• Title/Summary/Keyword: phylogenetic relationship

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Taxonomic Revision of the Genera Pareulype Herbulot and Pelurga Hubner (Lepidoptera, Geometridae) in Korea

  • Choi, Sei-Woong
    • Animal cells and systems
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    • 제10권2호
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    • pp.103-108
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    • 2006
  • A geometrid genus Pareulype Herbulot sensu Inoue (1977) is reviewed in Korea. Up to now, two species, P. taczanowskiaria (Oberthur) and P. onoi Inoue, were known from Korea and these two species were newly combined into another genus Pelurga Hubner. One Pareulype species, P. consanguinea (Butler), is first recognized from Korea throughout the present study. Diagnoses of each genus and species are provided with illustrations of adults and genitalia. Phylogenetic relationship of Pareulype and Pelurga Hubner is briefly discussed.

Phylogenetic relationship of the wild silkworm, Bombyx mandarina, inferred from aninternal transcribed spacer (ITS) of rDNA

  • Kim, Kyung-ah;Nho, Si-kab
    • 한국잠사학회:학술대회논문집
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    • 한국잠사학회 2003년도 제46회 춘계 학술연구 발표회
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    • pp.42-42
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    • 2003
  • The wild silkworm, Bombyx mandarina, was believed the only ancestor of B. mori, inhabits the limited area of Eastern Asia including China, Korea and Japan. However, the geographic dimorphism of B. mandarina was reported with chromosome number and arylphorin gene. In connection with those dimorphism, we studied the genetic differences of ITS-2 region in rDNA purposing the differentiation and geographic variation within the species of B. mandarina. (omitted)

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ITS 염기서열에 의한 한국산 담배풀속(Carpesium L.)의 계통분류학적 연구 (A Phylogenetic Study of Korean Carpesium L. Based on nrDNA ITS Sequences)

  • 유광필;박선주
    • 한국자원식물학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.96-104
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    • 2012
  • 한국산 담배풀속(Carpesium L.) 7분류군과 3개의 외군(Inula britannica L., Inula germanica L., Rhanteriopsis lannginosa(DC.) Rauschert)을 대상으로 유연관계를 파악하기 위하여 nuclear ribosomal DNA(nrDNA) 중 ITS(internal transcribed spacer) 지역의 계통분류학적 분석을 수행하였다. 계통분류학적 연구방법은 maximum parsimony, neighbor-joining와 maximum likelihood 방법을 사용하였다. 정렬된 계통분의 총 길이는 731 bp이며, ITS1, ITS2와 5.8S 부위의 길이는 각각 284~297 bp, 264~266 bp와 164 bp로 나타났다. 계통분류학 변이를 보이는 site는 111개로 확인 되었으며, 그 중 64개의 site가 계통학적으로 유효한 것으로 나타났고, ITS1 지역이 ITS2 지역보다 염기 변이가 다양하게 나타나는 것으로 확인되었다. 그 결과, 한국산 담배풀속은 단계통을 형성하였으며, 담배풀(C. abrotanoides L.)이 가장 기저부에 위치하였다. 여우오줌(C. macrocephalum Franch. & Sav.)와 두메담배풀(C. triste Maxim.)은 가까운 유연관계를 나타냈으며, 애기담배풀(C. rosulatum Miq.)와 천일담배풀(C. glossophyllum Maxim.) 그리고 좀담배풀(C. cernuum L.)와 긴담배풀(C. divaricatum Siebold & Zucc.)도 유연관계가 가깝게 나타났다. 이와 같은 결과로 담배풀속 nrDNA의 ITS 지역 염기서열에 기초한 분자 계통학적 연구는 계통분류를 이해하는데 유용한 방법으로 판단된다.

해조류 5종의 아미노산 조성 및 계통 다양성 비교 분석 (Comparative Analysis of the Amino Acid Composition and Phylogenetic Diversity of Five Seaweed Species)

  • 손승원;이혜영
    • 생명과학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.145-152
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    • 2024
  • 해조류는 풍부한 필수 영양소 공급으로 인해 귀중한 해양 자원으로 여겨지며 특히 단백질과 아미노산이 풍부하게 함유되어 있다. 한국에서는 500종 이상의 해조류가 서식하며 그 중 50종 이상이 식품용으로 이용되어 일상 식단의 중심 역할을 한다. 본 연구는 한국에서 가장 흔히 섭취되는 해조류 5종(매생이, 톳, 김, 다시마, 미역; Capsosiphon fulvescens, Hizikia fusiforme, Porphyra yezoensis, Saccharina japonica, Undaria pinnatifida)의 단백질 구성 아미노산을 분석하였다. 고성능 액체 크로마토그래피 분석 결과, 아스파르트산, 글루탐산, 알라닌, 류신이 가장 풍부한 아미노산 성분임을 알 수 있었다. 주성분 분석에서는 이 다섯 종류의 해조류가 아미노산 구성에 따라 세 개의 군집으로 분류될 수 있었고, 이는 부분적으로 계통 분류 결과와 일치하였다. 다양한 아미노산 중에서도 글루탐산, 아스파르트산, 알라닌이 구분을 주도하는 주요 아미노산이였다. 특히, 가까운 계통적 근접성을 보이는 Undaria pinnatifida와 Capsosiphon fulvescens는 뚜렷하게 유사한 아미노산 프로필을 나타내었다. 그에 비해 Porphyra yezoensis와 Saccharina japonica는 계통적 관계를 공유하더라도 다른 아미노산 구성을 보였다. Hizikia fusiforme는 두 분석 모두에서 독특한 군집으로 나타났다.

Molecular phylogenetic relationships within the PSP producing marine dinoflagellate, genus Alexandrium

  • Kim, Choong-jae;Kim, Sook-Yang;Kim, Kui-Young;Kang, Young-Sil;Kim, Hak-Gyoon;Kim, Chang-Hoon
    • 한국양식학회:학술대회논문집
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    • 한국양식학회 2003년도 추계학술발표대회 논문요약집
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    • pp.136-137
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    • 2003
  • The marine dinoflagellate genus Alexandrium has been recognized as the most representative toxic phytoplankton on account of production of paralytic shellfish poisoning (PSP) throughout the world. PSP producers, generally A, tamarense and A. catenella, within the genus Alexandrium have caused high level intoxicauon of fisheries products and even death of human. In addition, more recent increasing of geographical range of this deleterious species has given rise to alarming tension. The study presented here aimed construction of the molecular phylogenetic relationships through sequences-determination from 16 morphotypic species (containing newly sequenced 3 morphotypic species, A. tamiyavainchii, A. fraterculus and A. pseudogonyaulax) in LSU rDNA D1-D2 and 12 morphotypic species (containing newly sequenced 6 - morphotypic species, A. catenella, A. tamiyavanichii, A. fraterculus, A. affine, A. insuetum and A. pseudogonyaulax) in SSU rDNA region, and the sequences were subjected to comparative-analysis in respect to regional population using functionally expressed rDNA genus and pseudogenes. And we discussed on genetic differentiation between A. tamarense and A. catenella together with putative PSP divegence of the genus Alexandrium. The results of phylogenetic analysis showed the robust monophyletic 14 distinct classes of A. tamarense, A. excavatum, A. catenella, Tasmanian A. tamarense, A. affine (and/or A. concavum), Thai A. tamarense, A. tamiyavanichii, A. fraterculus, A. margalefii, A. andersonii, A. ostenfeldii, A. minutum (and/or A. lusitanicum), A. insuetum, and A, pseudogonyaulx clade. A. fraterculus and A. tamiyavanichii were sister relationship and they were positioned independently between A, affine cluster and those of A. margalefi, A. andersonii, A. ostenfeldii, A. minutum and A. insuetum. A. pseudogonyaulax appeared to be an ancestral taxon among Alexandrium.

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Sequence Divergence and Phylogenetic Investigation of the Nymphalidae (Lepidoptera: Papilionoidea) Occurring in South Korea

  • Wan, Xinlong;Kim, Min Jee;Cho, Youngho;Jun, Jumin;Jeong, Heon Cheon;Lee, Kwang Youll;Kim, Iksoo
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제26권2호
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    • pp.95-112
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    • 2013
  • As a first step toward understanding the divergence and relationships of the Nymphalidae (Lepidoptera: Papilionoidea) occurring in South Korea, cytochrome oxidase subunit I (COI), 16S ribosomal RNA (16S rRNA), and elongation factor-$1{\alpha}$ (EF-$1{\alpha}$) that comprise 3,501-3,716 bp were either sequenced (55 species) or the sequences were obtained from GenBank (23 species). The concatenated sequence divergence of six nymphalid subfamilies ranked in the following order: Danainae (10.3%), Satyrinae (9.5%), Limenitidinae (8.0%), Apaturinae (7.0%), Nymphalinae (6.7%), and Heliconiinae (6.2%). As has been reported in previous large scale international studies, the subfamilial relationships of (((((Limenitidinae + Heliconiinae) + (Nymphalinae + Apaturinae)) + Satyrinae) + Libytheinae) + Danainae) were also confirmed, except for the switched positions between Danainae and Libytheinae, and supported all subfamilies and tribe monophylies. Unlikely consistent phylogenetic relationships among genera within the majority of tribes in Nymphalidae, a conflicting relationship within the subfamily Apaturinae was obvious, presenting Apatura as sister to either Mimathyma or (Mimathyma + (Sephisa + (Hestina + Sasakia))), and both of these relationships are unconventional. Within the subfamily Limenitidinae, the genus Neptis was consistently revealed as a paraphyletic with respect to the genus Aldania, requiring further taxonomic investigation of the genus. Although limited, current sequence information and phylogenetic relationships are expected to be helpful for further studies.