Binding Mode Prediction of 5-Hydroxytryptamine 2C Receptor Ligands by Homology Modeling and Molecular Docking Analysis |
Ahmed, Asif
(Neuro-medicine centre, Life Sciences Division, Korea Institute of Science and Technology)
Nagarajan, Shanthi (Neuro-medicine centre, Life Sciences Division, Korea Institute of Science and Technology) Doddareddy, Munikumar Reddy (Neuro-medicine centre, Life Sciences Division, Korea Institute of Science and Technology) Cho, Yong-Seo (Neuro-medicine centre, Life Sciences Division, Korea Institute of Science and Technology) Pae, Ae-Nim (Neuro-medicine centre, Life Sciences Division, Korea Institute of Science and Technology) |
1 | Palczewski, K.; Kumasaka, T.; Hori, T.; Behnke, C. A.; Motoshima, H.; Fox, B. A.; Le Trong, I.; Teller, D. C.; Okada, T.; Stenkamp, R. E.; Yamamoto, M.; Miyano, M. Science 2000, 289, 739. DOI ScienceOn |
2 | Rosenbaum, D. M.; Cherezov, V.; Hanson, M. A.; Rasmussen, S. G. F.; Thian, F. S.; Kobilka, T. S.; Choi, H. J.; Yao, X. J.; Weis, W. I.; Stevens, R. C.; Kobilka, B. K. Science 2007, 318, 1266. DOI |
3 | Cherezov, V.; Rosenbaum, D. M.; Hanson, M. A.; Rasmussen, S. G. F.; Thian, F. S.; Kobilka, T. S.; Choi, H. J.; Kuhn, P.; Weis, W. I.; Kobilka, B. K.; Stevens, R. C. Science 2007, 318, 1258. DOI |
4 | Farce, A.; Dilly, S.; Yous, S.; Berthelot, P.; Chavatte, P. J. Enzym. Inhib. Med. Ch. 2006, 21, 285. DOI ScienceOn |
5 | Ahmed, A.; Choo, H.; Cho, Y. S.; Park, W. K.; Pae, A. N. Bioorganic & Medicinal Chemistry 2009, 17, 4559. DOI ScienceOn |
6 | Marti-Renom, M. A.; Stuart, A. C.; Fiser, A.; Sanchez, R.; Melo, F.; Sali, A. Annu. Rev. Bioph. Biom. 2000, 29, 291. DOI ScienceOn |
7 | Berman, H.; Henrick, K.; Nakamura, H.; Markley, J. L. Nucleic. Acids Research 2007, 35, D301. DOI ScienceOn |
8 | Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic. Acids Research 2000, 28, 235. DOI |
9 | Sali, A.; Blundell, T. L. Journal of Molecular Biology 1993, 234, 779. DOI ScienceOn |
10 | Laskowski, R. A.; Macarthur, M. W.; Moss, D. S.; Thornton, J. M. J. Appl. Crystallogr. 1993, 26, 283. DOI ScienceOn |
11 | Rarey, M.; Kramer, B.; Lengauer, T.; Klebe, G. Journal of Molecular Biology 1996, 261, 470. DOI ScienceOn |
12 | Ennis, M. D.; Hoffman, R. L.; Ghazal, N. B.; Olson, R. M.; Knauer, C. S.; Chio, C. L.; Hyslop, D. K.; Campbell, J. E.; Fitzgerald, L. W.; Nichols, N. F.; Svensson, K. A.; McCall, R. B.; Haber, C. L.; Kagey, M. L.; Dinh, D. M. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2003, 13, 2369. DOI ScienceOn |
13 | Welmaker, G. S.; Nelson, J. A.; Sabalski, J. E.; Sabb, A. L.; Potoski, J. R.; Graziano, D.; Kagan, M.; Coupet, J.; Dunlop, J.; Mazandarani, H.; Rosenzweig-Lipson, S.; Sukoff, S.; Zhang, Y. X. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2000, 10, 1991. DOI ScienceOn |
14 | May, J. A.; Dantanarayana, A. P.; Zinke, P. W.; McLaughlin, M. A.; Sharif, N. A. J. Med. Chem. 2006, 49, 318. DOI ScienceOn |
15 | Gross, J. L.; Williams, M. J.; Stack, G. P.; Gao, H.; Zhou, D. USA Patent, WO/2006/116151 2005. |
16 | Fredriksson, R.; Lagerstrom, M. C.; Lundin, L. G.; Schioth, H. B. Mol. Pharmacol. 2003, 63, 1256. DOI ScienceOn |
17 | Takeda, S.; Kadowaki, S.; Haga, T.; Takaesu, H.; Mitaku, S. Febs. Letters 2002, 520, 97. DOI ScienceOn |
18 | Tierney, A. J. Comp. Biochem. Phys. A 2001, 128, 791. DOI ScienceOn |
19 | Hoyer, D.; Hannon, J. P.; Martin, G. R. Pharmacol. Biochem. Be. 2002, 71, 533. DOI ScienceOn |
20 | Hoyer, D.; Clarke, D. E.; Fozard, J. R.; Hartig, P. R.; Martin, G. R.; Mylecharane, E. J.; Saxena, P. R.; Humphrey, P. P. A. Pharmacological Reviews 1994, 46, 157. |
21 | Burns, C. M.; Chu, H.; Rueter, S. M.; Hutchinson, L. K.; Canton, H.; SandersBush, E.; Emeson, R. B. Nature 1997, 387, 303. DOI ScienceOn |
22 | Leysen, J. E. Curr. Drug Targets CNS Neurol. Disord. 2004, 3, 11. DOI |
23 | Roth, B. L.; Willins, D. L.; Kristiansen, K.; Kroeze, W. K. Pharmacol. Therapeut. 1998, 79, 231. DOI ScienceOn |
24 | Pranzatelli, M. R.; Murthy, J. N.; Pluchino, R. S. J. Pharmacol. Exp. Ther. 1992, 261, 161. |
25 | Prous. Drug Data Report 2002, 24, 761. |
26 | Harada, K.; Aota, M.; Inoue, T.; Matsuda, R.; Mihara, T.; Yamaji, T.; Ishibashi, K.; Matsuoka, N. Eur. J. Pharmacol 2006, 553, 171. DOI ScienceOn |
27 | Lavielle, G.; Muller, O.; Millan, M.; Gobert, A.; Di Cara, B. US Patent 6998403 2006. |
28 | Goodacre, C. J.; Bromidge, S. M.; Clapham, D.; King, F. D.; Lovell, P. J.; Allen, M.; Campbell, L. P.; Holland, V.; Riley, G. J.; Starr, K. R.; Trail, B. K.; Wood, M. D. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2005, 15, 4989. DOI ScienceOn |
29 | Patrick, G. L. An Introduction to Medicinal Chemistry; Oxford University Press: New York, 2005. |
30 | Thompson, J. D.; Higgins, D. G.; Gibson, T. J. Nucleic Acids Research 1994, 22, 4673. DOI |
31 | Muntasir, H. A.; Takahashi, J.; Rashid, M.; Ahmed, M.; Komiyama, T.; Hossain, M.; Kawakami, J.; Nashimoto, M.; Nagatomo, T. Biol. Pharm. Bull. 2006, 29, 1645. DOI ScienceOn |
32 | Wang, C. D.; Gallaher, T. K.; Shih, J. C. Mol. Pharmacol 1993, 43, 931. |
33 | Herrick-Davis, K.; Grinde, E.; Harrigan, T. J.; Mazurkiewicz, J. E. J. Biol. Chem. 2005, 280, 40144. DOI ScienceOn |
34 | Roth, B. L.; Shoham, M.; Choudhary, M. S.; Khan, N. Mol. Pharmacol 1997, 52, 259. DOI |
35 | Choudhary, M. S.; Craigo, S.; Roth, B. L. Mol. Pharmacol 1993, 43, 755. |
36 | Rashid, M.; Manivet, P.; Nishio, H.; Pratuangdejkul, J.; Rajab, M.; Ishiguro, M.; Launay, J. M.; Nagatomo, T. Life Sciences 2003, 73, 193. DOI ScienceOn |
37 | Rasmussen, S. G. F.; Choi, H. J.; Rosenbaum, D. M.; Kobilka, T. S.; Thian, F. S.; Edwards, P. C.; Burghammer, M.; Ratnala, V. R. P.; Sanishvili, R.; Fischetti, R. F.; Schertler, G. F. X.; Weis, W. I.; Kobilka, B. K. Nature 2007, 450, 383. DOI ScienceOn |
38 | Niswender, C. M.; Copeland, S. C.; Herrick-Davis, K.; Emeson, R. B.; Sanders-Bush, E. J. Biol. Chem. 1999, 274, 9472. DOI ScienceOn |
39 | Abramowski, D.; Staufenbiel, M. J. Neurochem. 1995, 65, 782. |
40 | Becamel, C.; Alonso, G.; Geleotti, N.; Demey, E.; Jouin, P.; Ullmer, C.; Dumuis, A.; Bockaert, J.; Marin, P. Embo. J. 2002, 21, 2332. DOI ScienceOn |
41 | Bickerdike, M. J. Current Topics in Medicinal Chemistry 2003, 3, 885. DOI ScienceOn |
42 | Smith, B. M.; Thomsen, W. J.; Grottick, A. J. Expert. Opinion on Investigational Drugs 2006, 15, 257. DOI ScienceOn |