Browse > Article
http://dx.doi.org/10.5012/bkcs.2012.33.12.3941

Non-unique Lennard-Jones Parameter Problem with a Monatomic Cation  

Won, Youngdo (Department of Chemistry, Hanyang University)
Publication Information
Keywords
Ion force field; Free energy simulation; Radial distribution function;
Citations & Related Records
연도 인용수 순위
  • Reference
1 Yu, H.; Whitfield, T. W.; Harder, E.; Lamoureux, G.; Vorobyov, I.; Anisimov, V. M.; MacKerell, A. D., Jr.; Roux, B. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 774.   DOI   ScienceOn
2 MacKerell, A. D., Jr. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1584.   DOI   ScienceOn
3 Beglov, D.; Roux, B. J. Chem. Phys. 1994, 100, 9050.   DOI   ScienceOn
4 Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.   DOI
5 Zacharias, M.; Straatsma, T. P.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1994, 100, 9025.   DOI   ScienceOn
6 Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011.   DOI
7 Ryckaert, W. E.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327.   DOI   ScienceOn
8 Brooks, B. R.; Brooks, C. L. III; MacKerell, A. D.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comp. Chem. 2009, 30, 1545.   DOI   ScienceOn
9 Marcus, Y. Biophys. Chem. 1994, 51, 111.   DOI   ScienceOn
10 Leach, A. R. Molecular Modelling, 2nd Ed. Prentice Hall: Essex U. K., 2001; p 210.
11 Joung, I. S.; Cheatham, T. E. III J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9020.   DOI   ScienceOn
12 Jensen, K. P.; Jorgensen, W. L. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1499.   DOI   ScienceOn
13 Aqvist, J. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8021.   DOI
14 Lamoureux, G.; Roux, B. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 3308.   DOI   ScienceOn
15 Horinek, D.; Mamatkulov, S. I.; Netz, R. R. J. Chem. Phys. 2009, 130, 124507.   DOI   ScienceOn
16 Fyta, M.; Kalcher, I.; Dzubiella, J.; Vrbka, L.; Netz, R. R. J. Chem. Phys. 2010, 132, 024911.   DOI   ScienceOn