• 한국산림과학회지
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• 제97권1호
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• pp.113-117
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• 2008

본 연구는 2000년도에 산불이 발생한 강원도 삼척의 침엽수림 지역에서 피해목 처리 전과 후의 서식환경 및 설치류 개체군 특성 차이를 구명하기 위해 실시되었다. 피해목 제거 후 고사목과 수목잔존물의 수는 감소한 반면, 천이 단계의 진행으로 인해 하층 피도량 및 관목의 본수는 증가하였다. 전체 설치류 개체군 밀도, 흰넓적다리붉은쥐 및 대륙밭쥐의 개체군 밀도는 피해목 제거 후 감소하는 경향을 보인 반면, 등줄쥐의 개체군 밀도는 증가하였다. 피해목의 제거로 인한 서식환경의 변화는 설치류의 종 구성을 변화시켰으며, 특히 산림성 설치류에게는 부정적인 영향을 미치는 것으로 판단된다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제13권5호
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• pp.1799-1802
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• 2012

Objective: We aimed to analyze the association between excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 1 (XRCC1) and ovarian cancer risk. Methods: We performed a hospital-based case-control study with 155 cases and 313 controls in China. All Chinese cases with newly diagnosed primary ovarian cancer between May 2005 to May 2010 in our hospital were invited to participate within 2 months of diagnosis. Controls were randomly selected from people who requested general health examinations in the same hospital during the same period. SNPs in EXCC1, ERCC1 C8092A and ERCC1 T19007C, were analyzed by PCR-RFLP method. Results: We observed a non-significantly increased risk of ovarian cancer among individuals with ERCC1 8092TT compared with those with the 8092CC genotype (adjusted OR=1.55, 95% CI%=0.74-2.97). Moreover, 19007TT genotype carriers also showed a non-significant increased risk of ovarian cancer over those with the 19007CC genotype (adjusted OR=1.78, 95% CI%=0.91-3.64). Conclusion: Our firstly investigation of links between polymorphisms in the ERCC1 gene and the risk of ovarian cancer in Chinese population demonstrated no significant association. Further large sample studies in Chinese populations are needed.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제14권4호
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• pp.587-596
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• 2001

In the last decade, rapid developments in molecular biotechnology and of genomic tools have enabled the creation of dense linkage maps across whole genomes of human, plant and animals. Successful development and implementation of interval mapping methodologies have allowed detection of the quantitative trait loci (QTL) responsible for economically important traits in experimental and commercial livestock populations. The candidate gene approach can be used in any general population with the availability of a large resource of candidate genes from the human or rodent genomes using comparative maps, and the validated candidate genes can be directly applied to commercial breeds. For the QTL detected from primary genome scans, two incipient fine mapping approaches are applied by generating new recombinants over several generations or utilizing historical recombinants with identity-by-descent (IBD) and linkage disequilibrium (LD) mapping. The high resolution definition of QTL position from fine mapping will allow the more efficient implementation of breeding programs such as marker-assisted selection (MAS) or marker-assisted introgression (MAI), and will provide a route toward cloning the QTL.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제26권2호
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• pp.99-104
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• 2010

The subfamily Murinae is a very controversial group concerning their phylogenetic relationship. Previous studies could not resolve phylogeny among four genera Apodemus, Micromys, Mus and Rattus of the Muridae. In the present study, eight rodent species resident in South Korea were collected and phylogenetically analyzed based on sequence data of five mitochondrial and nuclear DNA regions: 12S rRNA, cytochrome b gene (cyt b), cytochrome oxidase II (COII), control region of mitochondrial DNA, and a thyroglobulin (Tg) of nuclear DNA. According to the phylogeny of the concatenated data, M. musculus separated early in Murinae (ML 100%; BA 1.00 pp) and the genus Rattus grouped with the harvest mouse, M. minutes; these were separated from the genus Apodemus with relatively strong support (ML 74%; BA 0.76 pp). The Siberian chipmunk population was also examined using the five genes to obtain better resolution. The phylogeny for Korean rodents determined using the 12S rRNA, cyt b, COII and control regions discriminated the Siberian chipmunk populations from Korea, Russia, and China.

• 대한임상검사과학회지
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• 제48권3호
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• pp.242-246
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• 2016

2013년 4월부터 11월까지 전라남도 곡성군 지역을 대상으로 들쥐를 포획하고 기생하는 털진드기의 분포를 조사하였다. 597개의 trap에서 79마리를 포획하여 포획률은 13.2%였고, 종류별로는 등줄쥐가 92.4%를 차지하여 절대 우점종이었다. 79마리의 들쥐중 68마리에 털진드기가 기생하고 있어 86.0%의 기생률을 보였고, 74.5개체의 chigger index를 보였다. 5,063개체의 채집한 털진드기는 2속 6종으로 동정되었고, 활순털진드기가 3,535개체(69.8%)로 절대적인 우점종이었다. 계절별로 봄철에는 대잎털진드기, 가을철에는 활순털진드기가 높은 밀도로 채집되어 진드기종의 분포가 채집시기에 따라 차이가 있었다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제33권1호
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• pp.27-36
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• 1995

쭈쭈가무시병 환자의 유병률이 가장 높은 남해안 연안지역과 유병률이 낮은 동해안 연안 지역에서 매개 진드기 및 들쥐와 연관되는 제반 역학적 비교조사를 1993년 10월에 실시하였다 채집된 6 종의 들쥐(187개체) 중 등줄쥐(Apodemugrwin)가 양지역에서 모두 절대 우점종이었고 개체군 밀도에 있어서도 차이가 없었다(트랩 채집률 각각 20.4%, 19.4%). 국내 매개종으로 확인된 Leptotrombidiumpalldum과 L. sueuare는 모두 채집된 6종의 들쥐중 등줄쥐에 주로 기생하였는데, 두당 각각 59마리와 69마리가 기생하고 있었다 등줄쥐의 Rickettsia tsutsugamushi, 병원체에 대한 항체 양성률은 남해안 43.2% 동해안 63.6%로 동해안 지역에서 약간 높게 나타나 환자 발생과는 다른 양상을 보였다. 지역에 관계없이 등줄쥐의 감염률(항체 양성률)과 매개종인 L. suteuure와 L. poninw의 개체군 밀도간에 높은 상관관계를 보였다(r : 0.87). 이와같은 사실은 들쥐에 대한 양종의 매개 효율성(vectorefacacy)이 똑같이 높다는 것을 의미한다. 양지역간의 가장 중요한 역학적 차이는 매개종으로. 남해안 지역에서는 L. sueuore가 절대 우점종(74.9%)인 반면 에 동해안 지역에서는 L. pallidum이 절대 우점종(60.4%)이었다. 두종의 개체군 밀도에는 큰 차이가 없었다. 조사지역이 불충분하여 확실하게 결론지을 수는 없지만 L. sueuqre의 개체군 밀도가 높을수록 환자 유병률도 높게 나타나 L. sueuare가 인체에 대한 매개효율성(vectorefacacy)이 L. pallidum보다 월등하게 높은 중요한 매개종이라 생각된다.

• 한국산림과학회지
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• 제99권4호
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• pp.553-558
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• 2010

본 연구는 산불피해 후 자연복원과 소나무 조림을 실시한 지역에서 서식환경과 설치류 개체군의 밀도 차이를 파악하기 위해 강원도 삼척시 검봉산 일대의 2000년도 산불피해 지역에서 2008년 3월에서 12월까지의 기간 동안 수행되었다. 자연복원지과 소나무 조림지에서 각각 3개씩 1 ha 크기의 조사지를 선정하여 2개월 간격으로 각각 4일간의 포획조사 및 서식환경조사를 실시하였다. 서식환경 조사 결과, 하층 피도량 및 치수의 수는 조림지가 자연 복원지에 비해 높은 값을 나타낸 반면, 중층 피도량, 중상층 피도량, 상층 피도량, 교목, 관목의 수, 고사목의 수, 수목잔존물의 양 등은 자연복원지에서 더 높은 값을 나타냈다. 포획 조사 결과 등줄쥐(Apodemus agrarius), 흰넓적다리 붉은쥐(Apodemus peninsulae), 대륙밭쥐(Eothenomys regulus), 다람쥐(Tamias sibiricus) 등 총 4종 688개체가 포획되었다. 설치류의 포획 개체수는 조림지보다 자연복원지가 더 높게 나타났으며, 흰넓적다리붉은쥐, 대륙밭쥐, 다람쥐 등 3종이 조림지보다 더 높은 포획 개체수를 보였다. 이에 비해 등줄쥐는 조림지에서 많이 포획되었다. 등줄쥐와 흰넓적다리붉은쥐는 4월과 12월에 최대 포획개체수를 나타내었으며, 대륙밭쥐는 4월과 6월에, 다람쥐는 6월과 10월에 가장 많은 개체수가 포획되었다. 수목잔존물 제거 및 조림으로 인해 수관층과 하층식생이 개방된 서식 환경은 설치류의 서식에 적합하지 않은 것으로 판단된다. 그러므로 산불 피해 발생후 하층식생 및 수관층이 유지될 수 있도록 산림을 관리하는 것이 설치류의 다양성 유지에 필요할 것으로 생각된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제29권6호
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• pp.782-792
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• 2016

As the most common neurodegenerative diseases, Alzheimer's disease (AD) and Parkinson's disease (PD) are two of the main health concerns for the elderly population. Recently, microRNAs (miRNAs) have been used as biomarkers of infectious, genetic, and metabolic diseases in humans but they have not been well studied in domestic animals. Here we describe a computational biology study in which human AD- and PD-associated miRNAs (ADM and PDM) were utilized to predict orthologous miRNAs in the following domestic animal species: dog, cow, pig, horse, and chicken. In this study, a total of 121 and 70 published human ADM and PDM were identified, respectively. Thirty-seven miRNAs were co-regulated in AD and PD. We identified a total of 105 unrepeated human ADM and PDM that had at least one 100% identical animal homolog, among which 81 and 54 showed 100% sequence identity with 241 and 161 domestic animal miRNAs, respectively. Over 20% of the total mature horse miRNAs (92) showed perfect matches to AD/PD-associated miRNAs. Pigs, dogs, and cows have similar numbers of AD/PD-associated miRNAs (63, 62, and 59). Chickens had the least number of perfect matches (34). Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analyses suggested that humans and dogs are relatively similar in the functional pathways of the five selected highly conserved miRNAs. Taken together, our study provides the first evidence for better understanding the miRNA-AD/PD associations in domestic animals, and provides guidance to generate domestic animal models of AD/PD to replace the current rodent models.

• 대한바이러스학회지
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• 제28권4호
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• pp.337-345
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• 1998

Hantaviruses are distributed in rodent population world-widely even in geographical areas where hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) has not been reported. Various species of Family Muridae and Arvicolidae serve as the natural reservoirs of hantaviruses. Hantaan virus, Seoul virus, Puumala virus, Prospect HII virus, Sin Nombre virus and New York virus are members of genus Hantavirus and isolated from lungs of A. agrarius, R. norvegicus, C. glareolus, M. pennsylvanicus, P. maniculatus and P. leucopus respectively. This experiment was intended to find the distribution of hantavirus infection among wild rodents and isolate the hantavirus from lung tissue of seropositve Apodemus peninsulae, and compared the nucleotide and amino acid sequences with prototype of hantaan virus 76-118 strain. Hantaviral sequences were amplified from lung tissues of A. peninsulae by reverse-transcriptase polymerase chain reaction. Alignment and comparison of the 324 nucleotide of G2 region of M-genomic segment diverged 4.6% and 0% at the nucleotide and amino acid levels, and complete N protein-coding region of S-genomic segment diverged 3.7% and 1.4% nucleotide and amino acid levels, respectively. This is the report to spill-over on the hantaan virus from A. agrarius to A. peninsulae in Korea.

• Genomics & Informatics
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• 제11권3호
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• pp.129-134
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• 2013

Orthostatic hypotension (OH) is defined by a 20-mm Hg difference of systolic blood pressure (dtSBP) and/or a 10-mm Hg difference of diastolic blood pressure (dtDBP) between supine and standing, and OH is associated with a failure of the cardiovascular reflex to maintain blood pressure on standing from a supine position. To understand the underlying genetic factors for OH traits (OH, dtSBP, and dtDBP), genome-wide association studies (GWASs) using 333,651 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were conducted separately for two population-based cohorts, Ansung (n = 3,173) and Ansan (n = 3,255). We identified 8 SNPs (5 SNPs for dtSBP and 3 SNPs for dtDBP) that were repeatedly associated in both the Ansung and Ansan cohorts and had p-values of < $1{\times}10^{-5}$ in the meta-analysis. Unfortunately, the SNPs of the OH case control GWAS did not pass our p-value criteria. Four of 8 SNPs were located in the intergenic region of chromosome 2, and the nearest gene (CTNNA2) was located at 1 Mb of distance. CTNNA2 is a linker between cadherin adhesion receptors and the actin cytoskeleton and is essential for stabilizing dendritic spines in rodent hippocampal neurons. Although there is no report about the function in blood pressure regulation, hippocampal neurons interact primarily with the autonomic nervous system and might be related to OH. The remaining SNPs, rs7098785 of dtSBP trait and rs6892553, rs16887217, and rs4959677 of dtDBP trait were located in the PIK3AP1 intron, ACTBL2-3' flanking, STAR intron, and intergenic region, respectively, but there was no clear functional link to blood pressure regulation.