The Korean Journal of Mycology (한국균학회지)

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Comparative Molecular Phylogenetic Relationships in Different Strains of Pleurotus spp.

느타리속 버섯 계통의 분자생물학적 유연관계의 비교연구

  • Cho, Hae-Jin (Division of Life Sciences, University of Incheon) ;
  • Lee, Jae-Seong (Division of Life Sciences, University of Incheon) ;
  • Yoon, Ki-Nam (Division of Life Sciences, University of Incheon) ;
  • Alam, Nuhu (Division of Life Sciences, University of Incheon) ;
  • Lee, Kyung-Lim (Division of Life Sciences, University of Incheon) ;
  • Shim, Mi-Ja (Department of Life Science, University of Seoul) ;
  • Lee, Min-Woong (Department of Life Science, Dongguk University) ;
  • Cheong, Jong-Chun (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, RDA) ;
  • Shin, Pyung-Gyun (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, RDA) ;
  • Yoo, Young-Bok (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, RDA) ;
  • Lee, U-Youn (Division of Life Sciences, University of Incheon) ;
  • Lee, Tae-Soo (Division of Life Sciences, University of Incheon)
  • 조해진 (인천대학교 생명과학부) ;
  • 이재성 (인천대학교 생명과학부) ;
  • 윤기남 (인천대학교 생명과학부) ;
  • ;
  • 이경림 (인천대학교 생명과학부) ;
  • 심미자 (서울시립대학교 생명과학과) ;
  • 이민웅 (동국대학교 생명과학과) ;
  • 정종천 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 신평균 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 유영복 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 이우윤 (인천대학교 생명과학부) ;
  • 이태수 (인천대학교 생명과학부)
  • Received : 2010.12.14
  • Accepted : 2010.12.21
  • Published : 2010.12.31
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Abstract

Pleurotus spp. have been used for edible and medicinal purposes in Asian countries for a long time. The fruiting bodies of the Pleurotus ostreatus, Pleurotus citrinopileatus and Pleurotus salmoneostramineus contained many physiologically beneficial substances for human health. Therefore, it is necessary to study the genetic diversity of Pleurotus mushroom cultivars commercially cultivated in Korea. Eleven strains of Pleurotus spp. were collected from different geographical regions in South-East Asia and ITS regions of rDNA and RAPD of genomic DNA were analyzed. The size of the ITS1 and ITS2 regions of rDNA from the different strains varied from 167 to 254 bp and 156 to 213 bp, respectively. The sequence of ITS1 was more variable than that of ITS2, and the 5.8S sequences were identical. A phylogenetic tree based on the ITS region sequences indicated that selected strains could be classified into 4 clusters. Eleven Pleurotus species were also analyzed by RAPD with 20 arbitrary primers. Ten of these primers were efficiently amplified the genomic DNA. The number of amplified bands varied with the primers and strains, with polymorphic fragments in the range from 0.1 to 2.0kb. The results revealed that genetic diversity of selected strains of P. ostreatus, P. citrinopileatus and P. salmoneostramineus is low.

느타리속에 속하는 버섯은 예로부터 인체에 이로운 생리 활성물질을 많이 함유한 버섯으로 알려져 왔다. 최근 우리나라에서 노랑느타리와 분홍느타리의 재배가 증가함에 따라 이들 버섯의 유전적 다양성과 유연관계의 규명이 필요하게 되었다. 이에 우리나라와 해외 지역에서 수집한 노랑느타리4균주, 분홍느타리 3균주 그리고 느타리 4균주를 대상으로 rDNA의 ITS region 염기서열과 genomic DNA의 RAPDPCR을 수행하였다. ITS1과 ITS2 영역의 염기의 수는 각각 167에서 254쌍, 156에서 213쌍으로 계통에 따라 변이가 있었고 5.8S 영역의 염기의 수는 노랑느타리 균주는 158쌍이었고, 분홍느타리와 느타리 균주는 157쌍으로 동일하였다. 각각의 균주 간 유연관계를 알아보기 위해 본 실험에 사용한 11균주와 NCBI GenBank에 염기서열이 등록되어있는 노랑느타리 3균주, 분홍느타리 2균주, 느타리 1균주의 ITS 영역의 염기서열을 이용하여 분지도를 작성한 결과, 4개의 클러스터로 나눠지는 것으로 나타났다. 분홍느타리와 느타리의 균주는 큰 클러스터 내에서는 하나의 클러스터에 속했지만 각각의 종은 이 클러스터 내에서 각기 서로 다른 2개의 소그룹으로 나누어졌다. 또한 20 종류의 primer를 이용하여 RAPD를 수행한 결과 10개의 primer가 효과적으로 염색체 DNA를 증폭하는 것으로 나타났다. 증폭의 양상은 느타리속의 계통과 primer의 종류에 따라 다르게 나타났는데, 증폭된 DNA의 단편 수는 균주 당10개, 단편의 크기는 0.1 kb에서 2.0 kb까지 다양하였다. 본 실험 결과 실험에 사용한 느타리속 균주의 계통과 품종간의 유연관계는 높았고 느타리속의 동일한 종은 우리나라, 중국 및 일본에서 수집한 장소와 상관없이 상동성이 높았다.

Keywords

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