• 제목/요약/키워드: southern blotting

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근권 길항세균 Pseudomonas fluorescens KR164에 Bacillus thuringiensis HD-1 유전자의 삽입과 발현 (Expression of Bacillus thringiensis HD-1 gene in rhizobacteria Pseudomonas fluorescens KR164)

  • 김영일;이영환;강흔수
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제35권4호
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    • pp.227-231
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    • 1992
  • 식물병원성 사상균에 대해 길항력을 갖는 그람음성 Pseudomonas fluorescens KR164의 chromosome에 그람 양성인 Bacillus thuringiensis(BT)의 HD-1 toxin gene을 삽입하기 위하여 이 유전자를 갖는 plasmids pSUPBT과 pSUPBTR을 작성하였다. Conjugation을 이용한 transposition으로 P. fluorescens KR164의 chromosome에 이 plasmids를 삽입시켜 BT toxin 유전자를 갖는 P. fluorescens KR164의 변이균주를 조제하였다. Southern blotting으로 균주의 cellular DNAs를 조사한 결과 모든 변이균주에서 한 개 이상의 BT toxin gene의 삽입이 확인 되었으며 독소단백질의 존재 역시 SDS-PAGE에 의해서 확인되었으며 이러한 독소단백질의 결정 생성은 전자현미경에서도 확인되었다.

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NaOH처리에 의한 Agrobacterium이용 팽이균사체 형질전환 (Agrobacterium-Mediated Transformation of Flammulina velutipes with NaOH Treatment)

  • 신동일;박희성
    • 한국균학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.235-238
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    • 2011
  • 팽이균사체의 형질전환을 위하여 Agrobacterium 세포를 사용하였다. 특히, Agrobacterium 세포의 감염단계 전에 약한 NaOH용액을 처리하였으며 이로써 균사체 세포들의 표면 상해 발생을 기대하였다. 그 결과, hygromycin 저항성 ($hyg^r$) 균사체는 NaOH 처리를 거친 경우에서만 출현하였다. 형질전환 균사체의 $hyg^r$ 유전자 도입은 PCR로 확인되었으며 또한 Southern blot hybridization과 western blotting 분석에 의하여 단일 유전자 copy의 삽입과 외래유전자의 발현을 확인할 수 있었다. 본 연구는 팽이균사체에 대한 효율적인 Agrobacterium 이용 형질전환수단을 보여주고 있다.

Isolation and partial haracterization of rat LDH A-genomic sequences

  • Lee, Mi-Young;Yim, Sun-Young;Lee, Seung-Ki
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제13권1호
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    • pp.69-73
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    • 1990
  • As a part of the study to elucidate the mechanism by which transcription of LDH A-gene is regulated by cAMP, we aimed to isolated rat LDH A gene and characterize cAMP-reponsive element (CRE). We have screened $1.2{\times}10^6$ recombinant phages of rat Charon 4A genomic library and isolated 33 positive clones among which we identified 12 different LDH A gene-related clones. By the results of restriction enzyme mapping, Southern blotting, and nucleotide sequence analyses, we concluded that the 12 LDH A gene-related clones were intronless and frequently mutated LDH A-pseudogenes. In this report, we present the characteristic features of the 12 rat liver LDH A-pseudogenes.

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A Macrolide-Lincosamide-Streptogramin B Resistance Determinant Gene (ermJ) Cloned from B, anthracis 590

  • Kim, Hee-Sun;Choi, Eung-Chil;Kim, Byong-Kak;Park, Young-In
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제15권1호
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    • pp.58-61
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    • 1992
  • Bacillus anthracis 590 having an inducibla resistance determinant to MLS antibiotics was isolated from a soli sample in Korea. The resistance gene (ernJ) was cloned by Southern blotting of chromosomal DNA fragment digested by various restriction enzymes and coloy hybridization method and the cloned plasmid was named as pBA423. The size of inserted DNA fragment of pBS42 vector was about 2.9 kb and the DNA sequence of the subcloned fragment (Hinc II-Hinc II, 1.4kb) WAS determined. The DNA sequence of ernJ was composed of 357 bp for leader region and 861 bp for the structural gene. Because the leader sequence of ernJ was homologous to that of ermK, the expression of ernJ is also thought to be controlled by a transcriptionl attenuation mechanism.

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형질전환동물의 유선조직으로부터 인간 성장호르몬의 분비 (Secretion of Human Growth Hormone from Mammary Gland of Transgenic Mice)

  • 구덕본;최강덕;정형민;이상민;이경광;이훈택;정길생
    • 한국가축번식학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.375-383
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    • 1994
  • The human growth hormone (hGH) gene uder the control of the rat $\beta$-casein promoter gene was designed to produce transgenic mouse expressed hGH gene in only mammary gland. One hundred seventy two eggs microinjected were transferred to the oviducts of pseudopregnants and 43 offspring were delivered. By Southern blotting hybridization, 3 were transgenic with rat $\beta$-casein/hGH gene. The copy numbers of three transgenic founder were 1, 5, and 15, respectively. A radioimmunoassay was developed to quantitate the amount of expression of the hGH gene in mammary gland of transgenic mice. The amount of hGH was 13.3ng/ml in the lactating milk of one transgenic line, showing predominantly higher than 3.0ng/ml in milk of control mice. Therefore, our findings suggested that $\beta$-casein promoter may induce the tissue specific expression of structural gene.

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중합효소 반응을 이용한 후두유두종 Human papillomavirus DNA의 검색 (DETECTION OF HUMAN PAPILLOMAVIRUS DNA IN RESPIRATORY TRACT PAPILLOMA USING POLYMERASE CHAIN REACTION(PCR))

  • 김광현;성명훈;정원호;최영민;박경찬
    • 대한기관식도과학회:학술대회논문집
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    • 대한기관식도과학회 1991년도 제25차 학술대회 연제순서 및 초록
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    • pp.18-18
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    • 1991
  • 후두유두종은 호흡기계에 발생하는 양성종양중 가장 흔한 질환으로 연령에 따라 소아형과 성인형으로 분류하는데 다발성 병변이 흔하고 재발율이 높다고 알려져 있다. 후두유두종의 원인으로는 human papillomavirus의 감염으로 생각되며 잠복 감염으로 인하여 후두유두종이 재발된다고 알려져 있다. Gissman등에 의해 HPV 11이 발견되었음이 보고된 이래 최근까지 HPV 6와 11이 후두유두종의 원인이 된다고 알려져 있다. HPV의 검출에는 Southern blotting이나 in-situ hybridization 방법이 알려져 있는데 저자들은 현재까지의 바이러스 검색방법 중 가장 예민한 방법인 PCR을 이용하여 후두유두종의 HPV DNA를 조사하여 보고자 한다. 저자들은 1989년 10월부터 1900년 12월까지 서울대병원 이비인후과에서 수술을 시행받은 후두유두종 환자 15예를 대상으로 하였으며 이중 소아형은 9예이었고 성인형은 6예였으며 대부분 다발성 병변이었다. HPV 6는 15예중 10예에서 HPV 11은 15예중 6예에서 발견되었으며 두가지 형이 같이 발견된 경우는 1예가 있었다. 소아형의 경우에는 HPV 6와 11이 각각 5예로 비슷한 비율로 검출된 반면 성인형에서는 HPV 6가 주로 검출되었다.

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국내에서 채집한 진드기에서 중합효소연쇄반응을 이용한 라임병균 및 Ehrlichiosis 원인체의 검출 (Detection of Borrelia burgdorferi and Ehrlichiosis Agent in Ticks Collected in Korea Using Polymerase Chain Reaction)

  • 김종배;송혜원;박성언;박상욱;안준환;엄용빈;김영미
    • 대한의생명과학회지
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    • 제4권2호
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    • pp.113-120
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    • 1998
  • 국내에서 채집한 진드기의 라임병 및 ehrlichiosis 원인체 보균 상태를 조사하기 위하여 총 516마리 (Ixodes spp. 22마리 , Haemaphysalis spp. 494마리)의 ixodid 진드기를 봄과 가을에 걸쳐 강원도 고산지대 일원에서 채집하였다. 수집한 진드기에서 DNA를 추출·정제한 후 추출한 DNA를 template로 이용하여, Borrelia burgdorferi sensu lato 및 Ehrlichia spp.에 특이하게 반응하도록 제작한 primer를 이용한 중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction, PCR)을 실시하였으며, 이 결과를 oligonucleotide probe를 사용한 southern blotting을 통하여 다시 확인하였다. 총 516마리의 진드기중 B. burgdorferi sensu lato DNA 양성인 진드기는 68 (13.2%)마리 (B. burgdorferi sensu stricto, 2; B. afzelii, 1; B. garinii, 33; B. tanukii, 8; B. turdae, 4)로 나타났으며 이 중 37 (7.2%)마리의 진드기는 southern blot analysis에서도 양성으로 확인되었다. 또한 101 (19.2%)마리의 진드기가 Ehrlichia spp.에 대한 PCR에서 양성이었으나, 이들 중 25 (4.8%)마리만이 southern blot analysis에서 양성으로 확인되었다. 그러나 사람의 병인체로 추정되는 human granulocytic ehrlichiosis (HGE) agent DNA를 보균한 진드기는 확인되지 않았다. 한편 라임병균과 ehrlichiosis원인체를 동시에 보균한 것으로 밝혀진 진드기가 3마리에서 (0.6%) 확인되어, 국내에서도 진드기 교상시 이들 두 가지 열성질환이 동시에 감염될 가능성이 있는 것으로 사료됨으로 진드기 매개성 열성질환에 대한 적절한 진단법 등을 보다 체계적으로 연구하여야 할 것으로 판단된다.

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cDNA Microarray Analysis of the Gene Expression Profile of Swine Muscle

  • Kim, Chul Wook;Chang, Kyu Tae;Hong, Yeon Hee;Jung, Won Yong;Kwon, Eun Jung;Cho, Kwang Keun;Chung, Ki Hwa;Kim, Byeong Woo;Lee, Jung Gyu;Yeo, Jung Sou;Kang, Yang Su;Joo, Young Kuk
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제18권8호
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    • pp.1080-1087
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    • 2005
  • By screening specific genes related to the muscle growth of swine using cDNA microarray technology, a total of 5 novel genes (GF (growth factor) I, II, III, IV and V) were identified. Results of southern blotting to investigate the number of copies of these genes in the genome of swine indicated that GF I, GF III, and GF V existed as one copy and GF II, and GF IV existed as more than two copies. It was suggested that there are many isoforms of these genes in the genome of swine. Also, results of northern blotting to investigate whether these genes were expressed in grown muscle, using GF I, III, and V indicated that all the genes were much more expressed in the muscle of swine with body weight of 90 kg. Expression patterns of these genes in other organs, namely muscle and propagation and fat tissues, were investigated by extracting RNA from the tissues. These genes were not expressed in the propagation and fat tissues, but were expressed in the muscle tissue. To determine the mechanism of muscle growth, further studies should be preceded using the 3 specific genes related to muscle growth, that is GF I, III, and V.

한국인에서 Hepatitis G Virus (HGV) 검출 및 항원분석에 관한 연구 (The Detection and the Antigenic Analysis of the Hepatitis G Virus in Korea)

  • 윤재득;지영미;이홍래;김기순;김영선;이윤성;정윤석;박정구;김지은;정상인;이원선;이원배
    • 대한바이러스학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.175-182
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    • 1998
  • We investigated the rate of hepatitis G virus infection among 50 patients who were not infected with the hepatitis C virus but showed symptoms of hepatitis. Viral RNA was extracted from the patients' sera and cDNA was synthesized and amplified by RT-PCR (reverse transcription-polymerase chain reaction) using random hexamer and 5 primers (470-20-1-77F, 470-20-1-211R, 470-20-1-211R-biotin, GV57-4512MF, GV57-4657MR). The amplified PCR products were confirmed by electrochemiluminescence (ECL), liquid hybridization (LH) and Southern blotting (SB). Among the 50 PCR products, by means of ECL, we found 4 samples to be positive and 5 samples to be indeterminate. The GV45-89M probe (5'-CYCGCTGRTITGGGGTGTACfGGAAGGC-3') was end-labelled with gamma-$^{32}P$ ATP and used for liquid hybridization with the PCR products. By using liquid hybridization, we detected specific bands from 4 positive sera and also from one indeterminate serum as determined by ECL. An 1.5% agarose gel electrophoresis of the 9 PCR products which were HGV positive or indeterminate as determined by ECL showed a 160bp band from 4 positive and one indeterminate serum. The 5 PCR products proved to be positive when SB was applied with the GV45-89M probe as well as when LH was applied. LH and SB were shown to have higher sensitivity and specificity than ECL. Two cases among 5 positive cases had relatively high SGOT, SGPT, ALP values when compared with other 48 cases. In summary, we confirmed hepatitis G virus infection in 5 cases among 50 Korean patients showing symptoms of viral hepatitis.

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오이 모자이크 바이러스 외피 단백질 유전자 분리 및 담배로의 형질전환 (Isolation of Coat Protein Gene from Cucumber Mosaic Virus and Its Introduction into Tobacco)

  • 손성한;김경환;김영태;박종석;김주곤;이광웅;황영수
    • 식물조직배양학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.149-155
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    • 1995
  • 국내에서 분리 동정한 오이모자이크 바이러스(CMV)로부터 외피단백질(CP) 유전자를 분리하였고 이의 염기서열을 결정한 결과 129번째 아미노산이 proline으로서 mosaic symptom을 보이고 염기 및 아미노산 서열의 유사성을 비교한 결과 subgroup I (type I)에 속한다는 것을 확인하였다. 분리한 CP 유전자를 식물형질전환용 운반체에 삽입하여 담배 재배종인 NC82와 바이러스 증식용인 Samsun에 잎절편을 통하여 형질전환시켰다. 형질전환된 담배의 DNA를 분리하여 Southern blotting과 PCR을 수행한 결과 대부분의 형질전환체에 CP 유전자가 삽입되였음을 확인하였고 T$_1$ 종자를 kanamycin이 첨가된 배지에서 후대 항생제 저항성 검정을 실시한 결과 1개의 CP 유전자가 삽입된 경우가 50%에 달했고 2개와 3개의 유전자가 삽입된 경우도 각각 39%와 11%에 달했다.

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