International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제15권2호
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pp.131-135
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2007
Open reading frame 4 of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV), designated as Bm4, is a gene whose function is completely unknown. With the recently developed BmNPV bacmid and a modified pFastBac1 whose polyhedrin promoter was replaced with ie1 promoter, a recombinant bacmid expressing Bm4-EGFP fusion protein under the control of ie1 promoter in BmN cells was successfully constructed. The result not only showed that the polyhedrin promoter can be replaced efficiently with other promoters to direct the expression of foreign gene in BmN cells by using Bac-to-Bac/BmNPV baculovirus expression system but also laid the foundation for rescue experiment of Bm4 deletion mutant due to the ability of ie1 promoter to direct gene expression throughout the infection cycle.
To elucidate the regulatory mechanism of virE operon from vir regions (virA, virB, virC, virD, virG, virE) of pTiA6 which have been known to be essential for efficient crown gall tumorigenesis in plants, the activity of the truncated virE, promoter was analyzed. pSM358cd, a recombinant plasmid in which virE :: Tn3-HoHo1 (Tn3-promoterless lacZ) was cloned into SalI site of pVK102, was digested with SalI, and virE :: Tn3-HoHo1 was seperated from pVK102. To construct the truncted virE recombinant plasmids (pJS031, pJS051, pJS102, pJS201, pJS301), 5'-end of vireE promoter was deleted with BAL31 and cloned into pVK102 and then transferred into a. tumefaciens A348(pTiA6). According to the activity of the truncated virE promoter in recombinant plasmids, they were classified into two groups, pJS031, pJS051, pJS101 and pJS201 belong to a functional group and pJS301 is a non-functional. The size of deleted nucleotides of pJS201 and pJS301 seemed to be about 130 nucleotides and about 250 nucleotides from 5'-end of virE promoter, respectively. Hence it was thought that the essential site of the virE promoter was located between about 130th nucleotide and 250th nucleotide from 5'-end of the virE promoter.
We isolated and functionally characterized a Dendrobium Actin1 (DmACT1) promoter that drives strong gene expression in the orchid genus Dendrobium. A genomic fragment containing the region 3227 bp upstream of the coding region of DmACT1 was obtained by inverse PCR. Detailed comparison of the full-length cDNA and genomic sequences revealed that DmACT1 has a 1374 bp first intron in the 5' UTR. However, the 5' flanking sequences upstream of the coding region showed no obvious sequence similarities compared to those of known promoters, including plant actin promoters. Serial deletion constructs of the 5' flanking region from the translation initiation codon were fused to the coding sequence of a GUS/luciferase fusion reporter to identify the regulatory elements necessary for promoter activity. Transient assays in the flowers of Dendrobium revealed that the 5' UTR-intron greatly enhanced promoter activity. Moreover, the DmACT1 promoter with its 5' UTR-intron yielded approximately 10-fold higher reporter activity than the rice Act1 promoter-intron. Our data suggest that the DmACT1 promoter with its 5' UTR-intron is a useful tool for strong expression of transgenes in Dendrobium orchids.
To develop a convenient promoter analysis system for fungi, a null-pigment mutant (NPG) of Aspergillus nidulans was used with the 4'-phosphopantetheinyl transferase (PPTase) gene, npgA, which restores the normal pigmentation in A. nidulans, as a new reporter gene. The functional organization of serially deleted promoter regions of the A. nidulans trpC gene and the Cryphonectria parasitica crp gene in filamentous fungi was representatively investigated to establish a novel fungal promoter assay system that depends on color complementation of the NPG mutant with the PPTase npgA gene. Several promoter regions of the trpC and crp genes were fused to the npgA gene containing the 1,034-bp open reading frame and the 966-bp 3' downstream region from the TAA, and the constructed fusions were introduced into the NPG mutant in A. nidulans to evaluate color recovery due to the transcriptional activity of the sequence elements. Serial deletion of the trpC and crp promoter regions in this PPTase reporter assay system reaffirmed results in previous reports by using the fungal transformation step without a laborious verification process. This approach suggests a more rapid and convenient system than conventional analyses for fungal gene expression studies.
This study analyzes the flow characteristics and sponge ball recovery performance in a ball strainer according to vortex promoter design variables through flow-particle analysis based on actual experiments to derive a method for improving the recovery rate of cleaning sponge balls of CTCS applied to existing power plants. Based on the ball strainer in CTCS used in the power plant, the experiment was conducted by changing the design factor of the improved shape. In addition, flow and particle analysis were performed under the same conditions as the experiment to numerically the flow characteristics and recovery rate in the ball strainer according to the design factor of the vortex promoter. As a result of the study, it was confirmed that the recovery performance was improved by about 3% by changing the design height of the Vortex promoter. And when comparing the difference between maximum and minimum recovery rate, it was found that the effect on the recovery performance increased slightly according to the distance condition compared to the vortex promoter design height condition.
감자의 genomic DNA library로 부터 분리한 proteinase inhibitor II (pin2) 유전자들의 제한효소 지도를 작성 하였던바 이미 분리된 상처 유발 (wound-inducible)pin2K 유전자의 것과 상이성이 있는 pin2T를 분리하여 염기서열을 결정하였다. 두 유전자의 염기서열은 전체적으로 약 86%의 동일성을 보였으며 특히 promoter 부위의 염기서열은 pin2K 유전자의 전사개시 부위의 상대적인 위치인 -714까지 네부분의 결손(20 내지 60bp)을 제외하던 약 91%수준의동일성을 보였다. 분리한 유전자들의 promoter 부위를 표지 유전자인 CAT와 GUS 유전자에 연결 시킨후 담배에서의 발현을 추적하였던바, pin2K 유전자의 promoter에 의한 표지유전자의 발현은 상처에 의해 발현 되었으나 pin2T 유전자의 promoter에 의한 표지유전자의 발현은 상처 유무와 관계없이 낮은 수준으로 나타났다. 또한 pin2T 유전자의 Promoter 내의 결손은 핵 단백질의 promoter에의 결합에 영향을 주지 않았으며 상처 유발pin2K 유전자의 promoter 염기서열과 비교하였을때 pin2T 유전자의 promoter 부위내에 5'-AGTAAA-3'라는 특별한 염기부위가 자연적으로 제거된것을 알수 있었다. 또한 5'-AGTAAh-3'의 염기부위가 다른 상처 유발 유전자들에서는 흔히 발견되고, 다른 식물 유전자들의 Promoter에서는 쉽게 발견이 되지 않았다. 따라서 상처 유발 pin2K 유전자의 Promoter내에 상처 유발과 관련있는 특별한 염기부위가 자연적으로 결실되어 pin2T 유전자의 발현이 상처 유발성을 잃은것으로 짐작된다.
본 연구에서는 질산염(nitrate) 존재하에서 혐기 조건이 되면 최대로 발현되는 변형된 naT 프로모터 를 대장균내에서 단백질을 대량 생산하기 위한 발현 운반체로 쓰일 수 있는지를 조사하였다. 이를 위해 용존산소농도에 따라 naT 프로모터의 유도에 영향을 미치는 염색체 fnT 유전자가 발현되지 못하는 대장 균(ES200l)에 pBR322 플라스미드에 프로모터상 의 10 지역에서 특정부위돌연변이화에 의해 cons sensus sequence로 바핀 변형된(modified) naT 프 로모터(pMW616)가 도입되어 있는 계(pMW616/ E ES2001 )가 이용되었다. 이 변형된 naT 프로모터의 하류에는 구조유전자(structural gene) 인 질산염 환 원효소대 신에 ${\beta}$-galactosidase를 발현하는 lacZ 유 전자가 클로닝되어 있다. 이 변형된 naT 프로모터의 유도에 대한 최적조건을 찾기 위해 변형된 naT 프로 모터를 유도시키는 방법, 변형된 naT 프로모터가 최 대로 유도되는 질산엽의 농도, 말현된 $\beta$galactosid a ase의 양 빛 변형된 naT 프로모터가 유도되는 특성 들이 조사되었다. 이에 대한 실험으로부터 다음과 같은 결론들이 얻어졌다; 이 변형된 naT 프로모터로 부터 ${\beta}$-galactosidase의 말현은 질산염의 농도에 의 해서는 크게 영향을 받지 않았다. 한편, 변형된 naT 프로모터로부터 ${\beta}$-galactosidase의 말현은 성장단계 에서 대장균을 호기상태에서 OD600이 약 2.27~ 될 때까지 키우다가 유도시 혐기상태로 만드는 것이 가 장 유리하였으며, 이 때 발현된 ${\beta}$-galactosidase의 비활성도는 약 13,000 Miller unit였다. 하지만, 이 변형된 naT 프로모터는 이켓을 유도시키기 전에도 발현된 ${\beta}$-galactosidase의 비활성도가 약 6,000 M Miller unit로 매우 높음으로 인하여 이 변형된 naT 프로모터는 원하는 단백질을 유도성보다는 구성적으 로 발현시키는데 더 적합한 프로모터였다.
Pro-inflammatory cytokine인 종양괴사인자-$\alpha$ (TNF-$\alpha$)는 B형 간염바이러스(HBV) 감염에 대한 면역반응의 중요한 매개인자이다. TNF-$\alpha$의 생산은 전사수준에서 주로 조절되며, TNF-$\alpha$ promoter 다형성은 TNF-$\alpha$ 유전자 발현을 변화시키기 때문에, TNF-$\alpha$ promoter 다형성이 만성 HBV 감염의 병태생리에 영향을 미칠 가능성이 높다. 그러므로, 본 연구에서는 TNF-$\alpha$ promoter 다형성과 만성 HBV 감염의 연관성을 조사하였다. 본 연구는 만성 HBV 감염환자 181명, HBV 감염이 자연적으로 치유된 201명, 그리고 건강한 대조군 170명을 대상으로 하였다. TNF-$\alpha$ promoter의 -308G/A와 -238G/A 다형성은 PCR-RFLP법을 통하여 분석하였다. 분석결과, 환자군에서 -308과 -238 유전자형의 분포는 자연치유군 및 건강대조군에서의 분포와 통계적인 차이를 보이지 않았다(p>0.05). 또한, 그룹 간에 allele frequency도 통계적 차이가 없었다(p>0.05). 따라서, 본 연구의 결과는 한국인에서 TNF-$\alpha$ -308과 -238 promoter 다형성은 만성 B형 간염 바이러스 감염의 발생과 연관성이 없음을 시사한다.
우리는 두 가지의 새로운 luciferase reporter plasmid를 개발하였는데 그 하나는 이 plasmid에 promoter조각을 삽입한 다음에 그 promoter의 활성을 측정하는 용도로 사용 될수 있고, 다른 하나는 매우 낮은 basal promoter 활성을 갖고 있기 때문에 진핵생물의 전사 조절인자의 연구에 도움이 될 수 있다. 후자의 reporter plasmid에는 17염기쌍의 initator 와 Spl,GAL4그리고 일부 Drosophila homeodomain protein의 결합우뷔에 해당하는 cis elements등을 들어 있다.그리고 tranciption termination을 촉진할 수 있는 signal을 initiator앞서 삽입하여 이런 reporter plasmid에 존재할 수 있는 cryptic promoter에서 시작된 transcript가 luciferase reporter cDNA로 진행되는 것을 방지하는 개선된 reporter plasmid를 제조하여 promoter활성을 Drosophila Schneider line 2 cells을 이용한 transient transfection assay방법으로 측정하였다. 여기에 사용한 termination 촉진 signal은 SV40 polyadenylation signal의 3연속 조각(AAA)과 tenscription termination signal이 포함된 것으로 믿어지는 mouse c-mos 유전자의 일부조각 (UMS)이다. 기대한으로 이 두가지의 signal을 삽입하였을 때 basal promoter활성이 최대한으로 감소하였으며 이 두 가지 signal을 삽입된 reporter plasmid를 사용하여 promoter의 활성을 보다 sensitive하게 측정하였다. 이 reporter plasmid는 Droiophlla melanogaiter뿐만 아니라 포유동물을 포함한 고등생물의 전사 조절인자 연구의 한 도구로 사용될 수 있을 것이다.
본 연구에서는 효과적인 유전자를 발현시킬 수 있는 retrovirus vector system을 구축하기 위하여 네 가지 promoter를 비교하였다. 일반적으로 사용되고 있는 RSV (Rous sarcoma virus), UbC (Ubiquitin), β-actin, CMV(cytomegalovirus) promoter 하에 GFP (green fluorescent protein)를 표지유전자로 사용하였다. 또한 WPRE (Woodchuck hepatitis virus Posttranscriptional Regulatory Element) 서열을 도입하여 각각의 promoter 하에서 GFP 유전자의 발현 증가 여부를 검정하였다. (중략)
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[게시일 2004년 10월 1일]
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