=0.024) 와 대조도대 잡음비 $50.13{\pm}5.47$(p=0.028)로 가장 높았고, 자궁경부암의 평균 신호대 잡음비 $12.0{\pm}2.04$(p=0.047)와 대조도대 잡음비 $10.6{\pm}1.24$(p=0.001)로 가장 높았으며, 이때 현성확산계수는 자궁근종 $1.19{\times}10^{-3}$(p=0.008), 자궁경부암 $0.96{\times}10^{-3}$(p=0.027) 이었다. 정성적 분석결과로서 병변의 묘출도와 명확성은 $4.02{\pm}0.18$(p=0.028), $4.39{\pm}0.25$(p=0.015)로 800에서 가장 높았다. 결론적으로 확산강조 자기공명영상은 여성골반 병변 검출에 있어서 중요한 방법이고, 최적의 b-value($s/mm^2$)값은 $800s/mm^2$ 이었으며, 정량적, 정성적 평가는 여성골반의 악성 및 양성 감별진단에 도움을 주었다.

Application of Collagenolytic Proteases from Bacillus subtilis B13 and Bacillus siamensis S6 for Tenderizing Goat Meat during Wet Aging

  • Supaluk Sorapukdee;Wiwat Samritphol;Papungkorn Sangsawad;Pussadee Tangwatcharin
    • 한국축산식품학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.430-442
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    • 2024
  • This research aimed to assess the effect of collagenolytic proteases from Bacillus subtilis B13 and Bacillus siamensis S6 for tenderizing goat meat during wet aging. Collagenolytic proteases B13 and S6 were prepared at 5 U/mL of collagenolytic activity before injecting into goat meat with 10% (v/w) of initial weight. The control sample was injected with distilled water and used as a negative control. The injected meats were placed in vacuum-sealed bags and wet aged at 4℃ for 0, 3, 5, 7, 14, and 21 days. Thereafter, total aerobic count and physicochemical quality were elucidated. Both enzyme-treated samples from B13 and S6 aged for 5 days showed an acceptable microbial quality with lower than 5.7 Log CFU/g. These conditions produced the tender meats by the reduction in shear force accounting for 30% for B13 and 26% for S6 as compared to the control. Moreover, the enzyme-treated samples showed lower values of hardness, gumminess, and chewiness, with higher springiness and trichloroacetic acid-soluble peptides than the control (p<0.05). The detrimental impact on cooking loss and lipid oxidation was not found. Enzyme-injected meat had a lower cooking loss than the control (p<0.05) with no significant difference in lipid oxidation (p>0.05). Notably, meats treated with B13 and S6 were lower in CIE L* value as compared to the control (p<0.05) with no significant impact on CIE a* and CIE b* (p>0.05). These results suggested that these two collagenolytic proteases could enhance the quality of goat meat in terms of tenderness and reduce the aging time for meat tenderization.

Histological study on the skin structure in two mudskippers, Periophthalmus waltoni and Boleophthalmus dussumieri in relation to their terrestrial life

  • Mehran Dorostghoal;Ashraf Jazayeri;Sara Ashiri
    • Applied Microscopy
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    • 제52권
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    • pp.13.1-13.6
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    • 2022
  • Microscopic structure of skin in two amphibious mudskipper fish; Boleophthalmus dussumieri Valenciennes, 1837 (B. dussumeri) and Periophthalmus waltoni Koumans, 1941 (P. waltoni) were investigated in relation to their lifestyle. The general structure of skin is the same among the two species. Epidermis in B. dussumeri was thicker significantly than P. waltoni. The dermal bulges were only well developed in the skin of B. dussumeri. Mucous cells were absent in the epidermis of P. waltoni but present in B. dussumeri. Both B. dussumeri and P. waltoni have well-developed swollen middle cells as a shared epidermal feature. The thickness of the middle cell layer of the epidermis in B. dussumeri was significantly greater than in P. waltoni. Capillaries in the dorsal and ventral parts of the body are more closely distributed to the epidermal surface in P. waltoni than in B. dussumeri. The diffusion distance in the dorsal epidermis of P. waltoni was less than that in the ventral epidermis of B. dussumeri. A comparative examination of the skin of mudskipper species suggests that, due to the more terrestrial lifestyle adopted by P. waltoni, the skin contributes more to respiration.

P-toluenesulfonanilide, $C_{13}H_{13}NO_2S$의 결정 및 분자구조 (The Crystal and Molecular Structure of P-toluenesulfonanilide, $C_{13}H_{13}NO_2S$)

  • 박권일;조성일
    • 한국결정학회지
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    • 제6권1호
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    • pp.43-48
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    • 1995
  • X-ray 회절법을 이용하여 P-toluenesulfonanilide, C13H13NO2S의 결정 및 분자구조를 규명하였다. Methanol 용액으로부터 얻은 무색 단결정은 단사정계, 공간군은 P21/c이며, a=8.777(1)Å, b=9.784(2)Å, c=15.139(2)Å, β=99.00(1)°, Z=4, V=1284.0(6)Å3, Dc=1.28g/cm3, λ(Mo-Kα)=0.71069Å, μ=2.3cm-1, F(000)=520, Temperature : 293±3K, 직접법으로 개략적인 분자모델을 설정하고 3.0σ이상인 711개의 독립 회절반점에 대하여 완전행렬 최소자승법으로 정밀화하여 최종신뢰도값 R=0.038인 최종적인 분자모형을 구하였다. 두 벤젠고리의 이면각이 68.4°이며 분자들은 c축 방향 2회선 나선형으로 이상적으로 충진되어 있으며 분자간은 van der Walls 결합력으로 이루어져있다.

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봉독의 세포자멸사를 통한 LNCaP 세포증식 억제 (Bee Venom Inhibits LNCaP Cell Proliferation Through Induction of Apoptosis Via Inactivation of $NF-{\kappa}B$)

  • 이홍선;송호섭
    • Journal of Acupuncture Research
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    • 제25권2호
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    • pp.59-74
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    • 2008
  • 목적 : 이 연구는 봉약침의 봉독과 그 주요성분인 멜리틴이 $NF-{\kappa}B$의 활성억제와 세포자멸사 관련 단백질의 발현 조절을 통하여 세포자멸사를 유도하고 전립선 암세포주인 LNCaP 세포의 성장을 억제하는지를 확인하고 해당 기전을 살펴보고자 하였다. 방법 : 봉독이나 멜리틴을 처리한 후 LNCaP의 성장억제를 관찰하기 위해 WST-1 assay, CCK-8 assay를 시행하였고, 세포자멸사의 관찰에는 DAPI, TUNEL staining assay를 시행하였으며, 세포자멸사 조절단백질의 변동 관찰에는 western blot analysis를 시행하였고, 세포자멸사와 연관된 $NF-{\kappa}B$의 활성 변화를 관찰하기 위해 EMSA를 시행하였으며, LNCaP에서 봉독이나 멜리틴과 $NF-{\kappa}B$의 상호작용을 관찰하기 위해 transient transfection assay를 시행 시 세포생존율과 $NF-{\kappa}B$의 활성 변동을 측정하였다. 결과 : LNCaP 세포에 봉독이나 멜리틴을 처리한 후, 전립선암세포의 성장, 세포자멸사의 유발, 세포자멸사 관련 단백질의 발현, $NF-{\kappa}B$의 활성, $NF-{\kappa}B$의 p50 치환 후 $NF-{\kappa}B$의 활성과 LNCaP 세포 증식에 미치는 영향을 관찰하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. LNCaP 세포에서 봉독이나 멜리틴을 처리한 후 세포자멸사가 유도되어 세포성장이 억제되었고, 세포자멸사 관련 단백질 중 분리된 PARP, caspase-9, Bax는 유의한 증가를, Bcl-2, p-Akt, MMP 13, XIAP, cXIAP는 유의한 감소를 나타내었다. 2. LNCaP 세포에서 봉독이나 멜리틴을 처리한 후 $NF-{\kappa}B$의 활성의 유의한 감소를 나타내었다. 3. LNCaP 세포에서 $NF-{\kappa}B$ p50를 치환하여 작용기를 없애고 봉독이나 멜리틴을 처리하였을 경우에도 $NF-{\kappa}B$의 활성의 유의한 감소를 나타내었다. 결론 : 이상의 결과는 봉독이나 멜리틴이 $NF-{\kappa}B$의 활성 억제를 통하여 인간 전립선암세포주인 LNCaP의 세포자멸사를 유발함으로써 증식억제 효과가 있음을 입증한 것으로 전립선암의 예방과 치료에 대한 효과적인 치료제 개발에 도움이 될 것으로 기대된다. 다만 그 기전에서 봉독이나 멜리틴은 기존연구와 달리 $NF-{\kappa}B$ p50의 작용기와 직접적으로 상호작용을 하지는 않는 것으로 보이므로 심화 연구를 요한다.

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Linear and Conformational B Cell Epitope Prediction of the HER 2 ECD-Subdomain III by in silico Methods

  • Mahdavi, Manijeh;Mohabatkar, Hassan;Keyhanfar, Mehrnaz;Dehkordi, Abbas Jafarian;Rabbani, Mohammad
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권7호
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    • pp.3053-3059
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    • 2012
  • Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) is a member of the epidermal growth factor receptor family of receptor tyrosine kinases that plays important roles in all processes of cell development. Their overexpression is related to many cancers, including examples in the breast, ovaries and stomach. Anticancer therapies targeting the HER2 receptor have shown promise, and monoclonal antibodies against subdomains II and IV of the HER2 extra-cellular domain (ECD), Pertuzumab and Herceptin, are currently used in treatments for some types of breast cancers. Since anti HER2 antibodies targeting distinct epitopes have different biological effects on cancer cells; in this research linear and conformational B cell epitopes of HER2 ECD, subdomain III, were identified by bioinformatics analyses using a combination of linear B cell epitope prediction web servers such as ABCpred, BCPREDs, Bepired, Bcepred and Elliprro. Then, Discotope, CBtope and SUPERFICIAL software tools were employed for conformational B cell epitope prediction. In contrast to previously reported epitopes of HER2 ECD we predicted conformational B cell epitopes $P1_C$: 378-393 (PESFDGDPASNTAPLQ) and $P2_C$: 500-510 (PEDECVGEGLA) by the integrated strategy and P4: PESFDGD-X-TAPLQ; P5: PESFDGDP X TAPLQ; P6: ESFDGDP X NTAPLQP; P7: PESFDGDP-X-NTAPLQ; P8: ESFDG-XX-TAPLQPEQL and P9: ESFDGDP-X-NTAPLQP by SUPERFICIAL software. These epitopes could be further used as peptide antigens to actively immune mice for development of new monoclonal antibodies and peptide cancer vaccines that target different epitopes or structural domains of HER2 ECD.

탄소동위원소분석을 이용한 한국 홀로세의 기후환경변화: 서해 영종도지역을 사례로 (Carbon Isotope Analysis for the Climatic Environment Change in South Korea During the Holocene: a Case Study in Yengjong Islands of Yellow Sea)

  • 정혜경;박지훈;김정빈
    • 한국지구과학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.313-321
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    • 2010
  • 연구지역의 지형은 해안과 인접한 소규모의 곡저평야에 속한다. 이 곡저평야는 낮은 구릉지 사이 개석된 곳에 충적물이 매적되어 형성되었다. 본 연구에서는 탄소안정동위원소비 분석과 토양유기탄소 분석을 이용하여 과거의 기후환경 복원을 시도하였다. I 시기(약 $6,600{\pm}60\;yr$ B.P.$-5,350{\pm}60\;yr$ B.P.)는 전반적으로 온난하고 습윤한 기후환경이었으나, 건습변화에 있어서는 약건조(또는 약습윤)${\rightarrow}$습윤의 미변화가 감지된다. II 시기(약 $5,350{\pm}60\;yr$ B.P.-2,200 yr B.P.)는 현재와 비슷한 온난습윤한 기후환경을 나타낸다. $4,720{\pm}60\;yr$ B.P.와 $4,210{\pm}50\;yr$ B.P. 사이는 전체 퇴적층 중 가장 습윤했던 것으로 파악된다. $4,210{\pm}50\;yr$ B.P. 이후에는 점차 습윤에서 약습윤(또는 약건조)환경으로 이행하는 과정이 나타난다. III 시기(약 2,200 yr B.P.$-210{\pm}60\;yr$ B.P.)는 앞선 두 시기와 확연히 구분되며, 약습윤(또는 약건조)의 기후환경을 나타낸다.

염소 또는 오존을 이용한 항생제 내성 유전오염물질 제어 (The Antibiotic Resistant Gene Pollutant Controls using Chlorine or Ozone disinfection)

  • 김성표;유대환;오준식;조윤철
    • 한국습지학회지
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    • 제13권3호
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    • pp.697-705
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    • 2011
  • 본 연구의 목적은 다제 항생제 내성특성을 가진 pB10을 함유한 Escherichia coli DH 5 alpha,(E.coli $DH5{\alpha}$)를 대상 미생물로 하여 염소와 오존의 살균효율을 비교하는 것이다. 또한 다제 내성플라스미드 pB10에 대한 염소와 오존에 의한 제거율을 조사하였다. 주입농도 대비 오존살균이 염소살균에 비해 약 1.2~1.4 배 정도 효율이 높게 나타났다. 또한 다제 내성플라스미드 pB10에 대한 제거 실험에서 오존에 의한 제거율이 염소보다 약 2~4배 높게 나타났다. 오존살균에 의한 높은 pB10 제거효율은 오존 살균시 발생하는 OH 라디칼에 의한 것으로 사료된다. 이러한 연구결과로부터 내성균 및 유전물질을 효과적으로 제어하기 위하여 기존 염소살균법에 오존 또는 광촉매산화와 같은 고급산화법을 연계처리에 대한 필요가 있을 것으로 판단된다.

Ionone류에 의한 랫드의 간엽별 cytochrome P450 유도 특성에 관한 연구 (Induction of Cytochrome P450 by Ionones in Liver Lobes of Sprague Dawley Rats)

  • 구희경;정태천;천영진;윤철호;노정구;최인경
    • Toxicological Research
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    • 제13권4호
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    • pp.385-391
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    • 1997
  • Inductive effects of cytochrome P450 2B1 by $\alpha$- and $\beta$-ionone were characterized in individual liver lobes of male Sprague Dawley rats. When rats were administered ionones orally at 100, 300, and 600 mg/kg for 24 hr, cytochrome P450 2B1 was induced dose-dependently in liver S-9 fractions as measured by P450 2B-specific monooxygenases and Western immunoblotting. The activity of P450 1A- and P450 2B-specific monooxygenases was differentially expressed in each lobe of normal liver. In addition, the monooxygenase activity was induced by $\alpha$- and $\beta$-ionone with different potency in each lobe of the liver. Our present results indicate that the different induction of P450s by $\alpha$- and $\beta$-ionone in each lobe may explain different susceptibilities of rat liver lobes to certain hepatotoxicants which require metabolic activation for their toxicity and that $\alpha$- and $\beta$-ionone may be useful model inducers of P450 2B1 in studying the toxic mechanism of certain toxicants which may require the metabolic activation by P450.

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