• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제4권2호
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• pp.155-160
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• 2001

목적: H. pylori의 vacA 대립유전자는 종족과 지역에 따라 다양하게 나타나고 있다. 저자들은 H. pylori에 감염된 소아의 위생검조직에서 vacA 대립 유전자에 대한 중합효소연쇄반응과 유전자염기분석을 실시하여 한국의 signal sequence와 mid-region의 다형성 및 고유의 시발체를 연구하고자 하였다. 방법: 상부 위내시경을 시행한 후 H. pylori 감염으로 진단된 10~18세 50명의 환아를 대상으로 위생검조직을 이용하여 vacA 대립유전자에 대한 PCR과 DNA 분석을 실시하였다. 이들 결과와 다른 나라의 vacA 대립유전자를 비교분석하였고 우리나라의 고유한 염기배열을 갖는 시발체를 제작하였다. 결과: 1) 서구의 시발체를 사용한 50명 중 30명(60%)에서 모두 s1이 검출되었고 이중 s1a가 14명, s1c 15명, s1a/s1c hybrid가 한 명이었으며 s1b는 발견되지 않았다. s1c/m1이 가장 많은 형이었다. 2) 우리 나라에 공통으로 발견되는 염기변이가 s1a에서는 GGGAGCGTTR, s1c는 GGGGYTATTG 이었으며 이들을 이용하여 새로운 시발체를 고안하였다(VASK-F, VASK-R, S1AK-F, S1CK-F). 새로이 제작된 시발체로 처음의 50개 조직을 재검한 결과 50개 모두에서 s region이 양성이었다. 결론: 우리 나라의 주된 vacA 대립유전자형조합은 s1c/m1이었고, vacA signal sequence의 한국 고유의 시발체를 만들었음을 보고하는 바이다.

• Journal of Microbiology
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• 제44권6호
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• pp.660-664
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• 2006

The relationship between H. pylori clarithromycin resistance and genetic pattern distribution has been differently explained from different geographic areas. Therefore, we aimed to assess the clarithromycin resistance rate, to evaluate the bacterial genetic pattern, and to search for a possible association between clarithromycin resistance and cagA or vacA genes. This prospective study enrolled 62 consecutive H. pylori infected patients. The infection was established by histology and rapid urease test. Clarithromycin resistance, cagA and vacA status, including s/m subtypes, were assessed on paraffin-embedded antral biopsy specimens by TaqMan real time polymerase chain reaction (PCR). Primary clarithromycin resistance was detected in 24.1 % of cases. The prevalence of cagA was 69.3%, and a single vacA mosaicism was observed in 95.1 % cases. In detail, the s1m1 was observed in 23 (38.9%) patients, the s1m2 in 22 (37.2%), and the s2m2 in 14 (23.7%), whereas the s2m1 combination was never found. The prevalence of cagA and the vacA alleles distribution did not significantly differ between susceptible and resistant strains. Primary clarithromycin resistance is high in our area. The s1m1 and s1m2 are the most frequent vacA mosaicisms. There is no a relationship between clarithromycin resistance and bacterial genotypic pattern and/or cagA positivity.