• 제목/요약/키워드: sCRP

검색결과 217건 처리시간 0.022초

온도변화에 의한 cAMP 수용성 단백질(CRP)의 구조 (Study on the structure of cAMP receptor protein(CRP) by temperature change)

  • 주종호;구미자;강종백
    • 생명과학회지
    • /
    • 제10권3호
    • /
    • pp.279-285
    • /
    • 2000
  • cAMP 수용성 단백질인 CRP는 Escherichia coli에서 대사와 관련된 유전자의 전사를 조절한다. 본 연구는 야생형과 돌연변이 CRP 단백질의 열적 안정성과 온도에 따른 단백질의 구조변화를 관찰하기 위 하여 proteolytic digestion, UV spectrophotometer, CD spectrapolarimeter 등의 방법을 사용하였다. cAMP가 없을 때에는 야생형, S83G, S128A CRP가 열적 안정성에서 큰 차이를 보이지 않았지만, cAMP가 존재할 때 야생형 CRP가 다른 돌연변이 CRP보다 열적으로 더욱 안정함을 보였다. 그리고 protease digestion 실험을 통하여 높은 온도에서 cAMP의 존재와 무관하게 돌연변이 CRP에서 단백질 의 변성으로 인한 절단된 단백질띠를 관찰할 수 있었다. 그리고 55$^{\circ}C$에서 측정한 CD 스펙트럼에서 단백 질의 2차 구조인 $\alpha$-helix 구조가 부분적으로 파괴되었음이 관찰되었다.

  • PDF

Optimal Timing to Assess Drain Amylase Concentration after Elective Gastrectomy

  • Wakahara, Tomoyuki;Kanemitsu, Kiyonori;Miura, Susumu;Tsuchida, Shinobu;Iwasaki, Takeshi;Sasako, Mitsuru
    • Journal of Gastric Cancer
    • /
    • 제21권1호
    • /
    • pp.30-37
    • /
    • 2021
  • Purpose: While the amylase concentration of the drainage fluid (dAmy) has been reported to be a predictor of postoperative pancreas-related complications (PPRC), the optimal timing for its measurement has not been fully investigated. Materials and Methods: The clinicopathological data of 387 patients who underwent elective gastrectomy for gastric cancer were reviewed. Laboratory data, including dAmy on postoperative days 1 (dAmy1) and 3 (dAmy3), and serum C-reactive protein (sCRP) concentrations on postoperative days 1 (sCRP1) and 3 (sCRP3) were compared between patients with PPRC and without PPRC. Results: Nineteen of the 387 patients (4.9%) developed PPRC. The optimal cutoff values of dAmy1, dAmy3, sCRP1, and sCRP3 were 1514 IU/L, 761 IU/L, 8.32 mg/dL, and 15.15 mg/dL, respectively. The area under the curve of dAmy1 was greater than that of dAmy3 (0.915 vs. 0.826), and that of sCRP3 was greater than that of sCRP1 (0.820 vs. 0.659). In the multivariate analysis, dAmy1 (P<0.001) and sCRP3 (P=0.004) were significant predictors of PPRC, while dAmy3 (P=0.069) and sCRP1 (P=0.831) were not. Thirteen (41.9%) of 31 patients with both dAmy1 ≥1,545 IU/L and sCRP3 ≥15.15 mg/dL had PPRC ≥Clavien-Dindo II. In contrast, among 260 patients with both dAmy1 <1,545 IU/L and sCRP3 <15.15 mg/dL, none developed PPRC. Conclusions: dAmy1 was more useful than dAmy3 in predicting PPRC. The combination of dAmy1 and sCRP3 may be a useful criterion for the removal of drains on postoperative day 3.

Polyphosphate Kinase Affects Oxidative Stress Response by Modulating cAMP Receptor Protein and rpoS Expression in Salmonella Typhimurium

  • Cheng, Yuanyuan;Sun, Baolin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제19권12호
    • /
    • pp.1527-1535
    • /
    • 2009
  • Polyphosphate (polyP) plays diverse physiological functions in prokaryotes and eukaryotes, but most of their detailed mechanisms are still obscure. Here, we show that deletion of polyphosphate kinase (PPK), the principal enzyme responsible for synthesis of polyP, resulted in augmented expression of cAMP receptor protein (CRP) and rpoS and lowered $H_2O_2$ sensitivity in Salmonella Typhimurium ATCC14028. The binding of cAMP-CRP complex to rpoS promoter and further stimulation of its transcription were proved through electrophoretic mobility shift assay, lacZ fusion, and exogenous cAMP addition, respectively. The rpoS expression increased in cpdA (cAMP phosphodiesterase coding gene) mutant, further suggesting that cAMP-CRP upregulated rpoS expression. These results demonstrate that PPK affects oxidative stress response by modulating crp and rpoS expression in S. Typhimurium.

Molecular Characterization of crp, the Cyclic AMP Receptor Protein Gene of Serratia marcescens KTCC 1272

  • Yoo, Ju-Soon;Kim, Hae-Sun;Chung, Soo-Yeol;Choi, Yong-Lark
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제10권5호
    • /
    • pp.670-676
    • /
    • 2000
  • Several clones obtained from Serratia marcescens stimulated E. coli TP2139 (${\Delta}lac, \;{\Delta} crp$) cells to use maltose as a carbon source. The crp gene clone, pCKB12, was confirmed to stimulate the $\beta$-galactosidase activity, by Southern hybridization [31]. The nucleotide sequence of the crp region consisting of 1,979 bp was determined. The sequencing of the fragment led to the identification of two open reading frames: One of these, the crp gene, encoded 210 amino acid and the other encoded a truncated protein. The S. marcescens and E. coli crp genes showed a higher degree of divergence in their nucleotide sequence with 120 changes, however, the corresponding amino acid sequences showed only two amino acid differences. Yet, an analysis of the amino acid divergence revealed that the catabolite gene activator protein, the crp gene product, was the most conserved protein observed so far. Using a crp-lac protein fusion, it was demonstrated that S. marcescens CRP could repress its own expression, probably via a mechanism similar to that previously described for the E. coli crp gene.

  • PDF

ECMA-392 기반 선박 내 네트워크에서 QoS를 지원하는 CRP 예약 충돌 해결 방안 (Resolution Scheme of CRP Reservation Conflicts for Supporting QoS in ECMA-392-Based Ship Area Networks)

  • 이성로;오주성;김범무;이연우;정민아;이승범
    • 한국통신학회논문지
    • /
    • 제39C권12호
    • /
    • pp.1298-1306
    • /
    • 2014
  • 본 논문에서는 선박 내 IT 서비스에 대한 요구에 부응하기 위해 인지무선 최초 표준인 ECMA-392 네트워크를 사용한다. ECMA-392 기반 네트워크에서 멀티 홉을 지원하는 장치들의 충돌 문제에 대해 살펴보고, 이를 해결하기 위한 CRP 예약 충돌 해결 방안을 제안한다. 현재의 CRP 예약 기법은 3홉 거리에서 이동하는 ECMA-392 장치들 사이의 CRP 예약 충돌을 해결하지 못한다. 기존의 CRP 예약 충돌 해결 방안은 멀티미디어 스트리밍과 같은 실시간 서비스의 QoS를 보장할 수 없다. 그래서 우리는 새로운 2-hop CRP Availability IE의 제안과 CRP Control 필드의 변경을 통해 새로운 CRP 예약 충돌을 방지하는 방안을 제안한다. 시뮬레이션 결과는 제안된 3홉 CRP 예약 충돌 해결 방식이 디바이스의 데이터 수율을 향상시키고 있음을 나타낸다.

온도 기울기 전기영동장치의 CAMP 수용성 단백질에 응용 (Application of Temperature Gradient Gel Electrophoresis To cAMP Receptor Protein)

  • Gang, Jong-Back;Cho, Hyun-Young
    • 생명과학회지
    • /
    • 제14권2호
    • /
    • pp.309-314
    • /
    • 2004
  • cAMP수용성 단백질(CRP)은 E. coli의 100가지 이상의 유전자 전자조절에 관계된다. CRP는 dimer로 존재하며 cAMP의 결합으로 활성인 형태로 전환된다. 이중체인 CRP 단백질의 열 안정성과 구조 전이의 연구에 효과적인 온도 기울기 전기영동장치를 이용하여 확인하였다. 본 연구에서 야생형과 S83C CRP 단백질의 melting temperature (Tm)는 산성인 완충용액[89.8 mM Glycine, 24mM Boric acid (pH 5.8)]에서 57$\pm$1(야생형 CRP)과 55$\pm$1$^{\circ}C$ (S83G CRP)였다. 그리고 온도에 따른 CRP 단백질의 구조변화도 protease digestion과 CD spectropolarimeter을 이용하여 확인하였다.

Stability and Structure of S128A Mutant cAMP Receptor Protein

  • Choi, Young;Gang, JongBack
    • 통합자연과학논문집
    • /
    • 제4권3호
    • /
    • pp.222-226
    • /
    • 2011
  • Cyclic AMP receptor protein(CRP) is involved in the activation of many genes corresponding to catabolite enzymes in Escherichia coli. In this study, mutant CRP(S128A) was used to elucidate the effect of Ser 128 on the cAMP-induced structural change. Based on the protease digestion and thermal analysis, serine 128 in CRP affects the cAMP binding capability and then structural change of CRP protein. In addition, CD spectra in near UV region revealed that S128A CRP retained the sensitive conformation to thermal effect relative to that of wild-type CRP, in spite of identical Tm values in the absence of cAMP.

C-Reactive Protein Signaling Pathways in Tumor Progression

  • Eun-Sook Kim;Sun Young Kim;Aree Moon
    • Biomolecules & Therapeutics
    • /
    • 제31권5호
    • /
    • pp.473-483
    • /
    • 2023
  • Many cancers arise from sites of chronic inflammation, which creates an inflammatory microenvironment surrounding the tumor. Inflammatory substances secreted by cells in the inflammatory environment can induce the proliferation and survival of cancer cells, thereby promoting cancer metastasis and angiogenesis. Therefore, it is important to identify the role of inflammatory factors in cancer progression. This review summarizes the signaling pathways and roles of C-reactive protein (CRP) in various cancer types, including breast, liver, renal, and pancreatic cancer, and the tumor microenvironment. Mounting evidence suggests the role of CRP in breast cancer, particularly in triple-negative breast cancer (TNBC), which is typically associated with a worse prognosis. Increased CRP in the inflammatory environment contributes to enhanced invasiveness and tumor formation in TNBC cells. CRP promotes endothelial cell formation and angiogenesis and contributes to the initiation and progression of atherosclerosis. In pancreatic and kidney cancers, CRP contributes to tumor progression. In liver cancer, CRP regulates inflammatory responses and lipid metabolism. CRP modulates the activity of various signaling molecules in macrophages and monocytes present in the tumor microenvironment, contributing to tumor development, the immune response, and inflammation. In the present review, we overviewed the role of CRP signaling pathways and the association between inflammation and cancer in various types of cancer. Identifying the interactions between CRP signaling pathways and other inflammatory mediators in cancer progression is crucial for understanding the complex relationship between inflammation and cancer.

미중부지역 농지보전 프로그램에 의한 경관구조 변화분석 (Spatial Analysis of Landscape Structure Changes Caused by the US Conservation Reserve Program in the Central High Plains)

  • 박선엽
    • 한국지역지리학회지
    • /
    • 제9권4호
    • /
    • pp.519-533
    • /
    • 2003
  • 미전역에 걸쳐 80년대 중반부터 시행된 미농지보전 프로그램(CRP)은 1992년까지 약 1480만 헥타르에 이르는 농경지를 초지, 임지, 삼림, 또는 기타 보전용도로 전환하였다. CRP 시행에 의한 한 가지 주요결과는 수백만 헥타르에 이르는 초지를 확보함으로써 야생동물을 위한 잠재서식처 면적을 현저하게 증가시킨 점이다. 본 연구는 CRP 시행에 따른 자연경관의 공간구조변화를 지역적으로 살펴보고자 하였다. 이를 위해, 계절별 Landsat Thematic Mapper 자료를 이용하여 캔자스주 남서부 6개 카운터에 대한 CRP 시행 이전과 이후의 경지 및 초지분포 지도를 생성하였다. 다음으로, 분류후 차이분석기법(post-classification differencing)을 적용하여 경지에서 초지로 전환된 지역의 분포를 파악해내었다. 공간구조분석 프로그램 FRAGSTATS을 이용하여 지표피복의 공간패턴을 나타내는 10개 주요 총계지표를 계산함으로써 CRP 시행에 따르는 경관구조변화를 살펴보았다. 연구지역에 미친 CRP의 주요 영향은 전반적으로 자연초지 분포의 분절화가 현격하게 감소했다는 것이다. 야생동물 서식처관리의 측면에서 CRP 초지의 도입은 지편(地片)의수, 평균 지편 크기, 지편 내부면적 등을 크게 증가시키는 효과를 낳았다. 또한, CRP 시행은 녹지간 연결성 및 결합도를 높였는데, 이는 넓게 연속된 서식처를 요하는 종들을 보호하는 데에 잠재적인 가치를 지닐 것으로 보인다. 끝으로, CRP는 이웃한 녹지간 거리를 감소시킴으로써 생물종들의 녹지간 이동을 용이하게 할 것이다. CRP 시행은 캔자스주남서부 지역의 자연공간구조를 현저히 변화시킨 주요요인으로 나타났으며, 이는 향후 야생동물 서식처 보호를 위한 중요한 의미를 갖는다.

  • PDF

Bending of DNA by cAMP Receptor Protein(CRP)

  • 정수열
    • 생명과학회지
    • /
    • 제4권3호
    • /
    • pp.119-123
    • /
    • 1994
  • CRP에 의한 DNA bending의 첫 실험은 cAMP, CRP, DNA complex의 gelelectrophoresis에 의해 확인되었다. Bent DNA fragment의 이동은 같은 크기의 linear fragment보다 느리며, EH cAMP, CRP, DNA 결합위치에 따라서 상이한 이동 pattern을 나타낸다. 즉, DNA 단편의 중앙에 CRP binding site가 있을 때는 말단부분에 있을 때보다 이동도가 느리다. benting각의 크기는 일반적으로 안정한 복합체의 형성에 관계하며, 큰 각을 갖는 것이 보다 더 안정된 구조를 형성하여 전사가 촉진되는 것으로 밝혀져 있다. 본고에서는 CRP에 의한 bending과 CRP에 의한 전사조절 관계와 bending의 관계에 대하여 알아보았다.

  • PDF