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Design of Metadata for Provenance Management of Genome Data

유전체 데이터의 유래(Provenance) 관리를 위한 메타데이터의 설계

  • Song, Myoung-Seon (Dept of Computer Engineering, Chonbuk National University) ;
  • Chang, Jae-Woo (Dept of Computer Engineering, Chonbuk National University) ;
  • Um, Jung-Ho (Korea Institute of Science and Technology Information) ;
  • Choi, Dong-Hoon (Korea Institute of Science and Technology Information)
  • 송명선 (전북대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 장재우 (전북대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 엄정호 (한국과학기술정보연구원) ;
  • 최동훈 (한국과학기술정보연구원)
  • Published : 2011.11.11

Abstract

최근 의료 분야에 대한 관심이 높아짐에 따라 유전체 데이터를 수집하고 관리하여 분석하는 기술에 대한 많은 연구가 수행되고 있다. 유전체 데이터는 크게 유전체 데이터를 분석하는 전처리단계와 유전체 데이터로부터 변이된 유전체 데이터를 생성하는 후처리단계를 통해 분석된다. 이러한 분석 과정은 많은 시간이 소요되며, 후처리단계에서 결과 데이터는 분석 알고리즘 및 처리 기법에 따라 상이한 결과 데이터를 생성한다. 또한, 유전체 데이터의 각 파이프라인 별 분석된 데이터의 관리가 필요하다. 본 논문에서는 유전체 데이터의 특성을 고려하여, 유전체 데이터 유래 관리를 위한 메타데이터를 설계한다. 아울러 데이터 유래 메타데이터는 자신의 이전데이터들의 결과데이터에 신속한 접근이 가능해야하며, 자신과 유사한 데이터 유래를 지닌 파이프라인의 상세 정보를 신속하게 검색하는 색인구조가 필요하다. 따라서 이를 고려한 유래 메타데이터 검색 알고리즘을 설계한다.

Keywords