Browse > Article
http://dx.doi.org/10.5012/jkcs.2007.51.6.487

Research Using Energy Landscape  

Kim, Hack-Jin (Department of Chemistry, Chungnam National University)
Publication Information
Abstract
Energy landscape is a theoretical tool used for the study of systems where cooperative processes occur such as liquid, glass, clusters, and protein. Theoretical and experimental researches related to energy landscape are introduced in this review.
Keywords
Energy Landscape; Liquid; Glass; Molecular Clusters; Protein;
Citations & Related Records
Times Cited By KSCI : 1  (Citation Analysis)
Times Cited By SCOPUS : 1
연도 인용수 순위
1 Stillinger, F. H.; Weber, T. A. Science, 1984, 225, 983   DOI   ScienceOn
2 Frauenfelder, H.; Steinbach P. J.; Young, R. D. Chemica Scripta, 1989, 29A 145
3 McQuarrie, D. A. Statistical Mechanics, University Science, Sausalito, 2000
4 Stanley, E.; Buldyrev, S. V.; Franzese, G.; Giovambattista, N.; Starr, F. W. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 509   DOI   ScienceOn
5 J. N. Onuchic, J. N.; Wolynes, P. G.; Luthey-Schulten, Z.; Socci, N. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1995, 92, 3626   DOI   ScienceOn
6 Bowron, D. T.; Soper, A. K.; Finney, J. L. J. Chem. Phys. 2001, 114, 6203   DOI   ScienceOn
7 Zavista, A. J. Phys. Chem. B, 2001, 105, 7805   DOI   ScienceOn
8 Finney, J. L.; Bowron, D. T. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 469   DOI   ScienceOn
9 Doye, J. P. K.; Miller, M. A.; Wales, D. J. J. Chem. Phys. 2002, 116, 8307   DOI   ScienceOn
10 Miller, M. A.; Doye, J. P. K.; Wales, D. J. J. Chem. Phys. 2002, 110, 328
11 Doye, J. P. K.; Wales, D. J. J. Chem. Phys. 1999, 111, 11070   DOI   ScienceOn
12 Wales, D. J.; Doye, J. P. K.; Miller, M. A.; Mortenson, P. N.; Walsh, T. R. Adv. Chem. Phys. 2000, 115, 1   DOI
13 Kumeda, Y.; Wales, D. J. Chem. Phys. Lett. 2003, 374, 125   DOI   ScienceOn
14 Walsh, T. R.; Wales, D. J. J. Chem. Phys. 1998, 109, 6691   DOI   ScienceOn
15 Angell, C. A. J. Res. Natl. Inst. Stand. Technol. 1997, 102, 171   DOI   ScienceOn
16 Stillinger, F. H.; Debenedetti, P. G.; Truskett, T. M. J. Phys. Chem. B, 2001, 105, 11809   DOI   ScienceOn
17 Jansen, M. Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41, 3746   DOI   ScienceOn
18 Korzhnev, D. M.; Salvatella, X.; Vendruscolo, M.; DiNardo, A.; Davidson, A. R.; Dobson, C. M.; Kay, L. E. Nature, 2004, 430, 586   DOI   ScienceOn
19 Salamon, M. B., Jaime, M., Rev. Mod. Phys. 2001, 73, 583   DOI   ScienceOn
20 Ahn, K. H., Lookman, T., Bishop, A. R. Nature, 2004, 428, 401   DOI   ScienceOn
21 Vendruscolo, M.; Paci, E.; Karplus, M.; Dobson, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 14817   DOI   ScienceOn
22 Lindorff-Larsen, K.; Kristjansdottir, S.; Teilum, K.; Fieber, W.; Dobson, C. M.; Poulsen, F. M.; Vendruscolo, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3291   DOI   ScienceOn
23 Best, R. B.; Vendruscolo, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8090   DOI   ScienceOn
24 Brooks, C. L.; Onuchic, J. N.; Wales, D. J. Science, 2001, 293, 612   DOI   ScienceOn
25 Wales, D. J. Energy landscapes, Cambridge, UK, 2003
26 Kim, H. J. Kor. Chem. Soc. 2006, 50, 429   DOI   ScienceOn
27 Warrena, P. B.; Buchananb, M. Cur. Opi. Coll. Inter. Sci. 2001, 6, 287   DOI   ScienceOn
28 Dobson, C. M. Nature, 2003, 426, 884   DOI   ScienceOn
29 Yang, W. Y.; Gruebele, M. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 565   DOI   ScienceOn
30 Frauenfelder, H.; Fenimore, P. W.; Chen, G.; McMahon, B. H. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2006, 103, 15469   DOI   ScienceOn
31 Russell, E. V.; Israeloff, N. E. Nature, 2000, 408, 695   DOI   ScienceOn
32 Crowe, J. H.; Carpenter, J. F.; Crowe, L. M. Ann Rev Physiology, 1998, 60, 73   DOI   ScienceOn
33 Braly, L. B.; Liu, K.; Brown, M. G.; Keutch, F. N.; Fellers, R. S.; Saykally, R. J. J. Chem. Phys. 2000, 112, 10314   DOI   ScienceOn
34 Schuler, B.; Lipmann, E.; Eaton, W. A. Nature, 2002, 419, 743   DOI   ScienceOn
35 Kim, S.; Blainey, P. C.; Schroeder C. M.; Xie, X. S. Nature Methods, 2007, 4, 397
36 Braly, L. B.; Cruzan, J. D.; Liu, K.; Fellers, R. S.; Saykally, R. J. J. Chem. Phys. 2000, 112, 10293   DOI   ScienceOn
37 Liu, K.; Cruzan, J. D.; Saykally, R. J. Science, 1996, 271, 929   DOI   ScienceOn
38 Liu, K.; Brown, M. G.; Carter, C.; Saykally, R. J.; Gregory, J. K.; Clary, D. C. Nature, 1996, 381, 501   DOI   ScienceOn
39 Dian, B. C., Longarte, A. Zwier, T. S. Science, 2002, 296, 2369   DOI   ScienceOn
40 Wales, D. Internat. Rev. Phys. Chem. 2006, 25, 237   DOI   ScienceOn
41 Fu, J.; Yoo, J.; Han, J. Phys. Rev. Lett. 2006, 97, 018103   DOI   ScienceOn
42 Golding, C.; Senior, S.; Wilson, M. T.; O'Shear, P. Biochemistry, 1996, 20, 10931
43 Yang, W. Y.; Gruebele, M. Nature, 2003, 423, 193   DOI   ScienceOn
44 Weinan, E,; Ren, W.; Vanden-Eijnden, E. J. Appl. Phys. 2003, 93, 2275   DOI   ScienceOn
45 Rodriguez-Sponga, B.; Priceb, C. P.; Jayasankara, A.; Matzgerb, A. J.; Rodriguez-Hornedoa, N. Adv. Drug Delivery Rev. 2004, 56, 241   DOI   ScienceOn
46 Muthukumar, M. Adv. Polym. Sci. 2005, 191, 241   DOI
47 Kim, H.; Hambir, S.; Dlott, D. D. J. Phys. Chem. B, 2000, 104, 4239   DOI   ScienceOn
48 Hummer, G.; Szabo, A. Acc. Chem. Res. 2002, 38, 504   DOI   ScienceOn
49 Shen, V. K.; Debenedetti, P. G.; Stillinger, F. H. J. Phys. Chem. B, 2002, 106, 10447   DOI   ScienceOn
50 Ma, H.; Wan, C.; Wu, A.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2007, 104, 712   DOI   ScienceOn
51 Jarzynski, C. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 2690   DOI   ScienceOn
52 Liphardt, J.; Dumont, S.; Smith, S. B.; Tinoco, I.; Bustamante, C. Science, 2002, 296, 1832   DOI   ScienceOn
53 Rief, M., Grubmuller, H. ChemPhysChem, 2002, 3, 255   DOI   ScienceOn
54 Lindorff-Larsen, K.; Best, B. R.; Depristo, M. A.; Dobson, C. M.; Vendruscolo, M. Nature, 2005, 433, 128   DOI   ScienceOn
55 Jaroniec, C. P.; Macphee, C. E.; Astrof, N. S.; Dobson, C. M.; Griffin, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002, 99, 16748   DOI   ScienceOn
56 Jaroniec, C. P.; Macphee, C. E.; Bajaj, V. S.; MaMahon, M. T.; Dobson, C. M.; Griffin, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002, 101, 711   DOI   ScienceOn
57 Miehle, W.; Kandler, O.; Leisner, T.; Echt, O. J. Chem. Phys. 1989, 91, 5940   DOI
58 Ruan, C.-Y.; Vigliotti, F.; Lobastov, V. A.; Chen, S.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 1123   DOI   ScienceOn
59 Gedik, N.; Yang, D.-S.; Logvenov, G.; Bozovic, I.; Zewail, A. H. Science, 2007, 316, 425   DOI   ScienceOn
60 Castleman, A. W.; Bowen, K. H. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12911   DOI   ScienceOn
61 Miranker, A.; Robinson, C. V.; Radford, S. E.; Aplin, R. T.; Dobson, C. M. Science, 1993, 262, 896   DOI
62 Vendruscolo, M.; Dokholyan, N. V.; Paci. E.; Karplus, M. Phys. Rev. E, 2002, 65, 061910   DOI
63 Sobott, F.; MaCammon, M. G.; Hernandez, H.; Robinson, C. V. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 379   DOI   ScienceOn
64 Topics in Fluorescence spectroscopy, Ed. J. R. Lakowicz, Kluwer, New York, 2000
65 Newman, M. SIAM Rev. 2003, 45, 167   DOI   ScienceOn
66 Rao, F.; Caflisch, A. J. Mol. Biol. 2004, 342, 299   DOI   ScienceOn
67 Liu, K.; Brown, M. G.; Cruzan, J. D.; Saykally, R. J. Science, 1996, 271, 62   DOI   ScienceOn
68 Goldman, N.; Leforestier, C.; Saykally, R. J. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 493   DOI   ScienceOn
69 Dong, F.; Miller, R. E. Science, 2002, 298, 1227   DOI   ScienceOn
70 Lunkenheimer, P.; Loidl, A. Chem. Phys. 2002, 284, 205   DOI   ScienceOn
71 Schmidt, M.; Pahl, R.; Srajer, V.; Anderson, S.; Ren, Z.; Ihee, H.; Moffat, K. Proc. Natl. Acad. Sci. 2004, 101, 4799   DOI   ScienceOn
72 Goldstein, R.; Luthey-Schulten, Z.; Wolynes, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89, 4918   DOI   ScienceOn
73 Goldstein, R.; Luthey-Schulten, Z.; Wolynes, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89, 9029   DOI   ScienceOn
74 Egelstaff, P. A. An introduction to the liquid state, Oxford, Clarenson, 1994
75 Wilding, M. C.; Wilson, M.; McMillan, P. F. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 589   DOI   ScienceOn
76 Kellermayer, M. S. Z.; Smith, S. B.; Granzier, H. L.; Bustamante, C. Science, 1997, 276, 1112   DOI   ScienceOn
77 Zewail, A. H. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 315   DOI   ScienceOn
78 Ruan, C.-Y.; Lobastov, V. A.; Vigliotti, F.; Chen, S.; Zewail, A. H. Science, 2004, 304, 80   DOI   ScienceOn
79 Srinivasan, R.; Lobastov, V. A.; Ruan, C.-Y.; Zewail, A. H. Helv. Chim. Acta 2003, 86, 1763
80 Dyson, H. J.; Wright, P. E. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005, 6, 197   DOI   ScienceOn
81 Marques, I, M.; Borreguero, J. M.; Stanley,H. E.; Dokholyan, N. V. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 138103   DOI   ScienceOn
82 Austin, R. H.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L. Frauenfelder, H.; Gunsalus, I. C. Biochemistry, 1975, 14, 5356
83 Fenimore, P. W.; Frauenfelder, H.; McMahon, B. H,; Young, R. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 14408   DOI   ScienceOn
84 Wales, D. J.; Doye, J. P. K. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12409   DOI   ScienceOn
85 Becker, O. M., Karplus, M., J. Chem. Phys. 1997, 106, 1459
86 Zang, Y.; Skolnick, J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 7594   DOI   ScienceOn
87 Wales, D. J., Miller, M. A., Walsh, T. R. Nature, 1998, 394, 758   DOI   ScienceOn
88 Wolynes, P. G. Phil. Trans. R. Soc. A, 2005, 363, 453   DOI   ScienceOn
89 Tarverna, D. M.; Goldstein, R. A. J. Mol. Biol. 2002, 315, 479   DOI   ScienceOn