• 제목/요약/키워드: proline-rich proteins

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꼼치에서 특징적으로 발현되는 새로운 유전자 곰신의 분리 및 동정 (Molecular Cloning and Identification of Novel Genes, Gomsin, Characteristically Expressed in Snailfish, Liparis tanakae)

  • 송인선;이석근;손진기
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제6권1호
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    • pp.7-16
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    • 2002
  • 점액질이 풍부한 꼼치 조직에서 NIH 3T3 세포주를 이용하여 subtracted cDNA 라이브러리를 얻어 200례의 클론을 제작하였다. 이 클른 중에서 비반복성 유전자를 선택하고, RNA in situ hybridization을 실행하여 꼼치 조직에서 특이하게 발현되는 곰신 클론(C90-171)을 선택하였다. 이 클론은 사람의 타액선 조직에서도 특이하게 발현되는 유전자로서 이를 확인하기 위하여 C90-171(곰신) 항체를 제작하였다. 꼼치의 cDNA 라이브러리에서 곰신의 항체를 통하여 스크리닝한 결과 PRP(proline-rich protein)와 가장 많이 교차반응하며, 면역조직화학적 염색으로 PRP와 유사한 양성반응으로 나타나 PRP와 유사한 기능을 하는 단백질로 사료된다. 또한 타액 내에서의 꼼치 단백질의 분해에 대한 실험결과 거의 분해가 일어나지 않는 것으로 보아, 곰신은 꼼치의 몸통을 보호하는 유전물질일 뿐만 아니라, PRP와 유사하게 조직을 보호하는 안정된 새로운 기능성 단백질로 사료된다.

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다양한 교정용 브라켓 표면에 부착하는 타액단백질에 관한 연구 (Adherence of Salivary Proteins to Various Orthodontic Brackets)

  • 안석준;임종안;남동석
    • 대한치과교정학회지
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    • 제32권6호
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    • pp.443-453
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    • 2002
  • 본 연구의 목적은 다양한 교정용 브라켓의 표면에 형성되는 타액성 피막의 조성을 확인하고, 전타액, 악하선타액 및 이 하선타액에서 유래하는 타액성 피막의 성분을 비교하는 것이다. 네 가지 서로 다른 종류의 교정용 브라켓을 본 연구에 사용하였다. 이들은 $022{\times}028$ Roth Prescription의 상악 소구치 브라켓으로 조성은 다음과 같다: 스테인레스 스틸, 단결정 사파이어, 다결정 알루미나 및 플라스틱 브라켓. 교정용 브라켓을 각각 전타액, 이하선타액 및 악하선타액에 2시간 배양하여 타액성 피막을 형성시켰다 브라켓 피막의 타액성분은 sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis, Western transfer method 및 면역검출법을 통해 확인하였다. 이 결과 low-molecular weight salivary mucin, ${\alpha}-amylase$, secretory IgA (sIgA), acidic proline-rich proteins, cystatins 등이 모든 브라켓의 타액성 피막에 존재하였으며, 치아우식증의 원인균인 Streptococcus mutans의 부착을 촉진시키는 타액단백질인 high-molecular weight mucin은 어떤 브라켓에도 부착하지 않았다. 그러나, 비록 동일한 타액단백질이 모든 브라켓에서 발견되었지만, 타액단백질 부착 양상은 타액의 종류 및 브라켓의 종류에 따라 양적 및 질적으로 다르게 나타났다. 특히 sIgA는 이하선타액에서 유래한 브라켓 피막에 더 많이 부착하였고, cystatins의 경우는 플라스틱 브라켓에서 유래한 브라켓 피막에 더 많이 존재하였다 본 연구는 다양한 타액단백질이 교정용 브라켓에 부착하며, 타액단백질이 타액의 출처 및 브라켓의 종류에 따라 교정용 브라켓의 표면에 선택적으로 부착함을 나타내었다.

Proline-Rich Acidic Protein 1 (PRAP1) is a Target of ARID1A and PGR in the Murine Uterus

  • Kim, Tae Hoon;Jeong, Jae-Wook
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제23권3호
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    • pp.277-284
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    • 2019
  • ARID1A and PGR plays an important role in embryo implantation and decidualization during early pregnancy. Uterine specific Arid1a knockout ($Pgr^{cre/+}Arid1a^{f/f}$) mice exhibit in non-receptive endometrium at day 3.5 of gestation (GD 3.5). In previous studies, using transcriptomic analysis in the uterus of $Pgr^{cre/+}Arid1a^{f/f}$ mice, we identified proline-rich acidic protein 1 (PRAP1) as one of the down-regulated genes by ARID1A in the uterus. In the present study, we performed RT-qPCR and immunohistochemistry analysis to investigate the regulation of PRAP1 by ARID1A and determine expression patterns of PRAP1 in the uterus during early pregnancy. During early pregnancy, PRAP1 expression was strong at day 0.5 of gestation (GD 0.5) and then decreased at GD 3.5 in the epithelium and stroma. After implantation, PRAP1 expression was remarkably reduced in the uterus. However, the expression of PRAP1 at GD 3.5 was remarkably increased in the $Pgr^{cre/+}Arid1a^{f/f}$ mice. To determine the ovarian steroid hormone regulation of PRAP1, we examined the expression of PRAP1 in ovariectomized control, $Pgr^{cre/+}Arid1a^{f/f}$, and progesterone receptor knock-out (PRKO) mice treated with progesterone. While PRAP1 proteins were strongly expressed in the luminal and glandular epithelium of control mice treated with vehicle, progesterone treatment suppressed the expression of PRAP1. However, PRAP1 was not suppressed in both the $Pgr^{cre/+}Arid1a^{f/f}$ and PRKO mice compared to controls. Our results identified PRAP1 as a novel target of ARID1A and PGR in the murine uterus.

당뇨병 환자의 이하선 타액내 단백질의 다형현상에 대한 연구 (A Study on the Polymorphisms in Parotid Salivary Proteins of the Patients with Diabetes Millitus)

  • Jong-Mo Ahn;Chang-Lyuk Yoon
    • Journal of Oral Medicine and Pain
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    • 제17권2호
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    • pp.99-108
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    • 1992
  • The purpose of this study was to evaluate the polymorphosms in parotid salivary proteins of the patients with diabetes mellitus. Saliva from the parotid glands was collected from 94 healthy Korean adults who were live in Kwang-ju and from 33 diabetes mellitus patients who had more than 140mg/dl of fastingblood sugar for one week. Diabetes mellitus patient group was subdivided to insulin dependent diatetes mellitus (IDDM) and non-insulin dependent diabetes mellitus (NIDDM). In the saliva collected from the parotid glands, parotid acidic protein(Pa), proline-rich protein(Pr) and double band protein(Db) were analyzed to evaluate the distribution of phenotype using alkaline slab polyacrylamide gel electrophoresis. The results were as follows : 1. The parotid acidic protein (Pa) was found more frequently in the diabetes mellitus patient group than in the control group, but the difference was not statistically significant. 2. The Pr(1-2) type was found more frequently in the control group, but the Pr(1-1) and Pr(2-2) type were found more freqnently in the diabetes mellitus patient group and the difference of phenotypic distribution was statistically significant between the two groups. (p<0.05) 3. The parotid acidic protein(Pa) and Pr(1-2) type were found more frequently in the noninsulin dependent diabetes mellitus (NIDDM) patients than in the insulin dependent diabetes mellitus patients, though the difference was not statistically significant.

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곤충유래 항균 펩티드의 의약학적 적용 (Pharmaco-medical Application of Antimicrobial Peptides Derived from Insect)

  • 이준하;김인우;김미애;윤은영;황재삼
    • 생명과학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.737-748
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    • 2016
  • 현재까지 곤충 항균 펩티드는 1980년에 세크로피아나방(Hyalophora cecropia) 번데기의 혈림프로부터 세크로핀(cecropin)이 처음으로 정제된 이후로 150개 이상의 펩티드가 분리되어 특성들이 보고되어 왔다. 그러므로 곤충은 항균 펩티드 선발을 위한 좋은 재료로서 고려되어 왔다. 곤충 항균 펩티드는 분자량이 작으며 양전하를 띠고 다양한 길이와 서열 및 구조를 갖는 양친매성의 특징을 갖는다. 곤충 항균 펩티드는 박테리아, 진균, 기생충, 그리고 바이러스와 같은 병원체들의 침입에 대항하여 곤충의 선천성 면역체계에서 중요한 역할을 수행한다. 대부분의 곤충 항균 펩티드들은 상처가 나거나 면역화 시 지방체와 다른 특정 조직들에서 유도 합성된다. 이어서 그 항균 펩티드들은 미생물들에 대항하여 작용하기 위해 혈림프로 분비되어 나온다. 이들 펩티드들은 항암활성을 포함하여 다양한 미생물들에 대해 광범위한 항균활성을 나타낸다. 곤충 항균 펩티드는 구조 및 서열상의 특징들에 기초하여 크게 4개의 패밀리로 나누어질 수 있다. 다시 말해서 α-나선형 펩티드, 시스테인-풍부 펩티드, 프롤린-풍부 펩티드, 그리고 글리신-풍부 펩티드/단백질이 그것이다. 예를 들면, 세크로핀, 곤충 디펜신(defensin), 프롤린-풍부 펩티드, 그리고 아타신(attacin)이 일반적인 곤충 항균 펩티드들인데, 글로베린(gloverin)과 모리신(moricin)은 나비목 종들에서만 확인되어 왔다. 본 총설에서는 곤충의 항균 펩티드들에 초점을 맞추어 곤충 항균 펩티드들의 적용 가능성 및 방향과 함께 현재의 지식들과 최근의 진전된 사항들에 대하여 논의하고자 한다.

The Role and Regulation of MCL-1 Proteins in Apoptosis Pathway

  • Bae, Jeehyeon
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 2002년도 창립10주년기념 및 국립독성연구원 의약품동등성평가부서 신설기념 국재학술대회:생물학적 동등성과 의약품 개발 전략을 위한 국제심포지움
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    • pp.113-113
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    • 2002
  • Phylogenetically conserved Bcl-2 family proteins play a pivotal role in the regulation of apoptosis from virus to human. Members of the Bcl-2 family consist of antiapoptotic proteins such as Bcl-2, Bcl-xL, and Bcl-w, and proapoptotic proteins such as BAD, Bax, BOD, and Bok. It has been proposed that anti- and proapoptotic Bcl-2 proteins regulate cell death by binding to each other and forming heterodimers. A delicate balance between anti- and proapoptotic Bcl-2 family members exists in each cell and the relative concentration of these two groups of proteins determines whether the cell survives or undergoes apoptosis. Mcl-1 (Myeloid cell :leukemia-1) is a member of the Bcl-2 family proteins and was originally cloned as a differentiation-induced early gene that was activated in the human myeloblastic leukemia cell line, ML-1 . Mcl-1 is expressed in a wide variety of tissues and cells including neoplastic ones. We recently identified a short splicing variant of Mcl-1 short (Mcl-IS) and designated the known Mcl-1 as Mcl-1 long (Mcl-lL). Mcl-lL protein exhibits antiapoptotic activity and possesses the BH (Bcl-2 homology) 1, BH2, BH3, and transmembrane (TM) domains found in related Bcl-2 proteins. In contrast, Mcl-1 S is a BH3 domain-only proapoptotic protein that heterodimerizes with Mcl-lL. Although both Mc1-lL and Mcl-lS proteins contain BH domains fecund in other Bcl-2 family proteins, they are distinguished by their unusually long N-terminal sequences containing PEST (proline, glutamic acid, serine, and threonine) motifs, four pairs of arginine residues, and alanine- and glycine-rich regions. In addition, the expression pattern of Mcl-1 protein is different from that of Bcl-2 suggesting a unique role (or Mcl-1 in apoptosis regulation. Tankyrasel (TRF1-interacting, ankyrin-related ADP-related polymerasel) was originally isolated based on its binding to TRF 1 (telomeric repeat binding factor-1) and contains the sterile alpha motif (SAM) module, 24 ankyrin (ANK) repeats, and the catalytic domain of poly(adenosine diphosphate-ribose) polymerase (PARP). Previous studies showed that tankyrasel promotes telomere elongation in human cells presumably by inhibiting TRFI though its poly(ADP-ribosyl)action by tankyrasel . In addition, tankyrasel poly(ADP-ribosyl)ates Insulin-responsive amino peptidase (IRAP), a resident protein of GLUT4 vesicles, and insulin stimulates the PARP activity of tankyrase1 through its phosphorylation by mitogen-activated protein kinase (MAPK). ADP-ribosylation is a posttranslational modification that usually results in a loss of protein activity presumably by enhancing protein turnover. However, little information is available regarding the physiological function(s) of tankyrase1 other than as a PARP enzyme. In the present study, we found tankyrasel as a specific-binding protein of Mcl-1 Overexpression of tankyrasel led to the inhibition of both the apoptotic activity of Mel-lS and the survival action of Mcl-lL in mammalian cells. Unlike other known tankyrasel-interacting proteins, tankyrasel did not poly(ADP-ribosyl)ate either of the Mcl-1 proteins despite its ability to decrease Mcl-1 proteins expression following coexpression. Therefore, this study provides a novel mechanism to regulate Mcl-1-modulated apoptosis in which tankyrasel downregulates the expression of Mcl-1 proteins without the involvement of its ADP-ribosylation activity.

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Characterization of a Salicylic Acid- and Pathogen-induced Lipase-like Gene in Chinese Cabbage

  • Lee, Kyung-Ah;Cho, Tae-Ju
    • BMB Reports
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    • 제36권5호
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    • pp.433-441
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    • 2003
  • A cDNA clone for a salicylic acid-induced gene in Chinese cabbage (Brassica rapa subsp. pekinensis) was isolated and characterized. The cabbage gene, designated Br-sil1 (for $\underline{B}$rassica $\underline{r}$apa $\underline{s}$alicylate-$\underline{i}$nduced $\underline{l}$lipase-like 1 gene), encodes a putative lipase that has the family II lipase motif GDSxxDxG around the active site serine. A database search showed that plant genomes have a large number of genes that contain the family II lipase motif. The lipase-like proteins include a myrosinase-associated protein, an anther-specific proline-rich protein APG, a pollen coat protein EXL, and an early nodule-specific protein. The Br-sil1 gene is strongly induced by salicylic acid and a non-host pathogen, Pseudomonas syringae pv. tomato, that elicits a hypersensitive response in Chinese cabbage. Treatment of the cabbage leaves with BTH, methyl jasmonate, or ethephon showed that the Br-sil1 gene expression is induced by BTH, but not by methyl jasmonate or ethylene. This indicates that the cabbage gene is activated via a salicylic acid-dependent signaling pathway. An examination of the tissue-specific expression revealed that the induction of the Br-sil1 gene expression by BTH occurs in leaves and stems, but not in roots and flowers. Without the BTH treatment, however, the Br-sil1 gene is not expressed in any of the tissues that were examined.

Bacillus thuringiensis Cry4A and Cry4B Mosquito-larvicidal Proteins: Homology-based 3D Model and Implications for Toxin Activity

  • Angsuthanasombat, Chanan;Uawithya, Panapat;Leetachewa, Somphob;Pornwiroon, Walairat;Ounjai, Puey;Kerdcharoen, Teerakiat;Katzenmeier, Gerd;Panyim, Sakol
    • BMB Reports
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    • 제37권3호
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    • pp.304-313
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    • 2004
  • Three-dimensional (3D) models for the 65-kDa activated Cry4A and Cry4B $\delta$-endotoxins from Bacillus thuringiensis subsp. israelensis that are specifically toxic to mosquito-larvae were constructed by homology modeling, based on atomic coordinates of the Cry1Aa and Cry3Aa crystal structures. They were structurally similar to the known structures, both derived 3D models displayed a three-domain organization: the N-terminal domain (I) is a seven-helix bundle, while the middle and C-terminal domains are primarily comprise of anti-parallel $\beta$-sheets. Circular dichroism spectroscopy confirmed the secondary structural contents of the two homology-based Cry4 structures. A structural analysis of both Cry4 models revealed the following: (a) Residues Arg-235 and Arg-203 are located in the interhelical 5/6 loop within the domain I of Cry4A and Cry4B, respectively. Both are solvent exposed. This suggests that they are susceptible to tryptic cleavage. (b) The unique disulphide bond, together with a proline-rich region within the long loop connecting ${\alpha}4$ and ${\alpha}5$ of Cry4A, were identified. This implies their functional significance for membrane insertion. (c) Significant structural differences between both models were found within domain II that may reflect their different activity spectra. Structural insights from this molecular modeling study would therefore increase our understanding of the mechanic aspects of these two closely related mosquito-larvicidal proteins.

말쥐치육의 사후경과에 따른 단백질조성의 변화 (Change in Protein Composition of Filefish Muscle during Post-Mortem Lapse)

  • 변재흥;남택정
    • 한국수산과학회지
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    • 제14권1호
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    • pp.15-23
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    • 1981
  • 말쥐치 등육 골낙근을 $0^{\circ}C$로 유지하면서 사후경과중 선도의 변화에 따라 단백질의 조성과 단백질의 아미노산 조성 및 유리아미노산의 조성 등을 분석 검토하였다. 말쥐치의 육은 약 $20\%$의 단백질을 함유하고 있었으며, 이 단백질은 근원질단백질 $31\%$, 근원섬유단백질 $55\%$, 세포내잔사단백질 $10\%$, 그리고 기질단백질 $4\%$로 구성되어 있었다. 근원질단백질과 근원섬유단백질은 사후선도의 변화와 더불어 감소하여 갔고, 세포내잔사단백질은 상대적으로 증가하는 관계를 보였다. 근원섬유단백질과 세포내잔사단백질은 전기영동과 densitometry에 의하여 분석한 결과, 근원섬유단백질의 약 $70\%$가 액틴과 미요신, 약 $20\%$가 조절단백질, 그리고 $10\%$전후의 미지단백질로 구성되어 있었다. 세포내잔사단백질은 그 대부분이 근원섬유단백질을 구성하는 단백질로 이루어져 있었다. 한편, 사후경과와 더불어 근원섬유단백질을 구성하는 단백질중 트로포닌-T, 트로포닌-C 및 미요신의 light chain 2는 각각 감소하는 추세를 보였다. 죽인 직후의 말쥐치 육단백질의 아미노산 조성은 다른 어육의 그것과 비슷하였으나, 트?토판과 함황아미노산은 보다 부족하였다. 휘발성 염기질소양에비추어 부패초기에 해당하는 사후 18일이 경과했을 때는 프롤린과 시스테인이 두드러지게 줄었으며, 로이신과 이소로이신 및 페닐알라닌은 조금 증가하였다. 말쥐치육의 유리아미노산중에는 타우린이 특히 많이 함유되어 있었으며, 알라닌과 글리신 및 리신도 비교적 많았다. 사후 18일이 경과했을 때는 타우린, 히스티딘, 발린 및 메치오닌은 증가하였으나 리신, 아르기닌, 아스파르트산, 스레오닌, 세린, 로이신 및 이소로이신은 반대로 감소하였다.

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합포체 분석을 위해 R 펩타이드가 결여된 형광 표지 Moloney 마우스레트로바이러스 Molecular Clone 제조 (Construction of a Fluorescently Labeled Infectious R Peptide-Less Moloney MLV Molecular Clone for Analysis of Syncytium)

  • 이용진;박진우;이규준;배은혜;박성한;임지현;김새로미;정용태
    • 미생물학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.246-250
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    • 2009
  • 레트로바이러스는 바이러스 외막과 숙주세포막의 융합에 의해 세포내로 들어간다. Moloney 마우스레트로바이러스(murine leukemia virus)의 외막 단백질은 표면단백질(SU)과 막단백질(TM)을 포함하는 85 kDa의 전구체로 합성되는데 바이러스의 성숙과정에 막단백질의 카르복시 말단 16개의 아미노산(R-peptide)이 바이러스의 프로티아제에 의해 절단된다. R 펩타이드가 절단된 막단백질은 Moloney 마우스레트로바이러스에 대한 수용체를 가진 NIH3T3 세포주에서 합포체(syncytium)를 형성한다. R 펩타이드가 절단된 막단백질의 합포체 형성 기작 연구를 위해 R 펩타이드가 절단되어 있으며 표면단백질의 PRR (proline rich region) 부위가 EGFP로 삽입되어진 Moloney full length molecular clone을 만들었다. 이 clone은 NIH3T3 세포에서 합포체를 형성하였으며 형광이 세포질과 세포막에서 관찰되었으나 핵은 염색이 되지 않고 검게 보여 신속 정확하게 합포체 관찰이 가능하였다. 흥미롭게도 절단된 막단백질을 가진 비리온이 NIH3T3 세포에서 광학현미경으로 관찰하였을때는 합포체를 형성하였으나 형광현미경에서는 형광이 관찰되지 않아서 비리온이 세포감염 없이 바이러스-세포 융합 방식으로 합포체를 형성한 것으로 생각되었다. 본 연구에서는 형광의 발현 여부로 합포체 형성을 신속 정확하게 관찰할 수 있는 방법을 개발하였으며 R 펩타이드가 절단된 비리온이 세포 감염 없이 세포와 세포 사이의 융합을 매개할 수 있음을 밝혔다.