Improvement in Sensitivity by Increasing the Frequency of SAW Sensors for DNA Detection

DNA 측정용 SAW 센서의 주파수 증대에 의한 감도향상

  • Published : 2007.01.31

Abstract

In this paper. we have studied improvement in sensitivity by increasing the frequency of SAW sensors for detecting the immobilization and hybridization of DNA. The sensor consists of twin SAW delay lines operating at 200MHz, a sensing channel and a reference channel. fabricated on $36^{\circ}$ rotated Y-cut X-propagation $LiTaO_3$ crystals. The optimum concentration of probe and target DNA was decided for the improvement of detection mechanism. and digital syringe pump system was used to reduce the human errors. The hybridization between immobilized probe DNA and target DNA on the gold-coated delay line results in mass loading on the delay line of the sensing channel. Thus, the relative frequency change was monitored in relation to the mass loading. The measurement results showed a good response of the sensor to the DNA hybridization with a maximum sensitivity level up to 0.066ng/m1/Hz.

본 논문에서는 probe DNA의 고정화 및 Probe DNA와 target DNA의 혼성화 반응을 감지할 수 있는 DNA 측정용 고주파 SAW 센서의 주파수 증대에 따른 감도향상에 대해 연구하였다. 센서는 $36^{\circ}$ YX $LiTaO_3$ 압전 단결정 기판위에 Au 박막이 증착된 측정채널 (sensing channel)과 기준채널 (reference channel)로 구성되며 200MHz에서 발진되는 이중 지연선 형태로 제작되었다. 또한 SAW 센서의 감지 미케니즘의 최적화를 위해 SAW 센서의 Au 지연선상의 Probe DNA의 최적 고정화 반응농도와 target DNA의 최적 혼성화 반응농도를 결정하였으며, 디지털 시린지 펌프시스템을 구성하여 실험자에 따른 오차를 최소화하였다. 측정채널의 Au 박막 지연선상에 probe DNA를 고정화시킨 후 target DNA를 주입하면, DNA의 혼성화 반응이 일어나며 Au 지연선상의 질량이 변하게 된다. 따라서 질량하중 효과에 대한 센서의 주파수 변화를 측정하였다. 개발된 센서는 최대 0.066ng/ml/Hz의 민감도를 가지며 질량하중 효과에 대한 안정적인 주파수 변화를 나타내었다.

Keywords

References

  1. B. Lewin, GENS VI, Oxford University Press and Cell Press, pp 89-90, 1994
  2. K. Skogerboe, 'Molecular Biology Techniques', Anal. Chem. 65. 416-419, 1993 https://doi.org/10.1021/ac00060a610
  3. T. Nordstorm, M. Ronaghi. L. Forsberg, U. DeFaire, R. Morgenstern and P. Nyren, 'Direct analysis of singlenucleotide polymorphism on double-stranded DNA by ovroseouencinc.' Biotechnol. Appl, Biochem., 31. 107-112, 2000
  4. I. Abdel-Hamid. P. Atanasov, A. L. Ghindilis and E. Wilkings, 'Developrnent of a flow-through immunoassay system,' Sensors and Actuators B, 49. 202-210, 1998 https://doi.org/10.1016/S0925-4005(98)00125-7
  5. D. S. Ballantine, R. M. White, S. J. Martin. A. J. Ricco, G. C. Frye. E. T. Zellers and H. Woltjen, Acoustic Wave Sensors, (Academic Press) pp 80--82. 1997
  6. 허영준, 박유근, 노용래, 'DNA 측정용 SH-SAW센서 개발,' 한국음향학회지, 24 (3) 160--165, 2005. 4
  7. 이승희, 노용래, 'DART와 EWC/SPUDT형 SAW 필터의 특성 비교,' 한국음향학회지, 18, 53-59, 1999
  8. T. Hianik, V. Ostatna, Z. Zalacova. E. Stoikova and G. Evtugn, 'Dectection of aptamer-protein interactions using QCM and electrochemical indicator methods,' Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 15, 291-295, 2005 https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2004.10.083
  9. X. Su, Y. J. Wu and W. Knoll, 'Comparison of surface plasmon resonance spectroscopy and quartz crystal microbalance techniques for studying DNA,' Biosensors and Bioelectronics, 21, 719-726, 2005 https://doi.org/10.1016/j.bios.2005.01.006
  10. K. Ikebukuro, Y. Kohiki and K. Sode, 'Amperometric DNA sensor usi ng the pyrroqui noli ne qui ni ne gl ucose dehydrogenaseavidin conjugate,' Biosensors and Bioelectronics, 17, 1075-1080, 2002 https://doi.org/10.1016/S0956-5663(02)00101-X
  11. A. Cox, A. Tilley, F. McOdimba, F. Fvfe, M. Eisler, G. Hide and S. Wei burn, 'A peR based assay for detection and differentiation of African trypanosome species in blood,' Experimental Parasitoloty, 111, 24-29, 2005 https://doi.org/10.1016/j.exppara.2005.03.014