• 제목/요약/키워드: ribose

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A Convenient and Versatile Synthesis of 2' (and 3')-Amino (and azido)-2' (and 3')-deoxyadenosine as Diverse Synthetic Precursors of Cyclic Adenosine Diphosphate Ribose (cADPR)

  • Kim, Beom-Tae;Kim, Seung-Ki;Lee, Seung-Jae;Hwang, Ki-Jun
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제25권2호
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    • pp.243-248
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    • 2004
  • As diverse synthetic precursors of cyclic adenosine diphosphate ribose (cADPR), several adenosine derivatives in which azido or amino group is introduced at 2'- or 3'-position of the sugar moiety of adenosine were prepared from readily available adenosine via conventional protocols. These synthetic sequence employs very efficient reactions conditions that proceed at or below ambient temperature with actual yields of >80% for each individual step.

The In Vitro Translocation of Escherichia coli Ribose-binding Protein via Various Targeting Routes

  • Lee, Byoung-Chul;Kim, Hyoung-Nan;Hwang, Yong-Il
    • BMB Reports
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    • 제34권2호
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    • pp.118-122
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    • 2001
  • The translocation of ribose-binding protein (RBP) into the inverted membrane vesicles (IMV) of Escherichia coli and eukaryotic microsomes was studied using the in vitro translation/translocation system. It was found that RBP was translocated into heterologous eukaryotic microsomes co-translationally, as well as post-translationally However, RBP was translocated only past-translationally into IMV. Degradation fragments of RBP with the molar mass of 14 and 16 kDa were produced during the translocation into IMV However, the amount of the degradation products decreased and the mature form of RBP appeared in the presence of phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF). PMSF and GTP accelerated the translocation of RBF It was also found that SecB enhanced the post-translational translocation of RBP It appears that RBP is translocated via at least two targeting paths.

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Studies on Benzofuran-7-carboxamides as Poly(ADP-ribose) Polymerase-1 (PARP-1) Inhibitors

  • Lee, Sun-Kyung;Yi, Kyu-Yang;Lee, Byung-Ho;Oh, Kwang-Seok
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제33권4호
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    • pp.1147-1153
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    • 2012
  • Benzofuran-7-carboxamide was identified as a novel scaffold of poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) inhibitor. A series of compounds with various 2-substituents including (tertiary amino)methyl moieties substituted with aryl ring and aryl groups containing tertiary amines, were synthesized and biologically evaluated to elucidate the structure-activity relationships and optimize the potency. 2-[4-(Pyrrolidin-1-ylmethyl)phenyl]-benzofuran-7-carboxamide (42) was the most potent as an IC50 value of 40 nM among those.

성인을 대상으로 D-리보오스 함유 비율을 달리한 설탕 섭취에 따른 Glycemic Index 및 혈당 반응 연구 (Comparing the effects of intake of sugar containing different levels of D-ribose in sugar on glycemic index and blood glucose response in healthy adults)

  • 김아름;이정숙;남혜경;경명옥;서승우;장문정
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제50권5호
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    • pp.426-436
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    • 2017
  • 본 연구는 10 주 동안 건강한 20대 성인 남녀 14명을 대상으로 D-리보오스 함유 비율이 다른 설탕 (D-리보오스 5%, 10%, 14% 함유) 섭취가 혈당 반응과 GI에 미치는 영향을 분석하여 혈당 저감화 효과를 확인하고자 하였다. 설탕과 D-리보오스함유 설탕의 혈당반응값을 비교하였을 때 D-리보오스 함유 설탕인 RB5, RB10, RB14 순으로 낮아졌으며 RB10, RB14는 설탕에 비해 유의적으로 낮은 혈당반응값을 보였다. 백설탕, RB5, RB10, RB14의 GI는 각각 67.39, 67.07, 47.57, 45.62로 설탕과 RB5는 중 GI 식품으로, RB10과 RB14는 저 GI 식품으로 분류되었으며, RB10, RB14의 GI는 설탕과 RB5의 GI에 비해 유의적으로 낮았다. 혈당 변화에 따른 Cmax를 보면 포도당 61.73 mg/dL에 비해 RB5, RB10, RB14가 각각 49.43 mg/dL, 37.25 mg/dL, 35.15 mg/dL로 유의적으로낮았으나, 설탕의 Cmax 58.18 mg/dL과 비교 시 RB10, RB14의 Cmax는 유의적으로 낮았으나, RB5와는 유의적인 차이를 보이지 않았다. 따라서 D-리보오스 함유 설탕의 혈당 상승 억제 효과는 D-리보오스를 5% 함유 시 보다는 D-리보오스를 10% 이상 함유할 때 더 효과적인 것으로 나타났다. 그러나 D-리보오스를 10%, 14% 함유한 설탕의 GI값과 혈당 변화율이 유사하게 나타나고 있으므로 D-리보오스 14% 함유보다는 D-리보오스 10% 함유하는 것이 혈당 저감화 효과 및 비용적인 측면을 고려할 때 기능성 설탕의 비율로 더 적절할 것으로 사료된다.

Saccharomyces cerevisiae에서 얻은 Purine Nucleoside Phosphorylase의 반응기작과 효소에 대한 Sulfhydryl Reagent의 영향 (Reaction Mechanism of Purine Nucleoside Phosphorylase and Effects of Reactive Agents for SH Group on the Enzyme in Saccharomyces cerevisiae)

  • 최혜선
    • 미생물학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.222-231
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    • 1994
  • Saccharomyces cerevisiae에서 얻은 purine nucleoside phosphorylase (PNP)의 반응 기작을 밝히기 위해 반응속도론적 분석이 수행되어졌다. 반응기작에 PNP${\cdot}$phosphate와 PNP${\cdot}$ribose 1-phosphate의 binary complex가 형성되는 것으로 추정되어진다. Initial velocity와 product inhibition study의 결과는 반응이 ordered bi, bi reaction으로 일어난다는 것과 일치하고 있다. 두 개의 기질중 무기인산이 효소에 먼저 붙고, 그 다음에 nucleoside, 그리고 base가 효소를 떠나는 첫 번째 생성물이고 마지막으로 ribose 1-phosphate가 생성되고 효소는 원래의 상태로 돌아간다. 반응속도론적 분석에 이해 제안된 작용기작은 sulfhydryl reagents인 p-chloromercuribenzoate(PCMB) and 5,5'-dithiobisnitrobenzoate (DTNB)에 의한 효소의 불활성화에 대한 기질으 보호작용의 결과와 일치하고 있다. PNP는 ribose 1-phosphate와 phosphate에 의해 보호되지만 nucleoside나 base에 의해서는 아무런 효과과 없다는 사실은 반응 순서가 효소에 무기인산이 먼저 붙는 ordered bi, bi 기작이라는 것을 지지하고 있다. PCMB 나 DTNB에 의해 불활성화된 PNP는 dithiothreitol(DTT)에 의해서는 활성이 완전히 회복되고 2-mercaptoethanol에 의해서는 77%의 활성이 회복된다는 사실은 효소의 불활성화가 가역적이라는 것을 시사하고 있다. PCMB에 의해 불활성화된 효소는 inosine이 변화하는 기질일때 정상효소보다 높은 $K_m$과 낮은 $V_m$ 값을 보여주고 이런 현상은 DTT 처리시 원래의 상태로 돌아온다. DTNB에 의해 불활성화된 효소는 PCMB 처리시와 비슷하게 정상효소보다 높은 $V_m$ 값을 보이지만 $V_m$ 값은 큰 변화가 없다. S. cerevisiae PNP에서 발견되는 높은 무기인산의 농도에서의 하위단위체간의 음성적 협동성이 PCMB나 DTNB를 처리한 PNP에서는 보이지 않았다.

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Membrane Topology of the Integral Membrane Transporter for Ribose

  • Park, Yongkyu;Park, Chankyu
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 1998년도 학술발표회
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    • pp.28-28
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    • 1998
  • RbsC of Escherichia coli is the integral membrane component of the high-affinity ribose transport system classified as the AraH family. To understand the function and structure of RbsC, the topology of RbsC was investigated by alkaline phosphatase fusion. Characterization of a total of 64 RbsC-PhoA fusions revealed that RbsC is composed of six transmembrane helixes and has three periplasmic and two cytoplasmic loops.(omitted)

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Stability and Folding of a Mutant Ribose Binding Protein of Escherichia coli

  • Kim, Joon-Sik;Kim, Hyoungman
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 1996년도 정기총회 및 학술발표회
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    • pp.25-25
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    • 1996
  • A mature mutant ribose binding protein (RBP) of Escherichia coli was obtained by site-directed mutagenesis, replacing Thr-3 in the N-domain of wild-type mature RBP (WT -mRBP) with a Trp residue (N- Trp-mRBP). The equilibrium unfolding properties and the refolding kinetics of this protein were monitored by fluorescence and circular dichroism (CD). (omitted)

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ADP-Ribosylation: Activation, Recognition, and Removal

  • Li, Nan;Chen, Junjie
    • Molecules and Cells
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    • 제37권1호
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    • pp.9-16
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    • 2014
  • ADP-ribosylation is a type of posttranslational modification catalyzed by members of the poly(ADP-ribose) (PAR) polymerase superfamily. ADP-ribosylation is initiated by PARPs, recognized by PAR binding proteins, and removed by PARG and other ADP-ribose hydrolases. These three groups of proteins work together to regulate the cellular and molecular response of PAR signaling, which is critical for a wide range of cellular and physiological functions.

L-리보스 생산을 위한 L-아라비노스의 에피머반응 (Epimerization of L-Arabinose for Producing L-Ribose)

  • 전영주;송성문;이창수;김인호
    • Korean Chemical Engineering Research
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    • 제49권5호
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    • pp.628-632
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    • 2011
  • L-리보스는 항바이러스 약의 출발물질로 근래 관심의 대상이다. 이 물질은 에피머 반응에 의해 L-아라비노스로 부터 얻을 수 있다. 몰리브덴 산화물이나 몰리브덴산 촉매 그리고 메탄올/물 용액에서 에피머 반응을 수행하였다. 반응 온도, 메탄올 분율, 촉매종류를 선정하여 최적 반응을 찾고자 하였다. 이온교환크로마토그래피를 이용하여 에피머 반응물을 분리하였고 L-리보스 HPLC 크로마토그램에서 반응수율을 계산하였다. Sodex 이온교환 HPLC 칼럼과 Phenomenex $NH_2$ HPLC 칼럼을 분석의 편의성 면에서 비교하였다. 20% 메탄올, $60^{\circ}C$, 그리고 40 g/L 몰리브덴산 조건에서 21% 최대수율을 얻었다.