• International Journal of Oral Biology
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• 제34권1호
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• pp.29-36
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• 2009

Cyclosporin A (CsA) has been used clinically as an immunosuppressive drug to prevent organ transplant rejection and in basic research as a mitochondrial permeability blocker. It has been reported that CsA has a protective role in severed neurons and a neurotrophic effect in neuronal cells. However, the molecular mechanisms underlying the stimulation of neuronal cell proliferation by CsA have not yet been elucidated. In our current study, we investigated CsA responsive proteins in PC12 cells using a systematic proteomic approach. The viability of these cells following CsA treatment increased in a dose- and time-dependent manner. Proteins in the CsA-treated PC12 cells were profiled by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) and identified by matrix-assisted laser desorption ionization time-of flight (MALDI-TOF) and electrospray ionization quadupole time-of-flight mass spectrometries (EIQ-TOFMS). This differential expression analysis showed significant changes for 10 proteins (6 up-regulated and 4 down-regulated) upon CsA treatment that were related to cell proliferation, metabolism and the stress response. These proteomics data further our understanding of the proliferation mechanisms of PC12 cells exposed to CsA and demonstrate that our methodology has potential to further elucidate the mechanisms and pathways involved.

• Genomics & Informatics
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• 제3권4호
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• pp.154-158
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• 2005

Germ-line mutations of the BRCA1 gene confer an increased risk for breast and ovarian cancers. BRCA1 in female cells is directly related with the maintenance of the inactive X chromosome (Xi). The effect by the loss of the BRCA1 function on the X chromosome gene expression remains unclear in cancer cells. We attempted to investigate the expression pattern of the X-linked genes by performing BRCA1 knockdown via RNA interference in the MCF7 breast cancer cell line. The transcriptional and translational levels of BRCA1 were decreased over 95% in the MCF7 cells after BRCA1 knockdown. The expression patterns of one hundred ninety X-linked genes were profiled by the X chromosome-specific cDNA arrays. A total of seven percent of the X-linked genes (14/190) were aberrantly expressed by over 2-fold in the MCF7-BRCA1 knockdown cells, which contained two up-regulated genes (2/190, 1 %) and 12 down-regulated genes (12/190, 6.3%). It is interesting that 72% of the aberrantly expressed X-linked genes were located on the Xq (10/14,) region. Our data suggests that BRCA1 may not be important to maintain X chromosome inactivation in cancer because the BRCA1 knockdown did increase the expression of the only one percent of X-linked genes in the human breast cancer cells.

• 전자공학회논문지CI
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• 제44권2호
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• pp.1-10
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• 2007

분기 명령어에 대한 분기 예측 정확도는 시스템 전체의 성능 향상에 중대한 영향을 미친다. 본 논문에서는 분기 예측의 정확도를 높이기 위한 방법의 하나로, 각 분기 명령어 별로 사용되는 History 길이를 동적으로 조절할 수 있는 "각 분기별 동적 History 길이 조절 기법"을 소개한다. 제안된 기법은, 분기 예측에 있어서 관련된 레지스터들 사이의 데이터 종속성을 추적하여, 최종적으로 관련이 있는 레지스터를 포함하도록 유도하는 분기를 파악한 후, 관련 분기의 History만을 사용하게 해 주는 방식이다. 이를 위해 본 논문에서는, 데이터 종속성을 추적할 수 있는 알고리즘과 관련 하드웨어 모듈을 소개하였다. 실험 결과 제안된 기법은, 기존의 고정 길이 History를 사용하는 방식에 비하여 최대 5.96% 분기 예측 정확도의 향상을 가져 왔으며, 프로파일링을 통해 확인된 각 응용 프로그램 별 Optimal History 길이와 비교해서도 성능 향상을 보였다.

• 대한화학회지
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• 제41권4호
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• pp.186-197
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• 1997

성 호르몬으로서의 역할과 암 성장의 잠재적 저해 효과를 지니고 있는 에스트로겐의 대사체들을 동시에 분석하기 위하여 Serdolit AD-2 수지와 효소 가수분해, 액체-액체 추출방법을 이용한 전처리 과정을 확립하였으며, MSTFA/TMSCl 혼합액에 의해 trimethylsilylether 형태로 유도체화된 에스트로겐들을 GC/MS의 SIM(selected ion monitorning) 방법으로 동시에 분석, 정량할 수 있는 조건을 설정하였다. 그 결과 회수율은 80.97~97.81%이었고, within-a-day 및 day-to-day 분석에서의 RSD값은 각각 0.24~25.35%, 1.05~23.94%이었으며, 이 방법으로는 소변 내에 존재하는 19종의 에스트로겐 대사체들을 정량하여 한국인 정상인 참고치(여자:22~35세, 남자: 39~57세)를 설정하였다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권2호
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• pp.482-488
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• 2013

Two piperazine-containing 3,4-dihyroquinazolines (BK10007S/8S) have been synthesized, based on our previous work on the synthesis and antitumoral activity of 3,4-dihyroquinazolines. After evaluating them for T-type calcium channel blocking effect and in vitro anti-cancer effect, they were profiled for acute and repeat dose toxicity (40 mg/kg, 2 weeks) to BALB/c mice. BK10007S/8S were further in vivo evaluated against human pancreatic MIA PaCa-2 carcinoma in $BALB/c^{nu/nu}$ nude mice, which exhibited 54 and 61% tumor growth inhibition through 57-day oral administration of 2 mg/kg of body weight, respectively.

• 대한기계학회논문집A
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• 제40권12호
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• pp.1077-1085
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• 2016

선형 롤러베어링은 하중이 크고 정밀성이 요구되는 이송장치를 지지하기 위해 광범위하게 사용되는 기계요소이다. 본 논문에서는 외력을 받는 선형 롤러베어링의 변위를 계산하기 위한 새로운 모델링 방법을 제시하였다. 먼저 LM 블록을 강체로 가정하여 롤러와 LM 블록의 지배방정식을 유도하였고 Newton-Raphson법을 이용해 계산하였다. 롤러와 레이스 사이의 접촉하중은 롤러의 형상을 고려하여 슬라이싱 기법을 이용하여 계산하였다. 강체 LM 블록 모델에 의해 계산된 접촉하중을 활용하여 LM 블록의 구조적 변형을 유한요소 모델로부터 계산하였다. 최종적인 변위는 강체 LM 블록을 가정한 모델로부터 계산된 변위와 LM 블록 구조해석 결과를 조합하여 도출하였다. 제안된 방법에 의한 결과와 베어링 제작 업체 프로그램 결과와의 비교를 통해 제안된 방법을 검증하였다.

• 정보처리학회논문지A
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• 제11A권5호
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• pp.373-382
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• 2004

이 논문에서는 내장형 소프트웨어의 성능 향상을 위하여 사용될 수 있는 레지스터 프로모션의 새로운 기법을 제안한다. 레지스터 프로모션은 프로그램 내의 메모리 접근 연산(memory access)을 레지스터 접근 연산(register access)으로 바꾸어서 프로그램의 성능 향상을 꾀하는 최적화 방법 중의 하나이다. 제안된 방법에서는 프로파일링(profiling)을 통하여 주어진 소스 코드 내에서의 메모리 접근 연산에 대한 트레이스(trace)를 얻는다. 그리고 각 함수의 수행 횟수에 대한 프로파일링 결과로부터 높은 동적 호출 횟수를 가지는 대상 함수를 선정하여 제안된 레지스터 프로모션 기법을 적용한다. 이와 같이 최적화의 대상이 되는 함수의 수를 줄임으로써 컴파일 시간을 줄일 수 있다. 최적화 대상 함수의 메모리 트레이스를 탐색하여 레지스터 접근 연산으로 변경될 경우 수행 사이클을 줄일 수 있는 메모리 접근 연산을 찾는다. 찾아진 메모리 접근 연산에 대해서는 컴파일러의 중간단계 코드를 수정하여 프로모션 레지스터를 할당한다. 이와 같은 과정을 거쳐 메모리 접근 연산이 프로모션 레지스터에 대한 접근 연산으로 대체되고 이로부터 성능향상을 얻을 수 있다. 제안된 레지스터 프로모션 기법을 ARM과 MCORE 프로세서용 컴파일러에 적용한 후 MediaBench와 DSPStone 벤치마크을 이용하여 실험한 결과 ARM과 MCORE 프로세서에 대하여 각각 평균 14%와 18%의 성능향상을 얻을 수 있었다.

• 대한약침학회지
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• 제12권1호
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• pp.5-12
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• 2009

Background : Anticancer effects of herbal medicine have been reported in various types of cancer, but the systematic approaches to explain molecular mechanism(s) are not established yet. Objective : To find the anticancer-effect and mechanism(s) of Water Extract of Coptis japonica (WECJ) colon cancer cell (SNU-81). Methods : We first selected 11 herbals, and anti-cancer effects of water-extracts from those herbals have been tested in human colon cancer cell line, SNU-81. Among the tested herbals, the WECJ significantly reduced proliferation of SNU-81. To establish a basis of understanding for anti-cancer mechanism, whole proteins have been obtained from SNU-81 harvested at 48 and 96 hrs after the treatment of WECJ, protein expression has been profiled by 2DE-based proteomic approach. Results : Various changes of the protein expression have been monitored, and most frequent dysregulation was found in the molecular chaperons including heat shock protein 90-alpha (Hsp90-alpha), 14-3-3 protein epsilon, T-complex protein 1 subunit alpha, protein disulfide-isomerase A3, and calreticulin. Interestingly, proliferation-associated protein 2G4 has been up-regulated, and it suggests the possible effect of Coptis japonica on ErbB3-regulated signal transduction pathway and growth control of human colon cancer cells. Conclusion : Based upon the present findings, the further study will focus on monitoring various cancer survival factors after artificial regulation of the proteins identified, and it would be the basis for the understanding of the Coptis japonica anti-cancer effect(s) at the molecular level.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제30권9호
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• pp.1404-1411
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• 2020

Lactic acid bacteria (LAB) play an important role in dairy fermentations, notably as cheese starter cultures. During the cheese production and ripening period, various enzymes from milk, rennet, starter cultures, and non-starter LABs are involved in flavor formation pathways, including glycolysis, proteolysis, and lipolysis. Among these three pathways, starter LABs are particularly related to amino acid degradation, presumably as the origins of major flavor compounds. Therefore, we used several enzymes as major criteria for the selection of starter bacteria with flavor-forming ability. Lactococcus lactis subsp. lactis LDTM6802 and Lactococcus lactis subsp. cremoris LDTM6803, isolated from Korean raw milk and cucumber kimchi, were confirmed by using multiplex PCR and characterized as starter bacteria. The combinations of starter bacteria were validated in a miniature Gouda-type cheese model. The flavor compounds of the tested miniature cheeses were analyzed and profiled by using an electronic nose. Compared to commercial industrial cheese starters, selected starter bacteria showed lower pH, and more variety in their flavor profile. These results demonstrated that LDTM6802 and LDTM6803 as starter bacteria have potent starter properties with a characteristic flavor-forming ability in cheese.

• 정보과학회 논문지
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• 제43권7호
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• pp.744-750
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• 2016

오늘날, 클라우드 인프라 서비스는 일정한 성능을 보장해주면서도 사용한 만큼 비용을 지불하는 과금체계를 통해 많은 인터넷 서비스들의 운영비용을 개선시켜 주고 있다. 특히 오브젝트 스토리지는 필요한 만큼 파일을 저장할 수 있고, 언제 어디서나 접근할 수 있다는 점에서 각광받고 있다. 이에 따라, 최근에는 오브젝트 스토리지를 HTTP 기반의 RESTful API 방식이 아닌 POSIX 기반 파일 액세스가 가능한 클라우드 기반 파일 시스템 연구들이 등장하고 있다. 하지만 이러한 파일 시스템들은 오브젝트 스토리지에 저장되는 모든 파일을 동일한 크기의 단위 오브젝트로 분할하기 때문에 데이터 접근 시 비효율적인 입출력이 발생할 여지가 있다. 따라서 본 연구에서는 파일 및 워크로드의 특성을 구별하여 오브젝트 스토리지에 저장되는 단위 오브젝트의 적합한 크기를 추정하고, 각 파일의 접근 성능을 향상시킬 수 있다는 점을 검증한다. 제안하는 기법은 S3QL에 비해 평균 18.6% 빨라진 것으로 나타났다.