A Combined Pharmacophore-Based Virtual Screening, Docking Study and Molecular Dynamics (MD) Simulation Approach to Identify Inhibitors with Novel Scaffolds for Myeloid cell leukemia (Mcl-1) |
Bao, Guang-Kai
(College of Chemical Engineering, Sichuan University)
Zhou, Lu (College of Chemical Engineering, Sichuan University) Wang, Tai-Jin (College of Chemical Engineering, Sichuan University) He, Lu-Fen (College of Chemical Engineering, Sichuan University) Liu, Tao (College of Chemical Engineering, Sichuan University) |
1 | Sprague, P. W. Perspect. Drug. Discovery 1995, 3, 1-20. DOI |
2 | Vega, J. H. C.; Rassidakis, G. Z.; Admirand, G. H.; Oyarzo, M.; Ramalingam, P.; Paraguya, A.; McDonnell, T. J.; Amin, H. M.; Medeiros, L. J. Hum. Pathol. 2004, 35, 1095-1100. DOI |
3 | Warr, M. R.; Shore, G. C. Curr. Mol. Med. 2008, 8, 138-147. DOI ScienceOn |
4 | Kitada, S.; Andersen, J.; Akar, S.; Zapata, J. M.; Takayama, S.; Krajewski, S.; Wang, H. G.; Zhang, X.; Bullrich, F.; Croce, C. M.; Rai, K.; Hines, J.; Reed, J. C. Blood. 1998, 91, 3379-3389. |
5 | Khoury, J. D.; Medeiros, L. J.; Rassidakis, G. Z.; McDonnell, T. J.; Abruzzo, L V.; Lai, R. J. Pathol. 2003, 199, 90-97. DOI |
6 | Aichberger, K. J.; Mayerhofer, M.; Krauth, M. T.; Skvara, H.; Florian, S.; Sonneck, K.; Akgul, C.; Derdak, S.; Pickl, W. F.; Wacheck, V.; Selzer, E.; Monia, B. P.; Moriggl, R.; Valent, P.; Sillaber, C. Blood. 2005, 105, 3303-3311. DOI |
7 | Rechsteiner, M.; Rogers, S. W. Trends. Biochem. Sci. 1996, 21, 267-271. DOI |
8 | Domina, A. M.; Vrana, J. A.; Gregory, M. A.; Hann, S. R.; Craig, R. W. Oncogene. 2004, 23, 5301. DOI |
9 | Kozopas, K. M.; Yang, T.; Buchan, H. L.; Zhou. P.; Craig, R. W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1993, 90, 3516-3520. DOI ScienceOn |
10 | Kim, J. H.; Sim, S. H.; Ha, H. J.; Ko, J. J.; Lee, K.; Bae, J. FEBS. Lett. 2009, 583, 2758-2764. DOI |
11 | Bae, J.; Leo, C. P.; Hsu, S. Y.; Hsueh, A. J. W. J. Biol. Chem. 2000, 275, 25255-25261. DOI |
12 | Jones, G.; Willett, P.; Glen, R. C.; Leach, A. R.; Taylor, R. J. Mol. Biol. 1997, 267, 727-748. DOI ScienceOn |
13 | Sakkiah, S.; Thangapandian, S.; John, S.; Kwon, Y. J.; Lee, K. W. Eur. J. Med. Chem. 2010, 45, 2132-2140. DOI ScienceOn |
14 | Lipinski, C. A.; Lombarde, F.; Dominy, B. W.; Feeney, P. J. Adv. Drug. Deliv. Rev. 2001, 46, 3-26. DOI ScienceOn |
15 | Cheng, F.; Wang, Q.; Chen, M.; Quicho, F. A.; Ma, J. Proteins 2008, 70, 1228-1234. |
16 | Lindahl, E.; Hess, B,; Spoel, V. D. J. Mol. Mod. 2001, 7, 306-317. |
17 | Aalten, D. M. F.; Bywater, R.; Findlay, J. B. C.; Hendlish, M.; Hooft, R. W. W.; Vriend, G. J. Comput. Aided. Mol. Des. 1996, 10, 255-262. DOI |
18 | Wang, J. M.; Chao, J. R.; Chen, W.; Kuo, M. L. Mol. Cell. Biol. 1999, 19, 6195-6206. |
19 | Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092. DOI ScienceOn |
20 | Zhang, Z. C.; Yang, H.; Wu, G.; Li, Z. Q.; Song, T.; Li, X. Q. Eur. J. Med. Chem. 2011, 46, 3909-3916. DOI |
21 | Liu, X. H.; Yu, E. Z.; Li, Y. Y.; Kagan, E. J. Cell. Biochem. 2006, 97, 755-765. DOI ScienceOn |
22 | Moulding, D. A.; Giles, R. V.; Spillers, D. G.; White, M. R. H.; Tidd, D. M.; Edwards, S. W. Blood. 2000, 96, 1756-1763. |
23 | Friberg, A.; Vigil, D.; Zhao, B.; Daniels, R. N.; Jason, J. P.; Burke, P.; Barrantes, P. M. G.; Camper, D.; Chauder, B. A.; Lee, T.; Olejniczak, E. T.; Fesik, S. W. J. Med. Chem. 2013, 56, 15-30. DOI |
24 | Tang, G. Z.; Ding, K.; Coleska, Z. N.; Yang, C. Y.; Qiu, S.; Shangary, S.; Wang, S. M. J. Med. Chem. 2007, 50, 3163-3166. DOI |
25 | Zhang, Z. C.; Wu, G.; Xie, F.; Song, T.; Chang, X. J. Med. Chem. 2011, 54, 1101-1105. DOI |
26 | Bernardo, P. H.; Sivaraman, T.; Wan, K. F.; Xu, J.; Krishnamoorthy, J.; Song, C. M.; Tian, L.; Chin, J. S. F.; Chai, C. L. L. J. Med. Chem. 2010, 53, 2314-2318. DOI |
27 | Smellie, A.; Teig, S. L.; Towbin, P. J. Comput. Chem. 1995, 16, 171-187. DOI ScienceOn |
28 | Kansal, N.; Silakari, O.; Ravikumar, M. Eur. J. Med. Chem. 2010, 45, 393-404. DOI |
29 | Kurogi, Y.; Guner, O. F. Curr. Med. Chem. 2001, 8, 1035-1055. DOI ScienceOn |
30 | Minn, A. J.; Swain, R. E.; Ma, A.; Thompson, C. B. Adv. Immunol. 1998, 70, 245-279. DOI |
31 | Reed, J. C. Adv. Pharmacol. 1997, 41, 501-532. DOI |
32 | Chao, D. T.; Korsmeyer, S. J. Annul. Rev. Immunol. 1998, 16, 395-419. DOI ScienceOn |
33 | Kelly, P. N.; Strasser, A. Cell. Death. Differ. 2011, 18, 1414. DOI ScienceOn |
34 | Korsmeyer, S. J. Cancer. Res. 1999, 59, 1693s-1700s. |
35 | Youle, R. J.; Strasser, A. Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2008, 9, 47. DOI ScienceOn |
36 | Johnstone, R. W.; Ruefli, A. A.; Lowe, S. W. Cell. 2002, 108, 153-164. DOI ScienceOn |
37 | Zhang, Z. C.; Liu, C. W.; Li, X. Q.; Song, T.; Wu, Z. Y.; Liang, X. M.; Zhao, Y.; Shen, X. Y.; Chen, H. B. Eur. J. Med. Chem. 2013, 60, 410-420. DOI |
38 | Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472. DOI ScienceOn |
39 | Smellie, A.; Kahn, S. D.; Teig, S. L. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1995, 35, 285-304. DOI ScienceOn |
40 | Clement, O. O.; Freeman, C. M.; Hartmann, R. W.; Handratta, V. D.; Vasaitis, T. S.; Brodie, A. M. J. Med. Chem. 2003, 46, 2345-2351. DOI ScienceOn |
41 | Toumi, S. W.; Robillard, N.; Gomez, P.; Moreau, P.; Gouill, S. L.; Loiseau, H. A.; Harousseau, J. L.; Amiot, M.; Bataille, R. Leukemia. 2005, 19, 1248-1252. DOI ScienceOn |
42 | Derenne, S.; Monia, B.; Dean, N. M.; Taylor, J. K.; Rapp, M. J.; Harousseau, J. L.; Bataille, R.; Amiot, M. Blood. 2002, 100, 194-199. DOI ScienceOn |
43 | Adams, J. M.; Cory, S. Science 1998, 281, 1322-1326. DOI ScienceOn |
![]() |