1 |
Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D.
A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157.
DOI
|
2 |
Wang, J.; Wang, W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Mol. Graph.
Model. 2006, 25, 247.
DOI
ScienceOn
|
3 |
Weichsel, A.; Gasdaska, J. R.; Powis, G.; Montfort, W. R. Structure
1996, 4, 735.
DOI
|
4 |
Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.;
Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577.
DOI
|
5 |
Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J.
Comp. Chem. 1997, 18, 1463.
DOI
|
6 |
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola,
A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
DOI
|
7 |
Buemi, G. Chem. Phys. 2002, 282, 181.
DOI
|
8 |
Granzhan, V. A.; Kolesnik, M. I. J. Struct. Chem. 1971, 11, 995.
DOI
|
9 |
Takezaki, M.; Hirota, N.; Terazima, M.; Sato, H.; Nakajima, T.;
Kato, S. J. Phys. Chem. 1997, 101, 5190.
DOI
|
10 |
Beckman, J. S. Chem. Res. Toxicol. 1996, 9, 836.
DOI
|
11 |
Abello, N.; Kerstjens, H. A.; Postma, D. S.; Bischoff, R. J. Proteome.
Res. 2009, 8, 3222.
DOI
|
12 |
Yamakura, F.; Ikeda, K. Nitric Oxide 2006, 14, 152.
DOI
|
13 |
Souza, J. M.; Peluffo, G.; Radi, R. Free Radic. Biol. Med. 2008,
45, 357.
DOI
|
14 |
Smith, C. D.; Carson, M.; van der Woerd, M.; Chen, J.; Ischiropoulos,
H.; Beckman, J. S. Arch. Biochem. Biophys. 1992, 299,
350.
DOI
|
15 |
Savvides, S. N.; Scheiwein, M.; Bohme, C. C.; Arteel, G. E.; Karplus,
P. A.; Becker, K.; Schirmer, R. H. J. Biol. Chem. 2002, 277,
2779.
DOI
|
16 |
Quint, P.; Reutzel, R.; Mikulski, R.; McKenna, R.; Silverman, D.
N. Free Radic. Biol. Med. 2006, 40, 453.
DOI
|
17 |
Lyashenko, A. V.; Zhukhlistova, N. E.; Gabdoulkhakov, A. G.;
Zhukova, Y. N.; Voelter, W.; Zaitsev, V. N.; Bento, I.; Stepanova,
E. V.; Kachalova, G. S.; Koroleva, O. V.; Cherkashyn, E. A.; Tishkov,
V. I.; Lamzin, V. S.; Schirwitz, K.; Morgunova, E. Y.; Betzel,
C.; Lindley, P. F.; Mikhailov, A. M. Acta Crystallogr. Sect.
F Struct. Biol. Cryst. Commun. 2006, 62, 954.
DOI
|
18 |
Han, S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008, 377, 612.
DOI
|
19 |
Goddard, T. D.; Huang, C. C.; Ferrin, T. E. J. Struct. Biol. 2007,
157, 281.
DOI
|
20 |
Frisch, M. J. et al., Gaussian03 program, Revision A.9 package,
Gaussian, Inc.; Pittsburgh, PA, 2003.
|
21 |
Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem.
Theory Comput. 2008, 4, 435.
DOI
ScienceOn
|
22 |
Sorin, E. J.; Pande, V. S. Biophys. J. 2005, 88, 2472. Also visit
http://chemistry.csulb.edu/ffamber
DOI
|
23 |
Zhang, H.; Tao, L.; Jiao, X.; Gao, E.; Lopez, B. L.; Christopher,
T. A.; Koch, W.; Ma, X. L. Free Radic. Biol. Med. 2007, 43, 39.
DOI
|
24 |
Borisenko, K. B.; Hargittai, I. J. Mol. Struct. 1996, 382, 171.
DOI
|
25 |
Han, S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2007, 362, 532.
DOI
|
26 |
Tao, L.; Jiao, X.; Gao, E.; Lau, W. B.; Yuan, Y.; Lopez, B.; Christopher,
T.; RamachandraRao, S. P.; Williams, W.; Southan, G,;
Sharma, K.; Koch, W.; Ma, X. L. Circulation 2006, 114, 1395.
DOI
|
27 |
Wang, J.; Cieplak, P.; Kollman, P. A. J. Comp. Chem. 2000, 21,
1049.
DOI
|
28 |
Pearlman, D. A.; Case, D. A.; Caldwell, J. W.; Ross, W. R.; Cheatham,
I. T. E.; De-Bolt, S.; Ferguson, D.; Seibel, G.; Kollman, P.
Comp. Phys. Commun. 1995, 91, 1.
DOI
|
29 |
Mobley, D. L.; Chodera, J. D.; Dill, K. A. J. Chem. Phys. 2006,
125, 084902.
DOI
|
30 |
Pigache, A.; Cieplak, P.; Dupradeau, F.-Y. Automatic and highly
reproducible RESP and ESP charge derivation: Application to the
development of programs RED and X RED, 227th ACS National
Meeting, Anaheim, CA, USA, March 28 - April 1, 2004. Also visit
http://q4md-forcefieldtools.org/RED/
|
31 |
Cieplak, P.; Cornell, W. D.; Bayly, C.; Kollman, P. A. J. Comput.
Chem. 1995, 16, 1357.
DOI
|
32 |
Roncone, R.; Barbieri, M.; Monzani, E.; Casella, L. Coord. Chem.
Rev. 2006, 250, 1286.
DOI
|