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대장암에서 PCR-SSCP와 DHPLC를 이용한 p53 돌연변이의 검출

Detection of p53 Mutation in Colorectal Cancer Using PCR-SSCP and DHPLC

  • 박상범 (단국대학교 자연과학대학 화학과) ;
  • 한상만 (단국대학교 자연과학대학 화학과) ;
  • 남윤형 (단국대학교 자연과학대학 화학과) ;
  • 장원철 (단국대학교 자연과학대학 화학과)
  • Sang-Bum Park (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University) ;
  • Sang-Man Han (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University) ;
  • Youn-Hyoung Nam (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University) ;
  • Won-Cheoul Jang (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University)
  • 발행 : 2003.10.20

초록

p53 유전자의 변이는 다양한 인체암 중 가장 일반적인 유전자적 변화로 알려져 있으며, 양성에서 악성 대장암으로 전이되는 과정에서 연관이 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 PCR-SSCP와 DHPLC를 이용하여 대장암 환자의 조직에서 p53 유전자의 엑손 5-8에서 돌연변이를 분석하였다. SSCP에서는 50개의 샘플중 엑손 5에서 C13109>T 형태의 돌연변이가 7례가(14%) 발견되었고, DHPLC에서는 C13109>T 7례와 C13202>A, C13204>G 형태의 돌연변이 2례, 모두 9례의(18%) 변이가 검출되었다. DHPLC 분석법을 이용하여 SSCP에서 발견하지 못했던 2례(4%)의 변이를 더 발견하였다. 최종적으로 염기서열분석법을 통해 위의 결과를 확인하였고, p53 돌연변이 검출법으로 SSCP보다 DHPLC가 더 감도가 좋고 효과적인 검출법임을 확인하였다.

Structural alteration of p53 and overexpression of p53 protein are the most common genetic abnormalities in various kinds of human cancer. Mutations in the p53 tumor-suppressor gene are usually associated with an advanced development of colorectal cancer characterized by the transition from the adenoma to carcinoma stage. Mutations in exons 5-8 of the p53 gene were analyzed by the polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism(PCR-SSCP) and denaturing high performance liquid chromatography(DHPLC). SSCP analysis detected 7 mutations(C13109>T) in 50 colorectal cancer samples(14%) at exon 5, and DHPLC analysis detected 7 mutations (C13109>T) and 2 mutation(C13202>A, C13204>G) in 50 colorectal cancer samples(18%) at exon 5. All of 9 mutations were proved by sequencing analysis. We conclude that DHPLC is a highly sensitive and specific method for p53 gene mutations.

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