• 제목/요약/키워드: variant detection

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악 조건 환경에서의 강건한 차선 인식 방법 (Robust Lane Detection Method Under Severe Environment)

  • 임동혁;;조상복
    • 전자공학회논문지
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    • 제50권5호
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    • pp.224-230
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    • 2013
  • 운전자 보조 시스템에서 차선 경계 검출은 매우 중요하다. 본 연구는 악조건인 환경에서 차선 경계를 검출하기 위한 강건한 방법을 제안한다. 첫 번째로 원래의 image에서 iVMD(improve Vertical Mean Distribution) Method를 이용하여 수평선을 검출하고, 수평선 하위영역 image를 결정하며, 두 번째로 Canny edge detector를 사용하여 하위 영역에서 차선 표시를 추출한다. 마지막으로, RANSAC algorithm을 이용하여 각각에 맞는 line model을 적용하기 전에, k-means clustering algorithm을 이용하여 오른쪽 왼쪽 차선을 분류 한다. 제안된 알고리즘은 변종조명, 갈라진 도로, 복잡한 차선 표시, 교통신호에 관하여 상당히 정확한 차선 검출 기능을 나타낸다. 실험결과는 제안된 방법이 악조건인 환경하에서 실시간으로 효율적인 요구 사항을 충족함을 보여준다.

SVM을 이용한 침입방지시스템 오경보 최소화 기법 (False Alarm Minimization Technology using SVM in Intrusion Prevention System)

  • 김길한;이형우
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제7권3호
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    • pp.119-132
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    • 2006
  • 지금까지 잘 알려진 네트워크 기반 보안 기법들은 공격에 수동적이고 우회한 공격이 가능하다는 취약점을 가지고 있어 인라인(in_line) 모드의 공격에 능동적 대응이 가능한 오용탐지 기반의 침입방지시스템의 출현이 불가피하다. 하지만 오용탐지 기반의 침입방지시스템은 탐지 규칙에 비례하여 과도한 오경보(False Alarm)를 발생시켜 정상적인 네트워크 흐름을 방해하는 잘못된 대응으로 이어질 수 있어 기존 침입탐지시스템보다 더 위험한 문제점을 갖고 있으며, 새로운 변형 공격에 대한 탐지가 미흡하다는 단점이 있다. 본 논문에서는 이러한 문제를 보완하기 위해 오용탐지 기반의 침입방지시스템과 Anomaly System 중의 하나인 서포트 벡터 머신(Support Vector Machines; 이하 SVM)을 이용한 침입방지시스템 기술을 제안한다. 침입 방지시스템의 탐지 패턴을 SVM을 이용하여 진성경보만을 처리하는 기법으로 실험결과 기존 침입방지시스템과 비교하여, 약 20% 개선된 성능결과를 보였으며, 제안한 침입방지시스템 기법을 통하여 오탐지를 최소화하고 새로운 변종 공격에 대해서도 효과적으로 탐지 가능함을 보였다.

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Accelerating next generation sequencing data analysis: an evaluation of optimized best practices for Genome Analysis Toolkit algorithms

  • Franke, Karl R.;Crowgey, Erin L.
    • Genomics & Informatics
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    • 제18권1호
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    • pp.10.1-10.9
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    • 2020
  • Advancements in next generation sequencing (NGS) technologies have significantly increased the translational use of genomics data in the medical field as well as the demand for computational infrastructure capable processing that data. To enhance the current understanding of software and hardware used to compute large scale human genomic datasets (NGS), the performance and accuracy of optimized versions of GATK algorithms, including Parabricks and Sentieon, were compared to the results of the original application (GATK V4.1.0, Intel x86 CPUs). Parabricks was able to process a 50× whole-genome sequencing library in under 3 h and Sentieon finished in under 8 h, whereas GATK v4.1.0 needed nearly 24 h. These results were achieved while maintaining greater than 99% accuracy and precision compared to stock GATK. Sentieon's somatic pipeline achieved similar results greater than 99%. Additionally, the IBM POWER9 CPU performed well on bioinformatic workloads when tested with 10 different tools for alignment/mapping.

Reduced Complexity Signal Detection for OFDM Systems with Transmit Diversity

  • Kim, Jae-Kwon;Heath Jr. Robert W.;Powers Edward J.
    • Journal of Communications and Networks
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    • 제9권1호
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    • pp.75-83
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    • 2007
  • Orthogonal frequency division multiplexing (OFDM) systems with multiple transmit antennas can exploit space-time block coding on each subchannel for reliable data transmission. Spacetime coded OFDM systems, however, are very sensitive to time variant channels because the channels need to be static over multiple OFDM symbol periods. In this paper, we propose to mitigate the channel variations in the frequency domain using a linear filter in the frequency domain that exploits the sparse structure of the system matrix in the frequency domain. Our approach has reduced complexity compared with alternative approaches based on time domain block-linear filters. Simulation results demonstrate that our proposed frequency domain block-linear filter reduces computational complexity by more than a factor of ten at the cost of small performance degradation, compared with a time domain block-linear filter.

순간주파수를 이용한 전력선 신호의 이상현상검출 (Detection of Anormalies on the Power Line using the Instantaneous Frequencies)

  • 임병관
    • 대한전기학회논문지:전력기술부문A
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    • 제55권12호
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    • pp.544-548
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    • 2006
  • The instantaneous frequency gives a frequency value at a time instance. Thus, it is natural to use the instantaneous frequency for detecting disturbances of voltage signal in power line. Various instantaneous frequency estimators are introduced. By applying to different types of disturbed signals, we show the estimators' ability to classify flickers. Also, the computational costs are compared between different instantaneous frequency estimators. The Prony's method (PRONY) and the modified covariance method (MCOV) need relatively smaller amount of calculation than the Teaser-Kaiser energy operator based estimator (DESA II). For an AM-FM modulated signal, the tracking performance of different instantaneous frequency estimators is also compared. Through simulation, it is shown that MCOV produces less variant frequency estimation values than DESA II and PRONY method.

Deletion or Duplication Syndromes of Chromosome 22: Review

  • Kyung Ran Jun
    • Journal of Interdisciplinary Genomics
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    • 제6권1호
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    • pp.1-5
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    • 2024
  • Chromosome 22 is an acrocentric chromosome containing 500-600 genes, representing 1.5%-2% of the total DNA in cells. It was the first human chromosome to be fully sequenced by the Human Genome Project. Several syndromes involving the partial deletion or duplication of chromosome 22 are well descibed, including 22q11.2 deletion syndrome, 22q11.2 duplication syndrome, 22q11.2 distal deletion syndrome, Phelan-McDermid syndrome caused by a 22q13 deletion or pathogenic variant in SHANK3, and cat-eye syndrome caused by a 22 pter-q11 duplication. This review aims to provide concise information on the clinical characteristics of these syndromes. In particular, the similarities in features among these syndromes, genetic basis, and standard detection techniques are described, providing guidance for diagnosis and genetic counselling.

변종 악성코드 유사도 비교를 위한 코드영역의 함수 분할 방법 (Function partitioning methods for malware variant similarity comparison)

  • 박찬규;김형식;이태진;류재철
    • 정보보호학회논문지
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    • 제25권2호
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    • pp.321-330
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    • 2015
  • 백신 프로그램이 일반화되면서 이를 우회하기 위한 목적으로 기존 악성 프로그램에 포함된 문자열 혹은 코드 일부가 변경된 변종 악성코드가 많이 나타나고 있다. 기존의 백신 프로그램이 시그너처에 기반한 분석을 통하여 악성 코드 여부를 판단하기 때문에 이미 알려진 악성코드라고 하더라도 일부만 변경되면 탐지하기 어려운 문제가 있었다. 본 논문에서는 해쉬값을 이용한 코드 비교 방법을 확장하여 일부만 변형된 악성코드를 손쉽게 탐지하기 위한 새로운 방법을 제안한다. 악성코드 전체에 대한 해쉬값 뿐만 아니라 함수 단위와 코드블록 단위로 해쉬값을 생성하여 일부만 일치하는지 판단하고 상수나 주소 등을 제거한 후에 해쉬값을 생성함으로써 상수나 주소 때문에 다르게 판단하는 오류를 제거하였다. 제시된 방법을 이용하여 변형된 악성코드에 숨겨진 유사성을 해쉬값 비교로 탐지할 수 있음을 확인하였다.

Circulating Tumor DNA in a Breast Cancer Patient's Plasma Represents Driver Alterations in the Tumor Tissue

  • Lee, Jieun;Cho, Sung-Min;Kim, Min Sung;Lee, Sug Hyung;Chung, Yeun-Jun;Jung, Seung-Hyun
    • Genomics & Informatics
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    • 제15권1호
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    • pp.48-50
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    • 2017
  • Tumor tissues from biopsies or surgery are major sources for the next generation sequencing (NGS) study, but these procedures are invasive and have limitation to overcome intratumor heterogeneity. Recent studies have shown that driver alterations in tumor tissues can be detected by liquid biopsy which is a less invasive technique capable of both capturing the tumor heterogeneity and overcoming the difficulty in tissue sampling. However, it is still unclear whether the driver alterations in liquid biopsy can be detected by targeted NGS and how those related to the tissue biopsy. In this study, we performed whole-exome sequencing for a breast cancer tissue and identified PTEN p.H259fs*7 frameshift mutation. In the plasma DNA (liquid biopsy) analysis by targeted NGS, the same variant initially identified in the tumor tissue was also detected with low variant allele frequency. This mutation was subsequently validated by digital polymerase chain reaction in liquid biopsy. Our result confirm that driver alterations identified in the tumor tissue were detected in liquid biopsy by targeted NGS as well, and suggest that a higher depth of sequencing coverage is needed for detection of genomic alterations in a liquid biopsy.

소아의 미만성 경화 변종 갑상선 유두암: 증례 보고 (Diffuse Sclerosing Variant of Papillary Thyroid Carcinoma in a Child: A Case Report)

  • 변승희;유선경;강성수;신경숙;이정은
    • 대한영상의학회지
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    • 제81권5호
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    • pp.1250-1254
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    • 2020
  • 미만성 경화 변종 갑상선 유두암은 갑상선 유두암의 드문 변종이다. 저자들은 통증을 동반하지 않은 미만성 갑상선 비대를 보였던 9세 여자 환아에서 발생한 미만성 경화 변종 갑상선 유두암의 드문 증례에 대해 보고하고자 한다. 환아는 갑상선 과산화효소 항체에 양성이었고, 처음에는 하시모토 갑상선염으로 진단받았다. 하지만 갑상선 초음파 상에서 미만성 경화 변종 갑상선 유두암의 특징적인 초음파 소견을 보였고, 수술 후 미만성 경화 변종 갑상선 유두암으로 확진되었다. 비록 소아에서 갑상선암은 드물지만 갑상선 비대를 보일 때 미만성 경화 변종 갑상선 유두암의 가능성을 고려해야 한다. 또한 초음파를 시행함으로써 갑상선암의 진단이 지연되는 것을 막을 수 있다.

차세대 염기서열 분석기법과 생물정보학 (Next Generation Sequencing and Bioinformatics)

  • 김기봉
    • 생명과학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.357-367
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    • 2015
  • 매우 빠른 속도로 발전하고 있는 차세대 염기서열 분석 플랫폼과 최신 생물정보학적 분석도구들로 말미암아, 1,000달러 이하의 가격으로 인간 유전체 염기서열을 해독하고자 하는 궁극적인 목표가 조만간 곧 실현될 수 있을 것 같다. 차세대 염기서열 분석 분야의 급속한 기술적 진전은 NGS 데이터의 분석과 관리를 위한 통계적 방법과 생물정보학적 분석도구들에 대한 수요를 꾸준히 증대시키고 있다. NGS 플랫폼이 상용화되어 쓰이기 시작한 초창기부터, NGS 데이터를 분석하고 해석하거나, 가시화 해주는 다수의 응용프로그램이나 도구들이 개발되어 활용되어 왔다. 그러나, NGS 데이터의 엄청난 범람으로 데이터 저장, 데이터 분석 및 관리 등에 있어서 해결해야 할 많은 문제들이 부각되고 있다. NGS 데이터 분석은 단편서열과 참조서열간의 서열정렬, 염기식별, 다형성 발견, 쌍단편 서열이나 비쌍단편 서열 등을 이용한 어셈블리 작업, 구조변이 발견, 유전체 브라우징 등을 본질적으로 포함한다. 본 논문은 주요 차세대 염기서열 결정기술과 NGS 데이터 분석을 위한 생물정보학적 분석도구들에 대해 개관적으로 소개하고자 한다.