Identification of Tumor Suppressor Loci on the Short Arm of Chromosome 16 in Primary Small Cell Lung Cancers

원발성 소세포폐암에서 염색체 16번의 단완에 위치한 종양억제유전자좌의 확인

Background : Loss of the short arm of chromosome 16 is a frequent event in various cancers, which suggests the presence of tumor suppressor gene(s) there. To map precise tumor suppressor loci on the chromosome arm for further positional cloning efforts, we tested 23 primary small cell lung cancers. Method : The DNAs extracted from paraffin embedded tissue blocks with primary tumor and corresponding control tissue were investigated. Twenty polymorphic microsatellite markers located in the short arm of chromosome 16 were used in the microsatellite analysis. Results : We found that six (26.1%) of 23 tumors exhibited LOH in at least one of tested microsatellite markers. Two (8.7%) of 6 tumors exhibiting LOH lost a larger area in chromosome 16p. LOH was observed in five common deleted regions at 16p. Among those areas, LOH between D16S668 and D16S749 was most frequent (21.1%). LOH was also observed at four other regions, between D16S3024 and D16S748, D16S405, D16S420, and D16S753. Six of 23 tumors exhibited shifted bands in at least one of the tested microsatellite markers. Shifted bands occurred in 3.3% (15 of 460) of the loci tested. Conclusion : Our data demonstrated that at least five tumor suppressor loci might exist in the short arm of chromosome 16 and that they may play an important role in small cell lung cancer tumorigenesis.

연구배경 : 다양한 암종들에서 빈번히 발견되는 염색체 16번 단완의 돌연변이가 소세포폐암의 발생 및 진행과 관련하여 어떤 양상을 보이는지 알아보기 위해 우리나라 소세포폐암 환자들을 대상으로 종양억제유 전자좌를 찾고자 하였다. 대상 및 방법 : 연세대학교 의과대학 세브란스병원에서 원발성 소세포폐암으로 진단된 23명의 남자 환자를 대상으로 하였다. 암 조직과 이에 대응하는 정상 조직의 파라핀 포매 블록으로부터 DNA를 추출하였으며, 염색체 16번 단완에 위치하는 20개의 현미부수체 표지자들을 이용하여 PCR-LOH 분석을 시행하였다. 결 과 : 1) 23예 중에서 LOH가 1개라도 관찰된 경우는 6예로 26.1%이었다(Fig. 1) 2) LOH가 있는 6예 중에서 비교적 넓은 부위의 결손이 관찰된 경우는 2예(SCLC1, SCLC2)로써 전체의 8.7%이었다(Fig. 1). 3) 검사를 시행한 20개의 표지자들중 50% 이상의 LOH 빈도를 보인 경우는 없었으나 다른 부위와 비교하여 우월하게 빈번한 빈도를 보인 부위는 D16S3024와 D16S748 사이에서 18.2%, D16S405에서 143%, D16S668과 D16S749 사이에서 21.1%, 그리고 D16S420과 D16S753에서 각각 8.3%의 빈도로 관찰되었다(Table 1, Fig. 1, Fig. 2) 4) Shifted bands는 23예 중 6예에서 관찰되었는데 a1tered loci의 빈도는 5~35% 이었다(Fig. 1, Fig. 2). 5) Shifted bands는 검사한 총 460개 loci중 3.3% 인 15 loci에서 관찰되었다(Fig. 1). 결 론 : 본 연구 결과 LOH 빈도가 낮은 문제점이 있으나 염색체 16번의 단완에는 원발성 소세포폐암 일부에서 종양의 발생 및 진행에 관여하는 최소 5개의 종양억제유전자좌가 존재할 가능성이 있는 것으로 추정되며, 향후 특이 유전자를 찾기 위한 추가적인 노력이 있어야 할 것으로 생각된다.