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Selection and optimization of nutritional risk screening tools for esophageal cancer patients in China

  • Dong, Wen;Liu, Xiguang;Zhu, Shunfang;Lu, Di;Cai, Kaican;Cai, Ruijun;Li, Qing;Zeng, Jingjing;Li, Mei
    • Nutrition Research and Practice
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    • 제14권1호
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    • pp.20-24
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    • 2020
  • BACKGROUND/OBJECTIVES: Malnutrition has multiple impacts on surgical success, postoperative complications, duration of hospital stay, and costs, particularly for cancer patients. There are various nutrition risk screening tools available for clinical use. Herein, we aim to determine the most appropriate nutritional risk screening system for esophageal cancer (EC) patients in China. SUBJECTS/METHODS: In total, 138 EC patients were enrolled in this study and evaluated by experienced nurses using three different nutritional screening tools, the Nutrition Risk Screening 2002 tool (NRS2002), the Patient-generated Subjective Globe Assessment (PG-SGA), and the Nutrition Risk Index (NRI).We compared sensitivity, specificity, positive and negative likelihood ratios, and Youden index generated by each of the three screening tools. Finally, cut-off points for all three tools were re-defined to optimize and validate the best nutritional risk screening tool for assessing EC patients. RESULTS: Our data suggested that all three screening tools were 100% sensitive for EC patients, while the specificities were 44.4%, 2.96%, and 59.26% for NRS 2002, PG-SGA, and NRI, respectively. NRI had a higher positive likelihood ratio as well as a higher area under the receiver operating characteristic curve compared to those of NRS 2002 and PG-SGA; although, all three tools had null negative likelihood ratios. After adjusting the cut-off points, the specificity and accuracy for all tools were significantly improved, however, the NRI remained the most appropriate nutritional risk screening system for EC patients. CONCLUSIONS: The NRI is the most suitable (highest sensitivity and accuracy) nutritional risk screening tool for EC patients. The performance of the NRI can be significantly improved if the cut-off point is modified according to the results obtained using MedCalc software.

토양 미생물로부터 생산된 Extracellular Cholesterol Oxidase의 특성 (Characterization of Extracellular Cholesterol Oxidase Produced from Soil Microorganism)

  • 박정수;정종문
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제37권11호
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    • pp.1507-1514
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    • 2008
  • 본 연구에서는 산업적으로 사용될 수 있는 안정하고 활성이 높은 cholesterol oxidase를 생산하는 균주를 얻기 위해 토양 미생물로부터 균주를 선별하였다. 선별된 균주에 대하여 세포외 효소 활성을 측정한 결과 BEN 115로 명명한 균주가 가장 높은 효소 활성도를 나타내었다. 이 균주는 형태학적, 생리학적 특성과 배양형태 및 G+C 함량을 분석한 결과 Nocardia속으로 확인되었다. 최적 효소 생산 조건을 조사한 결과 기존 yeast malt extract broth 조성인 0.4% yeast extract, 0.4% glucose, 1% malt extract에서 가장 높은 활성을 나타냈다. 본 균주에서 생산된 extracellular cholesterol oxidase는 SDS-PAGE와 Western blot 결과 분자량이 55, 57 kDa인 두 종류의 효소가 존재하는 것으로 나타났다. BEN 115에 대한 효소학적 특성을 연구한 결과 온도 안정성은 $55^{\circ}C$까지 효소 활성이 유지되었고, pH 안정성은 pH $3.5{\sim}9.5$의 범위까지 안정한 것으로 나타났으며 최적 온도와 최적 pH는 각각 35oC와 pH 5.5인 것으로 나타났다. 또한 detergent(Triton X-100, Triton X-114 그리고 Tween 80) 첨가 시 효소 활성이 첨가하지 않은 대조군보다 약 $1.6{\sim}2.0$배 증가하는 것으로 나타났다. Campesterol, sitosterol 그리고 stigmasterol에 대한 기질 특이성은 cholesterol(100%)과 상대적으로 비교 시 각각 50%, 50% 그리고 27%의 기질 특이성을 나타내었다.

유구낭미충증의 혈청학적 진단을 위한 ABC-ELISA와 Protein A-ELISA의 유용성 (Applicability of ABC-ELISA and Protein A-ELISA in serological diagnosis of cysticercosis)

  • 이종현;공윤;유제영;조승열
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제31권1호
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    • pp.49-56
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    • 1993
  • 현재 유구낭미충증을 혈청학적으로 진단하는 데에는 낭액항원을 이용한 특이항체검사법으로 micro-ELISA를 널리 이용하고 있다. 이 실험은 효소부착 이차항체를 사용하는 micro-ELISA방법 대신 민감도가 뛰어난 것으로 알려진 ABC-ELISA나 Protein-ELISA로 바꾸어 사용하면 검사의 민감도를 보다 개선할 수 있는지를 알기 위하여 실시하였다. ABC-ELISA에 의한 항체검사는 낭액항원 단백질 $2.5{\;}\mu\textrm{g}/ml$, 혈청 희석 1:10,000, biotinylated no-hmn IgG 1:100,000 회석, peroxidase conjugated streptavidin 1:40,000 희석 및 2,2-azino-di(3-ethylbenztlllazoline) sulfnnlc acid발색제를 사용하는 조건으로 실시하였고 415 nm에서 흡광도를 측정하였다. Protein A-ELISA는 항원단백질 $2.5{\;}\mu\textrm{g}/ml$, 혈청은 1:200 회석, HRP-Protein A 1:20,000 희석 및 ABTS 발색제를 사용하는 조건으로 실시하고 415 nm에서 흡광도를 측정하였다. 유구낭미충증 환자 115 명의 혈청을 검사한 바 민감도는 micro-ELISA 81.7%, Protein A-ELISA 82.6%, ABC-ELISA 86. 1%이었다. 다른 기생충성 질환자, 비기생충성 질환자 및 대조군 등 165명 혈청에서 특이도는 각각 88.5%, 93.3%, 93.8%이었다 세 가지 ELISA방법에 의한 항체가 사이에는 상관계수 0.84~0.86의 높은 상관관계가 성립하였다. 이상의 결과 ABC-ELISA는 micro-ELISA에 비하여 민감한 혈청학적 방법이고 실제 유구낭미충 특이항체 검사상의 특이도에서도 차이가 있다는 것을 알 수 있었다. 따라서 ABC-ELISA는 유구낭미충증의 혈청학적 진단에서 혈청 및 뇌척수액 등 검체를 적게 사용할 수 있다는 장점이 있다는 것을 알 수 있었다.

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간척지토양(干拓地土壤)의 수도근권(水稻根圈)에서 협생질소고정(協生窒素固定)에 관(關)한 연구(硏究) -제사보(第四報). 협생질소고정균(協生窒素固定菌)의 단당(單糖) 및 복합당류(複合糖類)와 근분비물질(根分泌物質)에 대(對)한 화학주화성(化學走化性) (Associated Nitrogen Fixation in the Rhizosphere of Rice in Saline and Reclaimed Saline Paddy Soil -IV. Chemotaxis of Associative N2-fixing Bacteria to Single or Combined Sugars and Root Exudates)

  • 이상규;서장선;고재영
    • 한국토양비료학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.359-367
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    • 1987
  • 수종(數種)의 유기산(有機酸), 당류(糖類)(단당(單糖), 복합당(複合糖)) 및 수도근계분비물질(水稻根系分泌物質)에 대(對)한 협생질소고정균(協生窒素固定菌)의 화학주화성(化學走化性)을 검토(檢討)하기 위하여 우리나라 서해간척지(西海干拓地)의 잡초(雜草) 및 수도(水稻) 근조직(根組織)에서 분리동정(分離同定)한 균(菌)을 공시(供試)하여 시험(試驗)하였다. 공시(供試)한 협생질소고정균중(協生窒素固定菌中) Azospirillum lipoferum Ecc 3-1은 유인물질(誘引物質)이 있는 방향(方向)으로 이동(移動)하기 위한 천이환(遷移環)을 만들었으나 Agrobacterium radiobacter Ecc 1-1과 Pseudomonas sp Ecc 4-1은 천이환(遷移環)을 만들지 않했다. 당류(糖類) 및 유기산(有機酸)에 대(對)한 공시세균(供試細菌)의 화학주화성(化學走化性)은 D(+)-glucose나 D(+)-fructose 보다 malic acid나 citric acid에 대(對)한 주화성(走化性)이 높았다. 특(特)히 복합당(複合糖)인 D-galactouronic acid와 L-aspartate는 공시(供試)한 타종(他種)의 당류(糖類)나 유기산(有機酸)보다 가장 높은 주화력(走化力)을 보였다. 수도근분비물질(水稻根分泌物質)에 대(對)한 공시협생질소고정균(供試協生窒素固定菌)의 주화성(走化性)을 수도품종(水稻品種)과 세균간(細菌間)에 서로 상이(相異)한 교호관계(交互關係)를 보였다.

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Immunoblot technique을 이용한 폐흡충의 발육단계별 항원 특이성 분석 (Analysis of antigenic specificities of Puragonimus westeymuni developmental stages using immunoblot technique)

  • 주경환;홍성철
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제27권1호
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    • pp.1-8
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    • 1989
  • 폐흡충증의 진단은 객담검사법이 가장 확실한 진단 방법이기는 하지만 폐흡충이 폐에 기 생한 경우에도 충란 검출이 어려울 때가 있으므로 혈청학적 진단법이 이용되고 있다. 혈청학적 진단법에 사용되는 항원인 기생충 추출물, 즉 조항원은 분류학적으로 유사한 기생충과 서로 공유하고 있는 공통 항원 때문에 교차 반응을 일으키는 경우가 있다. 이 연구는 발육단계 별 폐흡충에서 만든 조항원을 SDS-PAGE(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis)로 전기영동한 다음 EITB(enzyme-linked immunoelectrotransfer blot)를 이용하여 항원대별 항원성 및 특이성을 관찰하여 시기별로 채취한 고양이 혈청에 대한 특이 반응대를 관찰해 보고자 시행하였다. 실험에 사용한 항원은 실험적으로 고양이에 감염시켜 3, 5, 8및 12주 만에 얻은 폐흡충의 식염수 추출액 (SEPn; n=감염된 시기)이며 3∼20% linear gradient gel에서 SDS-PAGE하였다. Silver stain결과 폐흡충 조항원은 최소한 30개 이상의 band들로 구성되어 있었는데 각 발육단계 에 공통된 항원대로 203, 63, 35, 21, 19, 13 kDa band들이 관찰되었고, 단계별로 차이점도 관찰 되었다. SEPl2에서는 새로운 229 kDa band가 관찰되었다. 주요 항원대에 대하여 EITB를 한 결과 각 항원과 감염 후 5주 이상 된 혈청과 공통적으로 반응한 항원대는 203, 115, 91, 85, 67, 63, 48, 39, 35 및 25 kDa band들이었고, 8주 이상 된 혈청과의 반응에서는 19, 13및 10 kDa 항원대와 공통적으로 일관성 있게 반응하였다. SEP12는 12주 된 혈청과 229 kDa에서 특이하게 반응하였다.

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DNA 교차오염 방지기능이 있는 single-tube nested reverse transcription-polymerase chain reaction을 이용한 돼지생식기호흡기증후군바이러스 유전형 감별진단 (Single-tube nested reverse transcription-polymerase chain reaction for simultaneous detection of genotyping of porcine reproductive and respiratory syndrome virus without DNA carryover contamination)

  • 정필수;박수진;김은미;박지영;박유리;강대영;차현욱;이경기;김성희;박최규
    • 한국동물위생학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.107-116
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    • 2016
  • In the study, we developed and evaluated a uracil N-glycosylase (UNG)-supplemented single-tube nested reverse transcription-polymerase chain reaction (UsnRT-PCR) assay that can carried out first-round RT-PCR and second-round nested PCR in a reaction tube without reaction tube opening and can simultaneously detect EU- and NA-PRRSV. The UsnRT-PCR confirmed to have a preventing ability of mis-amplification by contamination of pre-amplified PRRSV DNA from previous UsnRT-PCR. Primer specificities were evaluated with RNAs extracted from 8 viral strains and our results revealed that the primers had a high specificity for both genotypes of PRRSV. The sensitivity of the UsnRT-PCR was 0.1 $TCID_{50}$/0.1 mL for EU- or NA-PRRSV, respectively, which is comparable to that of previously reported real time RT-PCR (RRT-PCR). Clinical evaluation on 110 field samples (60 sera and 50 lung tissues) by the UsnRT-PCR and the RRT-PCR showed that detection rates of the UsnRT-PCR was 70% (77/110), and was relatively higher than that of the RRT-PCR (69.1%, 76/110). The percent positive or negative agreement of the UsnRT-PCR compared to RRT-PCR was 96.1% (73/76) or 90.9% (30/33), showing that the test results of both assays may be different for some clinical samples. Therefore, it is recommend that diagnostic laboratory workers use the two diagnostic assays for the correct diagnosis for the relevant samples in the swine disease diagnostic laboratories. In conclusion, the UsnRT-PCR assay can be applied for the rapid, and reliable diagnosis of PRRSV without concerns about preamplified DNA carryover contamination that can occurred in PCR process in the swine disease diagnostic laboratories.

한국의 신지역지리학 : (2) 지리학 분야별 지역 연구 동향과 과제 (New Regional Geography in Korea : (2) Trends and Issues of Regional Research in Major Subfields)

  • 최병두
    • 한국지역지리학회지
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    • 제22권1호
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    • pp.1-24
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    • 2016
  • 이 논문은 2000년대 이후 한국의 신지역지리학의 발달 배경 및 종합적 연구 동향에 관한 앞선 논문에 이어서, 인문지리학의 주요 전공분야들에서 이루어진 경험적 지역 연구의 동향과 과제를 고찰하고자 한다. 특히 장소와 경관에 관한 역사문화지리학, 산업지구(또는 클러스터)에 관한 경제지리학, 도시 네트워크와 분화에 관한 도시(사회)지리학에서 지역이 어떻게 연구되고 있는가를 살펴보았다. 각 전공분야들에서 연구자들은 지역을 지칭하기 위해 각기 다른 용어들을 사용하고 있지만, 지역의 특수성을 보편적 과정과 관련시키고, 본질적 실체이지만 또한 담론적 구성물로 이 해하며, 영역성보다는 네트워크나 관계성에 더 많은 관심을 두고 있음이 확인된다. 이러한 공통점들은 기존의 전통적 지역연구에서 벗어나 신지역지리학의 경향을 반영한 것으로 평가된다. 앞으로 지역 연구에서 지역의 개념화를 위한 주요 과제로, 특수성/보편성, 실체성/구성물, 그리고 영역성/관계성의 이분법을 극복할 필요가 있으며, 또한 지역에 관한 경험적 연구의 주요 이슈로 새로운 관점에서의 지역적 종합, 지역 내 외적 관계로서 지역불균등발전, 그리고 대안적 지역 만들기 등이 제시된다.

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Mortierella sp. 유래 ${\alpha}$-Galactosidase의 기질특이성 (Substrate Specificities of ${\alpha}$-Galactosidase from Mortierella sp.)

  • 박귀근
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.245-251
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    • 2011
  • Mortierella sp. 유래 효소 정제는 CM-sephadex C-50 column chromatography와 Sephadex G-100 column에 의해 수행하여 SDS-전기영동에서 단일밴드를 확인하였고 분자량은 57kDa로 결정되었다. melibiose, raffinose 및 stachyose의 세 종류의 기질에 대한 특이성에서는 Mortierella sp. 유래 정제 ${\alpha}$-galactosidase는 세 종류 기질의 비환원말단에 위치하고 있는 galactose를 모두 유리하는 특이성이 있음을 확인하였다. Bacillus sp. 유래의 $Gal^3Man_4$에 대해서 반응초기 3시간부터 가수분해가 진행되어 반응말기에서는 galactose, mannotetraose 그리고 분해되지 않고 일부 남아있는 $Gal^3Man_4$의 spot이 출현된 반면, 중합도 7의 $Gal^{2,3}Man_5$에 대해서는 반응초기부터 말기까지 전혀 특이성이 없음을 시사하였다. Trichoderma harzianum 유래의 $Gal^2Man_3$에 대해서는 반응초기 3시간부터 가수분해가 진행되어 일부 galactose와 mannotriose spot이 출현되고 있는 반면, 중합도 7의 $Gal^2Man_6$에 대해서는 Bacillus sp. 유래의 중합도 7의 $Gal^{2,3}Man_5$와 동일하게 galactose를 절단하는 능력이 없는 특이성을 보이고 있다. Xylogone sphaerospora 유래의 $Gal^2Man_3$는 Trichoderma harzianum 유래의 중합도 4와 동일한 구조로서 가수분해 시간 경과에 따른 반응말기에서 역시 galactose, mannotriose 및 잔존하는 $Gal^2Man_3$ spot이 출현하고 있는 반면 중합도 6인 $Gal^2Man_5$에 대해서는 mannopentaose의 환원말단부터 2번 mannose에 결합하고 있는 galactose에 대해서는 역시 특이성을 나타내지 않아 반응 초기부터 말기까지 가수분해 pattern에 대한 변화를 보이지 않고 있다.

Comparative Analysis of the Multiple Test Methods for the Detection of Pandemic Influenza A/H1N1 2009 Virus

  • Choi, Young-Jin;Nam, Hae-Seon;Park, Joon-Soo;Kim, Hwi-Jun;Park, Kyung-Bae;Jeon, Min-Hyok;Kim, Chang-Jin;HwangBo, Young;Park, Kwi-Sung;Baek, Kyoung-Ah
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권10호
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    • pp.1450-1456
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    • 2010
  • Accurate and rapid diagnosis of Pandemic Influenza A/H1N1 2009 virus (H1N1 2009) infection is important for the prevention and control of influenza epidemics and the timely initiation of antiviral treatment. This study was conducted to evaluate the performance of several diagnostic tools for the detection of H1N1 2009. Flocked nasopharyngeal swabs were collected from 254 outpatients of suspected H1N1 2009 during October 2009. This study analyzed the performances of the RealTime Ready Inf A/H1N1 Detection Set (Roche), Influenza A (H1N1) Real-Time Detection Kit (Bionote), Seeplex Influenza A/B OneStep Typing Set [Seeplex Reverse Transcriptase PCR (RT-PCR)], BinaxNow Influenza A & B Test Kit [Binax Rapid Antigen Test (RAT)], and SD BIOLINE Influenza Ag kit (SD RAT). Roche and Bionote real-time RT-PCR showed identical results for the H1N1 2009 hemagglutinin gene. Compared with real-time RT-PCR, the sensitivities and specificities were 83.7% and 100% for Seeplex RT-PCR, 64.5% and 94.7% for Binax RAT, and 69.5% and 100% for SD RAT. The sensitivities of Seeplex RT-PCR, Binax RAT, and SD RAT in patients aged over 21 years were 73.7%, 47.4%, and 57.9%, respectively. The sensitivities of Seeplex RT-PCR, Binax RAT, and SD RAT on the day of initial symptoms were mostly lower (68.8%, 56.3%, and 31.3%, respectively). In conclusion, multiplex RT-PCR and RAT for the detection of H1N1 2009 were significantly less sensitive than real-time RT-PCR. Moreover, a negative RAT may require more sensitive confirmatory assays, because it cannot be ruled out from influenza infection.

Characterization of Monoclonal Antibodies against Human Leukocyte Common Antigen (CD45)

  • Shin, Hyang-Mi;Cho, Woon-Dong;Lee, Geon-Kook;Lee, Seon-Hwa;Lee, Kyung-Mee;Ji, Gil-Yong;Yoon, Sang-Soon;Koo, Ji-Hae;Lee, Ho-Chang;Lee, Ki-Hyeong;Song, Hyung-Geun
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제11권2호
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    • pp.114-122
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    • 2011
  • Background: The leukocyte common antigen (CD45) is a transmembrane-type protein tyrosine phosphatase that has five isoforms. Methods: We generated seven murine mAbs against human CD45 by injecting cells from different origins, such as human thymocytes, PBMCs, and leukemic cell lines. By using various immunological methods including flow cytometry, immunohistochemistry, and immunoprecipitation, we evaluated the reactivity of those mAbs to CD45 of thymus as well as tonsil lysates. Furthermore, we transiently transfected COS-7 cells with each of gene constructs that express five human CD45 isoforms respectively, and examined the specificities of the mAbs against the transfected isoforms. Results: In case of thymocytes, lymphocytes, and monocytes, all the seven mAbs demonstrated positive reactivities whereas none was reactive to erythrocytes and platelets. The majority of immune cells in formalin-fixed paraffin-embedded thymus and tonsil tissues displayed strong membranous immunoreactivity, and the main antigen was detected near 220 kDa in all cases. Among the mAbs, four mAbs (AP4, DN11, SHL-1, and P6) recognized a region commonly present in all the five isoforms. One mAb, YG27, recognized four isoforms (ABC, AB, BC, and O). Two mAbs, P1 and P14, recognized the isoforms that contain exon A encoded regions (ABC and AB). Conclusion: In this study, we confirmed that AP4, DN11, SHL-1, YG27 and P6, are mAbs reactive with the CD45 antigen whereas P1 and P14 are reactive with the CD45RA antigen.