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Identification of Bacteria Causing Fermentation of Oriental Melon in Korea

참외 발효과를 유발하는 세균의 동정

  • Choi, Jae-Eul (Division of Plant Resources, Chungnam National University) ;
  • Cha, Sun-Kyung (Division of Plant Resources, Chungnam National University) ;
  • Kim, Jin-Hee (Division of Plant Resources, Chungnam National University) ;
  • Yuk, Jin-Ah (Division of Plant Resources, Chungnam National University) ;
  • Hwang, Yong-Soo (Division of Plant Resources, Chungnam National University) ;
  • Kwon, Soon-Wo (Genetic Resources Division NIAST)
  • 최재을 (충남대학교 농업생명과학대학 식물자원학부) ;
  • 차선경 (충남대학교 농업생명과학대학 식물자원학부) ;
  • 김진희 (충남대학교 농업생명과학대학 식물자원학부) ;
  • 육진아 (충남대학교 농업생명과학대학 식물자원학부) ;
  • 황용수 (충남대학교 농업생명과학대학 식물자원학부) ;
  • 권순우 (농촌진흥청 농업생명공학연구원 유전자원과)
  • Published : 2003.12.01

Abstract

Bacteria causing fermentation in Oriental melon were identified as three independent groups on the basis of 16S rDNA sequence analysis. The 16S rDNA sequence of the strain CM2105 showed the highest identity (99.6%) with that of Microbacterium phyllosphaerae, and also indicated high sequence identity to that of M. holiorum (99.5%). The 16S rDNA sequences of the strain CM2101 and CM2121 matched at the high sequence similarity (98.9%, 98.8, respectively), to that of Pseudomonas pavonacea, and the DNA sequence of CM2126 showed high sequence identity to that of P. costantinii (99.5%), and P. grimontii (99.0%). The 16S rDNA sequence of the strain CM2113 showed the highest identity (99.7%) with that of Enterobacter cloacae. The 16S rDNA sequences, the physiological and biochemical analysis suggested that the strain CM2105 belonged to Microbacterium phyllosphaerae, CM2101, CM2121 and CM2126 to Pseudomonas spp., CM2113 to Enterobacter cloacae.

참외의 발효과를 유발하는 세균은 16S rDNA 염기분석에 의해 3 group으로 분류되었다. CM2105균주의 16S rDNA 염기서열은 Microbacterium phyllosphaerae의 염기서열과 99.6%의 높은 상동성을 나타냈고, M. holiorum과도 99.5%의 높은 상동성을 나타냈다. CM2101과 CM2121균주의 16S rDNA 염기서열은 "P. pavonaceae"와 각각 98.9%, 98.8, CM2126균주는 P. costantinii와 99.5%, P. grimontii와 99.0%의 높은 상동성을 나타냈다. CM21131균주의 16S rDNA 염기서열은 Enterobacter cloacae와 99.7%의 높은 상동성 나타냈다. 검정균주의 생리적, 생화학적 특성과 16S rDNA의 염기분석에 따라 CM2105 균주는 M. phyllosphaerae, CM2101, CM2121, CM2126 균주는 Pseudomonas spp., 그리고 CM2113 균주는 E. cloacae로 동정하였다.

Keywords

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