A biochemical genetic study on blood enzyme/protein systems in some breeds/crosses of sheep in Malaysia was carried out using horizontal starch gel electrophoresis. Blood samples were collected from 435 sheep, representing 8 breeds/crosses. These included 5 wool sheep breeds (Thai Longtail, wiltshire, Suffolk, Dorsimal and cMBLx), 1 hair sheep breed (Barbados Blackbelly) and 2 hybrids between wool sheep and hair sheep (Cameroon ${\times}$ Thai Longtail and Bali Bali ${\times}$ Malin). Twenty loci systems were examined. Of these, ten ($HB{\beta}$, ALB, TF, XP, CAT, DIA1, EsA, GPI, ME and NP) exhibited genetic variation whereas the other ten (AAT, CA, DIA2, ${\alpha}GLO$, ${\alpha}GLU$, LDH, MDH, PEP[leu-gly-gly], 6PGD and SOD) were monomorphic. The allelic frequencies which were obtained in 10 polymorphic markers are assessed and compared with the results obtained by previous workers. The estimations of inbreeding coefficient, intrabreed variation and breed relationships have been critically discussed and are used to reveal some important recommendations.
본 연구는 고추 잎 절편으로부터 유도한 callus로부터 체세포 배형성에 따른 peroxidase, esterase 및 MDH의 활성 및 전기영동적 변화를 비교 분석하여 세포분화에 따른 생리, 생화학적인 변화를 알아보고자 하였다. 고추 잎 절편에서 유도된 callus는 호르몬이 첨가 되지 않은 MS 액체배지에서 체세포배를 유도하였을 때 배양 7일째 peroxidase, esterase, MDH의 효소 활성이 가장 높게 나타났으며 특히 peroxidase의 활성도는 배양 12일째 세포내에 비해 배로 방출된 효소의 활성이 4배 정도 높았다. 이와같이 페세포 배형성에 따른 isozyme 의 활성도 및 전기영동적 양상의 배형성과 재분화 과정을 연구하는데 유용할 것으로 사료된다.
A thermophilic bacterium (strain DG0303) producing a thermostable $\alpha$-glucosidase was isolated from manure and identified as Bacillus sp. Strain DG0303 produced high level of $\alpha$-glucosidase compared with other thermophilic Bacillus strains. The cellular protein patterns were also compared with other Bacillus strains by sodium dodecyl sulfatepolyacrylamide gel electrophoresis(SDS-PAGE). On the basis of 16S rDNA analysis the Bacillus sp. DG0303 was found to be a member of Bacillus rDNA group 5. The optimum temperature for growth was 65$\circ$C and no growth was obtained at 40$\circ$C or 75$\circ$C. The optimum pH for growth was 5.5 to 8.5. $\alpha$-glucosidase activity was produced during growth and most activity was detected in the culture supernatant. The $\alpha$-glucosidase production was constitutive in the absence of carbohydrates. High level of enzyme activity was detected when the culture was grown on medium containing starch. Addition of glucose resulted in the repression of the $\alpha$-glucosidase production. The optimum pH and tempoerature for enzyme activity were pH 5.0 and 65$\circ$C, respectively. When analyzed by zymogram, the culture supernatant showed a single $\alpha$-glucosidase band with a molecular weight of approximately 60,000.
Kim, Wan-Seop;Youn, Deok-Joong;Cho, Won-Tae;Kim, Myung-Kuk;Kim, Hak-Ryul;Rhee, Sang-Ki;Choi, Eui-Sung
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제5권5호
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pp.297-301
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1995
An anthracycline antibiotic, aclacinomycin A (aclarubicin), was produced from a mutant strain of Streptomyces lavendofoliae. The mutant strain which showed a 4-fold higher productivity of aclacinomycin A compared with the parent strain was also found to produce a significantly higher amount of aclacinomycin A than the reported production strain, Streptomyces galilaeus. The aclacinomycin A was produced up to 125 mg/l using potato starch and soybean meal as carbon and nitrogen sources, respectively, on a 3 liter scale fermentation in a 5 liter jar fermentor. The mutant strain also produced significant amount of aclacinomycins Band Y. Aclacinomycin A was isolated from the culture broth by solvent extractions and further purified by silica gel column chromatography. The yield of aclacinomycin A with over 99$%$ purity was found to be over 60$%$ starting from 3 liters of culture broth.
Glycine soja Sieb. et Zucc., a predominantly selfing annual, has been served as a reservoir of germplasm for soybean, G. max (L.) Merr., cultivar improvement. This study describes the levels and distribution of genetic variation within and among 22 Korean populations of G. soja using starch gel electrophoresis. The species maintains very similar levels of genetic variability within populations observed in most other annuals. At the population level, the mean percent of polymorphic loci (P) was 32.6%, mean number of allele per locus (A) was 1.32, and mean expected heterozygosity (He) was 0.112. In addition, total genetic diversity (HT) calculated only for polymorphic loci was 0.347. However, significant differences in allele frequencies among populations were found for all loci (P<0.001 in each case) and, on average, about 70% of the total variation in the species is common to all populations. Indirects estimate of the number of migrants per generation (Nm=0.58, calculated from mean GST) indicates that gene flow is low among Korean populations of the species. In addition, analysis of fixation indices revealed a substantial heterozygote deficiency in most populations and at all loci. This indicates that most populations sampled may have been substructed largely due to inbreeding (predominantly selfing) and restricted gene flow, coupled with founder effect and genetic drift. Considering a high genetic divergence among populations, it is recommended that several Korean populations of the species should be preserved, especially such as populations in the eastern and southeastern Korean peninsula with high variation.
Raphanus sativus L. var. hortensis f. raphanistroides (wild radish: Brassicaceae), a herbaceous perennial, occurs only on beaches in East Asia. Genetic diversity and population structure of seven Korean populations were investigated using starch gel electrophoresis. Although the Korean populatins are small, isolated with patchy distribution, the population maintain a moderate level of genetic diversity; the mean percentage fo polymorphic loci was 51.4%, mean number of alleles per locus was 1.84, and mean expected heterozygosity was 0.116. A combination of animal-outcrossing breeding system, wide geographical distribution, restricted ecological distribution, and a propensity for high fecundity may in part be explanatory factors contributing the moderate level of genetic diversity within populations. An overall excess of homozygotes relative to Hardy-Weinberg expetations (mean FISa=0.116) indicates that consanguineous mating occur within wild radish populations, leading to a family structure within a circumscribed area. Although population of wild radish experience a limited gene flow, only 5% of the total genetic variation found in Korean wild radish populations examined is due to differences among populations (mean GST=0.052). This value is considerably lower than the mean values of species with similar life history and ecological characteristics. However, significant differences were found in allele frequencies between populations for all polymorphic loci (P<0.01). It is supposed that directional selection toward genetic uniformity (similar gene frequencies) in a relatively homogenous habitat is thought to be operated among Korean wild radish populations.
Genetic and morphological variations of Rhinogobius giurinus were surveyed. Populations of R.giurinus were clearly divided into two forms (Form-A and Form-B). Starch gel variation of this species. Three loci (Aco, Mpi, aGpd) out of 27 showed fixed allelic differences between Form-A and Form-B and they are well differentiated from each other genetically (Rogers' S=0.871). These two forms, moreover, are found to be allopatric in distribution and morphologi cally different in body length and caudal fin color pattern. Therefore, they are considered as two distinct taxa of subspecific rank. In addition, the genetic relationships among 5 taxa within 4 species of the genus Rhinogobius were investigated. Three species of the Rhinogobius brunneus complex (R.sp. OR, R. sp. CB and R. sp. CO) are well differentiated from each other genetically and two taxa of R. giurinus are genetically divergent from three species of the Rhinosotius brunneus complex (average Nei's D=0.603, average Rogers'=0.534).
A carboxymethyl-cellulase (CMCase) was purified from the culture supernatant of Bacillus sp. KD1014 by ultrafiltration, ammonium sulfate precipitation, and a series of chromatography on QAE-Sephadex A-50, hydroxylapatite and Sephadex G-75. The purified CMCase was a single protein of 32 kDa, showed an optimum activity at $60^{\circ}C$ and pH 6.0, and had a half-life of 23 min at $70^{\circ}C$. The enzyme activity was not influenced by metal ions such as $Mg^{2+},\;Fe^{3+},\;K^+,\;Zn^{2+}$, and $Cu^{2+}$ at a concentration of 1.0 mM, partially inhibited by $Mn^{2+}$ and $Ag^+$, and significantly inhibited by pentachlorophenol (PCP). The purified enzyme showed a 3.9-times higher activity on lichenan than on CMC, but hardly cleaved xylan, starch, avicel, laminarin, filter paper and levan. The results of activity staining of the purified enzyme separated by native and denaturing gel electrophoresis suggested that the CMCase might exist in dimeric, oligomeric or aggregated form as well as in monomeric form. The enzymatic cleavage products from cellotetraose indicated that the CMCase possessed transglycosylation activity.
A horizontal starch gel electrophoresis for enzyme proteins extracted from 2 species of Korean viviparid snails; Cipangopaludina chinensis malleata and C. japonica was carried out in order to elucidate their genetic relationships. A total of 10 enzymes were employed in three different kinds of buffer systems. Two loci from each enzyme of alcohol dehydrogenase, esterase, glucose phosphate isomerase, isocitrate dehydrogenase, iditol dehydrogenase, malate dehydrogenase and peptidase(VL); and only one locus dach from two enzymes, glycerlo-3-phosphate dehydrogenase and phosphoglucomutase were detected; but, four loci from peptidase(LGG) were observed. Most of loci in two viviparid species showed homozygous monomorphic banding patterns and some of them were specific as genetic markers between two different species. However, EST-1, MDH-1, PEP(VL)-1loci showed polymorphic banding patterns. Foru populations of C. chinensis malleata were more closely clustered in a dendrogram within the range of genetic identity values of 0.928-1.00, and these clusters were lineated with C. japonica at the value of 0.355. In summarizing the above results, two viviparid snail species dmployed in this study mostly showed monomorphic enzyme protein banding patterns, and genetic differences specific between two species.
두꺼비와 물두꺼비 종류의 아이소자임과 염색체를 조사 비교 하였다. 전기영동법에 의하여 23가지 종류의 효소성 및 비효소성 단백질을 분석하였으며, 두꺼비 종류는 23가지중 6종류의 단백질이 다형이었고 물두꺼비 종류에서는 23가지중 4종류의 단백질만이 다형이었다. 23가지 종류의 단백질중 11가지는 두꺼비와 물두꺼비 사이의 종간차이가 없었으며 12가지는 뚜렷한 종간차이를 보였다. 두꺼비의 이형율은 4.8%이었고 물두꺼비의 이형율은 3.7%이었다. 두꺼비와 물두꺼비의 유전적 유사성은 0.5 이하였다. 두꺼비와 물두꺼비는 모두 22개의 염색체를 가지고 있었으며 서로 유사한 핵형이었으나 두꺼비에 있어서는 한쌍의 염색체에 부수 염색체가 있었다. 본 실험결과는 두꺼비와 물두꺼비는 그들의 핵형은 서로 유사하나 유전자 구성에는 큰 차이가 있으며 진화학상 비교적 오래전에 2종이 서로 분화 하였음을 알 수 있었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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