카르밤산 화합물의 가아민 분해반응을 이론적으로 고찰하였다. AM1 이론적 계산 결과로서의 반응성은 결합의 형성-파괴효과 및 입체효과에 의하여 결정되는데, 결합의 형성에서 유리한 $B_{AC}2$ 반응메카니즘으로 진행되는데 결과를 줌으로써 실험과 잘 일치하였다. 특히 이론적으로 열적 forbidden인 2 + 2 반응의 구조적 특성을 가지더라도 반응에 관여하는 총 전자수가 6개인 5전자 4중심 반응의 경우 1단계 연속반응으로 진행됨을 밝혔다. 또한 각 반응경로의 활성화 장벽에 대한 차이를 정량적으로 고찰해 보면 전이상태에서 $\sigma$-결합이 깨어지는 것과 $\pi$-결합이 깨어지는 차이는 17kcal/mol이며, 6-각 고리형 구조가 갖는 입체 효과의 차이는 5kcal/mol임을 알았다.
메탄올-아세토니트릴 혼합용매에서 벤조산 무수물의 아닐린에 의한 친핵성 치환반응을$35.0{\circ}C$에서 속도론적으로 연구하여 반응 메카니즘을 밝혔다. 벤조산 무수물에 있는 두 개의 카르보닐 탄소에서 경쟁적으로 치환반응이 일어나므로 반응 생성물의 비율로부터 각각의 반응속도$k_{XY}$와$k_{XZ}$를 구하였다. Hammett$p_i$값과 교차작용상수$p_{ij}$를 이용하여 전이상태구조 및 반응메카니즘을 규명하였다. 현저히 큰$p_X,\;p_{XY},\;p_{XZ}$및 양의값을 갖는$p_Y$의 크기로부터, 본 반응이 사각고리 전이상태를 갖는 전면공격$SN_2$메카니즘으로 진행됨을 알았다.
Mutagen X (MX) exists in our drinking water as the bi-products of chlorine disinfection. Being one of the most potent mutagen, it attracted much attention from many researchers. MX and its analogs are synthesized and modeled by quantitative structure activity relationship (QSAR) methods. As a result, factors affecting this class of compounds have been found to be steric and electrostatic effects. We tried to collect all the data available from the literature. With both CoMFA and CoMSIA various combinations of physiochemical parameters were systematically studied to produce reasonable 3-dimensional models. The best model for CoMFA gave $q^2$ = 0.90 and $r^2$ = 0.97, while for CoMSIA $q^2$ = 0.85 and $r^2$ = 0.94. So the models seem to be reasonable. Unlike previous result of CoMFA, in our case steric parameter alone gave the best statistics. Although the steric contribution was found to be the most important in both CoMFA and CoMSIA, steric parameter along with electrostatic parameter produced slightly better model in CoMSIA. Overall, steric contribution is clearly the most important single factor. However, when we compare chlorine and bromine substitution, chlorine substitution can be more mutagenic. This indicates that other factors such as electrostatic effect also influence the mutagenicity. From the contour maps, steric contribution seems to be focused on rather small area near C6 substituent of the furanone ring, rather than C3 substituent. Therefore the locality of steric contribution can play a significant role in mutagenicity.
회전형 볼밀을 이용하여 Ar 분위기에서 기계적 합금화 방법으로 Fe$_{50}$Zr$_{50}$ 비정질을 제조하고 이들의 구조 및 자기적 성질을 투과전자현미경과 SQUID 자력계를 이용하여 조사하였다. 기계적합금화법으로 제조된 분말로 부터 얻은 제한시야 회절도형은 두개의 인접한 halo ring 도형을 나타내며, 이것은 비정질이 Fe rich 한 비정질과 Zr rich 한 두 비정질로이 공존하기 때문이다. 기계적 합금화한 Fe$_{50}$Zr$_{50}$ 비정질 분말에서 비정질상의 큐리온도로 부터 추정된 강자성 Fe-Zr계 비정지상의 Fe 조성은 100시간 합금화한 경우 65 at% 로서, 이것은 비정질의 상분리가 일어났기 때문이며, 이 결과는 회절도형의 분석결과와 일치한다. 기계적 합금화한 Fe$_{50}$Zr$_{50}$ 분말의 스핀파 탄성계수는 100시간 합금화한 경우에는 52.2 meV .angs. 이고, 200시간 합금화 한 경우에는 63.8 meV .angs. 으로 합금화시간이 증가함에 따라 증가하였다. 이것으 200시간 합금화한 경우 부분 결정화에 의하여 .alpha. -Fe가 일부 석출하였기 때문이다.
Thirteen compounds were isolated from the $CH_2Cl_2$ fraction of Machilus thunbergii as phospholipase $C{\Upsilon}1\;(PLC{\Upsilon}1)$ inhibitors. These compounds were identified as nine lignans, two neolignans, and two flavans by spectroscopic analysis. Of these, 5,7-di-O-methyl-3',4'-methylenated (-)-epicatechin (12) and 5,7,3'-tri-O-methyl (-)-epicatechin (13) have not been reported previously in this plant. In addition, seven compounds, machilin A (1), (-)-sesamin (3), machilin G (5), (+)-galbacin (9), licarin A (10), (-)-acuminatin (11) and compound 12 showed dose-dependent potent inhibitory activities against $PLC{\Upsilon}1$ in vitro with $IC_{50}$ values ranging from 8.8 to 26.0 ${\mu}M$. These lignans, neolignans, and flavans are presented as a new class of $PLC{\Upsilon}1$ inhibitors. The brief study of the structure activity relationship of these compounds suggested that the benzene ring with the methylene dioxy group is responsible for the expression of inhibitory activities against $PLC{\Upsilon}1$. Moreover, it is suggested that inhibition of $PLC{\Upsilon}1$ may be an important mechanism for an antiproliferative effect on the human cancer cells. Therefore, these inhibitors may be utilized as cancer chemotherapeutic and chemopreventive agents.
Le, Dung Tien;Lee, Hyun-Sook;Chung, Young-Je;Yoon, Moon-Young;Choi, Jung-Do
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제28권6호
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pp.947-952
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2007
Mycobacterium tuberculosis is a pathogen responsible for 2-3 million deaths every year worldwide. The emergence of drug-resistant and multidrug-resistant tuberculosis has increased the need to identify new antituberculosis targets. Acetohydroxy acid synthase, (AHAS, EC 2.2.1.6), an enzyme involved in branched-chain amino acid synthesis, has recently been identified as a potential anti-tuberculosis target. To assist in the search for new inhibitors and “receptor-based” design of effective inhibitors of tubercular AHAS (TbAHAS), we constructed four different structural models of TbAHAS and used one of the models as a target for virtual screening of potential inhibitors. The quality of each model was assessed stereochemically by PROCHECK and found to be reliable. Up to 89% of the amino acid residues in the structural models were located in the most favored regions of the Ramachandran plot, which indicates that the conformation of each residue in the models is good. In the models, residues at the herbicide-binding site were highly conserved across 39 AHAS sequences. The binding mode of TbAHAS with a sulfonylurea herbicide was characterized by 32 hydrophobic interactions, the majority of which were contributed by residue Trp516. The model based on the highest resolution X-ray structure of yeast AHAS was used as the target for virtual screening of a chemical database containing 8300 molecules with a heterocyclic ring. We developed a short list of molecules that were predicted to bind with high scores to TbAHAS in a conformation similar to that of sulfonylurea derivatives. Five sulfonylurea herbicides that were calculated to efficiently bind TbAHAS were experimentally verified and found to inhibit enzyme activity at micromolar concentrations. The data suggest that this time-saving and costeffective computational approach can be used to discover new TbAHAS inhibitors. The list of chemicals studied in this work is supplied to facilitate independent experimental verification of the computational approach.
표제화합물의 결정구조는 4-N,N-dimethylamino-4'-N'-methyl-stilbazolium, $C_{16}H_{19}N_2$와 tosylate, $C_7H_7SO_3$의 불연속한 이분자체로 구성되어 있다. 4-N,N-dimethylamino-4'-N'-methyl-stilbazolium 분자는 중간에 있는 C=C double bond에서 trans conformation을 가지고 있으며 phenyl 및 pyridyl ring들간의 이면각은 $5.7(2)^{\circ}$을 이루어 전분자는 $0.138(8){\AA}$ 내에서 평면을 이루고 있다. Tosylate 분자들은 거리가 각각 2.855(9) and $2.899(8){\AA}$인 O-H...O 수소결합으로 연결된 이분자체를 나타내고 있다. 이 두 분자간의 가장 가까운 거리는 O(3)와 C(16) 원자간의 $3.10(1){\AA}$이다.
완전히 Ca2+ 이온으로 치환된 탈수구조(a=12 2f3(2) .41와 이 결정에 요오드가 흡착된 구조(a= 12.258(2) 입)를 21살에서 입방공간군 Pm3m를 사 용하여 단결정 X-선 회절법으로 구조를 해석하였다. 탈수구조는 I>3 w (I)인 206개의 반사를 사용하 여 Rw값이 0.081까지 정밀화되었고 요오드가 흡착 된 구조는 173개의 반사를 사용하여 Rw값이 0.084 까지 정밀화되었다. 각각의 구조에서 단위세포당 6 개의 Ca2+ 이온은 6-링의 산소와 결합하면서 3개 의 다른 3회 회전축상에 위치하였다. 탈수한 칼슘 치환 제올라이트 A는 80살에서 단위세포당 여섯개의 요오드 분자를 흡착하며 각 요오드 분자는 골조 산소 원자와 전하이동 착물을 형성하였다(I-0=3. 32(3) A, I-I=2.7l (2) A 그리고 I-I-0=180℃).
[Cu(L)]I2, 2H2o(1) (L:3,14-Dimethyl-2,6,13,17-tetrazatricyclo[14,4,01.18, 07.12] docosane) 착물을 합성하고 구조를 규명하였다. 이 착물은 삼사정계, 공간군 P1, a=8.400(1)Å, b=8.986(3) Å, c=9.156(1) Å, α=82.42(1)˚, β=73.61(1)˚ λ=81.04(2)˚, Z=1로 결정화되었으며, 최종 신뢰도 R값은 288K에서 1926개 회석반점에 대하여 0.042이었다. 이 착물의 결정구조는 평면 사각구조를 갖고 Cu-N의 평균 거리는 2.029(11)Å이었다. 이 착물의 육면 고리가 오면 고리는 RRSS 배역을 갖는 이차 NH와 함께 각각 의자 형태와 고우시 형태를 갖는다.
Ocotillol-type saponins are one kind of tetracyclic triterpenoids, sharing a tetrahydrofuran ring. Natural ocotillol-type saponins have been discovered in Panax quinquefolius L., Panax japonicus, Hana mina, and Vietnamese ginseng. In recent years, the semisynthesis of 20(S/R)-ocotillol-type saponins has been reported. The biological activities of ocotillol-type saponins include neuroprotective effect, antimyocardial ischemia, antiinflammatory, antibacterial, and antitumor activities. Owing to their chemical structure, pharmacological actions, and the stereoselective activity on antimyocardial ischemia, ocotillol-type saponins are subjected to extensive consideration. In this review, we sum up the discovery, semisynthesis, biological activities, and metabolism of ocotillol-type saponins.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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