• 제목/요약/키워드: polyacrylamide cation

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Significance of Urease Distribution across Helicobacter pylori Membrane

  • Gang, Jin-Gu;Yun, Soon-Kyu;Choi, Kyung-Min;Lim, Wang-Jin;Park, Jeong-Kyu;Hwang, Se-Young
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제11권2호
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    • pp.317-325
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    • 2001
  • For heuristic purposes, the relative ratio of urease contents inside and outside cells was surveyed using nine ureB+ strains of Helicobacter pylori. the ratio of the enzyme specific activity appeared to vary greatly between the various H. pylori strains, ranging from 0.5 to 2.5. Besides the above compartment, urease was also richly found in the membrane fraction, especially in either peripheral or integral form. The urease distribution across the H. pylori membrane was significantly influenced by the ambient pH; the specific activity of external urease was highest at pH 5.5 with a narrow plateau, whereas the internal specific activity was highest within a pH range of 4.5 to 6.5 with a broad plateau. These finding strongly suggest that H. pylori urease is secretory and responded to the external pH. However, at pH 4.0 or below, no urease activity was detected in either the internal or external compartment, although an increase in the color development with 2,4,6-trinitrobenzene sulfonate (TNBS) was observed. Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) demonstrated that these phenomena may be related to a specific proteolysis in certain proteins, including urease or ${\gamma}$-glutamyl transpeptidase. Interestingly, the effect of ammonium ions n alleviating the enzyme inactivation inside the H. pylori cells was remarkably similar to that of D-glucose. In addition, it would appear that the cation acted as a surrogate of not only $Na^+$ but also $K^+$ thereby increasing the H. pylori P-type ATPase activity. This is of great interest, as it implies that the urease action in H. pylori is indispensible at any locus.

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황기 종자의 천연 항진균성 단백질의 분리정제 및 특성검정 (Purification and Characterization of Natural Antifungal Protein from Astragal Seeds (Astragalus membranaceus L.).)

  • 구본성;류진창;정태영;김교창
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제26권5호
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    • pp.379-386
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    • 1998
  • 본 연구에서는 천연 항균물질의 개발 이용을 위해 황기 종자로부터 인체에 무해한 천연 항균 단백질을 ion exchange chromatography 및 gel filteration을 이용하여, 순수 분리하고 특성을 조사하였다. 황기종자로부터 추출한 천연 항균 단백질은 Aspergillus ocraceus, Penicillium expensum, P. digitatum, Botrytis cineria의 포자 발아 및 효모인 Candida albicans의 생육을 현저하게 저해하였으며 ammonium sulfate 포화도가 0.4일 때 단백질의 침전량이 122.6 $\mu\textrm{g}$/$m\ell$로 가장 많았고 항균력도 15.2 mm로 가장 높게 나타났다. 강력한 cation exchange chromatography인 Mono-S를 이용하여 FPLC에서 단백질을 분획하였을때 첫번째 peak에서 분획된 단백질군이 항균력을 보였으며 Superose 12HR gel filteration column을 이용하여 2차 분획 하였을 때 분자량이 19 kDa되는 단일 단백질만을 순수분리 할 수 있었다. 전기 영동한 polyacrylamide gel위에 곰팡이 포자를 중층하는 bio autography로 19 kDa 단백질 band의 항균력을 직접 확인하였으며 분리된 항균 단백질의 아미노 말단의 아미 노산 22잔기를 sequencing하고 thaumatin 및 zeamatin 유사 단백질들과 상동성을 측정한 결과 50%내외의 homology를 나타내었다. 분리된 항균 단백질은 곰팡이 균사가 성장하는 선단부위에 가장 먼저 침투하여 channel을 형성함으로 osmolysis를 일으켜 곰팡이의 생육을 억제하는 것으로 추측할 수 있었다.

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Identification and Characterization of the Acid Phosphatase HppA in Helicobacter pylori

  • Ki, Mi-Ran;Yun, Soon-Kyu;Choi, Kyung-Min;Hwang, Se-Young
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제21권5호
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    • pp.483-493
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    • 2011
  • An acid phosphatase (HppA) activated by $NH_4Cl$ was purified 192- and 34-fold from the periplasmic and membrane fractions of Helicobacter pylori, respectively. SDS-polyacrylamide gel electrophoresis revealed that HppA from the latter appears to be several kilodaltons larger in molecular mass than from the former by about 24 kDa. Under acidic conditions (pH${\leq}$4.5), the enzyme activity was entirely dependent on the presence of certain mono- and/or divalent metal cations (e.g., $K^+$,$ NH_4{^+}$, and/or $Ni^{2+}$). In particular, $Ni^{2+}$ appeared to lower the enzyme's $K_m$ for the substrates, without changing $V_{max}$. The purified enzyme showed differential specificity against nucleotide substrates with pH; for example, the enzyme hydrolyzed adenosine nucleotides more rapidly at pH 5.5 than at pH 6.0, and vice versa for CTP or TTP. Analyses of the enzyme's N-terminal sequence and of an $HppA^-$ H. pylori mutant revealed that the purified enzyme is identical to rHppA, a cloned H. pylori class C acid phosphatase, and shown to be the sole bacterial 5'-nucleotidase uniquely activated by $NH_4Cl$. In contrast to wild type, $HppA^-$ H. pylori cells grew more slowly. Strikingly, they imported $Mg^{2+}$ at a markedly lowered rate, but assimilated urea rapidly, with a subsequent increase in extracellular pH. Moreover, mutant cells were much more sensitive to extracellular potassium ions, as well as to metronidazole, omeprazole, or thiophenol, with considerably lowered MIC values, than wild-type cells. From these data, we suggest that the role of the acid phosphatase HppA in H. pylori may extend beyond 5'-nucleotidase function to include cation-flux as well as pH regulation on the cell envelope.

Streptomyces mobaraensis로부터 생산되는 transglutaminase 분리 및 모델식품 적용 (The Separation of Transglutaminase Produced from Streptomyces mobaraensis and Its Application on Model Food System)

  • 유재수;신원선;전계택;김영수;정용섭
    • 한국식품과학회지
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    • 제35권2호
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    • pp.260-265
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    • 2003
  • 본 연구에서는 수율과 protease 제거정도 그리고 분리정제 비용을 고려하여 암모늄 설페이트 침전과 Monoplus S100 수지로 처리한 효소를 밀가루에 적용하여 반죽 형성 시 물리적 특성개선 효과를 조사하였다. 암모늄설페이트 침전, 이온 교환수지, 겔 크로마토그래피를 통한 정제된 효소의 분자량은 SDS-PAGE상에서 38,000으로 판정되었고 단일밴드로 나타나 정제도가 높음을 알 수 있었다. Farinograph를 이용하여 측정한 밀가루 반죽의 특성변화에서 저항성의 지표가 되는 안정도는 대조구가 4분, 조효소는 대조구보다 짧은 3.5분, 정제된 효소는 대조구보다 길게 측정되었다. 반죽의 약화도는 조효소의 경우 대조구보다 높게 측정되었고, 정제된 효소의 경우 대조구보다 낮은 값을 나타냈다. 이 결과로부터 조효소의 경우 protease 존재로 인하여 반죽의 분해가 진행됨을 알 수 있었고, 정제된 효소 첨가로 인하여 물성이 향상됨을 알 수 있었다. 대조군의 밀가루 반죽의 valorimeter 값은 52로 측정되었고, 정제된 효소첨가에 의해 증가되었다. S. mobaraensis가 분비하는 transglutaminase의 정제단계를 조절하고 최적화 시킬 경우 국내산 밀가루의 반죽특성의 효과를 기대할 수 있다고 판단된다.

Involvement of Lipopolysaccharide of Bradyrhizobium japonicum in Metal Binding

  • Oh, Eun-Taex;Yun, Hyun-Shik;Heo, Tae-Ryeon;Koh, Sung-Cheol;Oh, Kye-Heon;So, Jae-Seong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제12권2호
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    • pp.296-300
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    • 2002
  • Bacterial cell surface components are the major factors responsible for pathogenesis and bioremediation. In particular, the surface of a Gram-negative bacterium cell has a variety of components compared to that of a Gram-positive cell. In our previous study, we isolated an isogenic mutant of Bradyrhizobium japonicum, which exhibited altered cell surface characteristics, including an increased hydrophobicity. Polyacrylamide gel electrophoretic analysis of the lipopolysaccharide (LPS) in the mutant demonstrated that the O-polysaccharide part was completely absent. Meanwhile, a gel permeation chromatographic analysis of the exopolysaccharide (EPS) in the mutant demonstrated that it was unaltered. Since LPSs are known to have several anion groups that interact with various cation groups and metal ions, the mutant provided an opportunity to examine the direct role of LPS in metal binding by B. japonicum. Using atomic absorption spectrophotometry, it was clearly demonstrated that LPS was involved in metal binding. The binding capacity of the LPS mutant to various metal ions $(Cd^{2+},\;Cu^{2+},\;Pb^{2+},\;and\;Zn^{2+})$ was 50-70% lower than that of the wild-type strain. Also, through an EPS analysis and desorption experiment, it was found that EPS and centrifugal force had no effect on the metal binding. Accordingly, it would appear that LPS molecules on B. japonicum effect the properties, which precipitate more distinctly metal-rich mineral phase.

개량된 방법에 의한 사람혈소판으로부터 TGF-$\beta$ 1의 분리 (Purification of TGF-$\beta$ 1 from Human Platelets by an Improved Method)

  • 신충건;김상국;문병조;김평현;전계택;남상욱;김장환;이종원
    • KSBB Journal
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    • 제14권1호
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    • pp.9-16
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    • 1999
  • Transforming growth factor $\beta$1(TGF-$\beta$1)은 여러 가지 생물학적 활성을 가지는 관계로 의학적 치료제로서 사용될 가능성이 크다. 본 연구에서는 혈소판추출, 젤여과, 양이온교환 크로마토그래피 및 역상 HPLC등 네 단계의 정제과정으로 이루어져 있는 정제공정을 이용한 TGF-$\beta$1을 값싸고 효울적으로 정제하였다. 이 과정을 거쳐 최종적으로 얻어진 TGF-$\beta$1은 비환원조건하에서 SDS-PAGE를 행한 결과 구매된 TGF-$\beta$1 표준품과 일치한 위치에서 한 개의 band가 관찰되어 순수하다는 것을 확인하였으며 또한 이것이 Westem blot를 통하여 TGF-$\beta$1 항체와 결합하는 것으로부터 TGF-$\beta$1임을 확인하였다 또한, mink lung epithelial cell line 을 이용한 성장저해 실험을 통해 정제된 TGF-$\beta$1이 구매되TGF-$\beta$1 표준품보다 조금 높은 활성을 가지는 것을 확인하였다 최종적으로 농축혈소판 10단위로부터 약 3.7$\mu$g의 정제된 TGF-$\beta$1이 얻어져 그 최종수율은 약 21%였다.

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Streptomyces violaceoruber 유래 Alginate Lyase의 정제 및 Sodium Alginate 가수분해 올리고당의 중합도별 Bifidobacterium spp.과 Lactobacillus spp.에 대한 생육활성 (Purification of Alginate Lyase from Streptomyces violaceoruber and the Growth Activity of Intestinal Bacteria by Degree of Polymerization of Alginate Hydrolysates)

  • 윤민;박영서;박귀근
    • 산업식품공학
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    • 제21권2호
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    • pp.103-109
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    • 2017
  • DEAE sephacel anion chromatography 및 SP sepharose cation chromatography에 의해 Streptomyces violaceoruber 유래 alginate lyase의 정제를 수행하여 비활성 14.59 units/mL 정제배율 40.64배를 나타내었다. Tricine SDS-PAGE에 의한 단일밴드를 확인하였고, 분자량은 23.3 kDa으로 결정되었다. 정제효소에 의해 sodium alginate를 가수분해하여 1차 activated carbon column chromatography와 2차 bio gel P-2 gel filtration에 의해 당가수분해물을 분리 회수하여 TLC와 FACE를 통해 중합도를 확인하고 Timell's method에 의해 hetero type M/G-oligosaccharide 중합도 6, 8로 결정되었다. B. animalis, B. bifidum, B. breve, B. infantis, B. longum와 L. acidophilus, L. casei, L. reuteri에 생육활성에 대한 중합도 6, 8의 영향을 검토하기 위하여 modified-MRS media에 탄소원으로 중합도 6, 8를 대체하여 생육활성을 비교한 결과 B. longum에서는 D.P. 6 M/G-oligosaccharide를 탄소원으로 대체한 경우 표준 MRS배지와 비교하여 4.25배, D.P. 8에서 6.44배의 상대활성을 나타내어 가장 우수한 생육활성을 나타내었으며, B. bifidum의 경우에서도 D.P. 6에서 3.27배, D.P. 8에서 5.4배의 상대활성을 나타내었다. 이외에도 B. animalis, B. breve그리고 L. casei에 있어서도 D.P. 8의 경우 3배의 상대활성을 나타내었으나, L. reuteri에 대한 D.P. 8의 경우에서는 표준 MRS media와 비교하여 0.29배로 감소하였다. 결과적으로 D.P. 8의 올리고당이 D.P. 6의 올리고당보다 생육활성에 크게 기여하는 것으로 나타났다.