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남한강 지류에 서식하는 퉁가리(Liobagrus andersoni)의 식성 (Feeding Habits of Korean Torrent Catfish, Liobagrus andersoni in a Tributary of the Namhan River, Korea)

  • 윤희남;김종명;배양섭;채병수
    • 한국어류학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.236-245
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    • 2007
  • 남한강 지류인 충청북도 충주시 가금면 봉황리 한포천에서 2005년 10월부터 2006년 10월까지 계절별로 퉁가리(L. andersoni)를 대상으로 식성을 조사 연구하였다. 주요먹이생물로는 파리목, 하루살이목, 날도래목 등의 수서곤충이었으며, 체장이 50 mm 이하인 개체들에서는 크기가 매우 작으며, 먹이생물이 풍부한 꼬마하루살이류와 깔따구류를 주로 섭식하였고, 점차 성장하면서 크기가 크고 중량이 무거운 납작하루살이류가 주요 먹이생물로 나타났다. 깔따구류와 날도래류는 모든 개체들에서 고르게 섭식되었다. 계절에 따른 먹이생물의 구성은 여름과 가을에 다양하였고 겨울에 단순한 경향을 보였는데, 봄에는 하루살이류를 집중적으로 섭취하였으며, 여름과 가을에는 비교적 균등하게 먹이생물을 선택하였고, 수온이 낮은 겨울에는 이동력이 약한 날도래류와 깔따구류를 집중적으로 섭식하였다. 또한 위충만도 분석 결과 본 종은 섭식활동이 주로 일몰직후 시작되어 02~03시에 가장 활발하였으며, 일출직후부터는 점차 감소하여 낮에는 거의 이루어지지 않는 것으로 나타났다. 따라서 퉁가리는 야간에 여울역의 바위나 자갈의 표면에 서식하는 수서곤충을 주로 섭식하는 저서성 육식포식자에 속하는 어류로 판단된다.

경남지역 야계사방사업지의 산림환경특성 분석 - 사방댐 및 계류보전사업을 중심으로 - (Analysis of Forest Environmental Factors on Torrent Erosion control work area in Gyeongsangnam-do - Focus on Erosion Control Dam and Stream Conservation -)

  • 강민정;김기대;오강산;박진원;박재현
    • 농업생명과학연구
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    • 제50권5호
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    • pp.111-120
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    • 2016
  • 본 연구는 경남지역 야계사방사업지의 적지적소를 판정하기 위해 사방댐 총 526개소와 계류보전시설 총 230개소의 기시공지 및 시공예정지를 대상으로 입지 및 임상, 수문조건을 분석하였다. 사방댐 시공지과 계류보전시설은 입지환경인자 중 퇴적암, 표고 201~400m, 경사 21~30°, 산사태위험등급 2등급인 곳에 가장 많이 시공되었고, 임상환경인자인 임상, 경급, 영급, 밀도 중 소경급, III영급 임분에서만 시공빈도가 유사하였다. 또한 사방댐의 크기 및 개소수를 결정하는 수문환경인자 중 유역면적의 경우 50ha 이하, 수계밀도 2.1~4.0km/㎢, 종장형 수계, 1시간당 최대강수량 61~90mm, 1일 최대강수량 201~300mm인 곳에서 가장 많이 시공되었다. 따라서 사방댐 시공지와 계류보전시설지 간의 입지 및 수문조건이 다소 유사한 것으로 추후 야계사방사업을 실시할 경우 산각붕괴 및 침식 발생위험이 높은 지역에 한해서는 사방댐과 계류보전시설의 병행이 가능한 것으로 판단된다.

Toward Complete Bacterial Genome Sequencing Through the Combined Use of Multiple Next-Generation Sequencing Platforms

  • Jeong, Haeyoung;Lee, Dae-Hee;Ryu, Choong-Min;Park, Seung-Hwan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권1호
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    • pp.207-212
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    • 2016
  • PacBio's long-read sequencing technologies can be successfully used for a complete bacterial genome assembly using recently developed non-hybrid assemblers in the absence of second-generation, high-quality short reads. However, standardized procedures that take into account multiple pre-existing second-generation sequencing platforms are scarce. In addition to Illumina HiSeq and Ion Torrent PGM-based genome sequencing results derived from previous studies, we generated further sequencing data, including from the PacBio RS II platform, and applied various bioinformatics tools to obtain complete genome assemblies for five bacterial strains. Our approach revealed that the hierarchical genome assembly process (HGAP) non-hybrid assembler resulted in nearly complete assemblies at a moderate coverage of ~75x, but that different versions produced non-compatible results requiring post processing. The other two platforms further improved the PacBio assembly through scaffolding and a final error correction.

국립공원 지역에 있어서 토석류 재해의 특성 분석 (Characteristics Analysis of Debris Flow Disaster in Korean National Parks)

  • 마호섭;정원옥
    • 한국환경복원기술학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.52-64
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    • 2010
  • This study was carried out to analyze the occurrence characteristics and the influence of forest environment factors on the debris flow of 3 national parks in korea. The results obtained from this study were summarized as follows; The total number of debris flow occurrence was 125 areas. The average length of the debris flow scar was 144m, average width was 20m. And the average area and sediment were $2,854m^2$ and $3,959m^3$ respectively. The factors influencing the debris flow were highly occurred in Metamorphic rock, mixed forest type. And also, slope gradient was $30{\sim}35^{\circ}$, aspect was NE, altitude was over 1,000m, vertical and cross slope was concave (凹), soil depth was below 15cm, stream order was 0 order. The variables of cross slope (complex), deciduous tree, soil depth (over 46cm), cross slope (concave), mixed forest type and altitude (801~1200m) in correlation analysis were significant at 1 % level. The landslide of high mountain area highly tend to change the debris flow in stream bed of torrent. The debris flow in national parks mainly occurred in high mountain area with long ridge and steep slope.

한국 고유종 섬진자가사리 Liobagrus somjinensis의 핵형 분석 (Karyotype Analysis of Liobagrus somjinensis, an Endemic Species in Korea)

  • 조윤정;박종영
    • 한국어류학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.175-178
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    • 2016
  • 전라북도 남원시 식정동에서 채집한 한국 고유종인 섬진자가사리를 암, 수 각각 9마리와 8마리의 핵형 분석을 실시하였다. 섬진자가사리의 염색체 수는 2n=42로 조사되었고, 핵형은 28 metacentric과 14 submetacentric으로 이루어져 있었으며 FN은 80이었다. 이번 결과에서 배수체와 암수 간의 성적이형은 발견되지 않았다. 섬진자가사리는 근연종들과 염색체 수는 같았으나, 핵형에서는 차이를 보였다.

Whole genome sequencing of foot-and-mouth disease virus using benchtop next generation sequencing (NGS) system

  • Moon, Sung-Hyun;Oh, Yeonsu;Tark, Dongseob;Cho, Ho-Seong
    • 한국동물위생학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.297-300
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    • 2019
  • In countries with FMD vaccination, as in Korea, typical clinical signs do not appear, and even in FMD positive cases, it is difficult to isolate the FMDV or obtain whole genome sequence. To overcome this problem, more rapid and simple NGS system is required to control FMD in Korea. FMDV (O/Boeun/ SKR/2017) RNA was extracted and sequenced using Ion Torrent's bench-top sequencer with amplicon panel with optimized bioinformatics pipelines. The whole genome sequencing of raw data generated data of 1,839,864 (mean read length 283 bp) reads comprising a total of 521,641,058 (≥Q20 475,327,721). Compared with FMDV (GenBank accession No. MG983730), the FMDV sequences in this study showed 99.83% nucleotide identity. Further study is needed to identify these differences. In this study, fast and robust methods for benchtop next generation sequencing (NGS) system was developed for analysis of Foot-and-mouth disease virus (FMDV) whole genome sequences.

내장형 시스템 동적 메모리 할당 기법의 시스템 수준 성능에 관한 정량적 분석 (Quantitative Analyses of System Level Performance of Dynamic Memory Allocation In Embedded Systems)

  • 박상수;신현식
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제11권6호
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    • pp.477-487
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    • 2005
  • 내장형 컴퓨터의 규모가 커지고 기능이 복잡해짐에 따라 동적 메모리 할당 기법은 전체 시스템의 성능을 좌우하는 중요한 요인으로 등장하였다. 본 논문의 목적은 내장형 시스템에서 동적 메모리 할당 기법을 사용할 때 하드웨어, 소프트웨어 구성에 따른 성능을 측정하는데 있다. 기존의 연구가 운영체제를 탑재하지 않은 단일 스레드의 단일 메모리 주소 공간을 갖는 시스템을 대상으로 한 반면 본 논문은 실제 환경과 같이 리눅스 운영체제를 탑재한 내장형 시스템을 사용한다 이러한 시스템 기반에서 소프트웨어의 각 계층과 하드웨어 설계 인자의 변화에 따른 동적 메모리 할당의 수행시간을 실험적으로 분석하였다. 본 논문의 정량적인 성능분석 결과는 시스템 설계자에게 유용한 데이터를 제공함으로써 보다 효율적인 고성능 저전력 내장형 시스템의 구현을 가능하게 할 것이다.

Effects of Functional Oils on Coccidiosis and Apparent Metabolizable Energy in Broiler Chickens

  • Murakami, A.E.;Eyng, C.;Torrent, J.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제27권7호
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    • pp.981-989
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    • 2014
  • The objective of the present study was to investigate the effects of a mixture of functional oils (Essential, Oligo Basics Agroind. Ltda) on performance response of chickens challenged with coccidiosis and the determination of apparent metabolizable energy (AME), nitrogen-corrected apparent metabolizable energy (AMEn), the coefficients of protein and ether extract digestibility and intestinal morphology of broilers fed with diets containing Essential. In Exp. 1, a completely randomized design (CRD) was used, with one control diet without Essential inclusion with coccidiosis (Eimeria acervulina, Eimeria maxima, and Eimeria tenella) challenged birds and two different inclusion rates of Essential (1.5 kg/ton and 2 kg/ton) with coccidiosis-challenged and non-challenged birds for each inclusion rate, using 10 replicates and 50 birds per experimental unit. After 7 d of coccidiosis challenge, the livability was approximately 10% lower (p<0.05) for the control group. Intestinal lesion scores were lower (p<0.05) in the anterior intestine and the cecum for the chickens supplemented. Feed efficiency and growth rate were improved in birds supplemented with Essential (p<0.05) before the coccidiosis challenge and during the first 7 d post infection. In Exp. 2, a CRD was used, with one control diet without Essential inclusion and one diet with inclusion of Essential (1.5 kg/ton), using nine replications and 33 chicks per pen. The diets with Essential yielded approximately 4% higher AME (p = 0.003) and $AME_n$ (p = 0.001). Essential supplementation increased villus height in the jejunum on d 14 (p<0.05). Villus height:crypt depth ratio for the supplemented birds was larger (p<0.05) in the jejunum on d 7, larger (p<0.05) in the jejunum and ileum on d 14. In conclusion, these functional oils improved the energy utilization and the livability and decreased lesions caused by coccidiosis in supplemented birds.

한국산 물김에 관한 연구(제1보) 강원도 삼척군 초당산 물김에 관한 형태 및 생태학적 연구 (Study on the Prasiola sp. in Korea (I) Ecological and Morphological studies on the Prasiola sp. in the Samchuck-Chodang)

  • 바간규
    • Journal of Plant Biology
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    • 제13권2호
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    • pp.1-10
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    • 1970
  • This experiment surveys ecological and morphological phase on Prasiola sp. in the mountain torrent of Chodang-ri, Keunduck-myon, Samchuck-gun, Kangwon-do, Korea from November 1968 through January 1970 and the results obtained were summarized as follows. 1. The temperature of the surface water was 12.4$\pm$2.3$^{\circ}C$, and pH was 7.25$\pm$0.2. 2. The external forms of thallus are very variable, but its basic form likely lanceolated and ovated. 3. The length of thallus is 0.6cm-8.8cm (3.6$\pm$1.72cm), and the width, 0.2cm-5.5cm(1.7$\pm$0.92cm). (The inside of the parentheses the average for 500 individuals). 4. It is observed that thallus at the time of formation of a monospore is a monostratum cell whose thickness is 21$\pm$3.2$\mu$. 5. Thickness of thallus at the transveres section at the time of heteroplanogametes formation is 29.9$\pm$2.2$\mu$, and that of the female gametes cell is 6.3$\pm$1.7$\times$6.3$\pm$0.8$\mu$, and that of the male gametes cell is 2.8$\pm$0.6$\times$28.1$\pm$1.1$\mu$. 6. As for growth, it begins with apical growth, followed by marginal growth. It seems to grow, through cell division when microsopical papillae are produced in growth line cell of marginal rigion thus by fusioning microscopical papillae. 7. The two kinds of thallus, one produced from a monospore and other from a planozygotes, are both haplonts and observed as n-3. 8. It seems that a thallus sprouts in April and increases its number through a asexual reproduction by a monospore and begins a sexual reproduction in November by forming gametes. 9. Female gametes are produced 16 from one thallus cell, whose structure shows 8 cells in the surface view and 4 layers in transverse section. Male gametes are produced 128 from one thallus cell, 16 cells surface, 8 layers in transverse section.

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섬진자가사리 Liobagrus somjienesis(Siluriformes, Adrianichthyidae) 후각기관의 기능 해부학적 구조 (Functional Anatomy of the Olfactory Organ in the Torrent Catfish, Liobagrus somjinensis(Siluriformes, Amblycipitidae))

  • 김현태;박종영
    • 한국어류학회지
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    • 제30권1호
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    • pp.65-68
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    • 2018
  • 섬진자가사리 Liobagrus somjinensis 후각기관과 서식처 환경 및 생태적 습성의 연관성을 규명하기 위해 실체현미경과 디지털카메라를 이용하여 해부학적 특징을 묘사하였다. 후각기관은 주둥이 위에 좌우 한 쌍으로 존재하였으며, 전비공, 후비공, 비강으로 크게 구성되어 있었다. 전비공은 튜브형의 형태로 코수염과 윗입술 끝 사이에 위치하였다. 후비공은 표면과 평평한 유출공으로써 코수염의 기부 바로 아래에 위치해 있었다. 비강은 가로와 방사형으로 배열된 혀 모양의 22~24개의 판으로 구성된 로제트 구조를 보유하고 있었다. 결과적으로 섬진자가사리의 후각기관의 기능 해부학적 구조는 여울에서의 은신, 섭식, 야행성의 생활패턴에 연관된 높은 후각의존도를 반영하는 것으로 생각된다.