• 제목/요약/키워드: strains inoculation

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Fusarium oxysporum에 의한 황칠나무 묘목 뿌리썩음병 발생 보고 (First Report of Root Rot of Dendropanax trifidus Caused by Fusarium oxysporum in Korea)

  • 마혜린;최선규;상현규;김현준
    • 한국균학회지
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    • 제51권1호
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    • pp.51-56
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    • 2023
  • 황칠나무는 두릅나무과에 속하는 난대성 상록활엽수로 우리나라 제주도, 보길도, 거문도, 거제도, 완도, 해남 등에 분포한다. 2021년 6월 전라남도 나주에서 황칠나무 유묘의 지제부가 갈변하고 잘록해지는 뿌리썩음병을 국내 최초로 발견하였다. 황칠나무 뿌리썩음병균을 분리 및 동정하기 위해, 유묘의 병든 조직에서 3개의 균주를 분리하였고, PDA 배지에서 형태적, 균학적 특성 조사한 결과 Fusarium oxysporum으로 동정되었다. Internal transcribed spacer (ITS) 및 translation elongation factor 1-α (EF1-α) 염기서열을 통한 분자계통학적 분석을 수행하여 한국의 황칠나무 뿌리썩음병균은 F. oxysporum임을 확인하였다. 병원성 테스트를 위해 유묘의 뿌리를 분생포자 현탁액에 침지하여 정식하였고, 접종 20일 후 처리구에서 뿌리썩음 및 지제부의 갈변 증상을 확인하였다. 본 연구는 한국의 황칠나무 유묘에서 뿌리썩음병균 F. oxysporum의 첫 보고이다.

Construction of an Agroinfectious Clone of a Korean Isolate of Sweet Potato Symptomless Virus 1 and Comparison of Its Infectivity According to Agrobacterium tumefaciens Strains in Nicotiana benthamiana

  • Phuong T. Ho;Hee-Seong Byun;Thuy T. B. Vo;Aamir Lal;Sukchan Lee;Eui-Joon Kil
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제39권3호
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    • pp.255-264
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    • 2023
  • Sweet potato symptomless virus 1 (SPSMV-1) is a single-stranded circular DNA virus, belonging to the genus Mastrevirus (family Geminiviridae) that was first identified on sweet potato plants in South Korea in 2012. Although SPSMV-1 does not induce distinct symptoms in sweet potato plants, its co-infection with different sweet potato viruses is highly prevalent, and thus threatens sweet potato production in South Korea. In this study, the complete genome sequence of a Korean isolate of SPSMV-1 was obtained by Sanger sequencing of polymerase chain reaction (PCR) amplicons from sweet potato plants collected in the field (Suwon). An infectious clone of SPSMV-1 (1.1-mer) was constructed, cloned into the plant expression vector pCAMBIA1303, and agro-inoculated into Nicotiana benthamiana using three Agrobacterium tumefaciens strains (GV3101, LBA4404, and EHA105). Although no visual differences were observed between the mock and infected groups, SPSMV-1 accumulation was detected in the roots, stems, and newly produced leaves through PCR. The A. tumefaciens strain LBA4404 was the most effective at transferring the SPSMV-1 genome to N. benthamiana. We confirmed the viral replication in N. benthamiana samples through strand-specific amplification using virion-sense- and complementary-sense-specific primer sets.

Identification of virulence-associated genes of Erwinia amylovora by transposon mutagenesis

  • Seung Yeup Lee;Hyun Gi Kong;In Jeong Kang;Hyeonseok Oh;Hee-Jong Woo;Eunjung Roh
    • 농업과학연구
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    • 제50권2호
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    • pp.241-247
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    • 2023
  • Erwinia amylovora , which causes fire blight disease on apple and pear trees, is one of the most important phytopathogens because of its devastating impact. Currently, the only way to effectively control fire blight disease is through the use of antibiotics such as streptomycin, kasugamycin, or oxytetracycline. However, problems with the occurrence of resistant strains due to the overuse of antibiotics are constantly being raised. It is therefore necessary to develop novel disease control methods through an advanced understanding of the pathogenesis mechanism of E. amylovora . To better understand the pathogenesis of E. amylovora , we investigated unknown virulence factors by random mutagenesis and screening. Random mutants were generated by Tn5 transposon insertion, and the pathogenicity of the mutants was assessed by inoculation of the mutants on apple fruitlets. A total of 17 avirulent mutants were found through screening of 960 random mutants. Among them, 14 mutants were already reported as non-pathogenic strains, while three mutants, TS3128_M2899 (ΔSUFU ), TS3128_M2939 (ΔwcaG ), and TS3128_M3747 (ΔrecB ), were not reported. Further study of the association between E. amylovora pathogenicity and these 3 novel genes may provide new insight into the development of control methods for fire blight disease.

2차 발효 후 로제 스파클링 와인의 품질 특성 및 기능성 (Quality Characteristics and Functionality of Rose Sparkling Wines by Secondary Fermentation)

  • 신혜림;이윤정;황온빛;박의광;최성열;윤동규;윤향식
    • 한국식품영양학회지
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    • 제36권6호
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    • pp.425-435
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    • 2023
  • This study investigated quality characteristics and functionality of rose sparkling wine that were manufactured by secondary fermentation after inoculation of yeast strains. The pH of the samples ranged from 3.96 to 4.05 and total acidity ranged from 0.23 to 0.32%. The alcohol contents of wines ranged from 6.4 to 6.6% and the CO2 pressure ranged from 2.0 to 2.6 bar. The brightness of rose wines ranged from 84.72 to 87.36, the redness from 9.28 to 14.15, and the yellowness from 9.50 to 19.20. The hue value of wines ranged from 1.137 to 1.513 and color intensity ranged from 0.724 to 0.882. Aroma analysis identified 14 alcohols, 22 esters, 4 ketones, 4 acids, and 17 miscellaneous compounds. The total tannin contents and total polyphenol contents of wines were 11.28~12.43 mg% and 24.79~28.20 mg%, respectively. The DPPH radical scavenging activity of wines ranged 63.33 to 67.89% and the ABTS radical scavenging activity of wines 82.16~86.06%. The results of this study provide a basis for establishing the brewing process of rose sparkling wines yeast strains.

Bacillus subtilis S37-2 균주의 항진균활성 및 식물생육촉진 효과 (Plant Growth Promoting Effect and Antifungal Activity of Bacillus subtilis S37-2)

  • 권장식;원항연;서장선;김완규;장갑열;노형준
    • 한국토양비료학회지
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    • 제40권6호
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    • pp.447-453
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    • 2007
  • 작물생육에 유용한 미생물을 선발하여 생물비료로 이용하고자 고추, 토마토, 상추, 오이, 목초, 잔디, 콩의 근권토양 및 뿌리표면에서 세균을 373균주 분리하였다. 각각의 균주를 작물에 접종후 작물생육에 미치는 영향을 관찰하였다. 그 중 작물생육을 촉진시키는 균주를 대상으로 작물생육량과 식물병원성 진균 억제능을 평가한 후 우수한 1균주를 선발하였다. 그리고 선발한 균주의 배양적 특성 및 식물호르몬 생산성을 분석하였다. 선발된 균주는 16S rRNA 염기서열분석, 생화학적특성 등의 분석으로 속 종명을 동정하였다. 식물생육촉진 및 식물병원성 진균을 효과적으로 억제하는 Bacillus subtilis S37-2 균주를 선발하였다. 시험에 사용된 식물병원성 진균은 Fusarium oxysporum (KACC 40037), Rhizoctonia solani (KACC 40140), Sclerotinia sclerotiorum (KACC 40457)의 3 균주였으며, 이들 균주에 대하여 모두 효과적이었다. 토양이 충진된 폿트에 상추를 재배하여 B. subtilis S37-2 균주의 희석현탁액을 $10^5{\sim}10^8cell\;ml^{-1}$ 범위의 접종 농도별로 근권에 처리후 상추의 생육량을 조사하였다. 접종균수가 많을수록 상추 생육량은 증가하였다. $8.7{\times}10^8cell\;ml^{-1}$를 주당 50 ml씩 1~2회 접종시 대조구에 비해 상추의 엽 생체중이 48.7%, 뿌리의 건물중이 42.3% 씩 각각 생육량이 증가하는 효과를 나타내었다. 상추 유묘에 식물병원성 진균인 S. sclerotiorum (KACC 40457)처리후 B. subtilis S37-2 균주를 접종한 구와 접종하지 않은 대조구를 비교한 결과 접종후 9일에 접종구는 16.7%, 대조구는 100% 이병되어 고사되었다. 배지 종류별로 B. subtilis S37-2 균주의 균체증식량을 비교한 결과 TSB배지가 양호하였으며, 질소원을 첨가할 경우 peptone, tryptone보다 yeast extract를 첨가한 구가 균체생성량이 양호하였다. 그리고 배양 온도별로는 $30^{\circ}C$에 비해 $37^{\circ}C$가 약 2~4배이상 균체생성량이 많았다. L-tryptophan을 $20mg\;L^{-1}$ 첨가한 TSB 배지에 B. subtilis S37-2 균주를 접종하여 24시간 배양후 IAA(indole 3-acetic acid) 생성량은 $0.1{\mu}g\;ml^{-1}$ 이 검출되었다.

Panellus edulis 수집 균주의 균사배양 및 자실체 특성 분석 (Mycelial Culture and Fruiting Analysis of Panellus edulis Strains Collected in Korea)

  • 우성이;유림;장영선;박영애;정연석;가강현
    • 한국균학회지
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    • 제46권3호
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    • pp.281-294
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    • 2018
  • 국내에서 참부채버섯(Panellus serotinus)으로 수집한 8균주의 internal transcribed spacer 영역 염기서열을 이용하여 계통분석을 실시한 결과 참부채버섯이 아닌 Panellus edulis로 나타났다. Universal Fungal PCR Fingerprinting (UFPF) 분석결과 P. edulis 8균주는 크게 두 그룹으로 나눠졌다. 우리나라 산림에 서식하는 8개 균주의 배양특성을 이해하기 위해 균사의 성장과 효소 활성에 대한 기초특성 연구를 수행했다. 모든 균주는 21일 동안 3종류 배지를 사용하여 배양하였고 생장이 적합한 배지는 malt extract agar (MEA), Sabouraud dextrose agar (SDA) 배지보다 potato dextrose agar (PDA)로, 빠른 균사 생장 및 균사 밀도를 보였다. P. edulis 균주의 균사 생육 조건은 PDA에서는 $20^{\circ}C$, potato dextrose broth (PDB)에서는 $25^{\circ}C$가 선발되었으며, 균사생장에 적합한 수소이온 농도가 PDB는 pH 5~8로 이때 균사생장이 영향을 받지 않았다. 두 균주(NIFoS 2792, 2804)는 PDA의 균사 생장 및 밀도를 기준으로 우수한 균주로 선정되었다. 모든 균주는 셀룰라아제와 라카아제 활성을 나타내었고 NIFoS 2407과 2805는 다른 균주보다 높은 효소 활성을 보였다. 그 중에서도 라카아제 활성은 NIFoS 2387이었고 모든 균주는 셀룰라아제를 생산하였다. 톱밥 종류별 시험에서 상수리나무와 신갈나무에서 균사생장속도가 다른 톱밥에서보다 좋았고 균사 밀도도 가장 양호하였다. 버섯의 톱밥재배는 $23^{\circ}C$에서 균 접종 후 80~85일간 배양하였고, 원기형성 온도는 $17{\sim}18^{\circ}C$에서 10~11일간, 자실체 생육은 15~20일간 수행하였다. 버섯 재배 결과, 배양기간과 수량 면에서 NIFoS 2804, NIFoS 3993 균주가 가장 양호한 균주로 선발되었다. 이러한 결과는 추후 P. edulis의 인공재배를 하는데 유용한 정보로 활용 될 수 있을 것이다.

96-well microplate를 이용한 Trichophyton Rubrum의 항진균제 감수성검사 (Antimycotic Susceptibility Testing of Trichophyton Rubrum by Microculture Method)

  • 이무웅;김종철;최종수;김기홍
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제9권2호
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    • pp.396-406
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    • 1992
  • 저자들은 Granade와 Artis의 방법에 따라 96-well microplate와 24-well macroplate를 이 용하여 T. rubrum 9주를 대상으로 경구용 항진균제인 ketoconazole과 itraconazole에 대한 MIC를 측정하여 실제 임상사용 가능성을 알아보고 배양온도, 배양용기의 크기, 배지의 종류를 달리하여 MIC에 영향을 줄 수 있는 요소를 점검하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 96-well microplate를 사용하여 $25^{\circ}C$에서 배양시 균농도에 따른 판독시기의 차이는 높은 균농도(흡광도 2.0, 1.0)에서는 4일만에, 낮은 균농도(흡광도 0.5, 0.25)에서는 6-8일만에 판독할 수 있었고, MIC는 높은 균농도에서 높았으나 시간이 경과시 점차 차이가 줄어들었다. 2. $37^{\circ}C$$25^{\circ}C$에서 각각 배양시 배양온도에 따른 MIC의 차이는 96-well microplate를 사용하여 $37^{\circ}C$에서 배양시 ketoconazole에 대한 MIC는 0.006이하-$0.04{\mu}g/ml$, itraconazole에 대한 MIC는 0.006이하-$0.04{\mu}g/ml$였으며 $25^{\circ}C$에서의 ketoconazole에 대한 MIC는 0.08-$5.68{\mu}g/ml$, itraconazole에 대한 MIC는 0.006-$0.71{\mu}g/ml$$37^{\circ}C$에서의 MIC는 $25^{\circ}C$에서의 MIC에 비해 현저히 낮았다. 3. 24-well microplate와 96-well microplate에서 각각 배양시 배양용기의 크기에 따른 판독시기는 96-well microplate 액체배지에서는 4-6일로 24-well macroplate 액체배지에서의 8-12일에 비해 판독시기가 빨랐으나, MIC의 차이는 없었다. 4. 액체배지와 고체배지에서 배양시 배지종류에 따른 MIC의 차이는 액체배지를 함유한 24-well macroplate를 이용한 경우 ketoconazole에 대한 MIC는 0.006이하-$5.68{\mu}g/ml$, itraconazole에 대한 MIC는 0.006 이하-$0.36{\mu}g/ml$였고 고체배지에서는 ketoconazole에 대한 MIC는 0.006이하-$5.68{\mu}g/ml$, itraconazole에 대한 MIC는 0.006 이하-$5.68{\mu}g/ml$로 고체배지에서의 MIC가 다소 높게 측정되었다. 5. 이상의 결과를 종합하여 볼때 96-well microplate를 사용하여, 흡광도 1.0의 균농도로 접종하여, $25^{\circ}C$에서 배양 후 5-6일째 육안으로 판독하는 것이 항진균제 감수성 검사를 빠르고 간편하게 실시 할 수 있는 방법이다.

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Tco1 is a Hybrid Histidine Kinase Essential for the Sexual Development and Virulence of Ustilago maydis

  • Yun, Yeo Hong;Kim, Seong Hwan
    • 한국균학회소식:학술대회논문집
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    • 한국균학회 2015년도 춘계학술대회 및 임시총회
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    • pp.60-60
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    • 2015
  • Hybrid histidine kinase is a part of two-component system that is required for various stress responses and pathogenesis of pathogenic fungi. In the present study, Tco1, a homologue of human pathogen Cryptococcus neoformans Tco1 encoding a hybrid histidine kinase, was identified in corn smut pathogen Ustilago maydis by bioinformatic analysis. To explore the role of Tco1 in the virulence of U. maydis, mutants in which the tco1 gene was partially deleted were constructed by allelic exchange. The U. maydis tco1 mutants did show unaltered growth rate on axenic medium but were unable to produce conjugation tubes and develop fuzzy filaments, resulting in impaired mating of compatible strains. The expression levels of prf1, pra1, and mfa1 which are involved in the pheromone pathway significantly decreased in the tco1 mutants. In inoculation tests to host, the tco1 mutants showed significantly reduced ability in the production of anthocyanin pigments and tumor development on maize leaves. Overall, the combined results indicated that Tco1 plays important roles in sexual development and virulence of U. maydis by regulating the expression of the genes involved in the pheromone pathway.

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THE SUSCEPTIBILITY OF SCALELESS MUTANT CHICKENS TO VERY VIRULENT MAREK'S DISEASE VIRUS

  • Lin, J.A.;Liu Tai, J.J.;Lu, Y.S.;Liou, P.P.;Tai, C.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제9권6호
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    • pp.679-684
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    • 1996
  • This study evaluates the susceptibility of scaleless mutant chickens to very virulent Marek's disease virus (vvMDV) inoculation. One day old chickens were inoculated subcutaneously with Taiwanese isolates of LTB-1 and LTS-1 strains, and standard strain of Md/5. Compared with the non-inoculated group the vvMDV-inoculated chickens showed decreased body weights and atrophy of lymphoid organs before 35 days old. These results indicate that scaleless chickens show the same susceptibility as the wild type chickens to vvMDV infection. Furthermore, the protective effect of herpesvirus of turkey (HVT) vaccination at 1 day old against vvMDV challenge was evaluated. Scaleless mutant chickens of treated groups showed 20-30% early death, and 85.7-100% and 12.5-14.2% had lymphomatous lesions in visceral organs and peripheral nerves, respectively. No significant lesions were observed in non-challenged chickens of the control group. The HVT vaccination did not provide an effective protection against vvMDV infection. It is concluded that scaleless mutant chickens are susceptible to vvMDV infection.

Occurrence of crown gall of chrysanthemum caused by Agrobacterium tumefaciens.

  • Lee, Young-Kee;Lee, Jong-Hyoung;Kim, Jin-Young;Cho, Weon-Dae;Cha, Jae-Soon
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.126-126
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    • 2003
  • Incidence of crown gall on lower stem of chrysanthemum, Chrysanthemum morifolium Ramat., was first observed at Hwasung, Gyeonggi, Korea in 2001, Tumors on the stem were 1.5-2 cm in size and semi-round with rough surface texture of dark brown color. Four strains of bacteria isolated from the tumor tissues were characterized. Their colonies were convex, glistening, circular with an entire edge, and white to tannish-cream in color on PDA plus CaCO$_3$. They were gram negative, oxidase positive, and growing on DIM agar. The bacterial isolates inducing gall formation in chrysanthemum were identified as Agrobacterium tumefaciens based on biochemical and physiological characteristics, fatty acid profile using Sherlock Microbial Identification System, and substrate utilization patterns using Biolog Identification System. Young chrysanthemum plants inoculated with the bacteria developed typical galls within two to three weeks. Seedlings of tomato and slices of carrot roots also produced typical galls two to three weeks after inoculation. This is the first report on crown gall of chrysanthemum in Korea.

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