1 |
Gebauer, F.; Schwarzl, T.; Valcarcel, J.; Hentze, M.W. Nature Reviews Genetics 2021, 22, 185. DOI: 10.1038/s41576-020-00302-y.
DOI
|
2 |
Bunnik, E.M.; Batugedara, G.; Saraf, A.; Prudhomme, J.; Florens, L.; Le Roch, K.G. Genome Biol. 2016, 17, 1. DOI: 10.1186/s13059-016-1014-0.
DOI
|
3 |
Trendel, J.; Schwarzl, T.; Horos, R.; Prakash, A.; Bateman, A.; Hentze, M.W.; Krijgsveld, J. Cell 2019, 176, 391. DOI: 10.1016/j.cell.2018.11.004.
DOI
|
4 |
Urdaneta, E.C.; Vieira-Vieira, C.H.; Hick, T.; Wessels, H.-H.; Figini, D.; Moschall, R.; Medenbach, J.; Ohler, U.; Granneman, S.; Selbach, M.; Beckmann, B.M. Nature Communications 2019, 10, 1. DOI: 10.1038/s41467-019-08942-3.
DOI
|
5 |
Smirnov, A.; Foerstner, K.U.; Holmqvist, E.; Otto, A.; Guenster, R.; Becher, D.; Reinhardt, R.; Vogel, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2016, 113, 11591. DOI: 10.1073/pnas.1609981113.
DOI
|
6 |
Asencio, C.; Chatterjee, A.; Hentze, M.W. Life Science Alliance 2018, 1, e201800088. DOI: 10.26508/lsa.201800088.
DOI
|
7 |
Koo, K.; Foegeding, P.M.; Swaisgood, H.E. Biotechnol. Tech. 1998, 12, 549. DOI: 10.1023/a:1008859632378.
DOI
|
8 |
Shchepachev, V.; Bresson, S.; Spanos, C.; Petfalski, E.; Fischer, L.; Rappsilber, J.; Tollervey, D. Mol. Syst. Biol. 2019, 15, e8689. DOI: 10.15252/msb.20188689.
DOI
|
9 |
Yan, S.; Zhao, D.; Wang, C.; Wang, H.; Guan, X.; Gao, Y.; Zhang, X.; Zhang, N.; Chen, R. Anal. Chim. Acta 2021, 1168, 338609. DOI: 10.1016/j.aca.2021.338609.
DOI
|
10 |
Aw, J.G.A.; Shen, Y.; Wilm, A.; Sun, M.; Lim, X.N.; Boon, K.-L.; Tapsin, S.; Chan, Y.-S.; Tan, C.-P.; Sim, A.Y.L.; Zhang, T.; Susanto, T.T.; Fu, Z.; Nagarajan, N.; Wan, Y. Mol. Cell 2016, 62, 603. DOI: 10.1016/j.molcel.2016.04.028.
DOI
|
11 |
Jankowsky, E.; Harris, M.E. Nature Reviews Molecular Cell Biology 2015, 16, 533. DOI: 10.1038/nrm4032.
DOI
|
12 |
Nair, L.; Chung, H.; Basu, U. Nature Reviews Molecular Cell Biology 2020, 21, 123. DOI: 10.1038/s41580-019-0209-0.
DOI
|
13 |
Dreyfuss, G.; Kim, V.N.; Kataoka, N. Nature Reviews Molecular Cell Biology 2002, 3, 195. DOI: 10.1038/nrm760.
DOI
|
14 |
Sonenberg, N.; Hinnebusch, A.G. Cell 2009, 136, 731. DOI: 10.1016/j.cell.2009.01.042.
DOI
|
15 |
Burger, K.; Muehl, B.; Kellner, M.; Rohrmoser, M.; Gruber-Eber, A.; Windhager, L.; Friedel, C.C.; Doelken, L.; Eick, D. RNA Biol. 2013, 10, 1623. DOI: 10.4161/rna.26214.
DOI
|
16 |
Gerstberger, S.; Hafner, M.; Tuschl, T. Nature Reviews Genetics 2014, 15, 829. DOI: 10.1038/nrg3813.
DOI
|
17 |
Koehler, A.; Hurt, E. Nature Reviews Molecular Cell Biology 2007, 8, 761. DOI: 10.1038/nrm2255.
DOI
|
18 |
Chen, R.; Liu, Y.; Zhuang, H.; Yang, B.; Hei, K.; Xiao, M.; Hou, C.; Gao, H.; Zhang, X.; Jia, C.; Li, L.; Li, Y.; Zhang, N. Nucleic Acids Res. 2017, 45, 9947. DOI: 10.1093/nar/gkx600.
DOI
|
19 |
Cooper, T.A.; Wan, L.; Dreyfuss, G. Cell 2009, 136, 777. DOI: 10.1016/j.cell.2009.02.011.
DOI
|
20 |
Huang, A.; Zheng, H.; Wu, Z.; Chen, M.; Huang, Y. Theranostics 2020, 10, 3503. DOI: 10.7150/thno.42174.
DOI
|
21 |
Liao, Y.; Castello, A.; Fischer, B.; Leicht, S.; Foeehr, S.; Frese, C.K.; Ragan, C.; Kurscheid, S.; Pagler, E.; Yang, H.; Krijgsveld, J.; Hentze, M.W.; Preiss, T. Cell Reports 2016, 16, 1456. DOI: 10.1016/j.celrep.2016.06.084.
DOI
|
22 |
Jazurek, M.; Ciesiolka, A.; Starega-Roslan, J.; Bilinska, K.; Krzyzosiak, W.J. Nucleic Acids Res. 2016, 44, 9050. DOI: 10.1093/nar/gkw803.
DOI
|
23 |
Koenig, J.; Zarnack, K.; Luscombe, N.M.; Ule, J. Nature Reviews Genetics 2012, 13, 77. DOI: 10.1038/nrg3141.
DOI
|
24 |
Pereira, B.; Billaud, M.; Almeida, R. Trends In Cancer 2017, 3, 506. DOI: 10.1016/j.trecan.2017.05.003.
DOI
|
25 |
Castello, A.; Fischer, B.; Hentze, M.W.; Preiss, T. Trends Genet. 2013, 29, 318. DOI: 10.1016/j.tig.2013.01.004.
DOI
|
26 |
McHugh, C.A.; Russell, P.; Guttman, M. Genome Biol. 2014, 15, 203. DOI: 10.1186/gb4152.
DOI
|
27 |
Beckmann, B.M.; Horos, R.; Fischer, B.; Castello, A.; Eichelbaum, K.; Alleaume, A.-M.; Schwarzl, T.; Curk, T.; Foehr, S.; Huber, W.; Krijgsveld, J.; Hentze, M.W. Nature Communications 2015, 6, 1. DOI: 10.1038/ncomms10127.
DOI
|
28 |
Nechay, M.; Kleiner, R.E. Curr. Opin. Chem. Biol. 2020, 54, 37. DOI: 10.1016/j.cbpa.2019.11.002.
DOI
|
29 |
Castello, A.; Fischer, B.; Eichelbaum, K.; Horos, R.; Beckmann, B.M.; Strein, C.; Davey, N.E.; Humphreys, D.T.; Preiss, T.; Steinmetz, L.M.; Krijgsveld, J.; Hentze, M.W. Cell 2012, 149, 1393. DOI: 10.1016/j.cell.2012.04.031.
DOI
|
30 |
Baltz, A.G.; Munschauer, M.; Schwanhaeusser, B.; Vasile, A.; Murakawa, Y.; Schueler, M.; Youngs, N.; PenfoldBrown, D.; Drew, K.; Milek, M.; Wyler, E.; Bonneau, R.; Selbach, M.; Dieterich, C.; Landthaler, M. Mol. Cell 2012, 46, 674. DOI: 10.1016/j.molcel.2012.05.021.
DOI
|
31 |
Conrad, T.; Albrecht, A.-S.; Costa, V.R.d.M.; Sauer, S.; Meierhofer, D.; Orom, U.A. Nature Communications 2016, 7, 1. DOI: 10.1038/ncomms11212.
DOI
|
32 |
Kramer, K.; Sachsenberg, T.; Beckmann, B.M.; Qamar, S.; Boon, K.-L.; Hentze, M.W.; Kohlbacher, O.; Urlaub, H. Nat. Methods 2014, 11, 1064. DOI: 10.1038/nmeth.3092.
DOI
|
33 |
Kwon, S.C.; Yi, H.; Eichelbaum, K.; Foehr, S.; Fischer, B.; You, K.T.; Castello, A.; Krijgsveld, J.; Hentze, M.W.; Kim, V.N. Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 1122. DOI: 10.1038/nsmb.2638.
DOI
|
34 |
Mitchell, S.F.; Jain, S.; She, M.; Parker, R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 127. DOI: 10.1038/nsmb.2468.
DOI
|
35 |
Wessels, H.-H.; Imami, K.; Baltz, A.G.; Kolinski, M.; Beldovskaya, A.; Selbach, M.; Small, S.; Ohler, U.; Landthaler, M. Genome Res. 2016, 26, 1000. DOI: 10.1101/gr.200386.115.
DOI
|
36 |
Perez-Perri, J.I.; Rogell, B.; Schwarzl, T.; Stein, F.; Zhou, Y.; Rettel, M.; Brosig, A.; Hentze, M.W. Nature Communications 2018, 9, 1. DOI: 10.1038/s41467-018-06557-8.
DOI
|
37 |
Despic, V.; Dejung, M.; Gu, M.; Krishnan, J.; Zhang, J.; Herzel, L.; Straube, K.; Gerstein, M.B.; Butter, F.; Neugebauer, K.M. Genome Res. 2017, 27, 1184. DOI: 10.1101/gr.215954.116.
DOI
|
38 |
Matia-Gonzalez, A.M.; Laing, E.E.; Gerber, A.P. Nat. Struct. Mol. Biol. 2015, 22, 1027. DOI: 10.1038/nsmb.3128.
DOI
|
39 |
Nandan, D.; Thomas, S.A.; Nguyen, A.; Moon, K.-M.; Foster, L.J.; Reiner, N.E. PLoS One 2017, 12, e0170068. DOI: 10.1371/journal.pone.0170068.
DOI
|
40 |
Huang, R.; Han, M.; Meng, L.; Chen, X. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2018, 115, E3879. DOI: 10.1073/pnas.1718406115.
DOI
|
41 |
Ramanathan, M.; Porter, D.F.; Khavari, P.A. Nat. Methods 2019, 16, 225. DOI: 10.1038/s41592-019-0330-1.
DOI
|
42 |
Sysoev, V.O.; Fischer, B.; Frese, C.K.; Gupta, I.; Krijgsveld, J.; Hentze, M.W.; Castello, A.; Ephrussi, A. Nature Communications 2016, 7, 1. DOI: 10.1038/ncomms12128.
DOI
|
43 |
Lueong, S.; Merce, C.; Fischer, B.; Hoheisel, J.D.; Erben, E.D. Mol. Microbiol. 2016, 100, 457. DOI: 10.1111/mmi.13328.
DOI
|
44 |
Reichel, M.; Liao, Y.; Rettel, M.; Ragan, C.; Evers, M.; Alleaume, A.-M.; Horos, R.; Hentze, M.W.; Preiss, T.; Millar, A.A. Plant Cell 2016, 28, 2435. DOI: 10.1105/tpc.16.00562.
DOI
|
45 |
Marondedze, C.; Thomas, L.; Serrano, N.L.; Lilley, K.S.; Gehring, C. Sci. Rep. 2016, 6, 1. DOI: 10.1038/srep29766.
DOI
|
46 |
Hentze, M.W.; Castello, A.; Schwarzl, T.; Preiss, T. Nature Reviews Molecular Cell Biology 2018, 19, 327. DOI: 10.1038/nrm.2017.130.
DOI
|
47 |
Qin, W.; Myers, S.A.; Carey, D.K.; Carr, S.A.; Ting, A.Y. Nature Communications 2021, 12, 1. DOI: 10.1038/s41467-021-25259-2.
DOI
|
48 |
Liepelt, A.; Naarmann-de Vries, I.S.; Simons, N.; Eichelbaum, K.; Foehr, S.; Archer, S.K.; Castello, A.; Usadel, B.; Krijgsveld, J.; Preiss, T.; Marx, G.; Hentze, M.W.; Ostareck, D.H.; Ostareck-Lederer, A. Mol. Cell. Proteomics 2016, 15, 2699. DOI: 10.1074/mcp.M115.056564.
DOI
|
49 |
Kamel, W.; Noerenberg, M.; Cerikan, B.; Chen, H.; Ja, A.I.; Kammoun, M.; Lee, J.Y.; Shuai, N.; Garcia-Moreno, M.; Andrejeva, A.; Deery, M.J.; Johnson, N.; Neufeldt, C.J.; Cortese, M.; Knight, M.L.; Lilley, K.S.; Martinez, J.; Davis, I.; Bartenschlager, R.; Mohammed, S.; Castello, A. Mol. Cell 2021, 81, 2851. DOI: 10.1016/j.molcel.2021.05.023.
DOI
|
50 |
Castello, A.; Frese, C.K.; Fischer, B.; Jarvelin, A.I.; Horos, R.; Alleaume, A.-M.; Foehr, S.; Curk, T.; Krijgsveld, J.; Hentze, M.W. Nat. Protoc. 2017, 12, 2447. DOI: 10.1038/nprot.2017.106.
DOI
|
51 |
Harris, M.E.; Christian, E.L. 2009. RNA Crosslinking methods. In Methods In Enzymology, Vol 468: Biophysical, Chemical, And Functional Probes Of Rna Structure, Interactions And Folding, Pt A. D. Herschalag, editor. 127.
|
52 |
Zhang, Z.; Liu, T.; Dong, H.; Li, J.; Sun, H.; Qian, X.; Qin, W. Nucleic Acids Res. 2021, 49, e65. DOI: 10.1093/nar/gkab156.
DOI
|
53 |
Zhang, Y.; Chan, P.P.Y.; Herr, A.E. Angewandte ChemieInternational Edition 2018, 57, 2357. DOI: 10.1002/anie.201711441.
DOI
|
54 |
Qin, W.; Cho, K.F.; Cavanagh, P.E.; Ting, A.Y. Nat. Methods 2021, 18, 133. DOI: 10.1038/s41592-020-01010-5.
DOI
|
55 |
Luo, H.; Tang, W.; Liu, H.; Zeng, X.; Ngai, W.S.C.; Gao, R.; Li, H.; Li, R.; Zheng, H.; Guo, J.; Qin, F.; Wang, G.; Li, K.; Fan, X.; Zou, P.; Chen, P.R. Angewandte ChemieInternational Edition 2022, 61, e202202008. DOI: 10.1002/anie.202202008.
DOI
|
56 |
Castello, A.; Fischer, B.; Frese, C.K.; Horos, R.; Alleaume, A.-M.; Foehr, S.; Curk, T.; Krijgsveld, J.; Hentze, M.W. Mol. Cell 2016, 63, 696. DOI: 10.1016/j.molcel.2016.06.029.
DOI
|
57 |
Garcia-Moreno, M.; Noerenberg, M.; Ni, S.; Jarvelin, A.I.; Gonzalez-Almela, E.; Lenz, C.E.; Bach-Pages, M.; Cox, V.; Avolio, R.; Davis, T.; Hester, S.; Sohier, T.J.M.; Li, B.; Heikel, G.; Michlewski, G.; Sanz, M.A.; Carrasco, L.; Ricci, E.P.; Pelechano, V.; Davis, I.; Fischer, B.; Mohammed, S.; Castello, A. Mol. Cell 2019, 74, 196. DOI: 10.1016/j.molcel.2019.01.017.
DOI
|
58 |
Benhalevy, D.; Anastasakis, D.G.; Hafner, M. Nat. Methods 2018, 15, 1074. DOI: 10.1038/s41592-018-0220-y.
DOI
|
59 |
Sun, W.; Wang, N.; Liu, H.; Yu, B.; Jin, L.; Ren, X.; Shen, Y.; Wang, L. Nat. Chem. 2022. DOI: 10.1038/s41557-022-01038-4.
DOI
|
60 |
Smith, T.; Villanueva, E.; Queiroz, R.M.L.; Dawson, C.S.; Elzek, M.; Urdaneta, E.C.; Willis, A.E.; Beckmann, B.M.; Krijgsveld, J.; Lilley, K.S. Curr. Opin. Chem. Biol. 2020, 54, 70. DOI: 10.1016/j.cbpa.2020.01.009.
DOI
|
61 |
Bao, X.; Guo, X.; Yin, M.; Tariq, M.; Lai, Y.; Kanwal, S.; Zhou, J.; Li, N.; Lv, Y.; Pulido-Quetglas, C.; Wang, X.; Ji, L.; Khan, M.J.; Zhu, X.; Luo, Z.; Shao, C.; Lim, D.-H.; Liu, X.; Li, N.; Wang, W.; He, M.; Liu, Y.-L.; Ward, C.; Wang, T.; Zhang, G.; Wang, D.; Yang, J.; Chen, Y.; Zhang, C.; Jauch, R.; Yang, Y.-G.; Wang, Y.; Qin, B.; Anko, M.-L.; Hutchins, A.P.; Sun, H.; Wang, H.; Fu, X.-D.; Zhang, B.; Esteban, M.A. Nat. Methods 2018, 15, 213. DOI: 10.1038/nmeth.4595.
DOI
|
62 |
Tani, H.; Akimitsu, N. RNA Biol. 2012, 9, 1233. DOI: 10.4161/rna.22036.
DOI
|
63 |
Chomczynski, P.; Sacchi, N. Nat. Protoc. 2006, 1, 581. DOI: 10.1038/nprot.2006.83.
DOI
|
64 |
Queiroz, R.M.L.; Smith, T.; Villanueva, E.; Marti-Solano, M.; Monti, M.; Pizzinga, M.; Mirea, D.-M.; Ramakrishna, M.; Harvey, R.F.; Dezi, V.; Thomas, G.H.; Willis, A.E.; Lilley, K.S. Nat. Biotechnol. 2019, 37, 169. DOI: 10.1038/s41587-018-0001-2.
DOI
|