Karyotypes of Pneumocystis carinii from Korean Rats

한국산 횐쥐 카리니주폐포자충의 핵형

Molecular karyotyping was applied to Pneumocystis carinii (Pc) from two strains of experimental rats, Sprague Dawley(SD) and Fisher(F), in Korea. Field inversion gel electrophoresis and contour clamped homogeneous electric field electrophoresis resolved 15 chromosomal bands from the Pc. The size of the bands was estimated 270kb to 684kb from SD rats, and 273kb to 713 kb from F rats. The bands of 283 kb from SD rats and of 273 kb from F rats stained more brightly suggesting duplicated bands. Total number of chromosomes was at least 16, and total genomic size was estimated 7×106 bp. All of the bands from F rats hybridized to the probe of repeated DNA sequences of Pc and the band of 448 kb size was proved to contain rDNA sequences, but Pc. chromosome bands from SD rats showed no reactions to the probes. The 2 different karyotypes of p. carinii from 2 strains of rats were maintained consistently for 2 years.

한국 내에서 사육 공급하는 실험실용 흰쥐를 실험적으로 면역억제하여 Pneumocystis carinii (Pc)를 발현시키고, 이를 순수하게 모아서 전기영동을 이용한 핵형을 분석하였다. Field Inversion Gel Electrophoresis와 Contour Clamped Homogeneous Electric Field Electrophoresis를 사용하여 분리한 염색체 밴드는 Sprague Dawley(SD) 와 Fisher(F) 계 횐쥐 모두에서 15개 씩 이었다. 크기는 수D 횐쥐의 경우 270~684kb, 횐쥐에서 얻은 표본에서 273~713kb에 있었다. 이 중에서 SD 된쥐에서 얻은 것은 283kb의 염색체가, 횐쥐의 표본은 273 kb의 염색체가 특히 강하게 염색되어 두 개 이상의 같은 크기 분자가 중칩된 것으로 보인다. 그러므로 전체 염색체는 최소한 16개이며 각 염색체의 크기로 계산된 염색체 내 전체 유전자의 크기는 $7{\times}10^6{\;}bp$의 수준에 있다. F흰쥐에서 유래한 Pc는 전 염색체 분자가 공유하는 반복 염기서열을 가지며, 448kb 염색체가 rRNA의 유전자를 갖고 있었다. 그러나 SD횐쥐의 Pc표본에서는 어느 염색체 분자에서도 반복 염기서열과 rRNA유전자를 확인하지 못하였다. 두 개의 휜쥐 계통 군은 각각 2년간 같은 핵형의 Pc를 유지하였다. (이 연구는 한국과학재단 1990년도 일반과제 연구비 지원에 의하여 수행되었음)